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Science:破纪录的超大病毒

2003年法国科学家发现了当时已知世界上最大的病毒,并将其命名为Mimivirus,时隔十年,来自法国国家科研中心(CNRS)的研究人员报道称,他们发现了两种比Mimivirus更大的病毒,这些病毒被命名为Pandoraviruses(潘多拉病毒),这一研究成果公布在Science杂志上。 普通病毒的大小在10到100纳米之间,较大的天花病毒也只有300纳米。2003年发现的Mimivirus病毒则有400纳米,是当时已知世界上最大的病毒。目前针对Mimivirus病毒,已经完成基因组测序工作,发现这种病毒的DNA包含了大约1260个基因,并且有50个基因编码一些以前在病毒中没有发现的功能,例如DNA修复和将mRNA翻译成蛋白质的能力。当时研究人员推测Mimivirus可能曾经有靠自己进行自我复制的能力,但是后来则丢失了这个能力。 而最新发现的这两种巨型病毒:智利发现的Pandoravirus salinus,以......阅读全文

逆转录病毒5亿年前便已出现

  逆转录病毒可能在5亿年前便已进化形成,从而使得这种在医学和经济上都十分重要的病毒比科学家之前的预想“老”了5倍。  这一发现表明,逆转录病毒与它们的脊椎动物宿主一道从海洋来到了干燥的陆地。通过用新的数学方法计算一种古老的逆转录病毒株(被称为泡沫病毒)的年龄——这种病毒能够感染从狐猴到鱼的各类物种

复旦大学从基因组学角度揭示SARS-CoV-2的起源和出现

  新型人类冠状病毒SARS-CoV-2(之前称为2019-nCoV)的持续大流行引起了全球的极大关注。我们和中国的其他人参与了对这种病毒的初始基因组测序。在本文中,我们描述了针对SARS-CoV-2的出现,这些基因组数据揭示了什么,并讨论了我们对其起源理解上所存在的差距。  一种新的人类冠状病毒 

中国学者连发PNAS等两篇文章 解析病毒基因

  来自中国疾病预防控制中心,澳大利亚悉尼大学等处的研究人员发表了题为“A tick-borne segmented RNA virus contains genome segments derived from unsegmented viral ancestors ”的文章,发现了第一个

从历史探究病毒的免疫系统

  CRISPR/Cas的工作原理不是很复杂,当病毒感染细菌之后,细菌会把病毒的基因组序列的片段插入自己的基因组里,这样病毒的“模样”就被记录下来了,细菌存放入侵病毒序列的基因区域呈现出“规律间隔成簇短回文重复序列”(Clustered Regularly Interspaced Short Pal

70种节肢动物中发现112种全新病毒 负链RNA病毒危害最大

  中国疾控中心张永振研究员带领的人兽共患病研究团队,在70种节肢动物中发现了112种从未被报道过的全新病毒,并命名了一个全新病毒科。该研究成果日前发表在生命科学领域的顶级期刊eLife杂志上。  张永振介绍,该研究在我国的湖北、浙江、新疆等地采集了昆虫纲、蛛形纲、唇足纲、软甲亚纲的70种节肢动物,

中疾控等重磅研究揭示新冠病毒演变

  当地时间3月2日,中国医学科学院北京协和医院、中国疾控中心、加州大学洛杉矶分校、匹兹堡大学、湖南大学五家合作单位的研究人员共同在生物科学预印本网站bioRxiv在线发表了一项针对新冠病毒演化过程中的突变、重组和插入的重磅研究(“Mutations, Recombination and Inser

我国科学家发现214种全新脊椎动物相关病毒

  近日,我国科学家张永振带领的研究团队新发现了214种RNA病毒。这对于提高我国乃至世界对新发突发传染病的防控能力,甚至为进一步研究生命的起源进化具有重大意义。  神奇“探测器”搜寻病毒  在我们生活的地球上,病毒的历史非常古老,甚至参与了生命起源和地球重大进化转变的进程。在很多科学家的眼中,病毒

中国学者批露武汉新型冠状病毒的传染人的分子作用通路

  2020年1月21日,中国科学院上海巴斯德研究所郝沛研究员、军事医学研究院国家应急防控药物工程技术研究中心钟武研究员和中科院分子植物卓越中心合成生物学重点实验室李轩研究员合作,在SCIENCE CHINA Life Sciences 在线发表了题为“Evolution of the novel

重磅!武汉新型冠状病毒进化来源和传染人分子作用通路

  2020年1月21日,中国科学院上海巴斯德研究所郝沛研究员、军事医学研究院国家应急防控药物工程技术研究中心钟武研究员和中科院分子植物卓越中心合成生物学重点实验室李轩研究员合作,在SCIENCE CHINA Life Sciences(《中国科学:生命科学》英文版),在线发表了题为“Evoluti

吴仲义蒲慕明再次呼吁及时公开共享数据

   截至2020年2月10日,共有55条2019-nCoV的病毒基因组可公开获取。其中,在1月22日以前获取的31份测序数据几乎全部来自于中国(仅有1例来自于美国)。然而1月22日以后,余下的24份数据一律源于境外,包括日本、韩国、新加坡、澳大利亚、美国、法国、英国等。  国内学术界对于所谓“高影

冠状疫情发生源自试验室病毒泄露?专家回应来了!

