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细胞凋亡吞噬研究获进展

6月15日,Genes & Development杂志发表了中科院生物物理研究所刘迎芳实验室和北京生命科学研究所(NIBS)王晓晨实验室的合作研究成果—— Structural Study of TTR-52 Reveals the Functional Mechanisms of a Bridging Molecule in Apoptotic Cell Engulfment。该工作通过结构和功能研究,揭示了在秀丽线虫凋亡细胞的清除过程中,桥联分子TTR-52介导吞噬细胞识别凋亡细胞的作用机制。 细胞凋亡后需要被及时清除以维持机体平衡。在线虫中,TTR-52是一个介导凋亡细胞和吞噬细胞的桥联分子,通过识别凋亡细胞上外翻的磷脂酰丝氨酸( PS )来识别凋亡细胞,同时TTR-52也可以结合吞噬细胞上的受体CED-1,进而介导凋亡细胞的吞噬。从序列分析来看,TTR-52类似于 transthyr......阅读全文

如何选择蛋白晶体结构?

在使用殷赋云计算平台的时候,有不少用户对于如何选择蛋白晶体结构存在疑问。本篇就这个话题做一些经验分享。任何标准都有一个适用范围。我们在这里只讨论用于分子对接的蛋白晶体结构的选择原则和方法。1. 确定蛋白种属在实验当中,研究人员通常使用动物模型(如小鼠)来研究人源蛋白。这样做有许多原因,比如:1) 无

如何选择蛋白晶体结构

  在使用殷赋云计算平台的时候,有不少用户对于如何选择蛋白晶体结构存在疑问。本篇就这个话题做一些经验分享。任何标准都有一个适用范围。我们在这里只讨论用于分子对接的蛋白晶体结构的选择原则和方法。   1. 确定蛋白种属   在实验当中,研究人员通常使用动物模型(如小鼠)来研究人源蛋白。这样做有许

TATA结合蛋白

TBP用β-折叠结合到DNA双螺旋的小沟上,能使TATAbox弯曲80°。主要结合在A、T碱基上,因为这样有利于扭曲使小沟开放。

Science揭示CXCR4与趋化因子结合的晶体结构

  趋化因子是一种免疫信号蛋白,它与受体的互作与癌症、炎症和HIV感染有关,现在科学家们首次捕捉到了这一互作的3D结构。  加州大学和南加州大学的科学家们克服重重困难,获得了细胞受体CXCR4与趋化因子结合时的晶体结构,这一突破性成果发表在一月二十二日的Science杂志上。CXCR4与趋化因子的互

结合珠蛋白的介绍

结合珠蛋白 (haptoglobin,HP)又称触珠蛋白,是一种分子量为85000的酸性糖蛋白,广泛存在于人类和多种哺乳动物 的血清及其他体液 中。在CAM电泳及琼脂糖凝胶电泳中,结合珠蛋白位于α2区带,分子中有两对肽链(α链与β链)共同形成α2β2的四聚体。结合珠蛋白主要在肝脏合成,其降解也在肝脏

DNA结合蛋白的形成

它是解链酶(unwinding enzyme)类中的一种类型,发现于原核生物的大肠杆菌细胞内,由相同亚基组成的四聚体,分子量8×104,与单链DNA亲和力极大,与双链DNA结合力较差。因此,当DNA发生暂时性熔化时,它与DNA单链区结合而促使反应偏向单链的形成,使DNA在大大低于Tm(解链温度)的温

结合蛋白质(2)

重要的结合蛋白质血红蛋白血红蛋白(hemoglobin)是主要存在于脊椎动物红细胞中的一种色蛋白,它的主要功能是在人体内运载氧气和二氧化碳。正常人体的100ml全血中,含血红蛋白质12~16g。人类血红蛋白含铁约为0.33%~0.34%,其相对分子质量约为67 000。血红蛋白由珠蛋白和辅基血红

DNA结合蛋白测定实验

本实验主要用于检测粗制提取物中序列特异性的DNA结合蛋白。实验方法原理本分析方法是一种简单、快速和极为灵敏的用于检测粗制提取物中序列特异性的DNA结合蛋白的方法。在电泳时,与末端标记的DNA片段特异结合的蛋白质阻滞了片段的迁移,因而产生对应于蛋白-DNA复合物的清晰电泳条带。实验材料质粒DNA试剂、

DNA结合蛋白测定实验

实验材料 质粒DNA试剂、试剂盒 dNTPDNA聚合酶Klenow酶TETAE溴化乙锭TEMED过硫酸铵BSA仪器、耗材 培养箱离心管实验步骤 1.  用一种或多种限制性内切酶在100 μl 体积中消化10 μg 质粒人,产生25~100 bp  的含有结合位点的DNA片段,并至少有一端是5’突出的

DNA结合蛋白测定实验

            实验方法原理 本分析方法是一种简单、快速和极为灵敏的用于检测粗制提取物中序列特异性的DNA结合蛋白的方法。在电泳时,与末端标记的DNA片段特异结合的蛋白质阻滞了片段的迁移,因而产生对应于蛋白-DNA复合物的清晰电泳条带。