Cell:广泛靶向代谢组技术揭示番茄代谢育种与驯化历史

继广泛靶向代谢组技术成果在NG、NC、PNAS发表后,2018年1月11日,《Cell》在线发表了题为“Rewiring of the fruit metabolome in tomato breeding”的研究论文。论文的通讯作者为迈维代谢首席科学家华中农业大学罗杰教授与中国农业科学院深圳农业基因组研究所、蔬菜花卉研究所黄三文研究员。这也是Cell杂志首次通过“代谢组+基因组+转录组”多组学研究番茄的育种。 番茄是世界第一大蔬菜作物,根据世界粮农组织统计,2014年全球番茄产值是962.8亿美元,在蔬菜和水果中居于首位。为了评估育种如何改变番茄代谢组,这篇文章从数百种番茄基因型中生成并分析了包含代谢组、基因组和转录组的数据集。综合结果表明了全球范围内培育的果实代谢物含量是如何改变。 为了了解红色番茄种群中代谢组的自然变化,选择442份材料进行代谢定性定量,分成PIM(31份s. pimpinellifolium),C......阅读全文

Cell:广泛靶向代谢组技术揭示番茄代谢育种与驯化历史

  继广泛靶向代谢组技术成果在NG、NC、PNAS发表后,2018年1月11日,《Cell》在线发表了题为“Rewiring of the fruit metabolome in tomato breeding”的研究论文。论文的通讯作者为迈维代谢首席科学家华中农业大学罗杰教授与中国农业科学院深圳农

LCMS8060助力广泛靶向代谢组学研究

mGWAS (metabolome  Genome-Wide Association  Study)指基于代谢组学的全基因组关联分析,是将代谢组数据作为表型,与基因型数据进行关联分析的一种方法。由于代谢组数据对表型鉴定更为精细,因此关联分析的精度比传统GWAS分析更高。 海南大学和华中农业大学的罗杰

非靶向代谢组学与靶向代谢组学的区别主要表现在哪些...

非靶向代谢组学与靶向代谢组学的区别主要表现在哪些方面?非靶向代谢组学已实现了对众多生物体系代谢物进行定性和相对定量分析,其结果的分析为各类医学研究以及药物开发提供重要参考数据。特别是那些比较好的非靶向代谢组学更是致力挖掘基因与细胞间更深层的关系,现在就非靶向代谢组学与靶向代谢组学的区别主要表现在哪些

合作成果丨靶向代谢组学

     本文内容非商业广告,仅供专业人士参考。关于岛津      岛津企业管理(中国)有限公司是(株)岛津制作所于1999年100%出资,在中国设立的现地法人公司,在中国全境拥有13个分公司,事业规模不断扩大。其下设有北京、上海、广州、沈阳、成都分析中心,并拥有覆盖全国30个省的销售代理     

代谢组学-|-肿瘤治疗之靶向葡萄糖代谢

  能量代谢重编程是肿瘤的十大特征之一,其中葡萄糖代谢异常是肿瘤代谢最突出的特征。在氧气充足的情况下,肿瘤细胞依然倾向于进行糖酵解,将葡萄糖代谢为乳酸。肿瘤细胞有氧糖酵解能力是正常细胞的20 ~ 30倍,为肿瘤代谢提供 大量能量和中间产物。因此,靶向糖酵解等异常环节的代谢酶是抗肿瘤治疗的重点。一些研

非靶向代谢组学更适宜选用哪些代谢组学通路数据库?

据相关介绍表明非靶向代谢组学的研究成果为众多的药物靶学、疾病机理研究以及疾病诊断提供有力依据。它还推动了免疫组化以及免疫荧光等技术的发展,事实上长期供应非靶向代谢组学更是由此迅速推进了研究步伐,现在就非靶向代谢组学更适宜选用哪些代谢组学通路数据库作简要阐述:1.HMDB非靶向代谢组学的代谢通路必须借

非靶向代谢组学中鉴定代谢产物适宜选用哪些分析方法

据相关科技要闻解读表明非靶向代谢组学已逐步成为研究生命活动的重要基础。它可高清呈现代谢产物的变化规律以及代谢种类,特别是那些评价高的非靶向代谢组学更是揭开了研究集体生命活动发生和发展的本质,现在就非靶向代谢组学中鉴定代谢产物更适宜选用哪些分析方法作简要阐述:1.主成分分析(PCA)非靶向代谢组学中鉴

