基因测序的云计算平台
自二代测序的技术问世以来,就一直是研究和临床领域关注的重点。随着整个行业的技术发展,二代测序也带动了整个基因研究的产业链。在二代测序的产业链中,上游做检测,中游做分析,下游做应用。在测序价格持续下降的情况下,中游测序数据的生物信息学分析成为了提高效率最大的瓶颈。 传统的测序数据分析依赖于本地服务器的性能。而可以预见的是不断下降的测序价格将会带来更多海量测序数据的产生,而巨大数量的测序数据无疑会延长获得测序分析结果的时间。目前可能较好的解决方法是通过云计算的方式去做,云计算的优势在于能够通过分布式计算对大数据进行处理,从而极大提升运算效率以及降低成本。 目前国外的云计算平台Seven Bridge已经做的比较成熟,对二代测序数据也能够进行快速分析。缺点是作为典型的pipeline式分析,对用户的要求比较高,对于国内用户群体的使用会有一些障碍。而在国内的云计算平台中,GCBI将于2016年2月底......阅读全文
中科院基因组测序平台联盟成立
2月12日上午,在中国科学院条件保障与财务局的支持和推动下,中科院基因组测序平台联盟成立大会暨签约仪式在中科院北京基因组研究所召开。条财局副局长曹凝及中科院广州、武汉、上海、昆明及北京各区域中心专家代表和部分研究所代表共计20余人出席会议。 会上,北京基因组所副所长、党委
意大利VELP-Ermes云平台优势特点
为了提升您的实验室工作体验,随时随地查看仪器的工作状态和数据信息,VELP搭建了一个云平台,提供ermes服务,创造了一个设备、人和数据相互连接的生态系统,彼此之间信息畅通无阻,辅助挖掘您的科学潜力。1、优势特点——时刻连接… 通过平板电脑、手机或PC上的VELP Ermes可以对多台仪
植物养分速测仪管理云平台功能
1、自带仪器云管理平台包含C/S架构,可将所有便携式设备及在线设备数据进行汇总分析,数据备份不丢失,查看操作方式包括网页端及手机端(安卓系统)。 2、显示每种参数过程曲线趋势,峰值、谷值、平均值显示查看,放大、缩小功能。 3、数据可上传至管理云平台。平台内数据可下载,分析,打印。 4、平台
云计算资源产业联盟成立-中国云资源有望被整合
云计算资源产业联盟成立大会6日在北京举行。伴随着该联盟成立,全国云计算基础设施投资大、建设周期长和利用效率低下等问题有望得到解决。 6日上午,云计算资源产业联盟成立大会暨云计算资源平台上线启动仪式在北京举行。会议由贵阳市人民政府、云计算资源产业联盟主办,由贵阳云计算资源交易中心有
Nature-|-云计算助力发现新型病毒
病毒给人类的健康带来了巨大的威胁,比如1918年的西班牙流感、AIDS、埃博拉、SARS、新冠病毒等。据估计,能够造成人群传染病的病毒有3x105之多,然而可惜的是人们只认识其中的很少一部分。因此,在全球范围内对病毒进行监测是预测和预防未来病毒传播的最有效手段之一。借助于新技术,比如高通量测序,人类
日美公司联手开拓云计算市场
日本富士通公司正与美国微软公司合作,开展通过互联网向客户提供软件和信息系统服务的“云计算”业务,以增强竞争力,开拓世界云计算市场。 富士通公司日前发布报告说,该企业独自开拓世界云计算市场的力量有限,需要与软件开发能力强的微软开展合作。今年双方将利用设在东京附近馆林市的数据中
云健康开启Illumina-HiSeq-X-Ten全基因组测序时代
1月20日,沪上百余位知名媒体人及社会各界名流云集悦达889广场6楼云健康医疗科技集团总部(Cloud Health Medical Group,Ltd),共同见证航母级健康平台——云健康的上海首度公开亮相。当天云健康宣布启动 Illumina HiSeq X Ten 全基因组测序,同时旗下云健
云计算展|大数据展|2025深圳国际云计算技术及应用展览会
2025深圳国际大数据及云计算展览会2025 Shenzhen International Big Data and Cloud Computing Exhibition时间:2025年4月9-11日地点:深圳会展中心欢迎您的持续关注!前面三位数:136中间四位数:5198后面四位数:3978展会时
云计算展|大数据展|2025深圳国际云计算技术及应用展览会
2025深圳国际大数据及云计算展览会2025 Shenzhen International Big Data and Cloud Computing Exhibition时间:2025年4月9-11日地点:深圳会展中心欢迎您的持续关注!前面三位数:136中间四位数:5198后面四位数:3978展会时
基于云平台的水质监测系统问世
中国航天科工二院23所下属北京航天微电科技有限公司(以下简称微电公司)近日自主研发出基于云平台的水质监测系统,可快速、准确、长时间地获取局部水域的水质数据。 长期以来,我国水污染问题难以改善。城市水质污染的成因主要包括污染企业偷排、不良餐饮业丢弃废物、河流附近居民丢弃生活废品等。对城市内部河
猴外显子基因测序及分析平台开发成功
猴外显子测序及分析平台由全球最大的基因组学研究机构之一深圳华大基因开发成功。通过该平台,研究人员可以更加高效地了解各个猴基因组的细微差异,进行医药和疾病等方面的研究。 记者10月15日从华大基因获悉,猴外显子捕获芯片和新一代高通量测序技术为该平台的两大核心技术。这两大技术的结合,使研
云计算资源产业联盟成立-中国云资源有望被高效整合
云计算资源产业联盟成立大会6日在北京举行。伴随着该联盟成立,全国云计算基础设施投资大、建设周期长和利用效率低下等问题有望得到解决。 6日上午,云计算资源产业联盟成立大会暨云计算资源平台上线启动仪式在北京举行。会议由贵阳市人民政府、云计算资源产业联盟主办,由贵阳云计算资源交易中心有限公司、贵阳综
基因测序仪Out!DNA计算机除了诊断还能“配药”
