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上海生科院发现调控种子印迹基因表达的新机制

图A:ape1l 和zdp双突变对种子发育的影响图B:APE1L蛋白调控拟南芥中DNA主动去甲基化途径的工作模型 1月8日,中国科学院上海生命科学研究院上海植物逆境生物学研究中心朱健康课题组与科尔多瓦大学合作研究发现,拟南芥主动去甲基化途径中的新组件APE1L蛋白不仅是DNA主动去甲基化途径中的一个新组分,还与DNA磷酸酶ZDP同样是胚乳中FWA及MEA基因印迹所必需的,对于种子的发育非常重要。相关论文在线发表在国际学术期刊Plos Genetics上。 基因印迹是一种非常重要的表观遗传学现象之一,可导致来自不同父母本中的等位基因只有一个表达而另一个不表达或表达量很少。受这种表观遗传机制调控的基因称为印迹基因。这些印迹基因在调控胚及其附属机构的发育、控制种子的大小、生殖隔离以及防止无性生殖上都发挥着关键的作用。植物印迹基因亲源差异表达的调控方式是当今表观遗传研究的重点和热点。在植物中,雌配子中央细胞中甲基化的印迹基因通过一种......阅读全文

DNA甲基化研究方法的回顾与评价(图)

摘要: DNA 甲基化是表观遗传学(Epigenetics)的重要组成部分,在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要作用,是目前新的研究热点之一。随着对甲基化研究的不断深入,各种各样甲基化检测方法被开发出来以满足不同类型研究的要求。这些方法概括起来可分为三类:整体水平的甲

Science解读甲基化组新观点

  在真核生物中,DNA甲基化通常发生在CG中的胞嘧啶上。由于甲基化不会改变DNA序列,它被视为一种表观遗传学标志。DNA甲基化可以在细胞分裂过程中延续到子代细胞,这一机制现在已经相当明确。而这种继承性使DNA甲基化成为储存表观遗传学记忆的潜在途径,这种记忆包括环境或发育过程中的基因调控。不过要证实

DNA甲基化研究方法的回顾与评价

摘要: DNA甲基化是表观遗传学(Epigenetics)的重要组成部分,在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要作用,是目前新的研究热点之一。随着对甲基化研究的不断深入,各种各样甲基化检测方法被开发出来以满足不同类型研究的要求。这些方法概括起来可分为三类:基因组整体水平的甲

植物所解析RNA甲基化调控果实成熟的作用机制

  DNA甲基化(5mC)和RNA甲基化(m6A)是两种重要的核酸修饰,在基因表达调控中发挥重要作用并参与诸多生物学过程。然而,这两种核酸修饰之间是否存在内在关联性却不清楚。近日,中国科学院植物研究所秦国政研究组和田世平研究组合作,揭示了DNA甲基化可通过调节m6A去甲基化酶基因表达的方式影响番茄果

朱健康院士Nature子刊表观遗传学成果

拟南芥5-甲基胞嘧啶(5mC)DNA糖基化酶的ROS1/DEMETER家族,是真核生物中第一个遗传表征的DNA去甲基化酶。然而,ROS1靶基因位点的特征还没有得到很好的理解。10月31日在《Nature Plants》发表的一项研究中,来自中科院上海植物逆境生物学中心和普渡大学的研究人员,对拟南芥C

表观遗传学和人类疾病

上个世纪50年代初,Watson和Crick建立了DNA分子结构模型,极大程度地促进了生命科学的发展。自此遗传学便成为现代医学研究领域中一个重要的分支。人类已经认识到基因突变可以导致疾病的发生,如慢性进行性舞蹈病(Huntington's chorea, Hc)和囊性纤维化等。近年来

快速检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶&RNA甲基化水平(下)

  又到了一周云序生物课堂开讲时间!你,准备好了吗?   上一期文章当中,云序通过引用这样一张表格给大家传递了一个重要信息:表中的METLL3、METTL14、NSun2、FTO、ALKBH5、YTHDF2均是RNA甲基化重要的酶,而且这些酶在不同疾病当中意义有所不同,例如METTL3在AML、B

同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶&RNA甲基化水平(下)

  又到了一周云序生物课堂开讲时间!你,准备好了吗?   上一期文章当中,云序通过引用这样一张表格给大家传递了一个重要信息:表中的METLL3、METTL14、NSun2、FTO、ALKBH5、YTHDF2均是RNA甲基化重要的酶,而且这些酶在不同疾病当中意义有所不同,例如METTL3在AML、B

检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶&RNA甲基化水平(下)

  又到了一周云序生物课堂开讲时间!你,准备好了吗?   上一期文章当中,云序通过引用这样一张表格给大家传递了一个重要信息:表中的METLL3、METTL14、NSun2、FTO、ALKBH5、YTHDF2均是RNA甲基化重要的酶,而且这些酶在不同疾病当中意义有所不同,例如METTL3在AML、B

Cell Res重点论文:单细胞表观多组学测序技术最新突破

  2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研

Cell Res重点论文:单细胞表观多组学测序技术最新突破

  2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研

Nature破解百年争论:基因抵抗沉默新机制

  来自哈佛干细胞研究所(HSCI)的研究人员破解了一个百年以来的争论:DNA甲基化作用的出现是用于沉默基因表达,还是在甲基化出现前,基因就已经能通过其他方式被关闭了。   这一研究成果公布在10月9日的Nature杂志上。研究人员指出,甲基化实际上能强制关闭基因表达,而最新发现的一种新型非编码R

