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专家经验谈:如何减轻你的测序负担

拷贝数变异(CNV)是指基因拷贝数出现的异常,主要表现为基因组大片段的缺失和重复。CNV是基因组结构变异的重要组成部分,与自闭症、认知功能缺陷、癌症等多种疾病有关。芯片是目前临床上检测CNV的主要工具,但芯片检测在有些方面也是力不从心。举例来说,芯片只能帮助我们判断是否存在序列重复(或缺失),要获得更加全面的信息只能求助于二代测序(NGS)。NGS可以达到更高的分辨率,还能同时检出倒置、易位等其他结构异常,甚至为人们提供SNP和indel的信息。 不过,为了检测CNV而测序整个基因组显然有些大材小用。不少研究者选择先富集自己感兴趣的序列再进行测序,比如只占基因组1%-3%的蛋白编码序列,或者与特定疾病有关的已知基因。这样的策略可以节省大量的人力、物力和成本,受到了广泛的欢迎。 CNV检测的老大哥 如果需要检测1Kb-3.5 Mb的染色体重复或缺失,研究者们一般选择使用芯片。芯片是一种经济实用的检测方法,非常准确而且覆盖......阅读全文

从FDA批准首个癌症消费级基因检测看中国市场

  美国FDA宣布23andMe获得首个直接面向消费者(DTC)的癌症风险基因检测授权。这项检测的意义是什么,中国市场如何?基因慧就此专访了7位相关企业创始人,并分析相关市场趋势,供参考,欢迎留言讨论。  划重点  1. 此产品针对3个癌种的BRCA基因的3个突变  2. FDA对DTC基因检测政策

创新or围剿?一场关于基因检测体外诊断的争夺战!

  7月23日,国家食品药品监督管理总局CFDA批准了广州燃石的人EGFR/ALK/BRAF/KRAS基因检测试剂盒[1],这是CFDA批准的中国首个基于NGS的肿瘤伴随诊断试剂盒,在我国体外诊断领域具有里程碑式的意义。  基因检测从最初单个基因检测到一组基因检测,再到现在大panel检测,从PCR

基因检测产业缘何缺乏领军企业

  比尔·盖茨曾预言,“下一个世界首富将出自基因领域”,目前美国每年约有几十亿美元的市场规模,基因检测的市场逐年扩大,基因测序行业正在成为朝阳产业被广泛看好。   与美国迅猛的发展势头相比,我国基因检测市场稍显冷清,操作不规范、缺乏行业标准等严重制约着我国基因检测市场的发展。我国基因检测公司该如何

中国基因检测产业缘何缺乏领军企业?

  比尔·盖茨曾预言,“下一个世界首富将出自基因领域”,目前美国每年约有几十亿美元的市场规模,基因检测的市场逐年扩大,基因测序行业正在成为朝阳产业被广泛看好。   与美国迅猛的发展势头相比,我国基因检测市场稍显冷清,操作不规范、缺乏行业标准等严重制约着我国基因检测市场的发展。我国基因检测公

中国基因检测产业缘何缺乏领军企业?

  比尔·盖茨曾预言,“下一个世界首富将出自基因领域”,目前美国每年约有几十亿美元的市场规模,基因检测的市场逐年扩大,基因测序行业正在成为朝阳产业被广泛看好。   与美国迅猛的发展势头相比,我国基因检测市场稍显冷清,操作不规范、缺乏行业标准等严重制约着我国基因检测市场的发展。我国基因检测公司该如何

千亿基因检测蛋糕出炉 10股盛宴开席

  此前因著名影星安吉丽娜·朱莉切除乳腺一事而成为全球热点的基因检测,最近因歌手姚贝娜的“陨落”再度被人关注。凑巧的是,在国内,曾被一度叫停的国内基因检测临床应用,近日随着国家卫计委通过了第一批高通量测序技术临床应用试点单位名单,也再度放开。有业内人士预测,中国国内基因检测及其相关产业将可能形成每年

基因检测,究竟要不要做?

  前段时间我们说过基因检测预报的问题,虽然是作为一项未来科技,但它的1.0版本已经进入我们的生活。  于是人人都面临一个新问题:基因检测,到底要不要做?  其实,最简单的答案就是:能做就做,心态要开放;结果仅供参考,心态要放松。  对急性子的人来说,本文已结束。但对活得更仔细的人,关于基因检测的深

精准医疗未来走向多基因检测

  近年来,精准医疗概念在医疗领域备受资本青睐,越来越多资本、企业进入该领域进行发展。在市场层面,整个精准医疗市场规模正在以不断提升的速度逐年扩大;在技术、学术层面,精准医疗也正走在从单基因的个别热点检测向多基因、全基因范围的平台检测的路上。  据中商产业研究院发布的《2018-2023年全球精准医