  此前,网上不断有各种版本的流言,或多或少都把此次疫情的发生与国内科研机构的实验室病毒标本泄露关联在一起。  对此,2月2日下午,中国科学院武汉病毒所研究员石正丽在朋友圈说:“2019新型冠状病毒是大自然给人类不文明生活习惯的惩罚,我石正丽用我的生命担保,和实验室没有关系。”  《中国科学报》记者

我国学者揭示新型冠状病毒2019-nCoV的基因组组成和差异

  世界卫生组织(WHO)将一种新型冠状病毒命名为“2019年新型冠状病毒(2019-nCoV)”。它是最近于2019年12月初在中国湖北省武汉市开始的肺炎疫情的罪魁祸首。这次疫情与一家大型的海鲜和动物市场有关,目前正在开展调查以确定这种病毒感染的来源。迄今为止,中国已经确诊了成千上万例人类感染病例

研究揭示武汉新冠病毒进化来源和传染人分子作用通路

  2019年12月以来,湖北省武汉市集中发生了不明原因肺炎疫情。流行病调查发现这些陆续出现的肺炎病例都与武汉市“华南海鲜市场”有关联。武汉市组织多学科专家会诊调查,利用实验检测等手段认定武汉地区肺炎疫情为病毒性肺炎。2020年1月8日,初步确认了一种新型冠状病毒为此次疫情的病原。  武汉地区的病毒

PNAS重要成果:可移动遗传元件

  在一位使用了隐形眼镜液的法国女性的红肿眼睛中,科学家们发现了几个新型寄生虫,这些寄生虫能像俄罗斯套娃一样相互嵌套。   来自法国国家科学研究中心等处的Bernard La Scola 和Christelle Desnues发现这一护理液被一种新型巨型病毒污染了,他们将这种病毒命名为Lent

研究揭示揭示冠状病毒SARS-CoV-2如何传播和进化

  新型冠状病毒SARS-CoV-2(之前称为2019-nCoV)导致2019年冠状病毒病(COVID-19),如今正在全球肆虐。2020年2月28日,Christian Drosten在网上发布了SARS-CoV-2的基因序列后,立即在推特上发出警告。随着这种病毒在世界范围内的传播,350多个SA

首次揭示新型冠状病毒进化来源

  武汉新型冠状病毒感染的肺炎病例仍在蔓延。1月21日,中国科学家发表的一篇最新论文,首次揭示新型冠状病毒进化来源,以及其传播依赖的可能蛋白,为人们认识这种新型病毒提供了重要线索和科学依据。  1月21日,中国科学院上海巴斯德研究所研究员郝沛、军事医学研究院国家应急防控药物工程技术研究中心研究员钟武

2019-ncov的基因组为?

  冠状病毒主要引起呼吸道和胃肠道感染,并且在遗传学上被分为四个主要的病毒属:甲型冠状病毒(Alphacoronavirus)、乙型冠状病毒(Betacoronavirus)、丙型冠状病毒(Gammacoronavirus)和丁型冠状病毒(Deltacoronavirus)。前两个属主要感染哺乳动物

病毒的起源之谜

  这特么到底是啥?研究不同生物之间关联的科学家每天都在问这个问题。其答案并不简单,但很重要。生物联系不仅用来制作生命的目录,还有助于理解生命演化为不同形式的进化历程。  病毒是一个极佳的例子。病毒没有细胞结构,因此无法被归类为三种生命域中的任何一种——细菌,古生菌(另一种形式的微生物)及真核生物(

一文读懂如何破解新冠病毒基因组全长序列

随着疫情进入攻坚阶段,基于实时荧光RT-PCR法的核酸检测技术在新冠病毒快速鉴定及确诊中发挥了重要作用。然而,若要对新冠病毒来源、变异进化及致病机理等进行研究,需获取完整的病毒基因组信息,这离不开高通量测序和病毒序列组装。 为全面深入地揭示新冠病毒的相关特性,华大智造可为新型冠状病毒高通量

