5000bp！单分子测序读长再次升级
PacBio RS单分子测序在发布时就以其超长的读长引起研究者的极大兴趣。在不到一年的时间里，随着年初C2试剂的升级，Pacbio RS的平均读长达到了3000bp，并迅速在测序的各个领域，特别是De novo中发挥了巨大的读长优势。Pacific Biosciences公司在11月6日正式发布新的超长测序试剂：XL系列。该试剂将主要针对De novo应用，平均读长将达到5000bp，其中5%的读长将超过13000bp，最长超过20000bp。美国冷泉港实验室前期试用于水稻基因组的组装，得到9倍覆盖率的长片段读序中50%在4800bp以上，大大提高了其通过NGS mate-pair拼接的程度。相信随着该新试剂的正式全面投入使用，将会对现有基因组的完善带来更大的突破。 对于研究者所关心的一些问题，我们也联系了Pacific Biosciences公司的技术支持，并一一做了解答。 问：XL试剂有哪些更......阅读全文
遗传学大牛Science发现基因组新奥秘
来自斯坦福大学，霍德华休斯医学院的一组研究人员发现，当基因组中相似的基因不断“弹出来”的时候，通常这些基因会丢失，但如果能被留下来（也就成为了多余基因），就会由于一个基因发生一次表达消减这一理论，而在哺乳动物中受到保护。 这一研究成果公布在5月20日的Science杂志上。文章的通讯作者是斯坦
Science发文探讨人类基因组编辑
2015年4月，来自中山大学的科学家们报告称他们首次完成了对人类胚胎的基因组编辑工作，这一爆炸性新闻一经发布便受到了国内外科学界的广泛关注，并引发了支持者和反对者激烈的辩论。 12月，美国科学院、英国皇家学会和中国科学院联合主持在美国的华盛顿召开了人类基因编辑国际峰会。峰会经过三天的热烈讨论终
厦门大学Science文章：令人惊奇的基因组
甲藻（dinoflagellate）并不快乐。在好的时候，这些微小的海洋生物自由漂浮生活在海洋中，或是与珊瑚（corals）共生，成为一大群软体动物、小鱼和珊瑚物种的午餐。其中的一些甲藻能够生物发光，因此会在夜里发光。但在不好的时候，甲藻会用赤潮毒害贝类养殖区，抛弃珊瑚礁让其缓慢地白化死亡。
Science：基因组测序或将颠覆近亲繁殖
山地大猩猩是一种广泛近亲繁殖而且濒临灭绝的动物。日前，科学家们首次完成了山地大猩猩的全基因组测序，并将结果发表在四月九日的Science杂志上。这项研究不仅有助于理解种群衰退对动物产生的影响，还颠覆了人们对近亲繁殖的认识。 “山地大猩猩是野外研究得最多的灵长动物之一，而我们首次进行了深度的全基
张志国教授Science解析肿瘤表观基因组
来自梅奥临床医学院、明尼苏达大学和中科院生物物理研究所等机构的研究人员证实，组蛋白H3.3K36M突变重编程了成软骨细胞瘤（chondroblastomas）的表观基因组。这一重要的研究发现发布在5月26日的《科学》（Science）杂志上。 领导这一研究的是著名分子生物学家、梅奥临床医学院的
Science：中国科学家领衔“破译”绵羊基因组
由中国科学家领衔的一个国际科研小组 5 日宣布，历经 5 年时间，他们完成了对绵羊基因组的测序、组装及分析工作。这项成果使人们对反刍动物生物学有了崭新认识。更重要的是，中国是绵羊和山羊饲养及羊肉消费大国，新研究将促进选育出更优秀的肉羊新品种。 绵羊基因组的测序工作在 2009 年正式启
最新Science公布人类基因组重组图谱
来自美国国立卫生研究院NIH，美国健康科学统一服务大学等处的研究人员发表了题为“Recombination initiation maps of individual human genomes”的文章，构建出了一张人类基因组中染色体交换遗传信息的详细图谱，这将有助于解析这些位点如何影响人类基因
Science：绘制一张复杂疾病基因组图谱
尽管研究人员已经利用全基因组关联研究(GWAS)确定了与人类疾病相关的遗传因素，但是要解释这些数据，还需要清楚的了解这些新的风险基因是如何被调控的。 近期Science杂志发布了最新研究成果，解析了人类天然免疫系统中的遗传调控网络，并且也指出了这些信息如何能直接用于理解自身免疫疾病的遗传学
Science：应为广泛的癌症基因组测试提供医保覆盖
