上海生科院开发构建因果关系的分子调控网络模型和方法
2014年12月24日,国际学术期刊Nuclear Acid Research 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈洛南研究组的研究成果,开发基于小样本构建因果关系的分子调控网络模型和方法。 整合高通量生物学信息,构建分子生物网络,从而在系统的水准上揭示生物分子的相互作用机理及因果调控规律,是后基因组时代所面临的重要计算生物学问题之一。统计学上对于具有n个基因的调控网络的因果关系的精确推断,要求n-2阶条件相关性的评估(高斯噪声),即需要n个以上独立生物样本数据。对于大多哺乳动物,n远大于10000基因,因此在同一条件下采集这么多的生物样本构建分子调控网络或建立因果关系不现实。 根据基因调控网络的特性(如稀疏性等),利用信息熵的非线性测度的性质及条件相关性阶数的一致性特性,研究组建立了基于小样本推断基因调控网络的新模型和算法(CMI-PCA:通路一致性分析法)。该方法主要通过评估各基因之间的......阅读全文
上海生科院开发构建因果关系的分子调控网络模型和方法
2014年12月24日,国际学术期刊Nuclear Acid Research 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈洛南研究组的研究成果,开发基于小样本构建因果关系的分子调控网络模型和方法。 整合高通量生物学信息,构建分子生物网络,从而在系统的水准上揭示生物分子的
首个基于全基因组测序技术食源性疾病分子溯源网络建成
食源性疾病是全球范围内重要的食品安全问题,早期发现和查明病因是防控食源性疾病的重要保证。随着新一代基因组测序技术的发展,基于全基因组测序(WGS)的分子分型技术在食源性疾病聚集性病例识别和暴发溯源调查中已显示出极大的应用价值和发展潜力,逐渐成为国际研究热点,欧美相关国家已相继开展研究和布局。在国
生物大分子色谱仪种类
生物大分子色谱仪种类有多种。1、按功能可分:分析型生物大分子色谱仪和制备型生物大分子色谱仪。2、按灵敏性可分:生物大分子微量色谱仪和生物大分子痕量色谱仪。3、按应用范围可分:专用型生物大分子色谱仪和通用型生物大分子色谱仪。4、按固定相性质可分:键合固定相生物大分子色谱仪和硅胶固定相生物大分子色谱仪等
生物大分子色谱仪种类
生物大分子色谱仪种类有多种。1、按功能可分:分析型生物大分子色谱仪和制备型生物大分子色谱仪。2、按灵敏性可分:生物大分子微量色谱仪和生物大分子痕量色谱仪。3、按应用范围可分:专用型生物大分子色谱仪和通用型生物大分子色谱仪。4、按固定相性质可分:键合固定相生物大分子色谱仪和硅胶固定相生物大分子色谱仪等
生物大分子制备的干燥方法
生物大分子制备得到产品,为防止变质,易于保存,常需要干燥处理,最常用的方法是冷冻干燥和真空干燥。真空干燥适用于不耐高温,易于氧化物质的干燥和保存,整个装置包括干燥器、冷凝器及真空干燥原理外,同时增加了温度因素。在相同压力下,水蒸汽压随温度下降而下降,故在低温低压下,冰很易升华为气体。操作时一般先将待
大环生物分子快速合成有新法
美国范德堡大学官网近日发布公告称,该校生化学院化学系教授杰夫瑞·约翰斯顿与其学生开发出一种全新合成技术,能将生物体内重要的环状分子——环缩肽的合成步骤从之前的14步缩减到6步,而且产量更高,环状分子尺寸更大。新化合过程将开启全新的化学运用,更大环状缩肽具有独特的生物特性,可用来开发更高效抗生素、
脂质是生物大分子吗?
关于生物大分子,人教版教材说:“多糖、蛋白质、核酸等都是生物大分子,都是由许多基本的组成单位连接而成的,这些基本单位称为单体,这些生物大分子又称为单体的多聚体。”由于没有明确脂质。造成一线老师对于脂质是不是生物大分子争论不休。其他版本的教材比如北师大版明确以标题的形式出现:贮存能量的大分子——脂
生物大分子的结构与功能
生物大分子的多种多样功能与它们特定的结构有密切关系。蛋白质的主要功能有催化、运输和贮存、机械支持、运动、免疫防护、接受和传递信息、调节代谢和基因表达等。由于结构分析技术的进展,使人们能在分子水平上深入研究它们的各种功能。酶的催化原理的研究是这方面突出的例子。蛋白质分子的结构分4个层次,其中二
蛋白质芯片技术生物分子反应
使用时将待检的含有蛋白质的标本如尿液、血清、精液、组织提取物等,按一定程序做好层析、电泳、色谱等前处理,然后在每个芯池里点入需要的种类。一般样品量只要2-10μL即可。根据测定目的不同可选用不同探针结合或与其中含有的生物制剂相互作用一段时间,然后洗去未结合的或多余的物质,将样品固定一下等待检测即可。
脂质是生物大分子吗?
