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基因测序的云计算平台

自二代测序的技术问世以来,就一直是研究和临床领域关注的重点。随着整个行业的技术发展,二代测序也带动了整个基因研究的产业链。在二代测序的产业链中,上游做检测,中游做分析,下游做应用。在测序价格持续下降的情况下,中游测序数据的生物信息学分析成为了提高效率最大的瓶颈。 传统的测序数据分析依赖于本地服务器的性能。而可以预见的是不断下降的测序价格将会带来更多海量测序数据的产生,而巨大数量的测序数据无疑会延长获得测序分析结果的时间。目前可能较好的解决方法是通过云计算的方式去做,云计算的优势在于能够通过分布式计算对大数据进行处理,从而极大提升运算效率以及降低成本。 目前国外的云计算平台Seven Bridge已经做的比较成熟,对二代测序数据也能够进行快速分析。缺点是作为典型的pipeline式分析,对用户的要求比较高,对于国内用户群体的使用会有一些障碍。而在国内的云计算平台中,GCBI将于2016年2月底......阅读全文

基因测序市场深度剖析

   Technologies(现为Thermo Fisher收购)公司全国临床与科研事业部销售总监、ThermoFisher公司全国临床市场战略总监柴映爽写了一系列文章,对基因测序领域进行了深入剖析。让我们看看这个领域深入工作的人士,怎么看待2015年基因测序市场大热这一现实的。   ▌第一篇:基

消费级基因检测兴起,行业洗牌加速

  从基因检测下游服务行业拓展至上游设备行业,中国的基因检测企业存在感越来越强。欣喜之余不可忽视的是,当前基因测序公司对于医疗实际场景缺乏深入了解,临床信息与基因数据脱节,政策监管风险如同一只迟迟不落下的靴子,这些都是这个行业无法回避的痛点。  在华大基因董事长汪建的眼中,基因检测似乎“无所不能”。

产前DNA检测走红背后的基因江湖

  经历了2015年的热捧,2016年的资本小幅理性回归,2017年上半年的热潮趋缓后,泛泛的基因测序将无法持续吸引资本的目光,未来行业热点在于技术突破,或者商业模式的突破。  (做一次全基因检测,会产生100多G海量数据,其中能被用于科研与临床应用的,只是蛋白编码基因与少量的非蛋白编码基因,占整体

从一代到四代,基因测序渐成生命密码解读者

  基因测序行业发展迅速,二代测序为主流技术。  当下,一代基因测序技术由于通量较低、测序时间较长,已经不能满足研究应用的需要,以高通量低成本为特征的二代测序技术为目前应用最广泛的测序技术,测序时间相较于一代技术大大降低。  基因测序作为精准医疗的重要一环,随着技术的进步以及成本的下降,近年来发展迅

华大基因背后的技术武器

  斥巨资采购128台基因测序仪,一举成为全球最大的基因测序中心,全额收购美国纳斯达克上市公司Complete Genomics(下称CG),改变中国生物科技企业被跨国企业单向并购的格局。华大基因向来不按套路出牌。看似有些疯狂的举动,实际是华大基因建立技术优势的精心布局。华大基因的服务规模和测序团队

投资人必读:云计算如何为精准医疗助力?

  全民聚焦精准医疗  今年3月我国成立了精准医疗战略专家组,国家卫计委和科技部多次召开会议,论证启动精准医疗计划。一时间全国各地与精准医疗相关的机构和协会如雨后春笋一般出现,例如北京协和医院、四川大学华西医院等三甲医院筹建的精准医疗研究中心。各地与精准医疗相关的论坛和项目也如火如荼的开展

专访Illumina公司CEO:中国基因检测服务市场机会巨大

  “我是专程到中国来的,而且这次是带了整个的管理团队到中国来。我们的目的是为了更好地了解并且同我们本地的合作伙伴们进行沟通。”2017年3月22日在阴雨绵绵的上海,Illumina公司CEO Francis deSouza上任后首次到访中国,“如今,中国和美国应该是全球最大的两个基因市场,对于Il

华大基因发布业绩报告,一季度净利1.4亿增长42.59%

  4月26日,华大基因(300676)今日发布2020年第一季度报告,公告显示,报告期内实现营收791,193,880.94元,同比增长35.78%;归属于上市公司股东的净利润140,018,914.29元,同比增长42.59%。  截至本报告期末,华大基因归属于上市公司股东的净资产4,464,9

我国精准医疗如何让基因测序“言听计从”

  基因测序技术是临床分子诊断中的重要手段,其起源早于PCR技术。1968年华裔科学家吴瑞(Ray Wu)博士独创地提出了引物延伸的测序策略,在这一策略基础上基因测序方法得到发展,Sanger和Gilbert因开发不同的测序方法于1980年获得诺贝尔奖。目前的基因测序技术可以分为三类:毛细管电泳测序