美国前国家癌症研究所主任Harold Varmus和密歇根大学法学院教授Rebecca Eisenberg在Science期刊上发表一篇政策论坛论文，主张让癌症患者更好地使用基因组测试。他们建议政府和私人支付者（保险公司）更好地利用数据库和登记处来确定基因组测试是否能够用于癌症患者的个人化治疗。
Science：华大参与三种鳄鱼基因组测序
最近，德克萨斯理工大学的生物学家带领一个50多名科学家的研究小组，测定了三种鳄鱼——美洲鳄、咸水鳄和印度鳄的基因组序列。 生物学副教授David Ray指出，通过测定这些基因组序列，科学家们可以更好地了解鸟类的进化，它们是这类食肉动物的最近亲缘种。该研究小组完成了这三种鳄鱼的基因组，可以说真正
Science新闻：英国公布大型全基因组测序计划
基因分析技术在快速发展，昨日英国首相宣布了一项大型计划，将对患有癌症及罕见疾病的十万英国人进行全基因组测序。现在许多国家都在为治疗疾病而努力解码国民的DNA，而英国这一新项目的不同之处在于，其测序的是全基因组而非基因组个别区域。 英国首相David Cameron在声明中称，英国国民医
Science：“复活”人类基因组中的古老DNA
尽管尼安德特人(Neanderthal)已经在三万年前灭绝，但其基因组片段仍在现代人群中延续。科学家们通过新分析法，研究了665名欧洲和东亚人的全基因组测序数据，这些数据来自于千人基因组计划。研究显示，显示超过20%的尼安德特人基因组仍存在于现代人群中。文章于一月二十九日发表在Science杂志
Science：华大参与三种鳄鱼基因组测序
最近，德克萨斯理工大学的生物学家带领一个50多名科学家的研究小组，测定了三种鳄鱼——美洲鳄、咸水鳄和印度鳄的基因组序列。 生物学副教授David Ray指出，通过测定这些基因组序列，科学家们可以更好地了解鸟类的进化，它们是这类食肉动物的最近亲缘种。该研究小组完成了这三种鳄鱼的基因组，可以说真正
遗传学大牛Science重磅成果：改写活体基因组
遗传密码通常包含64个密码子， 但现在来自哈佛大学的研究人员和同事们设计出了只包含57个密码子的大肠杆菌基因组。在发表于8月18日《科学》（Science）杂志上的一篇论文中，该研究小组描述了这一计算机生成的基因组，并报告了在实验室中合成它的第一阶段。 论文的共同作者、哈佛大学George C
Science:新方法在活细胞中改变基因组
来自MIT Broad研究所和Rockefeller大学的研究者发展了一种新的方法，能够在活细胞内精确地增减基因，从而操作基因组。研究人员称，这项技术可以提供一种简单易行，并且相对低价的方法来从事各项研究，包括设计能够产生生物能源的有机体，设计动物模型来研究人类疾病，发展新的治疗方法等。
Science封面头条：十年破译采采蝇基因组
采采蝇可以在人类和牲畜中传播，分别引起人类非洲锥虫病(也叫做昏睡病)和那加那加病(Nagana)。在整个撒哈拉以南非洲地区，当前有7000 万人面临着致命感染的危险。人类非洲锥虫病是世界卫生组织(WHO)列表中被忽视的一种热带病，自2013年以来其成为了根除的一个目标。了解采采蝇，破坏其传播
Science：人巨细胞病毒病毒基因组测序
人巨细胞病毒是一种很常见的疱疹病毒，感染约50-100%的成人，但通常没有不良影响，并且它可以保持潜伏多年。人巨细胞病毒感染是比较常见的，发展中国家感染人数比发达国家人数多。 该病毒可导致出新生儿生缺陷和免疫系统受损，可能会导致致命疾病。该病毒也与癌症发展有关联。这项新的研究分析了病毒的蛋
简述单分子测序技术—第三代测序技术的基因组测序应用
由于具有读长长的特点，SMRT测序平台在基因组测序中能降低测序后的Contig数量，明显减少后续的基因组拼接和注释的工作量，节省大量的时间[25]。Christophern等[26]仅仅用0.5*的Pacbio RS系统长度的数据与38*的二代测序(NGS)的测序数据，对马达加斯加的一种指猴基因
2年Science基因组学文章引用次数高达100
据The Scientist报道，一篇发表在Science杂志上的基因组学文章成为基因组学领域热门的文章，从2007年发表后，总的引用次数高达100次。 这篇文章即是：V. Nene et al., “Genome sequence of Aedes aegypti, a major ar
Science：新生儿测序遇冷，“基因组计划”行路难
