上海生科院开发构建因果关系的分子调控网络模型和方法
2014年12月24日，国际学术期刊Nuclear Acid Research 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈洛南研究组的研究成果，开发基于小样本构建因果关系的分子调控网络模型和方法。 整合高通量生物学信息，构建分子生物网络，从而在系统的水准上揭示生物分子的相互作用机理及因果调控规律，是后基因组时代所面临的重要计算生物学问题之一。统计学上对于具有n个基因的调控网络的因果关系的精确推断，要求n-2阶条件相关性的评估（高斯噪声），即需要n个以上独立生物样本数据。对于大多哺乳动物，n远大于10000基因，因此在同一条件下采集这么多的生物样本构建分子调控网络或建立因果关系不现实。 根据基因调控网络的特性（如稀疏性等），利用信息熵的非线性测度的性质及条件相关性阶数的一致性特性，研究组建立了基于小样本推断基因调控网络的新模型和算法（CMI-PCA：通路一致性分析法）。该方法主要通过评估各基因之间的......阅读全文
生物大分子色谱仪种类
生物大分子色谱仪种类有多种。1、按功能可分：分析型生物大分子色谱仪和制备型生物大分子色谱仪。2、按灵敏性可分：生物大分子微量色谱仪和生物大分子痕量色谱仪。3、按应用范围可分：专用型生物大分子色谱仪和通用型生物大分子色谱仪。4、按固定相性质可分：键合固定相生物大分子色谱仪和硅胶固定相生物大分子色谱仪等
分子生物学的概念
分子生物学是对生物在分子层次上的研究。这是一门生物学和化学之间跨学科的研究，其研究领域涵盖了遗传学、生物化学和生物物理学等学科。分子生物学主要致力于对细胞中不同系统之间相互作用的理解，包括DNA，RNA和蛋白质生物合成之间的关系以及了解它们之间的相互作用是如何被调控的。
生物大分子的结构与功能
生物大分子的多种多样功能与它们特定的结构有密切关系。蛋白质的主要功能有催化、运输和贮存、机械支持、运动、免疫防护、接受和传递信息、调节代谢和基因表达等。由于结构分析技术的进展，使人们能在分子水平上深入研究它们的各种功能。酶的催化原理的研究是这方面突出的例子。蛋白质分子的结构分4个层次，其中二
生物大分子色谱仪种类
生物大分子色谱仪种类有多种。1、按功能可分：分析型生物大分子色谱仪和制备型生物大分子色谱仪。2、按灵敏性可分：生物大分子微量色谱仪和生物大分子痕量色谱仪。3、按应用范围可分：专用型生物大分子色谱仪和通用型生物大分子色谱仪。4、按固定相性质可分：键合固定相生物大分子色谱仪和硅胶固定相生物大分子色谱仪等
蛋白质与生物小分子结合
生物大分子,首先先说一下什么是生物大疯子,生物大分子指的是作为生物体内主要活性成分的各种分子量达到上万或更多的有机分子.高相对分子量的生物有机化合物（生物大分子）主要是指蛋白质、核酸以及高相对分子量的碳氢化合物.常见的生物大分子包括蛋白质、核酸、多糖.但是,这只是相对的说法,这个定义只是概念性的,与
生物大分子的色谱纯化方法
一、生物大分子色谱纯化方法的选择思路通常在做纯化前对自己的目标物质特性了解越多对纯化将会越有利，如果不太了解，也可以通过电泳知道目标物质和杂质的情况，找到一种简单的鉴定方法，此外在纯化前必须先建立可靠的活性测定的方法。如果是未知的蛋白，那么通常可以有几种简单的摸索：1. 凝胶过滤色谱。这个方法很常用
生物分子学中GUS什么意思
应该是指的GUS基因，在植物样品中很常用的一个报告基因。GUS基因就是β-葡萄糖苷酸酶基因 。该基因产物为β-葡萄糖苷酸酶，为一水解酶。可使用市售的底物 (substrate) 在原位 (in situ) 显现出酶的活性，以肉眼即可检测其产物，非常方便。
《PLoS生物学》：迄今最高精度的大脑网络地图出炉
一支国际科研小组最近创建出首张完整的大脑网络地图，它的精细程度无与伦比。该图反映了人类大脑皮层中负责高等思维的数百万神经纤维，如何相互连接和“交谈”。更为重要的突破是，研究人员从中确定出了一个大脑单一网络核心(network core)，它对于左右脑半球的工作都至关重要。新研究标志着人类在理解自身最
“恶性肿瘤免疫负调控分子网络的形成与干预”项目启动会
