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DNA提取:为微生物研究扫清障碍

近年来,尽管测序技术在快速发展,但DNA提取方法却鲜有改进。对于宏基因组研究,这是必需的一步。然而,许多微生物无法在实验室中培养,这成为分析大量微生物样品的一个主要瓶颈。参与美国NIH的人类微生物组计划(Human Microbiome Project)以及地球微生物组计划(Earth Microbiome Project)的科学家们也面临这一问题。 参与这些计划及其他计划的微生物学家使用专门的试剂盒,他们利用机械和化学裂解以及DNA纯化步骤,接着对16S rRNA基因进行PCR扩增,最后测序。但是他们发现,并非所有方法都是相似的,这不但影响结果的质量,还让不同研究之间的结果难以比较。为了解决这些挑战,多个研究小组都在优化DNA提取的效率,并研究不同步骤如何影响DNA的质量和产量。 例如,在上月发表在《PLoS ONE》的一项研究中,科罗拉多大学的微生物学家Gilberto Flores及其同事检验了......阅读全文

安捷伦推出实时活细胞 ATP 速率测定试剂盒

  新测定方法扩大了 Agilent Seahorse XF 技术的应用范围  2018年5月8日,北京——安捷伦科技公司(纽约证交所:A)日前宣布推出一款新产品— Agilent Seahorse XF 实时 ATP 速率测定试剂盒,这款试剂盒将帮助生物学家增进对活细胞实时功能的了解。  Seah

将高大上的CRISPR基因编辑技术普及给大众你怎么看?

  如果任何人都可以在线购买便宜的CRISPR试剂盒,会怎么样?购买者用这些试剂盒干什么?这种强大的基因组编辑工具应该如此容易地获取吗?  去年夏天,在一个星期五的晚上,美国科茨维尔一位爸爸和他7岁的儿子坐在地下室的充气椅上;他们之间的地板上放着一个白色的盒子。爸爸用一把剪刀把盒子打开,问:“你认为

Nature:新研究挑战人胎盘微生物组的存在,但也备受质疑

  多年来,科学家和医生都认为子宫是无菌的,但随着基于测序和培养的方法表明胎盘含有相对较小的微生物群落,这种情形发生了变化。但是,在一项新的研究中,来自英国剑桥大学的研究人员将胎盘中的少量细菌存在归因于实验室细菌污染和分娩过程中的细菌转移。他们作出结论:除了B族链球菌(一种已知的病原体)之外,没有证

CRISPR精品操作指南:如何精确有效完成实验!

  生物学家们总是沉迷于对基因组修修补补,而其中一种近期红得发紫的技术就是 CRISPR。自2012年CRISPR/Cas 首次作为一种基因组编辑工具登台以来,关于这种技术的论文数量就大幅增加,最好的证明之一就是2015年两位科学家由于在CRISPR基因组编辑技术方面的重要贡献而获得“科学突破奖”,

The Scientist Magazine评出2015年生命科学领域创新产品Top 10

  分析测试百科网讯 近日,The Scientist Magazine评选出了2015年度生命科学领域十大创新产品,包含了7个基因组学、1个蛋白组学和2个代谢组学进入该名单。该奖项旨在表彰对科学和医学领域产生巨大影响的

博奥晶典两大引进平台入围2015十大生命科学领域创新产品

  日前,致力于生命学科技研究的美国著名杂志The scientist推出2015年度生物十大创新产品排行榜。这十大创新产品,包含了7个基因组学、1个蛋白组学和2个代谢组学。该榜单旨在表彰对科学和医学领域产生巨大影响的测序仪、试剂盒、基因组编辑产品和其他技术。  博奥晶典长期致力于技术创新,引进转化

Nautre:婴儿身上的首批细菌来自出生前?

