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基因组学研究一直都存在着不同水平的偏向性（bias）。种族偏向性自不必说，美国“我们所有人（All of Us）”大规模研究计划的目标之一就是对过去代表性不足的群体进行抽样，比如非裔美国人。 同时，历史偏向性也一直存在。某些基因与疾病有着很强的相关性，但好像就是不入科学家的法眼，始终躺在角落里无人问津。如今，研究人员开始正视这些偏向性。 历史偏向性 由于历史偏向性，一些已被证明对人类疾病有重要意义的基因被忽视。之前的研究称，现阶段的研究主要集中在2,000个编码基因上，而人类基因组中大约有20,000个基因。最近一篇发表在《PLOS Biology》上的文章剖析了为什么研究人员只关注10%的基因。 研究团队发现，历史偏向性在这方面发挥了巨大的作用，而政策、资助和职业道路也成为主要的推动力。 西北大学的Thomas Stoeger谈道：“我们发现，目前对人类基因的研究并不反映基因的重要性。许多基因与人类疾病有着很强的......阅读全文
深圳华大生命科学研究院宏基因组研究所转化应用实验团队首次公开了使用BGISEQ-500对健康人群肠道样本进行深度宏基因组测序的数据，并通过一系列的性能评估，展示了BGISEQ-500宏基因组测序应用性能的优异性、准确性、稳定性及跨平台一致性，相应成果发表于GigaScience。 BGIS
目前多种新型分析技术，如新一代测序和芯片，都是为细胞群体而设计的，需要一定的样本量。对于一些临床或法医样本，如肿瘤细胞或循环胎儿细胞等，它们的细胞数量有限，直接限制了其下游应用。例如，在分析肿瘤细胞中的体细胞DNA突变或单个细菌基因组时，单细胞中的DNA无法满足测序的mg级样品量需求。为了从少量样品
染色质免疫共沉淀测序（ChIP-Seq）是指对染色质免疫共沉淀（ChIP）获得的DNA片段进行大规模测序，并能把所研究蛋白的DNA结合位点精确定位到基因组上。Roche GS FLX Titanium 、Illumina Hiseq2000和AB SOLID 4 这3种测序技术均可以用于ChIP-
来自西南大学蚕学与系统生物学研究所的研究人员利用家蚕全基因组芯片分析家蚕多种组织基因表达特征，这一研究成果公布在国际生物学权威期刊《Genome Biology》网络版上。 领导这一研究的是夏庆友教授，现任教育部“长江学者”特聘教授，“973”项目首席科学家 原文检索：Genome Biolog
近日，中国科学院广州生物医药与健康研究院-马克思普朗克(Max Planck -GIBH)再生生物医学中心Ralf Jauch及其博士生Vikas Malik主导团队揭示了转录因子诱导的体细胞多能性重编程的起始分子机制，阐明了多能性重编程对Oct4和Sox2的时态依赖性，为再生医学和
近日，中国科学院广州生物医药与健康研究院-马克思普朗克(Max Planck-GIBH)再生生物医学中心Ralf Jauch及其博士生Vikas Malik主导团队揭示了转录因子诱导的体细胞多能性重编程的起始分子机制，阐明了多能性重编程对Oct4和Sox2的时态依赖性，为再生医学和诱导多能干细胞
日前，国际生物学权威期刊《基因组生物学》在线发表了西南大学蚕学与系统生物学研究所夏庆友教授领衔的课题组关于利用家蚕全基因组芯片分析家蚕多种组织基因表达特征的最新研究成果。 家蚕是重要的经济昆虫，既能用于蚕丝的生产、也能作为生物反应器生产外源蛋白；同时，家蚕也是鳞翅目昆虫生化、分子遗传以及基
经过1500位左右的读者投票，最后iNature编辑部得到了2019年中国生命科学领域20大进展，其中结构有2项，植物3项，生物机理研究4项，新方法/技术/动物模型6项，生物医学5项。 结构：颜宁团队Cav通道结构，这些结构为未来针对Cav通道病的药物发现奠定了基础； 中科院生物物理所饶子和
