英国《自然》杂志日前在线发表的一项演化学研究报告,近乎完整地构建出了一种口腔细菌的基因组,这个有48000年历史的微生物的基因组,是迄今为止历史最悠久的微生物基因组草图,研究同时揭示了尼安德特人的饮食结构。 尼安德特人的DNA序列和现代人类的DNA序列非常相似。他们是现代欧洲人祖先的近亲,从12万年前开始“统治”着整个欧洲、亚洲西部以及非洲北部,但在24000年前,这些古人类却消失了。 澳大利亚阿德莱德大学研究人员劳拉·维利驰及其同事,此次对5个来自欧洲各地的尼安德特人样本的牙结石(一种硬化斑块)进行了DNA测序,几乎完整地“再现”了这些尼安德特人的口腔微生物组,得以评估他们的健康和疾病情况。结果表明,在西班牙发现的尼安德特人样本患有牙脓肿和胃炎,并且使用了天然止痛药白杨和能产生抗生素的青霉菌进行自我治疗。 研究团队还对尼安德特人饮食和健康情况进行了遗传重建。他们发现,来自比利时Spy村的尼安德特人吃过犀牛和野羊,而在......阅读全文
据CNN报道,近期的一项研究表明微生物的基因会整合到人类基因中,所以在某种意义上可以这样说:“你体内的微生物可能也是你哦”。 进化图谱通常显示的是人类与猿类拥有同一个祖先,但是现在情况不同啦!科学家指出人类进化图谱上缺失了本应占有一席之地的一个进化环节—我们的细菌、真菌、病毒。 基因水平转移
抗生素滥用或过度使用会引发一系列问题。近日,中国科学院微生物所朱宝利研究员带领的研究团队对中国、丹麦和西班牙人的肠道微生物耐药基因进行了分析,结果发现,中国人肠道微生物的耐药基因类型较多,而且这三个国家的人群,肠道微生物的四环素耐药基因型都很高。科研人员据此推测,这种情况的产生很可能与兽用抗生素
16SrRNA基因测序和宏基因组测序是现在微生物检验中的两大新型武器,它们在微生物研究中共同发挥着极大的作用,都是研究微生物的重要方法。但是二者又有什么不同呢?接下来将做一个简单说明。 定义 16SrRNA基因测序:就是指从微生物样本中提取16SrRNA的基因片段,通过克隆、测序或酶
肠道菌群与人体健康密切相关,二者之间的关系是目前研究的热点。随着研究者的不断深入,我们发现,对人体微生物的了解还远远不够,它们能帮助我们做什么,以及我们如何改变它们? 4月29日,美国《科学》杂志以“Microbiota at work”为主题发了一期专刊,从不同的方面介绍了人体微生物与健康的
饲用抗生素的过度使用带来细菌耐药性和超级细菌问题,严重威胁公众健康。伴随着越来越多的国家和地区加入“限抗”和“禁抗”的队伍,寻找和开发“安全、有效、可控、成本低”的天然替抗产品是目前全球研究的热点。 近日,中国农业科学院(深圳)农业基因组研究所研究员樊伟团队联合湖南农业大学教授曾建国团队、中国
人类消化道中居住着大量的微生物,它们被统称为肠道微生物组。肠道微生物组在人类代谢食物、抵御感染和应答药物等过程中起到了重要的作用。许多人类疾病都与微生物组失衡有关,但揭示其中的因果关系并不容易。 2014年七月,华南理工大学、华大基因、哥本哈根大学等单位在Nature biotechnolog
5月29日下午,上海交大生命学院召开推进学院文化建设动员会。学院院长邓子新院士在讲话中,就如何开展实验室文化建设和学院教师分享了他多年的心得。邓院士认为,学校开展校园精神文化建设,生命学院应趁势而上,积极推进学院精神文化建设,无论把这个活动纳入全国的大框架,还是小到一个研究组,一个办公室,都是一个及
[提要] 自然界(非临床环境)中本来就存在大量的“天然耐药基因”,而人类对抗生素的滥用如同“筛选压力”,选择并进化这些整合有“耐药基因”的病菌,使得后者最终成为人类的噩梦――临床上的“耐药菌”。 自然界(非临床环境)中本来就存在大量的“天然耐药基因”,而人类对抗生素的滥用如同“筛选压力