  受孕后不久,人类胚胎便开始组装一个对其生存至关重要的器官——胎盘。胎盘是胎儿与母体之间物质交换的重要器官,它将母体血液中的氧气、营养素和免疫分子运送到正在发育的胎儿身上,同时胎盘也是防止感染的屏障。一个多世纪以来,医生们认为这种短暂的结构——就像胎儿和子宫本身一样——是无菌的,除非出现了什么问题

【安特百货】Agilent Stratagene试剂盒现货7折热卖中

  Aglient Stratagene试剂盒全面上线安特百货,现货7折!  Stratagene产品以其高质量的试剂产品和独创性的技术,成为生物学家的最佳研究拍档之一。不但涉及分子生物学,还涉及基因组学,蛋白组学,抗体,药物,毒素等领域产品的开发和研制,为客户提供全方位高技术产品。经典产品包括:文

美国重查去年“流感”样品!结果是...

  两天前《美国科学院院报》出了一篇新冠病毒在全球传播进化的文章,结果微信上很多人传这么一条评论:这篇文章对全球的华人都是一个大幸事。我觉得这个说法脑补过度了,就写了一文谈了自己的看法,没想到收到到不少评论和私信,80%反对的人都提了一个强烈的要求:美国要是心里没鬼,就测查之前流感季节有没有新冠阳性

DNA分子标记技术研究进展(二)

2.第二代分子标记2.1 SSR标记技术    在真核生物基因组中存在许多非编码的重复序列,如重复单位长度在15~65个核苷酸的小卫星DNA(Minisatellite DNA),重复单位长度在2~6个核苷酸的微卫星DNA(Microsatellite DN

中国基因测序仪往事

  9月9日,来自深圳的消息,国产基因测序仪DNBSEQ-T7(原命名MGISEQ-T7)正式交付商用。从去年10月发布以来,诸多业内人士和媒体将T7誉为中国基因产业突破上游技术壁垒,实现跨越发展的现实注脚。  从关山难越,到部分引领,中国基因测序仪的研制开发攀越关山、跋涉荆棘,经历了起伏跌宕的20

盘点2014年度十大改变世界的革命性技术

  基因编辑更快更准更简单  1973年,斯坦利•N•科恩(Stanley N. Cohen)和赫伯特•W•博耶(Herbert W. Boyer)找到了改变生物体基因组的方法,成功将蛙的DNA插入到细菌中。20世纪70年代末,博耶的基因泰克(Genetech)公司对大肠杆菌进行基因改造,使其带有一

Science突破性成果:鸟瞰细胞RNA

  如同在房地产中一样,在生物学中位置也很重要。活化基因的mRNAs战略性定位在整个活体组织中,它们的位置往往帮助调控了细胞和组织的生长及发育方式。然而为了同时分析许多的mRNAs,科学学家们不得不将细胞碾磨成浆,这使得他们没有好的办法精确确定这些mRNAs在细胞内的定位。   现在,哈佛大学Wy

比较分子生理基因组学 —cDNA阵列的异种杂交实验

实验步骤 一、材料 这里用到的所有化学试剂都为分子生物学等级,或者用它们最高纯度的等效物。所有的塑料和玻璃制品,包括瓶子和移液器吸头都要高压灭菌,在核酸实验操作过程中必须始终戴手套。 cDNA A T L A S阵列从Clo

比较分子生理基因组学 —cDNA阵列的异种杂交实验

近几年来, DNA 微阵列已经被公认是分子生物学研究的一种标准方法。特别是在生物医学研究方面,常用物种的微阵列一面世就得到广泛应用。但是对于非模式生物来说 ,微阵列的应用尚未得到充分开展,而这些物种往往表现出一些很有趣的生理表型。对大多数比较生物学的研究者来说,制备一个新物种的 D N A 阵列或微

不可能!美国学者驳斥新冠病毒“人工合成”论

   2月18日和19日,来自世界各地的科学家在新冠病毒研究方面取得多项重要进展。具体如下:  • 美国学者发文反驳新冠病毒“人工合成”阴谋论,表示SARS-CoV-2不是实验室工程制造、泄漏的病毒,而是病毒自然进化的产物。  • 复旦大学附属华山医院感染科主任张文宏领衔发表的最新论文,认为呼吸道病