随着基因测序技术的不断发展,它被广泛应用于诊断和治疗罕见病、简单遗传疾病和癌症等疾病。不过,以编码的DNA序列为运算对象建立的一种信息技术形式开发而出的DNA计算机,具有实时探测和监控基因突变等细胞内一切活动的特征信息,确定癌细胞等病变细胞以及自动激发微小剂量的治疗效果 。 近日,位于荷兰南部
llumina高通量测序平台的应用
Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发,利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结(reversible terminator)”,实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收
llumina高通量测序平台的应用
Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发,利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结(reversible terminator)”,实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收
中科院计算所:云计算“脑补”-智慧城市
智慧城市是一个体系的变革,它需要产业辐射以及整体经济的转型。中科院计算所云计算中心正致力将城市智慧带给政府、市民以及企业。 “智慧城市的终极目标对政府来讲是个社会和谐的政府,对市民来讲是个人民幸福的环境,对企业来讲是能促进经济发展的一个城市。”中科院计算所云计算中心主任季统凯告诉记者,智慧城
推动云计算大数据落地生根
近日,以“技术融合、应用创新”为主题的第八届中国云计算大会在北京国家会议中心举行。会议由工信部、中国科协、北京市政府指导,中国电子学会主办。 工信部副部长、中科院院士怀进鹏,南开大学校长龚克,中科院院士、上海交通大学副校长梅宏,中国工程院院士李德毅、李伯虎、倪光南、俞梦孙、王恩东
大模型加速改变云计算行业规则
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498365.shtm
“云计算联合实验室”在京建立
曙光公司与北京市计算中心对外宣布,共同建设“云计算联合实验室”。据了解,在云计算联合实验室的基础设施构建上,曙光投资了500多万元进行基础构建,同时该云计算实验室集合了曙光公司在云计算平台构建运营经验的优势以及北京市计算中心计算平台成熟化应用经验上的优势,以辐射北京区域经济发展、提升中
释放基因组学云计算潜力--Illumina收购再下一城!
分析测试百科网讯 近日Illumina针对收购BlueBee发布公告。BlueBee是一家为研究机构和临床客户提供基因组分析解决方案的云软件公司,其总部位于荷兰,公司开发了符合安全法规的云平台,简化了对数据和工具的访问,使用户能够轻松地访问基因组数据。这种云计算能力有望降低存储、共享和管理来自I
基因测序
基因测序是一种新型基因检测技术,能够从血液或唾液中分析测定基因全序列,预测罹患多种疾病的可能性,个体的行为特征及行为合理。基因测序技术能锁定个人病变基因,提前预防和治疗。基因测序相关产品和技术已由实验室研究演变到临床使用,可以说基因测序技术,是下一个改变世界的技术
基因测序
第1代测序技术——荧光标记的Sanger法 在第一台全自动测序仪出现之前,使用最为广泛的测序方法就是 Sanger 在 20 世纪 70 年代中期发明的末端终止法测序技术。 Sanger 也因此获得 1980年的诺贝尔化学奖。 他的发明第一次为科研人员开启了深入研究生命遗传密码的大门。G1.1
万元全基因组测序在望-全新分析平台登场
今年早期,ABI公司应用SOLiD 3系统领先的寡核苷酸连接和检测技术对人类基因组进行了测序,费用低于6万美元。这台新仪器的技术改进使更高的样品和数据通量成为可能,从而有望进一步降低基因组测序的费用。例如,更廉价的基因组数据有望加速疾病关联和生物标志物的发现,从而改善诊断和疾病处理,支持与个人最佳治
九大测序平台对比(五)
7.The PacBio RS system企业: Pacific Biosciences推出时间: 2010年2月开始早期试用主流型号: PacBio RS样品要求: 1kb以下500ng,纯化的基因组 DNA, BACs, cDNA 文库 或PCR 产物测序原理: 边合成边测序,single m
九大测序平台对比(三)
4.HiSeq2000企业: Illumina推出时间: 2010/1/1主流型号: Illumina HiSeq2000样品要求: 6ug/sample,无RNA、蛋白污染,无降解,OD260/OD280=1.8-2.0测序原理: 边合成边测序这种测序技术通过将基因组DNA的随机片断附着到光学透明
九大测序平台对比(四)
5.Helicos企业: Helicos Biosciences推出时间: 2008年主流型号: HeliScope™ Single Molecule Sequencer(2008年推出)样品要求: 1-3 μg,起始DNA体积不超过100 μL.测序原理: 边合成边测序,可逆阻断测序待测DNA被随
九大测序平台对比(六)
8.PGM企业: Ion Torrent推出时间: 2010年主流型号: Ion Personal Genome Machine™(2010年)样品要求: 5 μg DNA,起始DNA体积不超过130μL测序原理: 半导体芯片测序该测序仪使用了一种高密度半导体小孔芯片。该芯片置于一个离子敏感层和离子
九大测序平台对比(一)
1.sanger企业:Life Technology推出时间:1977年发明,1986年第一台商业化测序仪主流型号:3730XL样品要求:PCR产物:浓度≥50ng/ul 体积≥10ul;质粒:含量≥5ug;菌液:体积≥1ml。测序原理:双脱氧链终止法:Sanger法测序的原理就是,每个反应含有所有