基于OrbitrapGCMS的非靶向代谢组学（二）
图 2. 大鼠肌肉组织样品代谢 0–3 天后的 GC-MS 色谱图（自上而下天数增加），X 轴为保留时间，Y 轴为强度（固定为1E9 计数）。例如，记下高亮区域中峰强度随时间的变化。 化合物发现阶段Q Exactive GC 系统获取了每个样品的全扫描色谱图（图 2）。该系统在较宽的动态范围内采集不同浓度水平代谢物的全扫描色谱图，不会丢失任何精确质量数信息。使用自动峰选取（结合使用 XCMS 和 MzMatch.R）功能提取每个 EI 峰簇。在该步骤中，已检测到 1193 个明显峰簇并进行了初步定量，强度阈值为 100,000。已解卷积峰簇的示例见图 3。 图 3. 已解卷积峰簇被推断识别为酪氨酸。 定量阶段首先使用单变量统计方法分析结果。使用 Student's t 检验对比每个时间点和时间零点。将每个代谢物的平均 T0 强度设为......阅读全文
基于－Orbitrap－GCMS－的非靶向代谢组学（二）
图 2. 大鼠肌肉组织样品代谢 0–3 天后的 GC-MS 色谱图（自上而下天数增加），X 轴为保留时间，Y 轴为强度（固定为1E9 计数）。例如，记下高亮区域中峰强度随时间的变化。 化合物发现阶段Q Exactive GC 系统获取了每个样品的全扫描色谱图（图 2）。该系统在较宽的动态范
基于－Orbitrap－GCMS－的非靶向代谢组学（三）
使用 SIMCA 软件进行多变量统计分析。5将结论数据转化为更为直观的对数值，将 Y 类别设为各时间点，生成数据的偏最小二乘判别分析（PLS-DA）模型。该软件生成分数图和载荷图，以显示沿着主成分每个时间点的聚类和分离（图 6）情况。从本次分析可知，死亡后立即取样的样品（RAT_T0）聚集在
基于－Orbitrap－GCMS－的非靶向代谢组学（一）
Stefan Weidt,2 Bogusia Pesko,2 Cristian Cojocariu,1 Paul Silcock,1 Richard J. Burchmore,2 and Karl Burgess21Thermo Fisher Scienti_c, Runcorn, UK2Glasg
基于赛默飞－Orbitrap－GCMS的非靶向代谢组学
引言：代谢组学旨在表征和定量生物系统中的完整小分子代谢通路或 代谢物组。代谢物组包含小分子多元混合物（包括氨基酸、糖 和磷酸糖、生物胺和脂质）。非靶向代谢组学挑战性，因 为其要求定性和定量上百个不同种类化合物，而有关这些代谢 物的经验知识有限。因此，有必要使用一个既可以以非靶向的 方式灵敏检
基于赛默飞－Orbitrap－GCMS的非靶向代谢组学
引言：代谢组学旨在表征和定量生物系统中的完整小分子代谢通路或 代谢物组。代谢物组包含小分子多元混合物（包括氨基酸、糖 和磷酸糖、生物胺和脂质）。非靶向代谢组学挑战性，因 为其要求定性和定量上百个不同种类化合物，而有关这些代谢 物的经验知识有限。因此，有必要使用一个既可以以非靶向的 方式灵敏检测特
非靶向代谢组学与靶向代谢组学的区别主要表现在哪些...
