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快速基因组进化法促进酵母工业生物技术

中国科学院深圳先进技术研究所(SIAT)戴俊彪课题组与曼切斯特生物技术研究所的Patrick Cai教授合作开发了一种“快速、高效和通用”的酵母分子水平转化方法,这种方法被命名为“合成染色体重排和LoxP介导的进化修饰(Synthetic Chromosome Rearrangement and Modification by LoxP-mediated Evolution,SCRaMbLE)”。 该系统允许科研人员对基因组“洗牌”,根据需要重新组合(包括自然界中从未发现的新基因组组合),定制新酵母菌株。 “本质上,这是快进工程改造周期。通常需要几年才能优化的工程酵母菌,现在用SCRaMbLE花三两天就能完成,”Cai教授说。 SCRaMbLE系统不仅可以将整合途径引入合成酵母基因组中,而且能让酵母本身在应激条件下进化成更好的宿主。这对先进药物生产等工业生物技术应用特别有吸引力,尤其是DNA研究和疟疾、肺结核等新药大规......阅读全文

Science:人类和酵母居然这么像

  科学家们发现,虽然人类和酵母已经在不同的道路上进化了十亿年,但我们之前的相似之处仍然非常多。他们将四百多个人类基因分别插入到酵母细胞中,发现大约50%的基因能够行使功能让这种真菌存活下来。这项研究于五月二十一日提前发表在Science杂志的网站上。  “这很神奇,”印第安纳大学的进化生物学家Ma

Science:人类和酵母居然这么像

  科学家们发现,虽然人类和酵母已经在不同的道路上进化了十亿年,但我们之前的相似之处仍然非常多。他们将四百多个人类基因分别插入到酵母细胞中,发现大约50%的基因能够行使功能让这种真菌存活下来。这项研究于五月二十一日提前发表在Science杂志的网站上。  “这很神奇,”印第安纳大学的进化生物学家Ma

Yeast基因文库的分类和选择

文库种类Dharmacon酵母资源包括多个酵母基因组文库,包括ORF文库、基因敲除(Knock Out)菌株、蛋白质相互作用文库、突变菌株和各种筛选文库等。除此之外,Dharmacon 针对Saccharomyces cerevisiae 研究领域提供了Zoonome siRNA 文库。酵母

Yeast基因文库的分类和选择

自1995 年成立以来,Dharmacon 提供各种用于批量研究基因功能的工具,支持最多从全基因组范围到信号通路、基因家族方面研究基因与疾病、表型、分子机理对应的关系。近年来随着高端酶标仪、高通量显微镜、自动化流式细胞仪、高内涵等设备的普及和技术更新,Dharmacon 文库在各个领域中

DNA重组(DNA recombination)技术:外源基因的蛋白表达-2

2.包涵体的分离与纯化细胞破碎时提取细胞内产物的关键。对于细菌的裂解常用的有酶溶法、超声破碎法、化学渗透法、玻璃珠研磨等。包涵体可通过超声波、匀浆等常规的方法是菌体破碎后,离心就可得到。密度梯度离心后可得到高纯度的包涵体。包涵体一般不溶于水,为了获得可溶性的蛋白质可加入强蛋白质变性剂后使其溶解。一般

甲醇酵母表达载体及其元件-2

2、选择标记选择标记一般为对应于营养缺陷型受体的野生型基因,常用HIs4。由于P.Pasotris不利用蔗糖,所以也可用啤酒酵母的蔗糖酶基因suC2作为标记。AMP:氨苄抗性基因,可在大肠 杆菌中筛选。G418和Zeocinr(Invitrogen,sandiego,CA)也是筛选标记,使得到高

全球研究人员致力于创造首个合成真核生物基因组

  10年前,当遗传学家Ronald Davis首次提出,他的同事正在尝试创造人工酵母染色体,并将其放入活细胞时,Jef Boeke并没有太多想法。Davis就职于美国加州斯坦福大学医学院,是一个有远见的人。他提出,实验室酵母是当时合成生物学领域的下一个发展方向。不过,Boeke并不理

科学家使用基因编辑技术酿造啤酒,口感更带劲

  据英国《每日邮报》报道,加州大学伯克利分校的科学家们使用基因编辑技术来酿造啤酒,味觉测试发现这种不用啤酒花的特制啤酒比用啤酒花酿制的酒更带劲。  为了实现这一点,研究者对酵母菌株进行基因改造并用于酿酒,结果成功模拟出用啤酒花酿制的口味。  查尔斯·登比(Charles Denby)发表论文称,酿

酵母双杂交系统的发展和应用

随着对多种重要生物的大规模基因组测序工作的完成,基因工程领域又迎来了一个新的时代---功能基因组时代。它的任务就是对基因组中包含的全部基因的功能加以认识。生物体系的运作与蛋白质之间的互相作用密不可分,例如:DNA合成、基因转录激活、蛋白质翻译、修饰和定位以及信息传导等重要的生物过程均涉及到蛋白质复合