2017年度十大医疗发明:从CAR-T芯片到10倍基因组

  科学家杂志(The Scientist)评选出了2017年度的十大医疗技术发明。他们是:  1. IsoCode芯片:分析CAR-T细胞的芯片    今年二月由Isoplexis公司推出,它包含数千个只能容纳单细胞的微型腔室。在每个微室内,15个分离空间的槽内包含多达三种针对特定分泌蛋白的不同抗

基因检测的真相与谎言

  2013年,好莱坞著名影星安吉丽娜·朱莉通过《纽约时报》发表公开信,宣布自己已经接受了双乳乳腺切除及乳房再造手术。原因是她的医生估计她有87%的可能性患上乳腺癌、有50%的风险患上卵巢癌。  医生做出这样的判断是基于两点:一是她有乳腺癌的家族史,她的妈妈和外婆都是因乳腺癌而去世;二是通过一种当时

Nature:CRISPR浪潮席卷学界

  每当有新的CIRSPR-Cas9相关文章发表时,Addgene公司的工作人员就会迫不及待地研读。Addgene是家非盈利公司,研究者们把自己使用的分子工具存放在这里,以供其他科学家们尽快使用这一技术。Addgene公司执行董事Joanne Kamens 指出,一篇大热的论文一发表,几分钟内他们就

CRISPR:基因编辑刚初出茅庐

  每当有新的CIRSPR-Cas9相关文章发表时,Addgene公司的工作人员就会迫不及待地研读。Addgene是家非盈利公司,研究者们把自己使用的分子工具存放在这里,以供其他科学家们尽快使用这一技术。Addgene公司执行董事Joanne Kamens 指出,一篇大热的论文一发表,几分钟内他们就

MIT:2015十大突破技术——液体活检入选

  近日,MIT Technology Review杂志发布了2015年度十大突破技术( Breakthrough Technologies 2015)的榜单。其中与生命科学密切相关的液体活检、大脑类器官(Brain Organoids)、DNA互联网等技术光荣上榜。  液体活检:快速、简便的癌症血

第二届AVDC大会新增会议嘉宾抢先看!

 为进一步提高中国兽医诊断服务在可靠性、准确性、及时性和高通量等方面的表现,第二届国际兽医检测诊断大会将于2020年9月10-12日在南京国际展览中心举行。大会广泛邀请全球兽医检测诊断的杰出代表与不断进取的中国兽医进行深层次的分享、对话及相互启迪。大会详情时  间:2020年9月

15项业内最新科研汇总

癌症液体活检新突破: TMB检测可精准确定免疫疗法是否对患者有效 8 月 7 日,《自然医学(Nature Medicine)》网上刊发的一项研究称,加州大学戴维斯分校基因工程与基础医学部门研究员首次发现,用以评估肿瘤突变负荷(tumor mutational burde

60万美元买来的仪器3年过气怎么办?看你会不会改造

过时的基因组测序仪不一定非得淘汰不用,研究人员可以稍加改造,让它们在下一代生物化学研究中发挥余热。  在斯坦福大学的一个地下储藏室里,十几台DNA测序仪被拆解开来,价值数十万美元的摄像头、激光器以及光学和流体控制器散落在地,它们都来自名为GAIIx的Illumina第二代DNA测序仪。地板上,一台旧

价值数十亿美元的生物科技公司

   Moderna Therapeutics公司可谓野心勃勃,但是它也有相配套的巨额资金支持。这家羽翼未丰的新创公司是如何成为有史以来最有价值的私有药物公司之一的呢?  在两年半前的一次早餐会上,制药巨头Astra­Zeneca公司新上任的首席执行官Pascal Soriot签署了一份药物研发协议

流式细胞仪和流式细胞术指南篇-1

Jay Haron Ph. D.jay dot haron at gmail dot comBD Biosciences, San Diego, United States引用实验材料和方法  从1968年 zui早的商品化 流式细胞术(FC) 和荧光激活细胞分类术(FACS)诞生以来,