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单细胞检测技术在肿瘤研究中的新挑战和新方向(二)

三.残留病变和复发:利用单核分析(冰冻材料)在许多癌症类型中,初始治疗后通常伴随着具有增强的侵袭性和抗药性的复发,突出了残留病变及其进展和生长对于建立复发性肿瘤的重要性。已有的研究比较了原发性和复发性肿瘤,并揭示耐药性的各种遗传原因。未来的研究将扩展这种方法,通过scRNA-seq进行比较,并提供更详细的复发肿瘤视图及其与相应原发肿瘤的区别。但是,一个重要的挑战是,目前的scRNA-seq方案需要新鲜肿瘤样本,在给定复发时间的情况下,为处理匹配的原发和复发样本就比较困难了。不过,已有多种方法可以实现冷冻样品的分析,如最近已有报道,可以通过单细胞核(而不是单细胞)的分离和测序来分析冷冻或固定的样品。除了复发性肿瘤外,scRNA-seq还直接发现通过治疗而存活的罕见残留细胞,而它们正是最终成为肿瘤复发的基础。 这种罕见细胞,通常被称为微小残留病变(MRD),可以在动物模型中进行分析,通过与原发性和复发性肿瘤进行比较,为其逃避......阅读全文

单细胞基因组,一个新时代的到来

  单细胞基因组旨在通过组学方法研究单个细胞。近年来随着技术的发展,这一年轻的领域正在迅速成熟起来。单细胞基因组研究的前身可以追溯到用芯片检测单细胞的基因表达。不过,新一代DNA测序才是单细胞基因组学的大功臣,这些技术的出现让单细胞基因组研究最终一飞冲天。  2012年7月,Nature Biote

现场同步直播 目击中国化学会第31届学术年会全过程

  分析测试百科网讯 2018年5月5日,中国化学会第31届学术年会在浙江省杭州市杭州国际博览中心盛大开幕。  在全国化学工作者的支持和积极参与下,中国化学会学术年会规模不断扩大,影响力不断提升,已经成为化学及相关领域门类最全、规模最大、水平最高的学术交流平台。中国化学会第 31 届学术 年会设

质谱——值得信赖的分析多面手

  分析测试百科网讯 2018年5月6日,中国化学会第31届学术年会质谱分析分会进展到第二天。与会专家学者热情不减,就质谱及其相关方面的知识展开了深入的交流学习。会上共有二十名专家做了精彩的报告。分会现场清华大学教授 张新荣  清华大学张新荣教授带来了题为“电喷雾质谱用于单细胞分析”的报告。张新荣指

单细胞基因组,一个新时代的到来

  单细胞基因组旨在通过组学方法研究单个细胞。近年来随着技术的发展,这一年轻的领域正在迅速成熟起来。单细胞基因组研究的前身可以追溯到用芯片检测单细胞的基因表达。不过,新一代DNA测序才是单细胞基因组学的大功臣,这些技术的出现让单细胞基因组研究最终一飞冲天。  2012年7月,Nature Biote

自动化的微流控芯片系统在单细胞中检测MicroRNA的异质性1

编辑推荐:Fluidigm 公司开发了一种在C1TM单细胞自动制备系统及BiomarkTM HD系统上检测单细胞miRNA表达谱的实验方案。此方案可以在小于24小时的时间内,平行处理96个单细胞,在一张GE 96.96芯片对每个单细胞分别检测多达96种miRNA。配套的SINGuLAR™ 2

《Nature》:新方法提高单细胞蛋白质组学质谱定量准确度

  单细胞蛋白质组学在蛋白丰度检测、转录修饰和翻译后修饰方面填补了单细胞转录组学的空白。单细胞蛋白质组学质谱(SCoPE-MS)是近年来兴起的一种定量分析多功能单细胞蛋白质组的方法,这种方法采用同位素标记和载体蛋白质组学来分析单个细胞【1】。同位素标记具有相同质量的化学标签,其中包含了独特的质量条码

“适用于单细胞内活性小分子物种检测的荧光分析仪”验收

  近日,国家自然科学基金委员会化学科学部在北京召开了2012年度“科学仪器基础研究专款”项目结题验收会。唐波教授作为我校获批的首个科学仪器基础研究专款项目“适用于单细胞内活性小分子物种检测的荧光分析仪”的负责人参加会议,并进行结题汇报。  该项目在以活性小分子为重点对象的新型荧光探针研究的基础上,

细胞研究新利器!岛津全自动CELLENT CM-MS发布

  分析测试百科网讯 2019年5月30日,岛津公司推出与清华大学化学系林金明教授合作研发的微流控芯片质谱联用细胞分析仪CELLENT CM-MS。该产品利用微流控芯片技术和质谱联用方法可进行细胞在线实时反应监测、药物筛查、代谢分析等研究。这一方法学上的创新,有望在高水平研究工作中发挥不可或缺的重要

