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5000bp!单分子测序读长再次升级

PacBio RS单分子测序在发布时就以其超长的读长引起研究者的极大兴趣。在不到一年的时间里,随着年初C2试剂的升级,Pacbio RS的平均读长达到了3000bp,并迅速在测序的各个领域,特别是De novo中发挥了巨大的读长优势。Pacific Biosciences公司在11月6日正式发布新的超长测序试剂:XL系列。该试剂将主要针对De novo应用,平均读长将达到5000bp,其中5%的读长将超过13000bp,最长超过20000bp。美国冷泉港实验室前期试用于水稻基因组的组装,得到9倍覆盖率的长片段读序中50%在4800bp以上,大大提高了其通过NGS mate-pair拼接的程度。相信随着该新试剂的正式全面投入使用,将会对现有基因组的完善带来更大的突破。 对于研究者所关心的一些问题,我们也联系了Pacific Biosciences公司的技术支持,并一一做了解答。 问:XL试剂有哪些更......阅读全文

Science解析热点基因组编辑工具

  近来,Cas9酶作为一种有力的新基因组编辑工具,引起了人们极大的研究热情。现在加州大学伯克利分校的研究人员,首次成像了这种酶的精细三维结构,这一成果无疑会进一步提高Cas9的应用价值。文章于二月六日发表在Science杂志上。   加州大学的生化学家Jennifer Doudna和生物物

Science公布最新基因组测序结果

  来自法国农业科学研究院(Institut National de Recherche Agronomique)的研究人员发表了题为“Early allopolyploid evolution in the post-Neolithic Brassica napus oilseed genome”

Science发表基因组研究重要成果

  科学家们日前发现,人类基因组的遗传学差异主要来自于拷贝数变异(CNV)。在此之前人们对CNV的了解并不多,因为CNV一直是基因组测序的一大挑战。  华盛顿大学的遗传学家Evan Eichler领导研究团队克服了这一困难。他们对来自全球125个族群的人进行了深度基因组测序,全面分析了基因组中的SN

Science揭示古老基因组的秘密

  马克斯•普朗克研究所的研究人员描述了丹尼索瓦人(Denisovans)的基因组,阐明了丹尼索瓦人与现代人类之间的关系。相关研究发表在8月30日的《科学》(Science)杂志上。   由德国马克斯•普朗克进化人类学研究所的Svante Pääbo领导的一个国际研究人员小组在新研究中证实了丹

Science专题:癌症基因组学

  在2001年完成人类基因组测序后,许多的研究人员立即将目光放到了利用这些信息来更好地了解遗传学上。最近,越来越多的研究确定了表观遗传学在癌症的发生、形成及发展过程中起效应。从鉴别与遗传性癌症相关的单基因变异的前基因组时代转向,测序技术的进步使得研究人员能够利用全基因组方法来检测基因组间的差异,以

Science发表基因组研究重要成果

  科学家们日前发现,人类基因组的遗传学差异主要来自于拷贝数变异(CNV)。在此之前人们对CNV的了解并不多,因为CNV一直是基因组测序的一大挑战。  华盛顿大学的遗传学家Evan Eichler领导研究团队克服了这一困难。他们对来自全球125个族群的人进行了深度基因组测序,全面分析了基因组中的SN

Science揭示基因组的捍卫者

  从细菌到人类,生物体都必须要保护自身对抗称作为转座子的寄生遗传元件,并且赌注下得很大。这些DNA片段可在基因组中四处跳跃破坏基因,其可以造成极大的破坏因此细胞有专门的监视机制来抑制它们。  为了保护后代对抗基因组破坏,这些天然防御系统发生缺陷通常会导致不育不孕。在动物中,对抗捣乱转座子的主要防御

第三代基因组测序仪实现单分子速读

第三代基因组测序仪实现单分子速读在上周末于美国佛罗里达州马可岛召开的“基因组生物学与技术进展大会”上,来自加利福尼亚门洛帕克市的太平洋生物科技公司介绍了其研制的第三代基因组测序仪,该测序仪实现了一次标记一个分子式的单分子速读。研究人员指出,第三代测序仪的关键优势是能够对单个DNA(脱氧核糖核酸)分子

第三代基因组测序仪实现单分子速读

第三代基因组测序仪实现单分子速读在上周末于美国佛罗里达州马可岛召开的“基因组生物学与技术进展大会”上,来自加利福尼亚门洛帕克市的太平洋生物科技公司介绍了其研制的第三代基因组测序仪,该测序仪实现了一次标记一个分子式的单分子速读。研究人员指出,第三代测序仪的关键优势是能够对单个DNA(脱氧核糖核酸)分子

第三代基因组测序仪实现单分子速读

在上周末于美国佛罗里达州马可岛召开的“基因组生物学与技术进展大会”上,来自加利福尼亚门洛帕克市的太平洋生物科技公司介绍了其研制的第三代基因组测序仪,该测序仪实现了一次标记一个分子式的单分子速读。研究人员指出,第三代测序仪的关键优势是能够对单个DNA(脱氧核糖核酸)分子进行测序,而目前市场上的主流测序