脂质不属于生物大分子。 脂质包括的范围广泛,其分类方法亦有多种。通常根据脂质的主要组成成分分为:简单脂质、复合脂质、衍生脂质、不皂化脂类。 脂质包括多种多样的分子,其特点是主要由碳和氢两种元素以非极性的共价键组成。由于这些分子是非极性的,所以和水不能相容,因此是疏水的。严格地说,脂质不是大分
生物分子学中GUS什么意思
应该是指的GUS基因,在植物样品中很常用的一个报告基因。GUS基因就是β-葡萄糖苷酸酶基因 。该基因产物为β-葡萄糖苷酸酶,为一水解酶。可使用市售的底物 (substrate) 在原位 (in situ) 显现出酶的活性,以肉眼即可检测其产物,非常方便。
生物大分子离心机分类
生物大分子离心机分类有多种。1、按分离目的可分:生物大分子化验室离心机和生物大分子工业离心机。2、按温控可分:生物大分子冷冻离心机和生物大分子常温离心机。3、按分离成分可分:固液分离生物大分子离心机和液液分离生物大分子离心机。4、按容量可分:小容量生物大分子离心机和大容量生物大分子离心机。5、按生产
大环生物分子快速合成有新法
美国范德堡大学官网近日发布公告称,该校生化学院化学系教授杰夫瑞·约翰斯顿与其学生开发出一种全新合成技术,能将生物体内重要的环状分子——环缩肽的合成步骤从之前的14步缩减到6步,而且产量更高,环状分子尺寸更大。新化合过程将开启全新的化学运用,更大环状缩肽具有独特的生物特性,可用来开发更高效抗生素、
分子生物学绪论(一)
一、分子生物学的基本含义 分子生物学是从分子水平研究生命本质为目的的一门新兴边缘学科,它以核酸和蛋白质等生物大分子的结构及其在遗传信息和细胞信息传递中的作用为研究对象,是当前生命科学中发展最快并正与其它学科广泛交叉与渗透的重要前沿领域。分子生物学的发展为人类认识生命现象带来了前所未有的机会,也
蛋白质与生物小分子结合
生物大分子,首先先说一下什么是生物大疯子,生物大分子指的是作为生物体内主要活性成分的各种分子量达到上万或更多的有机分子.高相对分子量的生物有机化合物(生物大分子)主要是指蛋白质、核酸以及高相对分子量的碳氢化合物.常见的生物大分子包括蛋白质、核酸、多糖.但是,这只是相对的说法,这个定义只是概念性的,与
理化所:开发出痕量生物分子“捕手”
近日,中科院理化技术研究所研究员王树涛团队与大连化学物理研究所研究员梁鑫淼团队合作,开发出一种具有亲水/疏水异质纳米孔的聚合物微球。该微球能在不同极性的溶剂中选择性吸附生物分子,进而从复杂样品中高效地分离出痕量的糖肽。相关研究成果发表于《先进材料》,研究工作得到了国家自然科学基金杰出青年基金、中
分子生物学的概念
分子生物学是对生物在分子层次上的研究。这是一门生物学和化学之间跨学科的研究,其研究领域涵盖了遗传学、生物化学和生物物理学等学科。分子生物学主要致力于对细胞中不同系统之间相互作用的理解,包括DNA,RNA和蛋白质生物合成之间的关系以及了解它们之间的相互作用是如何被调控的。
脂质是生物大分子吗
关于生物大分子,人教版教材说:“多糖、蛋白质、核酸等都是生物大分子,都是由许多基本的组成单位连接而成的,这些基本单位称为单体,这些生物大分子又称为单体的多聚体。”由于没有明确脂质。造成一线老师对于脂质是不是生物大分子争论不休。其他版本的教材比如北师大版明确以标题的形式出现:贮存能量的大分子——脂质。
分子生物学实验设备
分子生物学实验设备 1) 温度控制系统:冰箱:4 ℃、-20℃、-70 ℃--样品、 试剂 和材料等的保存 2) 恒温培养箱:细菌平板的培养 3) 恒温空气摇床;菌体的培养 4) 灭菌器: 培养基、 试剂 、耗材等的灭菌 5) PCR仪:PCR 扩增、保温实验等 6) 恒温水浴及微量加热器:保证实验
分子生物学绪论(二)
(二)现代分子生物学的建立和发展阶段 这一阶段是从50年代初到70年代初,以1953年Watson和Crick提出的DNA双螺旋结构模型作为现代分子生物学诞生的里程碑开创了分子遗传学基本理论建立和发展的黄金。DNA双螺旋发现的最深刻意义在于:确立了核酸作为信息分子的结构基础;提出碱基配对是核酸
脂质是生物大分子吗
关于生物大分子,人教版教材说:“多糖、蛋白质、核酸等都是生物大分子,都是由许多基本的组成单位连接而成的,这些基本单位称为单体,这些生物大分子又称为单体的多聚体。”由于没有明确脂质。造成一线老师对于脂质是不是生物大分子争论不休。其他版本的教材比如北师大版明确以标题的形式出现:贮存能量的大分子——脂
脂质是生物大分子吗?