中国农科院加工所与PerkinElmer共建实验室揭牌

  分析测试百科网讯 2017年6月30日,中国农业科学研究院农产品加工研究所与珀金埃尔默公司就共建的“单细胞检测与评价技术联合实验室”举办签约及揭牌活动。农加所、珀金埃尔默公司双方近20人参加了本次活动。中国农业科学院农产品加工研究所所长戴小枫、中国农业科学院农产品加工研究所农业部农产加工品质量监

金属基质增强飞行时间二次离子质谱用于单细胞脂质分析

  1引 言   单个细胞在结构、组成及代谢等方面存在差异,这种差异带来的影响在组织、器官等的功能上均有所体现。针对多个细胞的常规分析方法测得的结果通常无法保留这些个体差异信息,难以准确评估及预测细胞的生理学行为,因此,单细胞分析引起越来越多的关注[1]。单细胞分析的一个重要内容是单细胞脂

SCIENCE ADVANCES:单细胞Western揭秘胚胎发育异质性

  近日,美国加利福尼亚大学伯克利分校的科学家,利用单细胞Western技术在期刊SCIENCE ADVANCES(IF:12.804)发表文章:Assessing heterogeneity among single embryos and single blastomeres using ope

SCIENCE ADVANCES:单细胞Western揭秘胚胎发育异质性

  近日,美国加利福尼亚大学伯克利分校的科学家,利用单细胞Western技术在期刊SCIENCE ADVANCES(IF:12.804)发表文章:Assessing heterogeneity among single embryos and single blastomeres using ope

巨大应用前景:微流控技术 你知道多少?

  随着医疗行业逐渐向个性化医疗发展,临床检测诊断技术也在不断升级以适应市场需求。由于具有创新的解决方案和相对优势的应用成本,微流控吸引了越来越多的关注,其潜在的市场价值已经得到投资者的认可。  微流控芯片技术是生物芯片的基石,它通过多学科交叉将化学、生物学、医学等领域所涉及的样品预处理、生化反应、

微流控技术热点 你get到了多少?

  随着医疗行业逐渐向个性化医疗发展,临床检测诊断技术也在不断升级以适应市场需求。由于具有创新的解决方案和相对优势的应用成本,微流控吸引了越来越多的关注,其潜在的市场价值已经得到投资者的认可。  微流控芯片技术是生物芯片的基石,它通过多学科交叉将化学、生物学、医学等领域所涉及的样品预处理、生化反应、

当前微流控研究应用的这些热点,你get到了么

  随着医疗行业逐渐向个性化医疗发展,临床检测诊断技术也在不断升级以适应市场需求。由于具有创新的解决方案和相对优势的应用成本,微流控吸引了越来越多的关注,其潜在的市场价值已经得到投资者的认可。  微流控芯片技术是生物芯片的基石,它通过多学科交叉将化学、生物学、医学等领域所涉及的样品预处理、生化反应、

大连化物所微型分析仪器组在LIF及蛋白定量方面取得进展

  近日,大连化物所微型分析仪器研究组(105组)关亚风研究员和耿旭辉副研究员团队与大连理工大学物理学院王晓娜教授团队合作,在低成本高灵敏度激光诱导荧光检测器(LIF)研制及其在单细胞低丰度蛋白定量分析方面取得新进展。  定量检测单细胞表面和内部的低丰度蛋白,是在分子水平上研究生命过程的重要支撑技术

关注细胞分析!首届微纳流细胞分析学术报告会京召开

  分析测试百科网讯 2018年9月25日,首届微纳流细胞分析学术报告会在北京召开,百余位业内专家学者参与了此次报告会。本次大会为期两天,同期在清华大学化学系举办“第5期微流控芯片质谱联用细胞分析讲习会”。会议围绕着微流控及细胞研究领域的最新研究成果进行交流与探讨,关注微流控细胞分析基础研究与应用开

高效毛细管电泳仪分析的最高境界

  21世纪是生命科学大发展的世纪,人类基因组计划基本完成后,后基因组时代的基因组学和蛋白组学将快速发展,功能基因和蛋白质的分离检测对高效毛细管电泳仪(HPCE)提出更高的期望。  所有的化学反应集成在一块很小的芯片(Chip)上,建立有一个实验室功能的芯片是

科学家提倡乳腺癌单细胞诊断

   在近日发表在《癌症趋势》杂志上的一篇文章中,两位研究人员称,乳腺癌患者可能从其肿瘤内不同细胞的分子亚型中受益。虽然乳腺癌通常被视为一个整体进行治疗,但人们越来越对这样的理论达成共识,即肿瘤中的癌细胞可以有多个起源,并能对治疗做出不同反应。因此,作者主张开发更精确的诊断测试,

