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Docking相关 A:新手想问一下，docking结果怎么判断小分子和蛋白产生了结合呀，形成了疏水键或氢键吗? B:打分越低越好，一般会设置一个已知的配体用来做参照，或者说用来检验参数是否合理。 A:我是选择了有配体的蛋白，处理了蛋白和分子后进行docking，得到这个结果。 B:只要比这个配体的打分低，那肯定就更有可能结合在那里呀! E:新手想问下，配体和蛋白对接的时候怎么确定对接盒子的位置和坐标? D:选中ligand。 B:根据前期文献调研，需要大体知道结合位点的位置。否则就得进行全局docking。 E:下载pdb的蛋白的原文献吗?全局docking感觉不准啊。 D:你得先知道ligand结合口袋。 B:不一定，比如一些突变研究会告诉你大体结合位点。 D:可以用氨基酸残基定位结合口袋。 （提示：更多干货见《如何确定对接口袋？》） F:我有......阅读全文
Docking相关 A:新手想问一下，docking结果怎么判断小分子和蛋白产生了结合呀，形成了疏水键或氢键吗? B:打分越低越好，一般会设置一个已知的配体用来做参照，或者说用来检验参数是否合理。 A:我是选择了有配体的蛋白，处理了蛋白和分子后进行docking，得到这个结果。
虚拟筛选相关A:问一下，贵公司有没有关于虚拟筛选的在线培训课程?小殷 :没有呢。不过今年平台会上线虚拟筛选功能，届时会针对此功能进行免费培训。A :哦哦，之前看过公众号的教程，哈哈哈，但是想系统学一下如何选择和使用分子库。殷赋科技 : 分子库大多使用商业库，主要看你们经
1A: 有没有人做过共价化合物的分子对接?B:薛定谔有，covalent docking。A:有没有用过，结果可有价值?B:我有替实验室师兄做过一次，挺大的天然产物去对接，全塞进腔里了，感觉有点不对劲。需要你去定义反应位点，以及化合物的反应基团及类型，比如迈克尔加成。殷赋科技:@A 你要针对少数化合
A: 有没有人做过共价化合物的分子对接? B:薛定谔有，covalent docking。 A:有没有用过，结果可有价值? B:我有替实验室师兄做过一次，挺大的天然产物去对接，全塞进腔里了，感觉有点不对劲。需要你去定义反应位点，以及化合物的反应基团及类型，比如迈克尔加成。
1 A:我设计的靶点化合物已经测完细胞活性，除了需要买蛋白回来测活性以外，还有没有什么替代的方法来验证活性? B:你可以用生物物理的方法做亲和力测试，或者生物化学的方法做酶的抑制率和IC50(如果你是要研究抑制剂的话)。 C:你要明确你的靶点，最好有这个靶点现有药物的构效关系
1A:我设计的靶点化合物已经测完细胞活性，除了需要买蛋白回来测活性以外，还有没有什么替代的方法来验证活性?B:你可以用生物物理的方法做亲和力测试，或者生物化学的方法做酶的抑制率和IC50(如果你是要研究抑制剂的话)。C:你要明确你的靶点，最好有这个靶点现有药物的构效关系或者药效团，然后再做结构改造，
我们可以设想在任何一个分子中都可以找到一个正电荷重心和一个负电荷重心。也就是说,对于任何一个分子,我们可以设想它的正电荷集中于一点,称为正电荷重心;同理,可以设想它的负电荷集中于一点,称为负电荷重心。如果分子中正电荷重心与负电荷重心相重合,该分子就是非极性分子;如果分子中正电荷重心与负电荷重心不重合
记者从华南农业大学获悉，该校理学院日前设计、合成了两个具有抗肿瘤活性的新型化合物。相关成果近日在线发表于英国皇家化学会期刊《道尔顿无机化学》。 据了解，关于金属配合物型抗肿瘤化合物的抗肿瘤活性及其作用机理方面的研究已经成为当今抗肿瘤药物研究开发的重要方向。其中，靶向DNA小沟特异碱基系列的金属
氧化钾 氧化钾化学式K2O，分子量94.2，密度2.32g/cm3。易潮解，易溶于水。为白色粉末，溶于水生成氢氧化钾，并放出大量热。在空气流中加热能被氧化成过氧化钾或超氧化钾，易吸收空气中的二氧化碳成为碳酸钾。 过氧化钾 过氧化钾，黄色无定形块状物，易潮解。加热分解，遇水放出氧气，遇酸
目前，碘的抗菌机理还没有研究清楚。二价碘是主要的抗微生物剂，它可以破坏维系蛋白质细胞的键，抑制蛋白质合成。通常，游离碘元素和次碘酸是有效破坏微生物作用的活性剂。用于杀菌的主要碘化合物是碘伏、碘酒以及水溶性碘溶液，这两种溶液通常用于皮肤杀菌。碘伏可作为设备表面的清洗剂、杀菌剂或皮肤防腐剂、，同时碘