脂质不属于生物大分子。 脂质包括的范围广泛,其分类方法亦有多种。通常根据脂质的主要组成成分分为:简单脂质、复合脂质、衍生脂质、不皂化脂类。 脂质包括多种多样的分子,其特点是主要由碳和氢两种元素以非极性的共价键组成。由于这些分子是非极性的,所以和水不能相容,因此是疏水的。严格地说,脂质不是大分
分子生物学绪论(三)
2 基因组研究的发展 目前分子生物学已经从研究单个基因发展到研究生物整个基因组的结构与功能。1977年Sanger测定了ΦX174-DNA全部5375个核苷酸的序列;1978年fiers等测出SV-40DNA全部5224对碱基序列;80年代λ噬菌体DNA合部48502碱基对的序列全部测出;一些
脂质是生物大分子吗
脂质不属于生物大分子。 脂质包括的范围广泛,其分类方法亦有多种。通常根据脂质的主要组成成分分为:简单脂质、复合脂质、衍生脂质、不皂化脂类。 脂质包括多种多样的分子,其特点是主要由碳和氢两种元素以非极性的共价键组成。由于这些分子是非极性的,所以和水不能相容,因此是疏水的。严格地说,脂质不是大分
补体的分子生物学
补体的分子生物学 补体系统由30多种蛋白分子所组成,是迄今所知机体中zui复杂的一个限制性蛋白水解系统(limited proteolysis system),根据各成分功能不同,将它们分为三组。*组为补体系统的固有成分共14个蛋白分子。即C1(含三个亚组分:C1q、Clr和Cls)、C4、C2
分子逻辑门生物传感研究获进展
近日,中科院广州生物医药与健康研究院曾令文研究组模拟电子逻辑门运算机理,利用ATP和凝血酶为两种输入信号,依赖核酸适体作为分子识别元件,试纸条检测卡是否出T线为输出信号(有T线说明是阳性结果,有输出信号;没有T线说明是阴性结果,没有输出信号),成功构建了基于核酸适体
胃动素分子生物学特性
1 分子生物学特性 1.1 MTL分子结构及分布 MTL是由22个氨基酸组成的单链多肽,由Brown等于1966年在研究十二指肠pH变化和胃动力间关系过程中发现的,并于1972年将其分离并提纯,因能刺激胃小体运动而得名。MTL的化学结构为苯丙-缬-脯-异亮-苯丙-苏-酪-甘-谷-亮-谷酰-精-
分子生态学词汇转基因生物
中文名称:转基因生物外文名称:transgenic Organisms定 义:“转基因生物”一词的最初来源是英语“Transgenic Organisms”,因为在上世纪70年代,重组脱氧核糖核酸技术(rDNA)刚开始应用于动植物育种的时候,常规的做法是将外源目的基因转入生物体内,使其得到
有机分子可在非生物环境下形成
据英国《自然·通讯》杂志近日发表的一项天文学研究,在实验室的标准天体物理学条件下,美国科学家在紫外线辐射冰混合物后产生的残留物中,检测到了2-脱氧核糖(DNA的糖组分)和若干脱氧糖衍生物。这项研究还首次在碳质陨石样本中鉴定出了若干脱氧糖衍生物,但目前无法明确证实更大的糖类(如2-脱氧核糖)的存
生物分子实验室仪器配置
生物分子实验室仪器配置必需品: 冰箱: 根据药品、试剂及多种生物制剂保存的需要,必须具备不同控温级别的冰箱,最常使用的有:4℃、-20℃、-80℃冰箱。4℃适合储存某些溶液、试剂、药品等。 -20℃适用于某些试剂、药品、酶、血清、配好的抗生素和DNA、蛋白质样品等。 -8