概述番茄红素的广泛应用

  根据Minte公司的“全球新产品数据库”(GNPD),2003~2010年,全球共推出418种含有番茄红素的新产品。这些产品涵盖了食品、补充剂和化妆品领域,其中含番茄红素的补充剂是最受欢迎的产品。  保健品及运动补充剂  GNPD数据显示,全球共177种含有番茄红素的补充剂新产品。国家食品药品监

岛津超快速质谱助力靶向代谢组学研究

  靶向代谢组学中,通常需要同时检测多个目标组分,这对质谱数据的采集速度提出了很高的要求。   岛津超快速质谱(UFMS)拥有业内首屈一指采集速度。以LCMS-8050为例,其驻留时间(Dwell time≥0.8 ms)、切换时间(Pause time≥1 ms)、扫描速度(Scan s

岛津超快速质谱助力靶向代谢组学研究

靶向代谢组学中,通常需要同时检测多个目标组分,这对质谱数据的采集速度提出了很高的要求。  岛津超快速质谱(UFMS)拥有业内首屈一指采集速度。以LCMS-8050为例,其驻留时间(Dwell time≥0.8 ms)、切换时间(Pause time≥1 ms)、扫描速度(Scan speed≤3

聚焦科研热点,透视特色技术丨靶向代谢组学研究

        本文内容非商业广告,仅供专业人士参考。关于岛津      岛津企业管理(中国)有限公司是(株)岛津制作所于1999年100%出资,在中国设立的现地法人公司,在中国全境拥有13个分公司,事业规模不断扩大。其下设有北京、上海、广州、沈阳、成都分析中心,并拥有覆盖全国30个省的销售代理  

基于-Orbitrap-GCMS-的非靶向代谢组学(三)

使用 SIMCA 软件进行多变量统计分析。5将结论数据转化为更为直观的对数值,将 Y 类别设为各时间点,生成数据的偏最小二乘判别分析(PLS-DA)模型。该软件生成分数图和载荷图,以显示沿着主成分每个时间点的聚类和分离(图 6)情况。从本次分析可知,死亡后立即取样的样品(RAT_T0)聚集在

基于-Orbitrap-GCMS-的非靶向代谢组学(二)

   图 2. 大鼠肌肉组织样品代谢 0–3 天后的 GC-MS 色谱图(自上而下天数增加),X 轴为保留时间,Y 轴为强度(固定为1E9 计数)。例如,记下高亮区域中峰强度随时间的变化。 化合物发现阶段Q Exactive GC 系统获取了每个样品的全扫描色谱图(图 2)。该系统在较宽的动态范

HM350代谢组,靶向定量检测新标杆!

  产品介绍  HM350代谢组通过液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)技术对代谢物进行高通量的靶向代谢组学检测分析,可以同时检测350多个代谢物,每个代谢物均使用标准曲线进行绝对定量,并进行了方法学考察验证。覆盖各类重要的代谢物和核心代谢通路,可以充分反映代谢表型,其中220多个代谢物为肠道菌群相

基于-Orbitrap-GCMS-的非靶向代谢组学(一)

Stefan Weidt,2 Bogusia Pesko,2 Cristian Cojocariu,1 Paul Silcock,1 Richard J. Burchmore,2 and Karl Burgess21Thermo Fisher Scienti_c, Runcorn, UK2Glasg

番茄红素的代谢和排泄

目前对体内番茄红素的代谢产物还了解甚少,仅在人的血清、皮肤及乳汁中检测到2种氧化代谢物,即5,6-二羟基-5,6二氢番茄红素及1,5-二羟基-2,6-环氧番茄红素。据推测番茄红素可能首先氧化生成环氧化物,然后再被还原,生成5,6-二羟基-5,6-二氢番茄红素。未被吸收的番茄红素主要通过粪便排泄,分布