《Nature》子刊:新CRISPR技术 轻松实现单碱基精确基因敲除

  CRISPR-Cas9系统为研究者提供了精准编辑DNA的技术手段,如今,研究人员又利用它开发出了靶向酿酒酵母(S. cerevisiae)单基因的技术,研究人员通过删除DNA序列中1个碱基即可关闭基因。这种基因组级别的生物工程与传统的靶向单个基因或有限数量基因的策略相比,未来将更方便研究者独立研

比利时专家发现让葡萄酒更香的酵母基因

  据每日邮报11月7日报道,比利时根特大学VIB研究所的专家发现了让葡萄酒更香的酵母基因。该基因让酵母发酵时产生更多的香味物质,从而赋予葡萄酒更好的风味。  葡萄酒大部分的风味来自葡萄本身,而酵母其中扮演着重要角色。酵母发酵过程中产生的芳香类物质,可以增加葡萄酒的二次风味。  研究作者Thevel

毕赤酵母表达(pichia pastoris expression )实验手册(1)

大肠杆菌表达系统最突出的优点是工艺简单、产量高、周期短、生产成本低。然而,许多蛋白质在翻译后,需经过翻译后的修饰加工,如磷酸化、糖基化、酰胺化及蛋白酶水解等过程才能转化成活性形式。大肠杆菌缺少上述加工机制,不适合用于表达结构复杂的蛋白质。另外,蛋白质的活性还依赖于形成正确的二硫键并折叠成高级结构,在

Cell子刊:基因组,牵一发而动全身

  约翰霍普金斯大学的研究人员报告称,在酵母中任何一个基因缺失都会给生物体基因组施加压力去进行补偿,从而导致另一个基因突变。鉴于不同物种间DNA的保守性,他们的研究发现或许也适应于人类遗传学,有可能对癌症和其他研究领域的遗传分析方式造成重大的影响。   在发表于11月21日《分子细胞》(Molec

青岛能源所菊芋乙醇整合生物加工研究取得新进展

  近日,中国科学院青岛生物能源与过程研究所微生物资源团队李福利研究员和王士安博士在酿酒酵母菊芋乙醇整合生物加工研究方面取得了一系列阶段性进展。  菊芋又名洋姜,是一种新型能源植物,其土壤适应性强、无病虫害,可以在干旱、盐碱等非耕边际土地种植。以菊芋或菊芋工业废渣为原料生产乙醇,是发

Science:首次在体内绘制tRNA基因适应度景观图

  假定你正在试图设计一种疫苗来抵抗下一个季度的流感病毒。拥有一种准确地告诉你多种流感病毒毒株如何进化的详细图谱将是非常有益的。  构建这种类型的图谱是研究一种被称作适应度景观(fitness landscape)的概念工具的进化生物学家的目标,其中适应度景观提供一种可视化观察和预测进化的方法。  

酵母双杂交技术及其在蛋白质组研究中的应用

作为后基因组时代出现的新兴研究领域之一, 蛋白质组学(proteomics)正受到越来越多的关注。 蛋白质组学的研究目标是对机体或细胞的所有蛋白质进行鉴定和结构功能分析。 蛋白质组学的研究不局限任何特定的方法。 高分辨率的蛋白质分离技术如二维凝胶电泳和高效液相层析, 经典的蛋白质鉴定方法如氨

酵母双杂交技术及其在蛋白质组研究中的应用

     作为后基因组时代出现的新兴研究领域之一, 蛋白质组学(proteomics)正受到越来越多的关注。 蛋白质组学的研究目标是对机体或细胞的所有蛋白质进行鉴定和结构功能分析。 蛋白质组学的研究不局限任何特定的方法。 高分辨率的蛋白质分离技术如二维凝胶电泳和高效液相

Science:新研究揭示细胞中令人吃惊的三基因相互作用

  在一项新的研究中,在加拿大多伦多大学唐纳利中心的Charles Boone教授、Brenda Andrews教授和美国明尼苏达大学双城校区的Chad Myers教授的领导下,来自多个国家的研究人员在之前研究---展示了基因如何成对组合来维持细胞的健康---的基础上更进一步,首次研究了三基因组合如

CHO细胞表达系统与酵母细胞表达系统比较

 CHO细胞表达系统与毕赤酵母表达系统是当前发展前景看好的两个表达系统,为了能够更加直观地对两个表达系统有一定的认识,特意在此篇中对两个表达系统作一定的比较,从而能够更进一步的对两个表达系统有更深的了解1.CHO细胞表达系统       (