金小蜂是一类寄生性昆虫,靶向许多人类疾病传播的载体(如家蝇等),在害虫生物防治上具有重要地位。作为一个新的模式昆虫,近期公布的丽蝇蛹集金小蜂(Nasonia vitripennis)全基因组序列为研究寄生性昆虫天然免疫的分子和进化机制奠定了基础。 运用进化基因组学的
人体肠道中栖息着种类繁多的微生物,其数量超过人体自身细胞的10倍以上。这些微生物的基因组中(microbiome)蕴含大量的遗传信息,被称为是“人体的第二个基因组(the second genome of human body)”。人体肠道微生物对人体肠道内营养物质的代谢、人体自身的发育
许多人的体检报告上都提示有脂肪肝。这种肝脏疾病通常与肥胖、酒精和糖尿病相关。不过,根据本周发表在《Nature Medicine》上的一项研究,肠道微生物似乎也促进了疾病发展,表明有望通过粪便微生物移植来治疗。 肝脂肪变性(hepatic steatosis)是指肝细胞的胞浆内出现脂肪滴。通俗
来自中科院动物所研究员的研究人员以皮肤真菌犬小孢子菌为对象,利用生物信息学和实验生物学方法鉴定了一个新型的真菌来源的防御素(命名为孢子霉素),首次表明皮肤真菌为一种新的抗感染药物资源,为治疗耐药性细菌引起的感染带来了新的希望,这一研究成果公布在《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志上。 文
9月15日 中科院城市环境研究所研究员朱永官领衔的国际团队系统阐述了微生物通过人与动物、污水及其他物质的流通在全球范围的迁徙及其环境与生态效应。今天,相关研究论文发表于《科学》杂志。 数十亿年来,微生物及其所携带的基因主要在空气和水的自然驱动下发生迁移。此时,微生物对地球环境的影响模式类似
2016年,美国克利夫兰医学中心预言《2017十大医疗创新科技》,其中利用微生物组预防、诊断和治疗疾病领域高居榜首,这表明全球已掀起微生物研究的新热潮且取得瞩目成绩,同时在市场潜力与应用前景方面,微生物组学将焕发无限生机。 我们知道,所有机体包括人在内都与微生物是共生体,人体身上有超过1
走极端的小怪物 世界上的生物有千千万万,我们熟悉的那些生物往往都是肉眼所见的动植物,比如一些家畜、农作物、观赏树等。其实我们人类属于体型很大的生物了,所以我们站在自己大动物的角度上观察生物界,难免有失偏颇。 201808231534989602349.jpg 比如,很少有人知道
2007年12月美国《科学》杂志预测:人体共生微生物的研究将可能是国际科学研究在2008年取得突破的7个重要领域之一。就如何研究共生微生物与人体健康的关系等问题,4月刚刚出席了巴黎国际人类微生物组研究联盟筹委会会议的上海交通大学生命科学技术学院教授赵立平接受了《科学时报》的采访。 深圳华大基因
一、抗生素“退潮”,抗生素“精准应用”成难题 1. 高昂的研发成本及不匹配的市场前景,曾拯救全人类的抗生素正在被众多药企“抛弃”。 2018年6月,美国FDA批准Achaogen新一代氨基糖苷类抗生素Plazomicin用于治疗成人复杂性尿路感染,包括由肠杆菌科细菌、假单胞菌属等引起的肾盂肾
2015年9月28日,中国深圳—深圳华大基因研究院、哥本哈根大学等研究机构共同构建了全球首个小鼠肠道微生物参考基因集,为以小鼠为基础的人类疾病模型研究提供有益参考。最新研究成果今日在线发表于《自然生物技术》。 人类的肠道中居住着种类繁多,数量惊人的微生物,而在这些微生物中,细菌的比例高达90%
在人体肠道中生活着数以万亿的共生菌群,它们的种类繁多,可达上千种,数量也很惊人,是人体细胞总量的10倍以上,迄今为止,仍有80%以上的微生物不为人知。这些肠道微生物和人体存在着互利共生的关系,对于维持人类的健康发挥着重要的作用。它们在肠道中保持着一种动态的平衡,能够合成维生素、帮助人体从食物中吸收
