迄今为止,科学家们已经发现了上百种RNA修饰类型,但是其中大多数在mRNA和调控非编码RNAs中还是很罕见的。近期的一些研究发现指出,这些修饰中有至少有一些含量丰富,且保守性强。本期Cell杂志以此为中心,介绍了两种RNA修饰方式的分子机制,和生物学功能。
这两种RNA修饰方式分别是N6-甲基腺苷化修饰(N6-methyladenosine, m6A),以及尿苷化修饰(uridylation,U-tail)。前者也就是第5个碱基——N6-甲基腺苷(m6A)。
这种修饰方式是在2012年,由来自康奈尔大学维尔医学院的研究人员发现的,当时研究人员发现长期被视作是生成蛋白质的简单蓝图的信使RNA(mRNA),它的一个碱基腺嘌呤上往往会被添加一个甲基(methyl group)而发生化学修饰。过去mRNA被认为只包含4个碱基,这一研究表明第5个碱基——N6-甲基腺苷(m6A)遍布转录组。研究人员发现高达20%的人类mRNA常规发生了甲基化。超过5000种不同的mRNA分子包含m6A,这意味着这种修饰有可能广泛的影响了基因的表达模式。
而且更重要的是,研究人员发现m6A存在于与人类疾病相关的基因编码的大量mRNAs中,包括癌症和几种脑疾病例如自闭症、阿尔茨海默氏症和精神分裂症,这表明这种修饰可以作为疾病治疗的靶标。
此后陆续的一些研究表明这种RNA修饰具有许多重要的功能,如今年1月,研究人员发现这种修饰的一个主要功能是控制RNA的寿命和降解,这一过程对于健康细胞发育极为重要。
RNA寿命延长将会导致生成更多的蛋白。如果这一去甲基化机制存在缺陷,就有可能大大地影响你的细胞蛋白质水平。其中的一些蛋白质有可能对于人类机体的能量调控至关重要,影响了肥胖。这一研究揭示了mRNA上的m6A修饰如何影响mRNA的半衰期转而调控细胞蛋白质数量的机制。
近来还有研究者发现,通过减少m6A甲基化酶来抑制甲基化会扰乱生物钟,使生物钟周期延长。而过表达这种甲基化酶会使周期缩短。研究显示,当m6A甲基化被抑制时,细胞核的mRNA输出受到延迟。此外细胞中还出现了广泛的mRNA稳定化,特别是与生物钟有关的蛋白编码mRNA。
而另外一种修饰方式:尿苷化(uridylation,U-tail)也具有一些特殊作用。2012年,研究人员发现了miRNAs生物形成途径中的一名新成员:尿苷化转移酶TUT7/4/2,并与之前研究成果结合,证明了尿苷化的双重作用。
在这篇文章中,研究人员发现与标准的pre-miRNAs(group I,一类)不同,二类(group II)pre-miRNAs需要Drosha酶加工出一种更短的3’突出端——仅1 nt长,因此需要Dicer酶加工过程的3'端单尿苷化(mono-uridylation)。而且值得注意到是,对于癌症发生发展具有重要意义的let-7和miR-105两种miRNAs,其大部分都属于二类pre-miRNAs。
这些研究结果均表明了尿苷化的双重作用,并指出 TUT7/4/2参与了miRNAs生物形成途径,是这一途径中的一名新成员。
为了能完成精确沉默各种不同mRNA的任务,生物机体需要通过加工过程和成熟后处理等多种微调机制,确保其稳定性和有效性。了解RNA的修饰过程,将有助于科学家们解析这一作用机制,以及这一机制出现问题后,如果进行弥补。
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