DNA单链断裂检测技术:单细胞凝胶电泳(SCGE)检测原理和操作步


放回玻片托盘中待琼脂糖凝固。
(3)裂解:
移开盖玻片,将载玻片缓慢浸入新配制的冰凉的细胞裂解液中,置于4℃冷藏至少1h。细胞可在裂解液中至少保存4周,但时间太长可能会引起缓冲液沉淀。
碱性细胞裂解液配制(每1000ml)方法:
a、2.5mol/L NaCl 146.1g;
b、100mmol/L EDTA 37.2g;
c、10mmol/L Tris 1.2g;
d、用约12g NaOH 调至pH值为10;
e、1%肌氨酸钠10g;
f、用去离子水定容至890ml,过滤除菌,为储备液,室温保存;
g、加新配1%Triton X-100和10%DMSO为应用液,在应用前冷藏30-60min。
中性细胞裂解液配制方法:
a、2mol/L NaCl 117g;
b、30mmol/L EDTA 12.4g;
c、10mmol/L Tris 1.2g;
d、用约12g HCl 调至pH值为8.2-8.5;
e、1%肌氨酸钠10g;
f、用去离子水定容至890ml,过滤除菌,为储备液,室温保存;
g、加新配1%Triton X-100和10%DMSO为应用液,在应用前冷藏30-60min。
(4)电泳:
将冷藏1h后的载玻片从细胞消化液中轻轻取出,并列置于水平凝胶电泳槽中阳极端附近,载玻片间不留空隙。
向电泳槽中加入新配制的电泳缓冲液应用液,使液面完全覆盖载玻片。应防止在琼脂糖上产生气泡。
将载玻片在碱性缓冲液中放置20-60min,让DNA在电泳前解螺旋和产生碱性易损性损伤。时间越长,损伤表现得越充分。
在室温下,置电压25V,调整电泳槽中缓冲液液面高度使电流为300mA,根据研究目的会对照样品的迁移情况,电泳10-40min。不同类型的细胞电泳时间不同。
碱性电泳液应用液(1000ml):
a、300mmol/L NaOH 12g;
b、1mmol、L EDTA 372.24g
c、称取上述试剂后,用1000ml去离子水融解(pH>13)备用,注意在临用前现配。
中性电泳缓冲液应用液(0.5%TBE):
a、2mmol/L EDTA;
b、90mmol/L Tris;
c、90mmol/L 硼酸;
d、调pH 8.2-8.5,注意在临用前现配。
(5)中和:
切断电源,将载玻片置染缸,用中和缓冲液浸洗,每次5min。晾干,重复2次。目的是防止碱液和去污剂干扰溴化乙锭染色。
中和缓冲液(0.4mol/L Tris):
a、Tris 48.5g;
b、加去离子水定容至1000ml;
c、用>10mol/L HCl调pH值至7.5,室温储存。
(6)溴化乙锭染色:
呈中性后,晾干载玻片,将玻片用0.5ulEB应用液染色,盖上新盖玻片。
溴化乙锭(EB)染液(10 x储备液,即20ug/ml);
a、溴化乙锭 1mg;
b、去离子水 50ml;
c、室温贮存,临用时见储备液稀释10倍。
EB为诱变剂,小心操作。
注意:以上(1)-(3)步应在黄色、红色灯光下或暗处进行,以免额外DNA损伤,载玻片可在潮湿环境中保存72h,但最好在24h内读片。
(7)镜检姐结果评价:
EB染色后的DNA样品应尽快在荧光显微镜下观察。未受损细胞表现为一圆形荧光核心,即彗星头部,没有尾巴。而受损细胞则有彗星尾从核中伸向阳极,形成一个亮的荧光头部和尾部。用目镜测微尺测定或拍摄X 400黑白显微照片再作测定。每隔样品中至少随机挑选25个细胞测定。测定受试组合对照组核DNA直径和DNA迁移长度,再用透明尺测量彗星迁移部分的面积。也可测其斜度和峭度,因不受试物引起的彗星形状可有差异。
统计时,比较受试组和对照组之间的彗星尾长,或计算受试组(T)与对照组(C)彗星尾长之差(T-C)即T-C<10um(一);10-20um(±);20-40um(±);>40um(++).另外,也可计算各族受损细胞率,即彗星尾长<35um为未损伤;35-70um为中度损伤;>70um为重度损伤,此值在不同细胞稍有差异。

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