科学家提倡乳腺癌单细胞诊断

  “乳腺肿瘤是活动的目标,因为它们是‘多面手’。如果你使用能针对一种亚型的疗法,那只能杀死一种乳腺癌细胞,而其他类型的乳腺癌细胞亚型则在扩散。这样一来,治疗就失败了。”美国辛辛那提大学医学院癌症生物学家Jun  -lin Guan说。他与博士后研究员Syn Kok Yeo合作撰写了这篇文

CyTOF:以单细胞的视角重新审视生命

  【摘要】Fluidigm公司的CyTOF实验系统,不但使原来复杂的工作流程得到了简化,同时也将单细胞研究提升到了一个新的水平。基于此,Bendall和他 具有前瞻性思维的同事们已经获得了诸多新发现。他们的研究对象是人的免疫系统,相对于成熟的免疫系统,其发育的动态过程更加的复杂,他们正在利用 Cy

新型质谱技术让神经化学研究进入单细胞时代

世界上没有两片完全相同的叶子,细胞也是。然而,科学家们在进行现代生物学研究时,大多时候都考察的是细胞群体,而忽略了细胞异质性。 就拿神经细胞来说,大脑中有亿万个神经细胞,这些神经细胞在细胞形态,突触连结,细胞结构,电生理以及生理功能上具有高度的多样性。不同种类的神经细胞中,其基因组、蛋白组

中科院化学所启动两国家重大科学研究计划项目

近日,中科院化学所两项国家重大科学研究计划项目正式启动。 其中,以江雷研究员为首席科学家的“仿生智能纳米复合材料”项目,针对生命体系中信号识别、智能调控、驱动机制及结构效应,智能响应性分子体系制备的新方法及其在气/液/固三相界面中的响应机制,仿生智能纳米复合材料体系的设计构建和组装原理、多尺度协同

Nature发布单细胞基因组研究重要成果

  在第一个基因组范围的这类实验中,研究人员获得了对于小鼠胚胎如何首先从一个结构松散的细胞球开始转变为小的结构化实体的新认识。这项由欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)和维康信托基金会-MRC剑桥干细胞研究所领导的单细胞基因组学研究发布在《自然》(Nature)杂志上。  原肠胚形成(Gastr

基于单细胞测序绘制肿瘤微环境相关细胞代谢图谱

  肿瘤作为一个异常复杂的“生态系统”,不同类型的肿瘤细胞与非肿瘤细胞共同构成了肿瘤微环境。肿瘤存在肿瘤间异质性和肿瘤内异质性,可以说肿瘤内每种细胞都存在于不同的微环境中,每种细胞都可能有不同的代谢状态。由于异质性,肿瘤细胞会通过改变自身代谢模式(即“代谢重编程”)来适应不同的微环境,以满足其对能量

中外牛人眼中的生物技术前沿

  今年三月Nature Biotechnology就满二十了。该杂志近日推出周年特刊对生物技术领域的发展进行了回顾和展望,还邀请相关领域的五十名杰出研究者,分享他们眼中最激动人心的前沿研究以及最受期待的技术。  秦钧(Jun Qin):蛋白质组学最激动人心的前沿是,从穿刺活检样本鉴定一组蛋白,在3

一个完全不同的视野——单细胞研究最新进展

  由冷泉港亚洲主办的单细胞基因组学前沿学术会议(Frontiers in Single Cell Genomices)日前在苏州独墅湖会议酒店举行。美国科学院院士、斯坦福大学Stephen Quake教授作为本次会议的重要特邀嘉宾,在会上做了精彩演讲。  Quake教授谈到,近几年随着单细胞测序技

原来毛细管电泳仪有这么多应用

  你知道毛细管电泳仪的应用有哪些么?下面就让我们一起来了解一下吧。   1、DNA分析:   DNA分析包括碱基、核苷、核苷酸、寡核苷酸、引物、探针、单链DNA、双链DNA(DNA片段和PCR产物)和DNA序列分析。毛细管电泳仪通常用于碱基、核苷酸和简单的核苷酸等分析,以及较大

原来毛细管电泳仪有这么多应用

  你知道毛细管电泳仪的应用有哪些么?下面就让我们一起来了解一下吧。   1、DNA分析:   DNA分析包括碱基、核苷、核苷酸、寡核苷酸、引物、探针、单链DNA、双链DNA(DNA片段和PCR产物)和DNA序列分析。毛细管电泳仪通常用于碱基、核苷酸和简单的核苷酸等分析,以及较大

简化制样、提高灵敏度 看第四届全国样品制备会大咖报告

  2019年8月31日,第四届全国样品制备学术报告会在青岛银沙滩温德姆至尊酒店召开(相关报道:第4届全国样品制备学术会在青岛召开 关注新机遇新挑战)。开幕式后,中国科学院大连化学物理研究所研究员关亚风、中国科学院化学所研究员陈义、中山大学教授李攻科、东北大学教授王建华、清华大学化学系教授林金明、军