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中科院Cell发表CRISPRCas研究新成果

来自中科院生物物理研究所的研究人员,在新研究中揭示出了CRISPR-Cas系统依赖于PAM获取间隔序列(spacer)的结构基础及机制。这项重要的研究工作在线发布于10月15日的《细胞》(Cell)杂志上。 论文的通讯作者是中科院生物物理研究所的王艳丽(Yanli Wang)研究员,其主要研究方向为RNA干扰相关蛋白的结构与功能研究。王艳丽研究组的王久宇(Jiuyu Wang)和李佳智(Jiazhi Li)为本文的共同第一作者。 CRISPR和Cas蛋白一起形成了一种微生物适应性免疫系统,保护细菌对抗入侵噬菌体和质粒。CRISPR是由一些长度为30-60个核苷酸的 “重复序列”( repeat)组件构成,这些重复序列被长度变化为30-60个核苷酸的“间隔序列”(spacer)组件所间隔,间隔序列获取自外源DNA。定位在第一 个重复序列上游的富含A-T的前导序列(leader sequence)对于获取间隔序列至关重要,并......阅读全文

中科院Cell发表CRISPR-Cas研究新成果

  来自中科院生物物理研究所的研究人员,在新研究中揭示出了CRISPR-Cas系统依赖于PAM获取间隔序列(spacer)的结构基础及机制。这项重要的研究工作在线发布于10月15日的《细胞》(Cell)杂志上。  论文的通讯作者是中科院生物物理研究所的王艳丽(Yanli Wang)研究员,其主要研究

利用CRISPR–Cas系统将数字视频存储到一群细菌的基因组中

  科学家们正在努力利用DNA(即生物学生命蓝图)作为合成原材料在活细胞外面存储大量的数字信息。但是如果他们能够诱导活细胞像大的细菌群体那样使用它们自己的基因组作为能够被用来记录信息并且随后在任何时间能够获取这种信息的生物学硬盘,将会怎么样?这样的一种方法可能不仅为数据存储提供全新的可能性,而且也可

Nature: CRISPR/Cas系统,如何区分敌友

  不忙于攻击我们时,细菌之间会彼此竞争。但当病毒入侵细菌时,它们不总是给受感染的微生物带来灾难:有时候病毒实际上携带着细菌可以利用的有益基因,可以扩大其饮食或是让它们能够更好地攻击自身的宿主。  科学家们一直认为,细菌的免疫系统会自动地破坏它识别为入侵病毒基因的东西。现在,来自洛克菲勒大学的研究人

生物芯片的技术核心

所有的生物芯片技术都包含四个基本要点:芯片的制作、杂交或反应、测定或扫描、数据处理。生物芯片的技术核心是芯片的制备及反应信号的检测。 1、芯片制备技术 目前制备芯片的方法基本上可分为两大类:一类是原位合成(in situ Synthesis);一类是合成后交联(post-synthesis at

重磅!科学家深入解析CRISPR起源的5个谜团

  Francisco Mojica并不是第一个观察到CRISPR的研究者,但他却是第一个被CRISPR“深深打动”的人,他还记得,1992年的某一天当他首次看到微生物的免疫系统时,他就认为这或许能够带来一场生物技术的变革,随后Francisco Mojica对来自地中海富盐菌(Haloferax

强强联合:在CRISPR/Cas9相关研究中应用高通量测序技术

  摘要:   CRISPR/Cas9基因组编辑技术和新一代测序技术(也称高通量测序技术),是当今对生命科学研究有重大影响的两项技术。二者并非毫不相干。有效地将二者联用,有时可以大大加速科研进程。两者之间有什么样的联系呢?在哪些研究领域或方向上可以联用呢?上海伯豪生物根据在这两个领域的技术服务经验

在CRISPR/Cas9相关研究中应用高通量测序技术(一)

摘要:CRISPR/Cas9基因组编辑技术和新一代测序技术(也称高通量测序技术),是当今对生命科学研究有重大影响的两项技术。二者并非毫不相干。有效地将二者联用,有时可以大大加速科研进程。两者之间有什么样的联系呢?在哪些研究领域或方向上可以联用呢?上海伯豪生物根据在这两个领域的技术服务经验,对相关内容

重磅!科学家质疑巨病毒存在类似CRISPR/Cas的系统

  在很多细菌中发现的CRISPR/Cas免疫防御系统,因其能够简单地而又优雅地编辑宿主基因组,而成为时下最火热的生物技术,在近期产生一大批发现。在今年3月,来自法国艾克斯-马赛大学的Didier Raoult和同事们发表一篇论文,指出一种被称作mimivirus的巨病毒(giant virus)拥