基因测序:数据处理与标准问题仍待解

  【导读】目前我国在数据行业标准方面概念还很模糊,这就导致科研机构、医疗机构、企业在利用基因数据的时候,没有统一的规则,也造成基因测序行业良莠不齐。这种情况,亟须得到改变。  目前我国在数据行业标准方面概念还很模糊,这就导致科研机构、医疗机构、企业在利用基因数据的时候,没有统一的规则,也造成基因测

如何使基因测序更好地服务于我国精准医疗

   基因测序和精准医疗是近年来讨论很热的两个概念。这两个词之所以能联系到一起,主要还是因为越来越多与疾病有关的基因得到确认,而更加个性化诊疗的需求,正在对传统的医学模式提出挑战,同时技术进步导致基因测序成本大幅降低,使得人们看到了它应用于临床诊疗的前景。在美国NIH (国家卫生研究院)2015年颁

基因测序:数据处理与标准问题仍待解

图片来源:百度图片 目前我国在数据行业标准方面概念还很模糊,这就导致科研机构、医疗机构、企业在利用基因数据的时候,没有统一的规则,也造成基因测序行业良莠不齐。这种情况,亟须得到改变。 基因测序,一直被视为生命科学和生物技术发展的重大革命。在经历过前些年的积累之后,今年的基因测序行

云健康与阿里云共建BT/IT云计算和大数据人工智能平台

  2017年12月22日,云健康基因科技(上海)有限公司(以下简称:云健康)总裁/CEO金刚博士与阿里云上海分公司(以下简称:阿里云)总经理张婷华,在上海正式签署了基因组大数据云计算战略合作协议,双方未来将加快BT(生物技术)和IT(信息技术)的深度结合,利用云端优化基因大数据的存储、分析、管理等

基因测序应用行业

基因检测目前主要有三大细分领域,分别是生殖与遗传健康、肿瘤个性化诊断、以及健康人群疾病预防与监测。■生殖与遗传健康基因检测在生殖与遗传健康领域具有广阔的发展前景。当前主要的产品是通过对母体血液中的胎儿DNA(cfDNA)进行测序,检测胎儿染色体13,18,21等是否出现异常,从而排除胎儿患有Pata

创世界纪录!深企新技术1分钟解码基因

  导读: 伴随着基因测序技术的快速发展,基因数据的生成呈现指数级增长,对检测速度和分析能力也提出更高要求。近日,深圳承启生物云计算平台,搭载自主研发的FANSe三代算法,在全世界刷新了一个记录,首次实现一分钟解析一个人近两万个基因信息,比以往的同类技术快了数十倍,准确度更是有了惊人的提升。  伴随

基因测序描绘个体化医疗产业图谱

  随着高通量测序技术的引入和“大数据”处理能力的提高,现代医学正在经历巨大的变革,由传统标准化医疗模式向个体化医疗模式转变。而人类基因组计划和DNA元素百科全书计划的完成及肿瘤基因图谱的绘制,也为“量体裁药”式的个体化医疗提供了有力工具,医学领域面临新的机遇。不过,业内人士表示,尽管市场空间可观,

华大基因的3万多“铁粉”,能否等到股价的再次起飞?

自2017年7月打开IPO涨停板,到2017年11月股价涨到巅峰的261.39元,再到2018年9月3日股价降到73.39元,华大基因的股东户数一直在3万多;而截止2018年上半年股东户数,为33,283户。这3万多“铁粉”,能否等到华大基因的再次腾飞?我翻越了它不少资料,试图从公司披露的中报,谈谈

华大基因、阿里云、英特尔三巨头聚首国家基因库BGIOnline

2016年11月3日,在第十一届国际基因组学(ICG-11)大会上,华大基因、阿里云、英特尔等行业巨头齐聚深圳国家基因库,举行了“漫步云端――BGI Online合作伙伴大会暨新版发布会”。华大基因股份有限公司执行总裁尹烨、阿里巴巴集团副总裁孙炯、英特尔医疗和生命科学集团亚太区总经理李亚东出席大会。

英特尔联手华大基因等构建医疗平台:24小时内完成基因测序

  2001年,6个国家的科学家花了11年的时间,花费30亿美金,共同发表首个人类基因组工作草图。如今,除了时间大大缩短外,测序成本下降至1000美元。而在英特尔看来,完成包括基因序列检测、数据分析、疾病诊断,以及制定个性化治疗方案在内的精准医疗的主要过程也许用不了24小时。  4月13日,英特尔公

