想象一下如果有一份击中某种特别致命癌症形式的最佳药物靶点完整目录,或是针对所有主要癌症类型和亚型的最佳药物靶点主目录会怎样。来自冷泉港实验室的科学家们在今天的《自然生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上发布了编写这样的目录的一种方法,他们称利用了称作为CRISPR-Cas9的革命性基因编辑技术(延伸阅读:华南农大Cell子刊发表CRISPR/Cas9研究新文章 )。
CRISPR使得生物学家们能够以从所未有的精度(逐个DNA碱基)轻松地操控细胞的遗传物质。冷泉港实验室助理教授Chris Vakoc博士和实验室的博士生Junwei Shi,想到了如何利用CRISPR的精细能力来完成他们以及全球那么多实验室竞相争夺的一项任务:找到癌细胞中的一些结合口袋——当这些结合口袋受到阻断时可以阻止癌细胞增殖,并导致它们死亡。
几年前Vakoc利用现有最好的技术找到了一个这样的结合口袋——叫做BRD4的蛋白,当用现有的一种药物JQ1阻断BRD4时可给急性髓系白血病(AML)细胞造成严重打击。这一药物现已进入人类临床试验。
Vakoc说:“这一经历让我们开始思考,我们是否可以通过一种方法一次性检测特定癌细胞类型中数百或数千的具有药物可及结合口袋的蛋白,在一次实验中发现更多的BRD4s?”
简洁的回答是:的确可以如此。这篇论文为他们设计的一种方法提供了原理证明。在白血病细胞中,他们采用这种基于CRISPR-Cas9的方法调查了大约200个潜在靶点,成功鉴别出了6个已知且得到了制药科学家们验证的靶点,其中大多数都是当前药物研发工作的焦点;并发现了另外19个以往从未识别出的靶点。Vakoc说:“这只是单个证明。更广泛地说,我们提供了一种方法来全面鉴别跨越多种癌症类型癌细胞中特异的脆弱点。”
被CRISPR所迷住,博士生Junwei Shi将去年大部分的时间都放在了设计一种方法,利用它来快速及准确地鉴别最佳白血病药物靶点上。这一概念并不难解释。它始于一个观点:基因为细胞提供了构建蛋白质的密码。
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