Nature重大成果:揭示125000个病毒基因组

  在地球的内部、地球之上以及地球的周围,微生物的数量达到了10^30,估计超过了银河系中的星星。微生物已知在调控碳固定,维持全球氮、硫、磷和其他营养素的循环中起至关重要的作用,但目前大多数的微生物仍然是无法培养和未知的。美国能源部正以这一“微生物暗物质”作为目标,更好地了解地球微生物的多样性,收集

CRISPR的前世今生:酸奶中的CRISPR

  两年前,一个缩写为CRISPR(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,规律间隔成簇短回文重复序列)的基因编辑工具横空出世,席卷了许多实验室。而在这一系统被开发的数亿年前,细菌和古细菌就利用其非常精确的对几乎每个基因组中

CRISPR的前世今生:酸奶中的CRISPR

  两年前,一个缩写为CRISPR(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,规律间隔成簇短回文重复序列)的基因编辑工具横空出世,席卷了许多实验室。而在这一系统被开发的数亿年前,细菌和古细菌就利用其非常精确的对几乎每个基因组中

Nature重大成果:揭示125000个病毒基因组

  在地球的内部、地球之上以及地球的周围,微生物的数量达到了10^30,估计超过了银河系中的星星。微生物已知在调控碳固定,维持全球氮、硫、磷和其他营养素的循环中起至关重要的作用,但目前大多数的微生物仍然是无法培养和未知的。美国能源部正以这一“微生物暗物质”作为目标,更好地了解地球微生物的多样性,收集

张锋连发两篇Nature子刊 细述可能超越CRISPR-Cas9的新技术

  CRISPR-Cas9在全球各地的实验室中大放光彩,并且已经被应用到了临床上且证明了其威力。但CRISPR-Cas9有其局限性:上个月末Nature Methods上的一篇“Unexpected mutations after CRISPR–Cas9 editing in vivo”就指出了在全

抗铜绿假单胞菌I-E型CRISPR-Cas的噬菌体蛋白质结构

  本研究首次对铜绿假单胞菌抗I-E型CRISPR/Cas系统蛋白AcrE1进行了结构解析,分析了AcrE1作用的机理,并且利用AcrE1蛋白将铜绿假单胞菌內源的I-E型CRISPR系统变成了基因组调控工具。   image.png   CRISPR/Cas广泛存在于细菌和古细菌中,是细胞保护自

Nature:“武林高手”细菌CRISPR系统VS病毒,以快为尊

  CRISPR是规律间隔性成簇短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeat)的简称,Cas是CRISPR相关蛋白的简称。  CRISPR是一种细菌免疫系统。它也是一种强大的基因组编辑工具。在与病毒的斗争当中,打响的

著名学者朱健康教授PNAS发表CRISPR新研究成果

  来自中国科学院上海生命科学研究院的研究人员在拟南芥中,对CRISPR/ Cas系统诱导的基因修饰的遗传度、特异性及模式进行了多代分析,研究结果发表在《美国科学院院刊》(PNAS)上。   文章的通讯作者是中科院上海生命科学研究院的朱健康(Jian-Kang Zhu)教授,朱教授是植物抗

Natureasia聚焦:CRISPR/Cas研究进展Top20

  CRISPR/Cas系统是目前发现存在于大多数细菌与所有的古菌中的一种后天免疫系统,其以消灭外来的质体或者噬菌体并在自身基因组中留下外来基因片段作为“记忆”。  CRISPR/Cas系统全名为常间回文重复序列丛集/常间回文重复序列丛集关联蛋白系统(clustered regularly inte

将CRISPR-Cas系统用于抗菌“基因疗法”

  CRISPR于1987年出现于日本,当时的研究人员报告称,他们在大肠杆菌基因组中发现了一种不寻常的结构,其中包含一系列重复片段,中间以独特的间隔序列隔开。后来的研究表明,间隔序列对应了感染细菌细胞的噬菌体的序列。在一些原核生物和古生物中,CRISPR和CRISPR相关蛋白(Cas)作为一种适应性

《自然》文章盘点关于基因“剪刀”的五大谜题

  它是个非常了不起的工具。我想知道这个系统从头到尾如何工作。  Francisco Mojica并非第一个看见CRISPR的人,但他可能是第一个为它着迷的人。他还记得1992年当他首次瞥见可能引发一场生物技术革命的这个微生物免疫系统的那一天。他在评估地中海嗜盐菌的基因测序数据,注意到14个不寻常的

