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microRNA的实时定量茎环RTPCR技术(五)

TaqMan miRNA的检测能力不同,是依据采用let-7a, let-7b, let-7c, let-7d 和let-7e 5个合成miRNA来检测低至一个核苷酸(图7)。每个miRNA的检测对应每个miRNA。相对探测效率是通过计完全匹配和不匹配的目标CT之间的差异,假设完美匹配的效率为100%。观察非特异性信号处在非常低的水平,从零到0.3%,对于miRNA有2-3不匹配,0.1-3.7%的单核苷酸不同。许多交叉反应,是由RT反应反应中G-T的错配导致的。如果miRNA之间出现超过三个不匹配,会有针对性的miRNA检测。 我们比较歧视的TaqMan miRNA的检测能力的不同,以解决杂交分析为基础的检测(图8)。在我们的手中,杂交方法可以很好地区分let-7a和let-7b。然而,在let-7a, let-7c 和 let-7d之间,几乎没有区别,而是由1–3 nt区分。 我们推测,茎环引物可能会比线性引物提供更好的......阅读全文

microRNA RT-PCR实验方法

Stem-loop实时定量RT PCR传统实时定量RT PCR只能检测到miRNA前体,而Stem-loop实时定量RT PCR技术可以解决这一问题。Stem loop实时定量RT PCR是一项高特异度、敏感度的检测miRNA表达的实验技术,包括设计具有茎环(stem loop)结构的反

microRNA的实时定量茎环RT-PCR技术(一)

摘要:已开发出一种新型的microRNA(miRNA)的定量方法,即利用茎环反转录,Taqman PCR分析。茎环RT引物在RT 效率和特异性方面比传统的更好。TaqMan miRNA的检测是很具体的,可以检测成熟miRNA和区分相关的甚至低至一个核苷酸的miRNAs。此外,他们不会受到基因组DNA