非靶向代谢组学与靶向代谢组学的区别主要表现在哪些方面?非靶向代谢组学已实现了对众多生物体系代谢物进行定性和相对定量分析，其结果的分析为各类医学研究以及药物开发提供重要参考数据。特别是那些比较好的非靶向代谢组学更是致力挖掘基因与细胞间更深层的关系，现在就非靶向代谢组学与靶向代谢组学的区别主要表现在哪些
朱正江：基于离子淌度质谱的非靶向代谢组学研究
分析测试百科网讯 2020年9月14日，由中国质谱学会（中国物理学会质谱分会）主办，分析测试百科网和中国质谱学会网承办的2020年中国质谱学会质谱网络研讨会（2020 CMSS）正式开幕。本届质谱网络研讨会正值中国质谱学会成立40周年，按报告内容涉及领域包括生命科学与组学、药物药理毒理分析、元素
非靶向代谢组学更适宜选用哪些代谢组学通路数据库？
据相关介绍表明非靶向代谢组学的研究成果为众多的药物靶学、疾病机理研究以及疾病诊断提供有力依据。它还推动了免疫组化以及免疫荧光等技术的发展，事实上长期供应非靶向代谢组学更是由此迅速推进了研究步伐，现在就非靶向代谢组学更适宜选用哪些代谢组学通路数据库作简要阐述：1.HMDB非靶向代谢组学的代谢通路必须借
非靶向代谢组学中鉴定代谢产物适宜选用哪些分析方法
据相关科技要闻解读表明非靶向代谢组学已逐步成为研究生命活动的重要基础。它可高清呈现代谢产物的变化规律以及代谢种类，特别是那些评价高的非靶向代谢组学更是揭开了研究集体生命活动发生和发展的本质，现在就非靶向代谢组学中鉴定代谢产物更适宜选用哪些分析方法作简要阐述：1.主成分分析（PCA）非靶向代谢组学中鉴
GCMS－HRAM－代谢组学数据库－探索代谢组学的奥秘
盐城4公分厚外墙岩棉板报价 岩棉制品是以精选的优质玄武岩为主要原料、经冲天炉熔化后，采用的四辊离心制棉工序，将玄武岩高温熔体甩扭成4-7μm的非连续性纤维，再在岩棉纤维中加入一定量的粘结剂、防尘油、憎水剂，经过沉降、固化、切割等工艺，根据不同用途制成棉毡、半硬板、保温带、管壳等系列产品。
合作成果丨靶向代谢组学
本文内容非商业广告，仅供专业人士参考。关于岛津 岛津企业管理（中国）有限公司是（株）岛津制作所于1999年100%出资，在中国设立的现地法人公司，在中国全境拥有13个分公司，事业规模不断扩大。其下设有北京、上海、广州、沈阳、成都分析中心，并拥有覆盖全国30个省的销售代理
赛默飞Orbitrap－GCMS系统增加3项新功能
分析测试百科网讯 近日，赛默飞宣布为Orbitrap GC-MS系统更新了高分辨率精确质量（HRAM）GC-MS的新功能，现在可以为用户提供跨越代谢组学、食品安全、环境、制药和毒理学应用的高精确度的数据。 基于赛默飞Q Exactive GC Orbitrap和Exactive GC Orbi
代谢组学－|－肿瘤治疗之靶向葡萄糖代谢
能量代谢重编程是肿瘤的十大特征之一，其中葡萄糖代谢异常是肿瘤代谢最突出的特征。在氧气充足的情况下，肿瘤细胞依然倾向于进行糖酵解，将葡萄糖代谢为乳酸。肿瘤细胞有氧糖酵解能力是正常细胞的20 ～ 30倍，为肿瘤代谢提供 大量能量和中间产物。因此，靶向糖酵解等异常环节的代谢酶是抗肿瘤治疗的重点。一些研
LCMS8060助力广泛靶向代谢组学研究
mGWAS (metabolome Genome-Wide Association Study)指基于代谢组学的全基因组关联分析，是将代谢组数据作为表型，与基因型数据进行关联分析的一种方法。由于代谢组数据对表型鉴定更为精细，因此关联分析的精度比传统GWAS分析更高。 海南大学和华中农业大学的罗杰
高分辨质谱Orbitrap直击靶标代谢组学新热点
在生命科学奇妙世界里，基因、核酸、蛋白和小分子代谢产物构成了细胞生命活动的基本要素，以这些物质为基础的诸多组学技术的发展，推动着生命科学研究不断向前。 基因-蛋白-代谢-表型之间的互动成为生命科学研究中研究的范式⁽¹⁾，研究成果可谓精妙纷呈、大放异彩。 图1：基因-蛋白-代谢-表型之间的互动成为生命
基于－Orbitrap－技术的全新GCMS具有超高分辨率和亚...（二）
获得精确而稳定的质量数可以大大提高化合物识别和元素组分归属的可靠性。如果测量质量数的精度很高，则可归属到已知化合物的分子式数量会明显减少。图 2 中显示了精确质量数测量和候选分子式数量之间的关系。其中，一个 50 ppm 质量数精度窗口生成（从预选的 C、H、O、N 和 Cl 数量）147
岛津超快速质谱助力靶向代谢组学研究
靶向代谢组学中，通常需要同时检测多个目标组分，这对质谱数据的采集速度提出了很高的要求。 岛津超快速质谱（UFMS）拥有业内首屈一指采集速度。以LCMS-8050为例，其驻留时间（Dwell time≥0.8 ms）、切换时间（Pause time≥1 ms）、扫描速度（Scan s
岛津超快速质谱助力靶向代谢组学研究
靶向代谢组学中，通常需要同时检测多个目标组分，这对质谱数据的采集速度提出了很高的要求。 岛津超快速质谱（UFMS）拥有业内首屈一指采集速度。以LCMS-8050为例，其驻留时间（Dwell time≥0.8 ms）、切换时间（Pause time≥1 ms）、扫描速度（Scan speed≤3
代谢组学、脂质组学在病毒研究中的应用（二）
案例三基于代谢组学技术挖掘病毒感染宿主后代谢动态变化情况2019年发表在Viruses杂志上的另一篇文章，采用基于Orbitrap 的非靶标和靶标代谢组学方式研究了麻痹病毒（Cricket paralysis virus, CrPV）感染昆虫Bm5细胞后宿主代谢的动态变化情况。研究人员发现，CrPV