《自然》文章盘点关于基因“剪刀”的五大谜题

原核生物利用CRISPR-Cas抵抗在细胞上形成图中结构的病毒。 它是个非常了不起的工具。我想知道这个系统从头到尾如何工作。Francisco Mojica并非第一个看见CRISPR的人,但他可能是第一个为它着迷的人。他还记得1992年当他首次瞥见可能引发一场生物技术革命的这个微生物免疫系

中山大学等开发RNA编辑新工具

  CRISPR-Cas9系统使用一段引导RNA(其与Cas9蛋白结合起来才能发挥作用)来靶定一段DNA,并裂解双链DNA。这一现象提出了一个问题:由一个Dicer结合RNA元件和一段反义RNA组成的一种人造小RNA(asRNA,是否也能用来诱导Dicer处理和降解一段特定的RNA呢?  为此,5月

华中农大:利用I型及III型CRISPR-Cas系统实现基因组编辑

  CRISPR-Cas系统广泛存在于细菌和古细菌中,近年来科学家们针对它们的分子机制开展研究促使开发出了基于II型系统的一些基因编辑技术(延伸阅读:中科院Cell发表CRISPR-Cas研究新成果 )。然而,却未有研究报道利用I型及III型系统来实现基因组编辑。  来自华中农业大学的研究人员报告称

中国学者最新文章利用DNA序列鉴别隐性杂交种

  物种自然杂交现象在自然界中普遍存在, 并被认为在适宜条件下可以多地独立发生. 2013年, 在云南元江采集的7种铁线蕨属植物中, 其中一种在形态上疑似台湾产梅山铁线蕨, 而该种被认为是以假鞭叶铁线蕨为母本、半月形铁线蕨为父本的自然杂交物种.  来自中国科学院上海辰山植物科学研究中心,上海师范大学

CRISPR-Cas9技术及其在肿瘤研究中的应用

CRISPR的前世今生1987年,日本科学家在研究大肠杆菌的时候发现其基因组上存在一些看起来“奇怪”的重复结构:有一段29碱基的序列反复出现了5次,且两两之间被32个碱基形成的序列隔开了!但这个发现在当时并没有引起科学界的很大关注,毕竟在自然界的生物体内,各种奇奇怪怪的发现实在太多。然后仅仅几年后,

真核生物基因组-1

真核生物的基因组比较庞大,并且不同生物种间差异很大,例如人的单倍体基因组由3.16×109 bp组成。在人细胞的整个基因组中实际上只有很少一部份(约占2%~3%)的DNA序列用以编码蛋白质。 第一节 真核生物基因组特点 真核生物体细胞内的基因组分细胞核基因组与细胞质基因组,

不同强度重复经颅磁刺激对脑梗死大鼠条件性恐惧记忆...

摘要目的:研究不同强度重复经颅磁刺激(repetitive transcranial magnetic stimulation, , rTMS )对脑梗死大鼠条件性恐惧记忆的影响。方法:雄性成年SD大鼠40只,体重200 -250 g ,采用改良Zea longa线栓法对大鼠制作右侧大脑中动脉闭

研究表明新冠病毒传染迅速,出现症状前就开始传染!

  德克萨斯大学奥斯汀分校(University of Texas at Austin)研究新型冠状病毒的传染病研究人员确定了冠状病毒的传播速度,这一因素可能有助于公共卫生官员采取控制措施。他们发现,在一个传播链中,病例之间的间隔时间不到一周,而且超过10%的患者是由携带病毒但尚未出现症状的人感染的

年终盘点:2018年基因编辑盘点

  2018年11月,中国科学家贺建奎声称世界上首批经过基因编辑的婴儿-一对双胞胎女性婴儿---出生。他利用一种强大的基因编辑工具CRISPR-Cas9对这对双胞胎的一个基因进行修改,使得她们出生后就能够天然地抵抗HIV感染。这也是世界首例免疫艾滋病基因编辑婴儿。这条消息瞬间在国内外网站上迅速发酵,

产生RNA干扰RANi 的方法

4 产生RANi 的方法产生RANi 的方法主要有体外合成和体内合成siRNA 法。将siRNA 导入细胞的方法又分为微量注射法、电穿孔法、浸泡法、工程菌喂养法、转基因法和病毒感染法等。Harborth 等[14 ]设计体外合成21nt siRNA 的方法是:在基因库中寻找靶向基因的mRNA 序列,

Piggybac转座子载体的作用原理和应用

在我们研究某种疾病的发病机制或者某种药物的作用靶点时,经常需要建立目的基因过表达或基因敲除的细胞模型,目前构建稳转细胞株及部分敲除细胞株最常用的方式之一是慢病毒法,慢病毒因其可以转染几乎所有种类的细胞,且在转染后可以整合到细胞的基因组而长期表达的优势,是目前较为主流的构建方法,但慢病毒构建的稳转细胞