6月18日上午，由秦志海研究员担任首席科学家的国家重大科学研究计划“恶性肿瘤免疫负调控分子网络的形成与干预”项目启动会在中科院生物物理研究所召开。 肿瘤微环境中存在着大量的负调控蛋白质分子，它们相互作用，相互影响，构成一个复杂的三维分子网络，其形成过程伴随着肿瘤细胞和微环境的
神经网络电活动调控抑制性突触稳态可塑性的分子机制
12月1日，《神经科学杂志》以封面文章的形式发表了中科院上海生命科学研究院神经所树突发育与神经环路形成研究组的论文Postsynaptic spiking homeostatically induces cell-autonomous regulation of inhibitor
科学家提出基于动态互相关网络分析的酶分子改造策略
近日，华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室副教授陈琦、教授郑高伟提出了基于动态互相关网络分析的理性酶工程改造策略，并将该策略运用于卤代甲基转移酶BxHMT的改造工作中。相关研究发表于《德国应用化学》。 S-腺苷甲硫氨酸（SAM）是自然界中广泛应用的甲基供体，可作为甲基转移酶（MT）的辅因子
科学家提出基于动态互相关网络分析的酶分子改造策略
近日，华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室副教授陈琦、教授郑高伟提出了基于动态互相关网络分析的理性酶工程改造策略，并将该策略运用于卤代甲基转移酶BxHMT的改造工作中。相关研究发表于《德国应用化学》。S-腺苷甲硫氨酸（SAM）是自然界中广泛应用的甲基供体，可作为甲基转移酶（MT）的辅因子，实现多
分子相互排斥，大脑神经元复杂网络连接的新机制
哺乳动物的内侧和外侧海马环路分别优先处理空间和物体相关信息。然而，在发育过程中组装这种并行环路的机制在很大程度上仍然未知。 2021年6月4日，斯坦福大学骆利群团队在Science 在线发表题为“Reciprocal repulsions instruct the precise assemb
微生物分子生物学检测新技术问世
日前，中国地质科学院水环所经过积极探索，反复试验，建立了适合土样和地下水样的微生物分子生物学检测高新技术。 微生物分子生物学检测技术通过对不同样品微生物DNA的提取，将提取的DNA进行扩增并识别，来确定样品中微生物的多样性和种属，具有先进性和准确性，免去了烦琐、需时长的培养过程，可检出传统
微生物鉴别方法：分子生物学方法
1、DNA碱基比DNA碱基比[（G+C）mol%]，以G+C物质的量分数（mol%）表示：（G+C）mol%=（G+C）/（A+T+G+C）%该比值的变化范围很大，原核生物变化范围是20-78%，真核生物的变化范围为30%-60%。目前已经测定了大量生物的DNA碱基组成这方便的结论有：①亲缘关系密切
基于生物分子构象变化的生物传感策略研究获进展
利用DNA分子构象变化发展新型生物传感策略 近日，权威化学综述杂志Accounts of Chemical Research发表了中国科学院上海应用物理研究所物理生物学实验室樊春海课题组撰写的邀请综述文章 (Target-responsive structures for nucleic acid
低温保存对生物样本及其生物大分子的影响
引言生物样本库主要是指收集和应用健康及疾病生物体的生物分子、细胞、组织和器官等，包括人体器官、组织、体液或处理过的样本（DNA、RNA、蛋白等），以及与这些样本相关的临床资料、质控、管理等生物应用系统。在医学研究中，生物样本是联系分子信息与疾病的桥梁。根据使用目的的区别，样本的保存要求也会有所差别。
中科院应用微生物网络工业微生物研究中心启动会召开
2月15日，中科院应用微生物网络工业微生物研究中心（南方）启动会在植生生态所召开。中科院生物局工业生物技术处处长邢雪荣，植生生态所所长薛红卫研究员，以及来自中科院微生物所、大连化物所、天津工业生物技术所和植生生态所所的项目/课题负责人近20人出席会议。会议由中科院生物局工业生物技术
中科院应用微生物研究网络农业微生物研究中心启动会召开
近日，中国科学院应用微生物研究网络农业微生物研究中心启动会暨学术研讨会在武汉召开。本次会议由农业微生物研究中心依托单位中国科学院武汉病毒研究所主办。上海交通大学邓子新院士，中科院生物局副局长苏荣辉，生物局工业生物技术处处长邢雪荣、副处长刘斌，应用微生物研究网络总中心主任