代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍
什么是代谢组学？代谢组学是用来解决什么问题的？ 代谢组学（Metabonomics/Metabolomics）是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科，是研究关于生物体被扰动后（如基因的改变或环境变化后）其代谢产物（内源性代谢物质）种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生
代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍
什么是代谢组学？代谢组学是用来解决什么问题的？ 代谢组学（Metabonomics/Metabolomics）是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科，是研究关于生物体被扰动后（如基因的改变或环境变化后）其代谢产物（内源性代谢物质）种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生
代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍
什么是代谢组学？代谢组学是用来解决什么问题的？ 代谢组学（Metabonomics/Metabolomics）是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科，是研究关于生物体被扰动后（如基因的改变或环境变化后）其代谢产物（内源性代谢物质）种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生
代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍
什么是代谢组学？代谢组学是用来解决什么问题的？ 代谢组学（Metabonomics/Metabolomics）是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科，是研究关于生物体被扰动后（如基因的改变或环境变化后）其代谢产物（内源性代谢物质）种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生
将领域知识引入神经网络，MIT团队用光谱Transformer研究非靶向代谢组学图谱
代谢组学研究已经确定了介导细胞信号传导、竞争和疾病病理学的小分子，部分原因是大规模社区努力测量数千种代谢物标准品的串联质谱。然而，在临床样品中观察到的大多数光谱不能与已知结构明确匹配。令人惊讶的是，用于阐明小分子结构的深度学习方法无法与经典统计方法相媲美，科学家认为这可能是由于缺乏纳入当前神经网络架
首篇梅毒患者血清的非靶代谢组学研究发表
梅毒是世界范围内一种常见的性传播疾病，致病病原体是梅毒螺旋体，2017年，中国疾控中心报告梅毒新发病例47.5860万例，死亡45人，在所有乙类传染病中排名第三位。今天小编要为各位老师解读一篇APT客户厦门大学附属中山医院杨天赐课题组最近发表的文献，是首篇对梅毒患者进行代谢组学研究的文章，并筛选到了
大咖面对面丨代谢组学前景广阔－质谱构建核心平台
临床质谱近年来发展迅猛，许多诊断标志物都是小分子代谢物，表明代谢组学从研究到临床转化的路径更快；与此同时，代谢组学近年来在生命医学、植物学、暴露组学等研究中发挥了越来越重要的作用，几乎每一项多组学研究的卓越成果都离不开代谢组学。在成为热点的同时，代谢组学研究目前还存在数据库不够丰富、代谢流方法不
代谢组学的研究方法
代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似，通常有两种方法。一种方法称作代谢物指纹分析 （metabolomic fingerprinting），采用液相色谱-质谱联用（LC-MS）的方法，比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。从本质上来说，代谢指纹分析涉及比较不同个体中代谢产物的质谱
代谢组学的研究方法
代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似，通常有两种方法。一种方法称作代谢物指纹分析 （metabolomic fingerprinting），采用液相色谱-质谱联用（LC-MS）的方法，比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。从本质上来说，代谢指纹分析涉及比较不同个体中代谢产物的质谱
基于－Orbitrap－技术的全新GCMS具有超高分辨率和亚...（四）
在复杂基质中，基质组分很可能干扰极低浓度的目标分析物，评估Q Exactive GC 系统的质量数精度性能就很有必要。在下面例子中，测量水果和蔬菜婴儿食品样品中的敌敌畏（图 7），可获得亚 ppm 级的质量数精度。就信号和质量数精度而言，这些数据证实了很宽的质动态范围。 质量数范围内的质量
基于－Orbitrap－技术的全新GCMS具有超高分辨率和亚...（三）
当重复进样加标 5 ng/g 农残化合物的婴儿食品样品时，可观察到测量数据具有稳定的亚 ppm 质量数精度。这个结果表明，当日常分析复杂样品如农残提取物时，系统出色稳定性起到关键作用。 图 6. 加标 5 ng/g 农残化合物的婴儿食品样品的 14 次重复进样的质量数精度 线性和“质谱内”动态范围