FDA释放两大信号 精准医疗未来走向多基因检测

  近年来,精准医疗概念在医疗领域备受资本青睐,越来越多资本、企业进入该领域进行发展。在市场层面,整个精准医疗市场规模正在以不断提升的速度逐年扩大;在技术、学术层面,精准医疗也正走在从单基因的个别热点检测向多基因、全基因范围的平台检测的路上。  据中商产业研究院发布的《2018-2023年全球精准医

用户需求多样!2019年消费级基因检测有望快速增长

  2018年,美国消费级基因检测公司创造了新的销售记录。据业界观察人士估计,在接下来的几周内,随着对已获得样本处理的完成,进行消费级基因检测的人数将达到3000万。  随着越来越多基因数据的积累,Ancestry、23andMe、Helix、MyHeritage、Insitome、Family T

各类癌症基因检测技术优劣势大对比

提到基因检测,前几年,临床医生在向患者推荐时还心存疑虑,而近两年,基因检测已成为癌症诊疗的标准动作,基本上每一个癌症患者都有一套自己的基因检测报告。 不得不说,一个患者一套方案的个体化诊疗时代已经到来。比如,一位患者患了癌症,不仅要做病理诊断还要做全基因检测,发现突变位点,进而为患者制定包括化疗

16种常见癌症可做预测性基因检测

  研究人员正在进行肿瘤组织基因组提取。  随着癌症发病率逐年上升,癌症基因检测愈发流行。基于自身健康的考虑,一些高危人群开始主动进行癌症基因检测。目前,癌症基因检测还处于发展阶段,多数用于肿瘤的靶向治疗以及临床疾病的药物治疗,不过我国现在已有16种常见癌症变异基因被破译,可做预测性基因检测。  精

中国基因检测投保路还有多远

  8月13日,在genomeweb网站上,有2篇新闻报道了美国知名的商业保险公司 Noridian Medicare宣布将多家基因检测产品在局部范围内(LCD、local coverage decision)纳入自己的投保范围,并进行全额报销,其中包括知名的以基因医学来开发医疗及分子诊断产品的My

量身打造!RNA-Capseq更适合临床融合基因检测

  基因融合或易位可能产生功能改变的嵌合蛋白,也可能重新排列基因启动子,通过激活原癌基因或抑制抑癌基因导致细胞信号通路紊乱,它们在肿瘤的发生过程中扮演着重要的角色。[1,3] 例如,BCR–ABL1融合会导致酪氨酸激酶活性以及下游PI3K和MAPK信号通路的组成型激活,使细胞逃避凋亡,实现无限增殖。

23andMe基因检测业务放开释放积极信号

  事件:23andMe个人基因检测重获批准。  个人基因检测公司23andMe 在被FDA禁止向个人消费者出售基因疾病分析服务两年后,日前宣布重获FDA 批准。此次提供修订后的个性化基因组服务,包括祖源、健康、非医学特征(如雀斑、头发卷曲、乳糖不耐受症等)以及疾病携带状况的信息报告。  23and

王在峰教授:肿瘤患者的诊疗需“量体裁衣”

  导语:肿瘤一直以来都是块难啃的“硬骨头”,医生和科研人员为了“啃碎”它,忙的焦头烂额;平常人对它是“谈癌色变”;患者和家属对它则“寝食难安”。在菏泽市抗癌协会上我们邀请到菏泽市抗癌协会会长、菏泽肿瘤康复研究院院长、正大医院王在峰董事长,看看他对肿瘤的诊疗有着怎样的见解。  转化医学网:王院长您好

PCR技术在突变基因检测中的应用

基因突变(gene mutation)是遗传病和肿瘤发生的根本原因,检测与遗传病及恶 性肿瘤发生有关的突变基因(mutant gene)是分子生物学,医学遗传学及肿瘤学研究 的热点,它对阐明遗传病和肿瘤发生的分子生物学基础及其诊断和早期诊断具有重要 \意义,分子生物学技术的发展,尤其是PCR技术的出

PCR技术应用三:突变基因检测

   基因突变(gene mutation)是遗传病和肿瘤发生的根本原因,检测与遗传病及恶 性肿瘤发生有关的突变基因(mutant gene)是分子生物学,医学遗传学及肿瘤学研究 的热点,它对阐明遗传病和肿瘤发生的分子生物学基础及其诊断和早期诊断具有重要 \意义,分子生物学技术的发展,尤其

美人类遗传协会给儿童基因检测8大建议

  美国人类遗传协会7月2日发表报告声明,儿童和青少年的基因检测会引发道德问题,同时检测的临床试验研究会引发其他问题,针对这些问题该协会对儿童和青少年的基因检测提出了几点建议。   该报告发表在《美国人类遗传学杂志》上,报告主要对1995年《美国人类遗传学杂志》和《美国大学医学遗传学和基因组学》关于