生物活性分子体内原位构筑超分子组装体研究获新进展
随着纳米生物技术和纳米医药的发展，生物活性分子体内原位构筑超分子组装体的概念越来越受人们的重视。实现对聚合物的可控组装调控，对改进材料在体内的生物效应和安全性，具有重大意义。但是，由于生物医用材料在体内的生物过程极其复杂，如何实现聚合物在病生理条件下的组装调控，是医用高分子领域极具挑战性的科学问
距今6.5亿年古生物分子化石现身
据澳大利亚国立大学（ANU）官网8月17日消息，该校科研团队在澳大利亚中部古代沉积岩中找到了距今6.5亿年的古代生物分子化石，并据此认为此前的“雪球地球”时期与更复杂的生命演化有关。研究成果发表在最新一期的《自然》杂志上。 消息称，该校地球科学研究学院的科学家将古代沉积岩粉碎成粉末，并从中提取
噬菌体让生物分子进化增速100倍
据美国物理学家组织网近日报道，美国科学家在《自然》杂志上撰文指出，他们利用噬菌体，在实验室中让生物分子的进化速度提高了100倍。新研究有望让制药业使用实验室培育出来的蛋白质、核酸和其他成分按需制药。 该研究的领导者、哈佛大学化学和生化教授戴维·刘说，大多数现代药物都由有机小分子制成，但某
《自然》：研究揭示生物钟的分子“开关”
这是迄今为止得到的关于人体生理节奏研究最明确的信息 调节人体内部生物钟的遗传机制一直是科学家研究的热点问题。近日，美国科学家发现了触发这一机制的化学“开关”。这是迄今为止得到的关于人体生理节奏（circadian rhythms）研究最明确的信息，为失眠以及其它相关疾病的药物治疗确定了精确的标靶。
分子生物学技术的应用
分子生物学技术：可应用于遗传性疾病的研究和病原体的检测及肿瘤的病因学、发病学、诊断和治疗等方面的研究提高到了基因分子水平。 生物学定义：生物学是研究生命现象和生物活动规律的科学。 据研究对象分为动物学、植物学、微生物学、古生物学等；依研究内容，分为分类学、解剖学、生理学、细胞学、分子生物学、
生物大分子的结构特点和功能
生物大分子是指生物体细胞内存在的蛋白质、核酸、多糖等大分子。每个生物大分子内有几千到几十万个原子，分子量从几万到几百万以上。生物大分子的结构很复杂,但其基本的结构单元并不复杂。蛋白质分子是由氨基酸分子以一定的顺序排列成的长链。氨基酸分子是大部分生命物质的组成材料,不同的氨基酸分子有好几十种。生物体内
生物分子蛋白质核磁共振光谱
利用核磁谱研究蛋白质，已经成为结构生物学领域的一项重要技术手段。X射线单晶衍射和核磁都可获得高分辨率的蛋白质三维结构，不过核磁常局限于35kDa以下的小分子蛋白，尽管随着技术的进步，稍大的蛋白质结构也可以被核磁解析出来。另外，获得本质上非结构化（Intrinsically Unstructured）
新型潜在分子或可用于检测生物老化
近日，Doug博士说：“鉴于早期干预的需要，许多当前治疗阿尔茨海默氏症的药物正在疾病的早期阶段被测试，甚至在症状开始之前就已经开始测试了。进一步的研究可以帮助我们发现新的治疗方法，让更容易患阿尔茨海默氏症的人来参与临床试验。” “先前的研究已经确定了阿尔茨海默氏症患者的血液标记，但他们在定期研
分子生物学常用溶液配制
分子生物学常用溶液配制一、分子生物学常用贮存液的配制1．30%丙烯酰胺溶液【配制方法】将29g丙烯酰胺和1g N，N’-亚甲双丙烯酰胺溶于总体积为60ml的水中。加热至37℃溶解之，补加水至终体积为100ml。用滤器（0.45μm孔径）过滤除菌，查证该溶液的pH值应不大于7.0，置棕色瓶中保存于室温
分子生物学技术的分类
目前，常用的分子生物学技术有如下几种[1]： PCR单链构象多态性分析 PCR-单链构象多态性分析(PCR -single strand conformation analysis,PCR -SSCP) 是近年来在基因突变检测中运用最广泛的方法之一。PCR -SSCP 技术凭借突变可引起单链
口蹄疫分子生物学诊断技术
近年来，由于分子生物学技术的迅速发展及其在FMD诊断中的应用，建立了各种FMD的分子生物学诊断技术，主要包括以下几种方法，核酸杂交、等电点聚焦电泳、寡核苷酸指纹图谱分析、聚丙烯酰胺凝胶电泳、聚合酶链式反应、单克隆抗体技术等。（1）核酸探针 核酸探针即应用FMD的cDNA克隆片段，用32P或生物素等标