3月4日《自然》杂志精选

  封面故事:   人肠道微生物的基因目录   人体是大约100万亿微生物细胞的宿主,其中大部分在肠道中,在那里它们对人的生理和营养都有深远影响,而且现在还被认为对人的生命非常关键。肠道微生物帮助人从食物中摄取能量,肠道微生物群落的变化还可能与肠道疾病或肥胖症有关。现在,一个国际合作课题组(

重组蛋白表达系统

  选择合适的蛋白表达系统是重组蛋白成功表达的关键。需要考虑以下方面的因素,包括:目标蛋白性质、用途、蛋白质产量和成本。此外,许多蛋白质表达项目也存在着风险,尤其是大蛋白、膜蛋白、核蛋白和具有大量翻译后修饰的蛋白质。   目前卡梅德生物可以提供几种表达系统可供客户选择,不同的系统有不同的特性和应用

重组蛋白表达系统

  选择合适的蛋白表达系统是重组蛋白成功表达的关键。需要考虑以下方面的因素,包括:目标蛋白性质、用途、蛋白质产量和成本。此外,许多蛋白质表达项目也存在着风险,尤其是大蛋白、膜蛋白、核蛋白和具有大量翻译后修饰的蛋白质。   目前卡梅德生物可以提供几种表达系统可供客户选择,不同的系统有不同的特性和应用

重组蛋白表达系统

选择合适的蛋白表达系统是重组蛋白成功表达的关键。需要考虑以下方面的因素,包括:目标蛋白性质、用途、蛋白质产量和成本。此外,许多蛋白质表达项目也存在着风险,尤其是大蛋白、膜蛋白、核蛋白和具有大量翻译后修饰的蛋白质。目前卡梅德生物可以提供几种表达系统可供客户选择,不同的系统有不同的特性和应用。在这里,我

基因分裂揭示自然选择的详细过程

据physorg网站2007年10月10日报道,美国威斯康辛大学麦迪逊分校研究人员发现了分子所具有的一项绝技,他们在基因层面上详细阐述了自然选择的过程。 霍华德.休医学研究所研究员肖恩.B.卡罗尔和前美国威斯康辛大学麦迪逊分校研究生克里斯.托德.黑亭基尔在《自然》杂志上撰写了一篇论文,详细阐述了

Cell:朊蛋白,表观遗传学的新层面

  朊蛋白prion总是与疯牛病和克-雅氏病等联系在一起,不过人们正逐渐意识到,朊蛋白在生物中也能够发挥正常的有益功能。   日前科学家们发现,朊蛋白能够使酵母从常规单细胞形态转变为多细胞协作形式,并由此在不利环境条件下增大酵母的生存几率。这种可遗传的改变不会影响酵母基因组,是一种表观遗传学现象。

甲醇酵母系统表达的影响因素-2

2、表达框的染色体整合位点和方式虽然相对于自主复制载体来讲,整合性载体的转化率较低,但由于Pp没有天然质粒,所以设计表达载体偏向于染色体整合,通过同源重组,载体整合到细胞染色体中间。整合性载体具有表达框稳定和可控制整合位点等优越性,并且能够发生多位点整合而获得多拷贝。AOX1和组氨酸脱氢酶(hist

2016年诺贝尔生理或医学奖得主论文一览

  2016年诺贝尔生理学或医学奖揭晓,来自东京工业大学的大隅良典Yoshinori Ohsumi因发现自体吞噬的机制而获得此奖,他的代表论文包括:  Autophagy in yeast demonstrated with proteinase-deficient mutants and cond

甲醇酵母系统表达的影响因素-1

酵母菌是单细胞真核生物,具有生长快、易于遗传操作、能对外源蛋白进行翻译后加工和修饰、不产生有毒产物等特点,被认为是表达外源蛋白的合适宿主。几种工业酵母尤其是巴氏毕赤酵母(pichia pastoris, Pp),因具有旺盛的生长力以及其它一些独特的性质,已发展成为较成熟的蛋白生产的表达系统。

酵母双杂交系统简介

酵母双杂交系统酵母双杂交系统是在真核模式生物酵母中进行的,研究活细胞内蛋白质相互作用,对蛋白质之间微弱的、瞬间的作用也能够通过报告基因的表达产物敏感地检测得到,它是一种具有很高灵敏度的研究蛋白质之间关系的技术。大量的研究文献表明,酵母双杂交技术既可以用来研究哺乳动物基因组编码的蛋白质之间的互作,也可

著名华人科学家Science重大成果:首张全面的基因适应度景观图

   假设你正在试图设计一种疫苗来对抗下一季的流感病毒。获得一张能够告诉你各种流感病毒株将如何进化的明细图将会非常有帮助。  构建这类的图谱是研究适应度景观(fitness landscape)的进化生物学家们的一个目标,这一概念性工具为可视化及预测进化提供了一种方法。  适应度景观这一概念出现于2