新生儿测序是近年来比较热门的话题，中国新生儿基因组也于今年8月份正式起航，不过在此之前，美国已经开展了一项名为“BabySeq”的新生儿测序计划。10月19日，在加拿大温哥华召开的美国人类遗传学协会（ASHG）年会上，科学家们表示首个探讨利用新生儿基因测序来指导健康护理的研究项目——BabySe
基因组学大牛Science发布癌症重大成果
Whitehead研究所的科学家们发现，称作为“隔绝邻域”的环状染色质结构遭到破坏可以激活能够推动侵袭性肿瘤生长的癌基因。这一研究发现对于癌症诊断及治疗均具有重大的意义。相关论文发布在《科学》(science)杂志上。 领导这一研究的是Whitehead生物医学研究所的Richard A Yo
Nature，Science两大顶级杂志聚焦“第二基因组”
人体内有两个基因组，一个是从父母那里遗传来的人基因组;另一个则是出生以后才进入人体、特别是肠道内的多达1000多种的共生微生物，其遗传信息的总和叫“微生物组”，也可称为“元基因组”，相当于人的第二个基因组，它们所编码的基因有100万个以上。两个基因组相互协调、和谐一致，保证了人体的健康。
Science：重磅！西安交大叶凯团队成功破译罂粟基因组
在一项新的研究中，来自中国西安交通大学、上海海洋大学；英国约克大学、威康基金会桑格研究所；澳大利亚太阳制药私人有限公司的研究人员破译出罂粟（opium poppy）基因组的DNA密码，揭示出这种植物产生用于制造重要药物的药用化合物的关键步骤。这一发现可能为科学家们提高这种药用植物的产量和抗病性铺
第三代测序重大突破！首次完成人类基因组测序
第二代测序是当今应用最为广泛的技术，但读长短是它的软肋，并且它无法解决高度杂合的基因组、高度重复序列、高GC区域、拷贝数变异、大的结构变异等问题。第三代测序技术避免了第二代测序读长短的缺点，近年来渐渐被应用于各大研究中。以前谈到第三代测序，也许你想到的是病毒基因组或细菌基因组测序，而如今随着技
Nature：借助第三代测序韩国发表最连续人类基因组
国立首尔大学医学院的研究人员和美国被誉为“测序黑马”的公司——10x Genomics联合运用去年新发售的GemCodeTM测序平台以及第三代测序PacBio单分子实时测序平台在本期的Nature上发表了一项新的研究，对一名韩国人的基因组（AK1）进行从头组装和单倍体型定相信息分析。这是迄今为止
中国学者连发Science，GenomeRes参与国际基因组项目
生物通报道：在2001年，人类基因组计划产生了近乎完整的人类DNA。但是研究人员还希望了解这些GS，CS，和TS是如何利用，控制或组织，比它们少得多的编码区域，造就活生生的人。9月，一个聚集了422位科学家的国际团队，在经过十年的努力后，完成了解析基因组剩余部分(非编码区域)的工作，宣布了
科学怪咖Science革命性成果：构建最小的基因组
Craig Venter博士被誉为是21世纪最顶尖的科学家之一。除了一些科学上的重要头衔，他还是一位企业家，是J. Craig Venter研究所（JCVI）的创始人总裁兼CEO。在基因组学和合成生物学领域，Craig Venter一直是先行者。由于在人造人，以及对基因研究等方面的偏执热爱，其因
Science：利用宏基因组数据预测之前未知的蛋白结构
根据一项新的研究，从多种环境中收集的DNA序列数据有助研究人员构建出600多种蛋白家族的三维结构模型，而在此之前，它们的结构是未知的。这些宏基因组数据能够让人们在多种物种之间进行蛋白序列比较，从而允许利用统计学力量预测这些之前不可能预测的蛋白结构。相关研究结果发表在2017年1月20日那期Sci
王文研究组连发Science，Nature子刊文章解析基因组
在“973”项目的支持下，中国科学院昆明动物研究所研究员王文领导的团队继2013年解析山羊基因组揭示羊绒生长的基因基础之后，近日再次携手华大基因研究院、澳大利亚联邦科学与工业研究组织等国内外机构“破译”了绵羊基因组。至此，所有重要家畜动物的基因组密码全部告破。 山羊和绵羊是反刍动物的典型代表动
中国科学家发表在《Nature》《Science》封面的基因组文章
随着测序技术的便捷化、廉价化进程的推进，中国已经逐步进入基因组测序普及化的时代，目前，我国已经获得多个物种的基因组图谱。 其中，影响比较大的基因组图谱成果都发表在国际一流期刊《Nature》或《Science》的封面上。 2002年 水稻基因组图谱 《Science》 《Nat