中美面对面之NGS肿瘤检测试剂盒

  NGS(高通量测序)在肿瘤领域应用途径主要为液体活检,肿瘤基因的液态活检,即是在人体的循环血液中检测ctDNA (死亡肿瘤细胞上脱落释放的小片段肿瘤基因)、循环肿瘤细胞(CTC)以及外泌体等的技术。它通过体外无创抽血即可对全身的肿瘤信息进行检测,非常适合于癌症的早期诊断和精准医疗。其中,肿瘤基因

常用的分子生物学基本技术

核酸分子杂交技术由于核酸分子杂交的高度特异性及检测方法的灵敏性,它已成为分子生物学中最常用的基本技术,被广泛应用于基因克隆的筛选,酶切图谱的制作,基因序列的定量和定性分析及基因突变的检测等。其基本原理是具有一定同源性的原条核酸单链在一定的条件下(适宜的温室度及离子强度等)可按碱基互补原成双链。杂交的

十九大!看看分子病理领域,未来发展方向!

  今天党的十九大召开,习近平大大指出:中国特色社会主义进入新时代,我国社会主要矛盾已经转化为人民日益增长的美好生活需要和不平衡不充分的发展之间的矛盾。想想都觉得高中政治课本过时了,而考研又多了一道大题。然而这些年,医疗领域进展可不止一点!就让我们一起看看这些年,分子病理领域的发展!  其实相对于其

应用非标记探针法进行基因分型(六)

外显子14:多重探针分析       主要实验的外显子14, 两个野生型的探针同时用于一个反应,用来检测所有已报道的外显子14的突变,同时消除密码子836(p.S836S)多态性(图4;a和b;表3;补充表5;http:/

带你走近神秘的基因检测服务

  目前绝大多数基因检测服务没有临床应用方面的证据。这意味着,基因检测尽管意义重大,如果不加以严格管理,就有可能因为商业利益而毁掉这一前程远大的技术的信誉。  在分子生物医学迅速发展的今天,基因测序是每个人都避不开的话题。对于肺癌患者,在治疗前进行基因组测序,知道是哪种驱动基因导致的癌症,就可以有针

基因检测新技术可应用于儿童自闭症诊断

  加拿大纽芬兰纪念大学遗传医学院的研究团队于9月1日发表一篇论文,证明染色体微阵列分析和完整外显子检测能够筛查与自闭症相关的基因,帮助家长和医生更好的了解孩子患自闭症的几率。相关研究结果发表于《the American Medical Association》。  染色体微阵列分析可以检

Illumina子公司Helix将打造DNA定制化王国

  乔布斯在2011年死于胰腺癌之前,曾花10万美金来给自己的DNA做了一次测序。这一做法在当时昂贵又罕见,谁想到在乔帮主离世5年之后,一模一样的基因测序已经降到了几千美金,甚至更低的价格,进入百万民众的视野。  让DNA测序发生革命性改变的公司,毫无疑问是基因测序巨头Illumina。这个价值20

原位PCR技术基本原理、类型、步骤和应用-2

标本的制备原位PCR技术可应用于细胞悬液、细胞涂片、冰冻切片以及石蜡切片。相比较而言,以悬浮的完整细胞做原位PCR效果最好,石蜡切片效果最差。随着技术方面的一些问题被解决,近年也有从石蜡切片中得到满意的PCR效率的报道。效果不好的原因是多方面的,如:玻片上做PCR,热传导较差,热对流不均匀,TaqD

应用非标记探针法进行基因分型(三)

高分辨率熔解 在高分辨率熔解仪器HR-1(爱荷华科技,盐湖城,犹他州)上进行分析,将LightCycle毛细管加入HR-1中,0.3℃/s加热。主要的实验中,RET外显子的扩增及非标记探针熔解数据从60℃到95℃采集。主要实验分析了每个外显子的扩增子及探针数据,除了外显子14。因为所有报道的外显子1

微流控芯片与基因诊断关系的研究进展

微流控芯片已经广泛于医学、生物、电子、流体、化学等领域,且微流控芯片可把样品制备、反应、分离、检测、扩增、分析等集成到一块几微米至几百微米尺度的芯片上并自动完成所有基本过程。目前,微流控芯片已经广泛地应用到医学基因诊断方面,例如基因多态性检测、基因高效性测序、基因快速性扩增等,为此,本文主要对微流控

科普:基因检测如何测出你的未来

  随着医学技术的发展,基因检测的价值与日俱增。近日,美国《麻省理工学院技术评论》杂志评出了可能在2018年造成重大影响的“全球十大突破性技术”,基因检测榜上有名。  专家预言,未来人们或许可以一出生就接受全基因组检测,预测与基因相关的健康风险,从出生开始就采用科学的健康管理方式。  什么是基因检测