基于赛默飞-Orbitrap-GCMS的非靶向代谢组学

引言:代谢组学旨在表征和定量生物系统中的完整小分子代谢通路或 代谢物组。代谢物组包含小分子多元混合物(包括氨基酸、糖 和磷酸糖、生物胺和脂质)。非靶向代谢组学挑战性,因 为其要求定性和定量上百个不同种类化合物,而有关这些代谢 物的经验知识有限。因此,有必要使用一个既可以以非靶向的 方式灵敏检

基于赛默飞-Orbitrap-GCMS的非靶向代谢组学

  引言:代谢组学旨在表征和定量生物系统中的完整小分子代谢通路或 代谢物组。代谢物组包含小分子多元混合物(包括氨基酸、糖 和磷酸糖、生物胺和脂质)。非靶向代谢组学挑战性,因 为其要求定性和定量上百个不同种类化合物,而有关这些代谢 物的经验知识有限。因此,有必要使用一个既可以以非靶向的 方式灵敏检测特

《科学》:靶向大脑特殊代谢途径

  来自日本冈山大学的研究人员利用一种用于治疗癫痫的膳食操控系统,发现了一种能靶向大脑中特定代谢通路的药物,这种药物能抑制抗药的小鼠癫痫模型中的癫痫发作。这一研究成果公布在3月20日的Science杂志上,同期Science杂志上也发表了题为“Metabolic control of epileps

番茄基因组作图与分子育种

摘要:       The cultivated tomato, Lycopersicon esculentum, is the second most consumed vegetable worldwide and a well-studied crop speciesin terms of g

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?       代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

  什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?   代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

  什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?   代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

  什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?   代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

朱正江:基于离子淌度质谱的非靶向代谢组学研究

  分析测试百科网讯 2020年9月14日,由中国质谱学会(中国物理学会质谱分会)主办,分析测试百科网和中国质谱学会网承办的2020年中国质谱学会质谱网络研讨会(2020 CMSS)正式开幕。本届质谱网络研讨会正值中国质谱学会成立40周年,按报告内容涉及领域包括生命科学与组学、药物药理毒理分析、元素

一种新的具有高检测覆盖面的靶向代谢组学方法

  文章题目为SWATHtoMRM: Development of High-Coverage Targeted Metabolomics Method Using SWATH Technology for Biomarker Discovery,是由中科院生物与化学交叉研究中心的朱正江研究员课题组

番茄红素的代谢和排泄的相关介绍

  目前对体内番茄红素的代谢产物还了解甚少,仅在人的血清、皮肤及乳汁中检测到2种氧化代谢物,即5,6-二羟基-5,6二氢番茄红素及1,5-二羟基-2,6-环氧番茄红素。据推测番茄红素可能首先氧化生成环氧化物,然后再被还原,生成5,6-二羟基-5,6-二氢番茄红素。未被吸收的番茄红素主要通过粪便排泄,

代谢组服务介绍​​

  代谢组学是继基因组学和蛋白质组学之后新近发展起来的一门学科,是系统生物学的重要组成部分。基因组学和蛋白质组学分别从基因和蛋白质层面探寻生命的活动,而实际上细胞内许多生命活动是与代谢物相关的,如细胞信号(cell signaling)、能量传递等都是受代谢物调控的。代谢组学正是研究代谢物——在某一

我国构建世界首个番茄超泛基因组,或大幅提升番茄产量

近日,由新疆农科院加工番茄生物育种创新团队牵头,联合中国农业科学院、新疆大学、新疆农业大学等多家单位,成功构建了国际首个番茄超泛基因组。相关科研成果已于4月6日以《超泛基因组研究揭示野生和栽培番茄物种基因组和结构变异多样性》为题在线发表于国际学术期刊《自然·遗传》。超泛基因组是指在一个基因组序列内涵

许国旺:拟靶向代谢组学—让质谱更好地服务于临床研究

“精准分析”我们的成功故事系列——写在前面的话  “精准分析•量化释能”——我们的成功故事系列栏目,是SCIEX帮助科学家们分享有意义的科学发现和研究成果的科普平台。我们期待让更多的人感受到科学和“质谱”的力量,“让质谱改变每个人的生活”始终是SCIEX最美好的愿景。SCIEX非常荣幸能够参与到这一