一文读懂如何破解新冠病毒基因组全长序列

随着疫情进入攻坚阶段,基于实时荧光RT-PCR法的核酸检测技术在新冠病毒快速鉴定及确诊中发挥了重要作用。然而,若要对新冠病毒来源、变异进化及致病机理等进行研究,需获取完整的病毒基因组信息,这离不开高通量测序和病毒序列组装。 为全面深入地揭示新冠病毒的相关特性,华大智造可为新型冠状病毒高通量

“蝙蝠女侠”团队找出SARS病毒源头

  石正丽研究组正在进行样本处理。中国科学院武汉病毒研究所供图  SARS样冠状病毒的自然宿主菊头蝠。广东省昆虫研究所张礼标研究员供图  电子显微镜下的SARS冠状病毒粒子。中国科学院武汉病毒研究所杨兴娄博士供图  石正丽研究组在野外作业。中国科学院武汉病毒研究所供图  15株蝙蝠SARS样冠状病毒

狙击艾滋病毒――“引蛇出洞”还是“关门打狗”?

  曾庆平   有很多非专业或跨专业人士对于人类为何数十年攻克不了艾滋病难题感到迷惑不解,那是因为他们不太了解艾滋病毒致病的“特洛伊木马”机制。   艾滋病毒之所以能“摧毁”人类的免疫系统,是因为它们专门感染并杀死免疫细胞。不过,只要它们在免疫细胞内复制并产生新的病毒,人体都能立即识别它们并设法

罗氏GSJunior测序帮助确认新型冠状病毒出现

        今年世界卫生组织确认了一个由新型冠状病毒引起的急性呼吸系统感染事件。第一个病人在中东地区发病后回到英国后被确诊,第二起病人在沙特阿拉伯确诊。世界卫生组织因此对全球发出警报,要求监控是否还有其他由这一新型冠状病毒引起

探索庞大未知的“病毒圈” 脊椎动物RNA病毒研究获重要突破

  由中国疾病预防控制中心传染病所研究员、复旦大学附属上海市公共卫生临床中心兼职教授张永振带领的研究团队,在脊椎动物RNA病毒的发现、遗传与进化领域取得重要突破,这项成果4月5日在《自然》杂志上以研究论文形式发表。  目前,人们对脊椎动物RNA病毒多样性及其进化史的认识,很大程度上还局限在哺乳类和鸟

张永振组发Nature:2019-nCoV与中国正爆发的呼吸道疾病有关

  严重急性呼吸综合征(SARS)和寨卡(Zika)等新兴传染病对公共卫生构成了重大威胁。尽管进行了广泛的研究,但是如何、何时和何地出现新疾病仍然具有相当大的不确定性。最近在中国湖北省武汉市报道了一种严重的呼吸系统疾病。自第一位患者于2019年12月12日住院以来,截至2020年1月25日,已报道了

我国科学家获得埃博拉病毒研究最新成果

  5月13日,国际学术期刊《自然》在线发表我国科学家关于埃博拉病毒最新研究成果:Genetic diversity and evolutionary dynamics of Ebola virus in Sierra Leone,并同期配发评论文章Latest Ebola data rule ou

深度分析人体病毒组

  自从微生物学诞生以来,研究人员着重关注让我们、我们驯养的家畜和种植的植物患病的病原体。鉴于症状的产生是了解特定病毒是否在几年前就已存在的唯一方法,因此大多数得到很好研究的病毒是那些导致疾病的病毒。但是很多病毒长期地感染人类,不会导致疾病,但是可能会导致年龄非常小的、年龄非常大的或者存在免疫抑制的

Cell头条:奇妙的基因组“手风琴”

  单个基因的复制就能对抗宿主抗病毒防御,这听起来好像不太真实,但是痘病毒(poxviruses)在病毒演化过程中,通过一个基因的快速多拷贝扩增,就能适应并对抗宿主的抗病毒防御,这被称为“基因组手风琴”(Genomic Accordions),利用这个机制,痘病毒实现了突变率虽然低,但能快速进化

冠状病毒是怎样敲开人体大门的?

   新冠肺炎病毒因其强大的感染和传播能力,在全球掀起了一场紧急防控大战。在这一过程中,一系列疑问在医生、科学家,甚至普通人的心中浮现:是什么决定了冠状病毒是否、何时、如何传染给人类,以及达到怎样的传染程度?为什么不同冠状病毒的致病性会有如此大的区别:有的只是让人流鼻涕,而有的则会引发重症肺炎?过去

和平共生、感染致病、化为己用?病毒与人类之间的事

  科学家们将寄居于人类体内或者表面的病毒统称为“人类病毒组”(human virome)。它们不仅仅会入侵人体细胞,还会对其他微生物造成影响,,例如细菌。得益于基因组学的发展,我们已经发现了很多之前从未发现的病毒种类,它们存在于皮肤、肠道、肺部、血液……  值得注意的是,很多病毒并不会立即引发病变