NatureGenetics：翟巍巍等描绘肺腺癌间种族差异​

　　肺癌是人类癌症里的第一大杀手。全世界每年有接近200万人患肺癌。特别引起学界注意的是肺癌在东亚和高加索人两个族裔之间有着非常大的差异。以肺腺癌为例，东亚每年有更高比例的非吸烟女性患肺癌。其次，在东亚肺腺癌里，40-60%的病人带有表皮细胞生长因子受体（EGFR，一个重要的癌基因）的基因突变，而在高加索人里，只有10-15%患者带有该基因突变。EGFR是癌症靶向治疗里的最为重要的靶标基因之一。理解肺癌种族差异的全貌并探索其起源进化规律是领域高度关注的科学问题。

　　2020年2月3日，来自中国科学院动物研究所的翟巍巍研究员，德国科隆大学医院的Axel Hillmer, 新加坡基因组研究所及新加坡癌症中心的等多家单位的研究人员一起合作在Nature Genetics杂志上发表文章Genomic landscape of lung adenocarcinoma in EastAsians，收集了来自新加坡的210例全外显子组及181例全转录组测序数据，并整合了已发表的92例来自中国的全外显组测序数据，构成了目前东亚最大的肺腺癌基因组数据集。研究人员首先系统地刻画了东亚肺腺癌的基因组全景，并通过和来自美国癌症基因组图谱计划（TCGA）的数据进行比较，刻画了东亚和高加索人的肺腺癌的基因组差别。

　　在该东亚肺腺癌数据集中，研究人员鉴定出27个驱动基因，其中7个为首次被报道（PARP4，EPRS，LYST，NCOR2，PBRM1，RASA1及ZMYM2）。除了EGFR的突变率差异以外，研究人员发现东亚肺腺癌的整体突变程度比高加索肺腺癌低，表现为较低的肿瘤突变负荷（TMB），驱动基因突变，以及拷贝数突变。此差异在两个人群的吸烟者之中更为显著。在转录组的比较中，研究人员发现了一个东亚特异的炎症亚型(命名为“终端呼吸单元炎症亚型”，Terminal Respiratory Unit-Inflammatory subtype，图一)。值得关注的是，该终端呼吸单元炎症亚型(TRU-I)具有相当高的免疫活性以及较高的免疫治疗与应答指标。这一发现或将为东亚肺腺癌的免疫治疗提供新的思路。

图一：研究人员在东亚肺腺癌里发现了一个东亚特异的“终端呼吸单元炎症亚型”(Terminal Respiratory Unit-Inflammatory subtype,TRU-I)，有别于在高加索人群中发现的三种亚型。

　　最后，在整合性分析中，研究人员发现驱动基因等分子特征与临床指标均可独立地预测病人总生存期。而不同预后模型的预测准确率在东亚人群中皆显著优于高加索人群。研究人员推测这可能与东亚的肺腺癌的基因组突变较少，基因组稳定性较高有关。这一发现提示在东亚人群中，癌症基因组的测序将更易于为临床决策提供参考。该研究也为东亚肺腺癌的精准治疗提供了重要的科学观察和理论依据。

图二：基于不同特征的预后模型在两个族裔中的预测准确率，及不同模型在不同基因组稳定性病人组(高和低倍性）样本中的预测准确率。