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罗氏454追踪“超级细菌”传播途径

2011年6月,一位女性肺部感染伴呼吸困难的患者被美国国家健康研究所的医院收治,很快被确诊感染了对多种抗生素具有耐药性的肺炎克雷博氏菌,在其住院期间医院使用了最严格的防止院内感染的措施,包括隔离病人、清洁病人所接触的医疗器械等等。在其住院期间,未发现院内感染事件,病人于2011年7月治愈出院。然而,时隔一个月,再次出现了同一种具有耐药性的肺炎克雷博氏菌感染病例。短短5月的时间,共出现17位病人相继感染,其中10人死亡,6人死于肺炎克雷博氏菌。此事引起医院的密切关注,这些新出现的病例是否来自第一个病例?为什么在最严密的疫情控制措施之下仍然发生了超级细菌的传播?是这些现有的疾控措施失效,还是尚有其他传播渠道尚未得到控制?在这个真实的传染病事件中,研究人员利用罗氏454测序仪对超级细菌的传播途径以及其耐药性突变的进化进行了追踪1。最初使用传统的脉冲电泳或者PCR分析方法,只能将病人所感染的确认为ST 258型肺炎克雷博氏菌而无......阅读全文

罗氏454测序分析软件升级

  罗氏公司近日宣布推出一款新的软件包(v2.8),能显著改善其GS FLX+系统上长读取鸟枪法测序的性能。这一测序平台能带来百万个读取,其读长超过1000 bp。此次改进将让研究人员发现更多复杂的遗传变异,并揭开隐藏在基因组、转录组和宏基因组样品中难以测序的区域下的生物学秘密。   罗氏