物种身上的微生物与其健康之间有没有联系?这是美国科罗拉多大学微生物学家罗布·耐特想找破解的谜团。耐特在世界各地从野生动物身上提取细菌样本,然后带到实验室进行分析。耐特是微生物医学领域的权威,被誉为“基因序列机器”。他首先把各种微生物的基因序列破译出来,然后通过计算工作与物种身上的微生物
2月17日,由中国科学院院士黄路生领衔的江西农业大学科研团队在国际顶级学术期刊《Nature Communications 》发表重大科研成果,提供了目前为止国际上规模最为宏大的猪肠道微生物基因集和基于宏基因组组装的基因组。该成果的面世,为猪肠道微生物组相关研究提供了重要的扩展资源。 家猪是
中国科学院城市环境研究所研究员朱永官领衔的国际团队系统阐述了微生物通过人与动物、污水及其他物质的流通在全球范围的迁徙及其环境与生态效应。相关研究论文发表在《科学》杂志上。 数十亿年来,微生物及其所携带的基因在空气和水的自然驱动下发生迁移。此时,自然驱动力形成的对微生物的生物地理作用模式类似于它
随着城市化和高强度集约化农业的发展,人类正以前所未有的速度和规模改变着微生物的全球迁徙和分布。9月15日,美国《科学》杂志刊登了中国科学院城市环境研究所及其国际团队的一篇论文,系统阐述了微生物通过人与动物、污水及其他物质的流通在全球范围的迁徙及其环境与生态效应。 文章指出,污水的处理促进了微生
一、基于分子杂交的分子诊断技术 上世纪60年代至80年代是分子杂交技术发展最为迅猛的20年,由于当时尚无法对样本中靶基因进行人为扩增,人们只能通过已知基因序列的探针对靶序列进行捕获检测。其中液相和固相杂交基础理论、探针固定包被技术与cDNA探针人工合成的出现,为基于分子杂交的体外诊断方法进行了
人体是由自身细胞及共生的大量微生物细胞所共同组成的复杂共生生命体。人体肠道微生物数量庞大、种类繁多,被称为“第二基因组”。在人体微生物组学中,96-99%的微生物聚集在胃肠道,肠道微生物与机体健康有着极为密切的联系。 本文,我们整理了肠道微生物行业的产业现状,包括肠道微生物的应用场景、产业化
经过近3年的酝酿和筹备,以解析人类共生微生物与健康关系为目标的国际人类微生物组联盟(IHMC)近日在德国海德堡宣布成立。来自美国国立卫生研究院(NIH)、欧盟委员会,以及中国、日本等9个国家的科学家出席成立大会并交流了各自的计划和进展。 基因与环境相互作用决定人体健康,目前大量的研究都集中在分析人
对于中国引用量最高的100篇文章,一直不是很清楚。iNature花了数月时间,仔细的整理了中国学者发表的引用量最高的100篇文章。我们发现: 【1】对于这100篇文章而言,平均引用量是2142次,其中最高引用量是赫捷发表的CA文章,引用量达到了6091次,最少的为1496次; 【2】100篇
肠道微生物是由一群构成不同的微生物群体组成,其中包括细菌,古细菌和真核生物,它们亲密无间的生活在一起。在过去二十年间,科学家们对于这些小生物的兴趣日趋浓厚,很大一部分原因是由于测序技术相关的分析飞速发展,今天大量的证据表明肠道微生物在宿主生理病理,以及肠道免疫平衡过程中扮演了重要的角色。 近期
最近在Nature1及其他刊物中发表了多篇与人类微生物菌落项目(Human Microbiome Project)有关的文献,该项目已历时5年旨在发现人体不同部位的微生物菌落特征。而最近的这些文献的发表只是该项目大量数据的初步分析结果,随之而来的将是从更多分析方法角度带来的新的思路
科技部关于发布科技基础资源调查专项2016年度项目指南的通知国科发基〔2016〕228号国务院各有关部门,军委科技委: 根据中央财政科技计划(专项、基金等)管理改革的总体要求,科技部、财政部按照需求导向和分类整合的原则,在原“科技基础性工作专项”基础上,重新整合设立“科技基础资源调查”专项。现将