1、高通量测序在微生物多样性研究中的应用介绍 微生物环境基因组学又叫宏基因组学，它是研究某一环境样品中所包含的全部微生物的遗传组成及其群落多样性的一门科学，它是一种研究微生物多样性、开发新的生理活性物质（或获得新基因）的新理念和新方法。 第二代高通量测序技术为研究微生物群落结构提供了新的技术平台，并
1、高通量测序在微生物多样性研究中的应用介绍 微生物环境基因组学又叫宏基因组学，它是研究某一环境样品中所包含的全部微生物的遗传组成及其群落多样性的一门科学，它是一种研究微生物多样性、开发新的生理活性物质（或获得新基因）的新理念和新方法。 第二代高通量测序技术为研究微生物群落结
1、高通量测序在微生物多样性研究中的应用介绍 微生物环境基因组学又叫宏基因组学，它是研究某一环境样品中所包含的全部微生物的遗传组成及其群落多样性的一门科学，它是一种研究微生物多样性、开发新的生理活性物质（或获得新基因）的新理念和新方法。 第二代高通量测序技术为研究微生物群落结
我们知道细胞内的生命活动由众多基因、蛋白质、以及小分子代谢产物来共同承担，而上游的（核酸、蛋白质等）大分子的功能性变化最终会体现于代谢层面，如神经递质的变化、激素调控、受体作用效应、细胞信号释放、能量传递和细胞间通讯等，所以代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游，所提供的是生物学的终端信息
我们知道细胞内的生命活动由众多基因、蛋白质、以及小分子代谢产物来共同承担，而上游的（核酸、蛋白质等）大分子的功能性变化最终会体现于代谢层面，如神经递质的变化、激素调控、受体作用效应、细胞信号释放、能量传递和细胞间通讯等，所以代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游，所提供的是生物学的终端信息
继启动万种动物线粒体基因组计划（MT10K, https://www.mt10k.org）之后，深圳国家基因库成功研发出一套应用线粒体基因组监测生物多样性的宏线粒体基因组重测序方法（mitochondrial metagenomics，以下简称“全线粒体混合多样性分析法”）。此方法高效、准确且可
我们知道细胞内的生命活动由众多基因、蛋白质、以及小分子代谢产物来共同承担，而上游的（核酸、蛋白质等）大分子的功能性变化最终会体现于代谢层面，如神经递质的变化、激素调控、受体作用效应、细胞信号释放、能量传递和细胞间通讯等，所以代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游，所提供的是生物学的终端信息。如
454测序协助发现疱疹样病毒与热带珊瑚礁的大面积减少有关为了确定病毒病原体对珊瑚健康衰退的影响，圣地亚哥州立大学的研究人员最近在Forest Rohwer博士的领导下，用454生命科学的Genome Sequencer系统对各种环境压力下的Porites compressa珊瑚样本进行了宏基
首篇利用454测序系统全新GS FLX Titanium试剂发表的论文聚焦宏基因组学 一种在公海中发现的非同寻常的微生物迫使科学家们不得不重新思考他们对于海洋生态系统中碳氮循环的理解。一个来自美国加利福尼亚大学的研究小组利用罗氏属下454生命科学公司全新的GS FLX Titani
12月21日，Macrogen千年基因应邀赴汕头大学•香港中文大学联合汕头国际眼科中心进行学术交流，该中心的陈建欢老师、陈浩宇主任等数十名研究人员参加了会议。会议期间，双方共同探讨了眼科疾病的研究进展及基因组学技术在该类疾病研究中的应用。基于汕头国际眼科中心在眼病基因组学领域取得的科研成果，以及
当今，生物医学研究面临的一个主要挑战是确定复杂疾病的特定表型下隐藏的遗传变异。就临床可行性和成本而言，与低覆盖度的全基因组测序、甚至全外显子组测序相比，定向测序是目前最有希望且最可行的方式，有望可靠发现人类基因组中的常见和稀有变异。 定向DNA测序提供了目标区域的更深度覆盖，实现