我国超级稻基因组数据从“云端”向全球共享

  “我们的3000份绿色超级稻基因组原始测序数据,覆盖了全球25万份种质基因全部遗传变异的95%。这份核心数据,将正式通过阿里云平台,向全球免费开放。”9月15日,中国农业科学院、阿里云计算有限公司、华智水稻生物技术有限公司、北京聚道科技有限公司在长沙共同启动“云之稻项目”,中国农科院农作物基因资

华大基因携手阿里云打造DNA商店

  今日,华大基因宣布其在阿里云计算平台部署的服务产品BGI Online国内beta版本正式上线。  随着生命科学领域数据爆炸式的增长,如何及时获取、快速分析、安全储存这些庞大的数据是研究者们急需解决的问题。华大基因推出的BGI Online集成了高性能计算,大规模存储及安全网络互联等基础设施,支

基因检测过去、未来与问题

  10月11日,美国国立卫生研究院美国国家人类基因组研究所所长Eric D. Green,美国加州首席科学官Edward M. Rubin以及美国华盛顿华盛顿华盛顿大学华盛顿大学医学与基因组科学荣誉教授Maynard V. Olson在Nature联合发表了一篇预测性文章,题为The future

华大智造 “超级生命计算机”DNBSEQ-T7 正式交付商用

019年9月9日,由深圳华大智造科技有限公司(以下简称“华大智造”)自主研发的超高通量基因测序仪——DNBSEQ-T7正式交付商用,首批测序仪已抵达华大基因科技服务有限公司和微基因(WeGene)等合作伙伴的实验室。来自交付前的用户测试数据表明,T7数据表现符合预期,各项指标均表现良

中国版精准医疗计划将启动

  国家卫计委11月30日消息,目前我国正在制定“精准医疗”战略规划,或将纳入到“十三五”重大科技专项中。  精准医疗主要由基因测序等顶尖技术构成,将改变现有的诊断、治疗模式,为医学发展带来一场变革。据透露,我国将研发一批国产新型防治药物和医疗器械,形成一批我国定制、国际认可的疾病诊疗指南

美吉生物引领生物信息挖掘进入交互时代

  “大数据、云计算、免费”这些在互联网行业司空见惯的字眼,如果我们把它们融入到基因测序行业会出现什么样的新鲜事物?有一家公司就把互联网的理念灌输到了基因测序行业里,它就是上海美吉生物医药科技有限公司(以下简称“美吉生物”)。  互联网思路玩转基因测序行业  近日,一则“生物信息挖掘进入交互时代”的

华大基因投资百亿在武汉建千亿产业园

  在4月28日的签约仪式上,华大基因方面宣布,投资100亿元重点用于五大项目上,力争打造1000亿元产值。投资分两类,一是耗资5亿建立创新平台,每年通过教学,向全国输送4000名基因人才。利用该平台,华大基因还将在武汉建立万万亿次超算中心,用于数据信息分析,发展云计算产业。另外,95亿元是要规划1

争雄基因云,华大、阿里云、药明康德、华为都来玩儿

  今日,药明康德及药明康德下属企业明码生物科技与华为在上海联合发布了精准医学云平台——明码云。  什么是明码云  据介绍,明码云旨在打造覆盖全国、标准统一、安全可靠的精准医学大数据云平台,推动国内基因组信息及精准医学大数据的集中和应用,促进政府相关部门、医疗行业、学术界以及业界在精准医学领域的交流

最聪明的生物公司在做什么?扒一扒你不知道的黑科技

  近日,美国著名的《麻省理工科技评论》评选出了全球最聪明(创造力)的50家公司。这50个名单不仅包含了亚马逊、谷歌、微软等互联网巨头,也包含了创立于2013年的Editas Medicine这一类新型公司。在这50家公司里,生物医疗相关的公司总共有15家。  在这15家公司中,有10家公司与基因相

NGS检测试剂生产应获得《医疗器械生产许可证》

  为加强第二代测序技术检测试剂的规范和指导,进一步保证和提高相关产品的质量,8月8日,中国食品药品检定研究院(中检院)组织制定了《第二代测序技术检测试剂质量评价通用技术指导原则》(下称《指导原则》)。  该文件是中检院发布的首个质量评价技术指导原则,旨在对产品设计、研发及验证的各关键环节进行规范,

中检院发布二代测序试剂质量评价通用原则

  一.前言  本指导原则主要针对第二代测序(next generation sequencing,NGS)技术检测试剂(以下简称“NGS检测试剂”)产品质量提出指导性要求,涉及基本原则、主要原材料、检测流程及性能评价等方面。  本指导原则是对企业和检验人员的指导性文件,但不包括注册审批所涉及的行政