Nature2015最佳评论文章：汤富酬、文路、马晓娅入选

　　Nature杂志近日展开了一年一度的年终大盘点，评出了2015年的最佳评论文章。本次盘点选入了三名中国学者的两篇文章，他们分别是北京大学的研究员汤富酬和研究员文路，以及云南大学的研究员马晓娅。

　　汤富酬和文路在这篇文章中重点介绍了Grün等人开发的RaceID的算法，该算法能够在复杂的细胞混合物中有效鉴定稀有细胞类型。

　　Grün等人从体外培养的小鼠“迷你肠”获得238个细胞，并对它们进行了单细胞转录组测序。然而，标准聚类算法无法鉴别稀有细胞（分泌细胞谱系）中的亚类。他们为此开发了一种聪明的算法，RaceID。

　　RaceID假定给定细胞类型强力表达一些特异性的“异常值”基因。只要仔细排除技术和生物学噪音，就可以从测序数据中鉴定到这些基因。Grün等人通过RaceID鉴定了新的分泌细胞亚型，并且在体内验证了它们的存在。

　　汤富酬和文路在文章中指出，通过研究者们的不懈努力下，不久的将来我们将能绘制完整的人体细胞谱系图。（下接：Nature盘点本年度最佳评论文章）

　　作者简介：

　　汤富酬研究员 2003年在北京大学获理学博士学位，2004－2010年，英国剑桥大学Gurdon研究所博士后，2010年至今在北京大学生物动态光学成像中心任研究员。主要围绕哺乳动物早期胚胎发育，研究胚胎干细胞和上胚层干细胞的自我更新能力和多能性调控的分子机理，特别是表观遗传学调控机理，以及相关的原始生殖细胞发育过程中的表观遗传学重编程机理。利用本实验室发展的单细胞microRNA表达谱分析技术、基于深度测序的单细胞数字转录组分析技术、单细胞基因分型技术、以及染色体免疫共沉淀-深度测序技术、小鼠胚胎显微操作技术深入分析多能性干细胞的动态基因表达网络和表观遗传学调控。

　　文路 助理研究员 理学博士，中南大学医学遗传学国家重点实验室，2004，遗传学；医学硕士，中南大学湘雅医学院，2000，神经外科学；医学学士，中南大学湘雅医学院，2000，临床医学（七年制本硕连读）。工作经历：2005-2008，北京大学生命科学学院，博士后；2009-2010，中山大学生命科学学院，讲师；2011-现在，北京大学生物动态光学成像中心，助理研究员