在过去的几年中，许多生物的基因组完成了测序工作，如何对如此庞大的原始序列信息进行分析和应用，正是现在最为棘手的问题。大量的基因预测软件和在线工具应运而生。如何广泛而深入地了解并能有的放矢地利用这些工具，已经成为21世纪分子生物学家的必修课。随着大规模EST和cDNA序列信息的获取，那些基于表达序列同
最新一期的国际学术期刊《科学》杂志刊登了复旦大学生命科学学院、生物医学研究院苏志熙和黄伟等提出的最新假说，认为偏向性突变是导致后生动物进化过程中酪氨酸丢失以及复杂酪氨酸激酶调控网络形成的主要原因。这一新假说对目前世界生命科学研究领域权威观点“后生动物进化过程中酪氨酸丢失是自然选择作用的结果”进行
由中国疾病预防控制中心传染病所研究员、复旦大学附属上海市公共卫生临床中心兼职教授张永振带领的研究团队，在脊椎动物RNA病毒的发现、遗传与进化领域取得重要突破，这项成果4月5日在《自然》杂志上以研究论文形式发表。 目前，人们对脊椎动物RNA病毒多样性及其进化史的认识，很大程度上还局限在哺乳类和鸟
反义Piwi相互作用RNA（piRNA）指导生殖细胞发育过程中已建立的转座子的沉默，正义piRNA驱动反义Piwi池的乒乓扩增，但生殖细胞如何响应基因组入侵尚不清楚。 2019年10月10日，同济大学翁志萍，麻省大学医学院William E. Theurkauf及昆士兰大学Keith Chap
DNA微阵列技术的发展[1]带来了基因表达研究方法上的一场革命。传统的Northern blots或RT-PCR方法只能逐一地研究单个基因的表达，而DNA微阵列技术可以同时例行检测成千上万个基因表达水平的变化，在微芯片上置入寡核苷酸探针或相应于mRNA序列的cDNA，与细胞cDNA或cRNA进行杂交
上一期为大家介绍了过去一年里CRISPR技术在动物造模及单碱基技术方面取得的重大突破。本期继续为大家从功能基因组筛选、细胞谱系示踪及疾病诊断方面谈谈CRISPR-Cas系统的技术运用。 一、大规模基因功能的筛选 尽管测序和基因组编辑技术取得了重大进展，但是解析复杂的基因型-表型关系仍
上一期为大家介绍了过去一年里CRISPR技术在动物造模及单碱基技术方面取得的重大突破。本期继续为大家从功能基因组筛选、细胞谱系示踪及疾病诊断方面谈谈CRISPR-Cas系统的技术运用。 一、大规模基因功能的筛选 尽管测序和基因组编辑技术取得了重大进展，但是解析复杂的基
来自中科院北京基因研究所、迈阿密大学Miller医学院的研究人员证实，丧失Asxl1会改变骨髓基质干细胞的自我更新和命运，在小鼠中导致Bohring-Opitz样综合征。这一研究发现发布在Stem Cell Reports杂志上。 中国科学院北京基因组研究所的王前飞(Qian-fei Wang
蛋白质组（Proteome）指由一个基因组或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。蛋白质全谱分析目的在于鉴定样本中尽可能多的肽和蛋白质混合物的组分。基于质谱技术的全谱鉴定，可为蛋白高通量的定量和修饰分析提供参考信息。传统的方法如蛋白质微量测序、氨基酸组成分析（如Edman降解法）费时费力、通量低，存
蛋白质组（Proteome）指由一个基因组或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。蛋白质全谱分析目的在于鉴定样本中尽可能多的肽和蛋白质混合物的组分。基于质谱技术的全谱鉴定，可为蛋白高通量的定量和修饰分析提供参考信息。传统的方法如蛋白质微量测序、氨基酸组成分析（如Edman降解法）费时费力、通量低，存在不容
DNA基因测序技术从上世纪70年代起，历经三代技术后，目前已发展成为一项相对成熟的生物产业。测序技术的应用也扩展到了生物、医学、制药、健康、农林、园艺、花卉、环保、法医等许多领域，并成为一项与我们衣食住行密切相关的高技术产业。据最新统计，2012年全球基因测序市场的产值已超过百亿，按最近几年增长