朱健康研究团队发现植物DNA主动去甲基化新机制

  7月30日,《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为Histone Acetylation Recruits the SWR1 Complex to Regulate Active DNA Demethylati

染色质,解锁癌症表观遗传学的钥匙

  表观遗传学指基因序列不变化的前提下,基因表达发生了可遗传的变化,包括DNA甲基化、染色质改型、基因沉默、RNA编辑、组蛋白修饰(甲基化、乙酰化、磷酸化等)等。其中,染色质改型调控基因表达的过程,涉及多种导致DNA和组蛋白组成变化、染色质构象变化的蛋白质。  众多研究已经证明,染色体畸变和染色质异

【盘点】肿瘤常见生物标志物之:胃癌

  胃癌是发病率和死亡率较高的恶性肿瘤,中国每年胃癌死亡病例占全球同期胃癌总死亡数的40%以上。目前的研究显示胃癌筛查是减少胃癌病死率有效的策略之一。利用胃癌生物标志物代替胃镜筛查,可达到更高的普及率,能做到早发现、早诊断、早治疗。本文介绍了胃癌常见的生物标志物及其研究概况。  CA与CEA  糖类

广州生物院发现DNA被动去甲基化的新作用

  DNA甲基化是胞嘧啶的甲基化是最重要的表观遗传学修饰之一,多项生物学过程均涉及DNA甲基化水平的调控。近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院郑辉课题组通过研究细胞增殖过程中DNA甲基化(胞嘧啶的甲基化)的调控,发现DNA被动去甲基化的新作用。相关研究成果在线发表在Journal of Biol

广州生物院发现DNA被动去甲基化的新作用

  DNA甲基化是胞嘧啶的甲基化是最重要的表观遗传学修饰之一,多项生物学过程均涉及DNA甲基化水平的调控。近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院郑辉课题组通过研究细胞增殖过程中DNA甲基化(胞嘧啶的甲基化)的调控,发现DNA被动去甲基化的新作用。相关研究成果在线发表在Journal of Biol

研究发现植物DNA主动去甲基化新机制

  近期《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为Histone Acetylation Recruits the SWR1 Complex to Regulate Active DNA Demethylation i

朱健康院士团队揭示植物DNA主动去甲基化的完整调控途径

  近日,PNAS杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为“Histone Acetylation Recruits the SWR1 Complex to Regulate Active DNA Demethylation in Arabidops

上海生科院:用CRISPR靶定DNA去甲基的新方法

  在哺乳动物细胞中,DNA甲基化精密地调节基因的表达,从而在许多生理和病理过程中起着举 足轻重的作用。近期,来自中科院上海生命科学研究院“百人计划“胡荣贵研究员带领的研究小组,在《Cell Discovery》发表题为“A CRISPR-based approach for targeted DN

DNA羟化酶Tet1可取代外源Oct4促进体细胞重编程

  2013年4月5日,北京生命科学研究所高绍荣博士实验室首次发现Tet1和5hmC在iPS细胞诱导过程中参与内源Oct4基因的去甲基化和激活,并且进一步证明Tet1可以取代外源Oct4实现安全高效的体细胞重编程。相关研究论文发表在近期出版的《Cell Stem Cell》杂志上。该文章被选为本

表观遗传学关于DNA甲基化

表观遗传学是研究表观遗传变异的遗传学分支学科从目前的研究来看,X 染色体剂量补偿、DNA 甲基化、组蛋白密码、基因组印记、表观基因组学和人类表观基因组计划等问题都是表观遗传学研究的内容。其中甲基化是基因组DNA 的一种主要表观遗传修饰形式,是调节基因组功能的重要手段。在脊椎动物中,CpG二核

肿瘤常见生物标志物之:胃癌

胃癌是发病率和死亡率较高的恶性肿瘤,中国每年胃癌死亡病例占全球同期胃癌总死亡数的40%以上。目前的研究显示胃癌筛查是减少胃癌病死率有效的策略之一。利用胃癌生物标志物代替胃镜筛查,可达到更高的普及率,能做到早发现、早诊断、早治疗。本文介绍了胃癌常见的生物标志物及其研究概况。CA与CEA糖类抗原199(

一文了解甲基化研究领域新进展!

  本文中,小编整理了多篇重要研究成果,共同解读科学家们在甲基化研究领域取得的新进展,分享给大家!图片来源:Vossman/ Wikipedia  【1】Nature:母体维生素C调节DNA甲基化重编程和生殖细胞产生  doi:10.1038/s41586-019-1536-1  发育通常被认为是在

上海生科院揭示DNA甲基化对番茄果实成熟的重要作用

  5月15日,《美国科学院院刊》(PNAS)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物逆境生物学研究中心朱健康研究组和郎曌博研究组题为Critical roles of DNA demethylation in the activation of ripening-induced genes an

植物DNA去甲基化的机理和功能

  10月19日,Journal of Integrative Plant Biology(JIPB)在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心郎曌博研究组题为The mechanism and function of active DNA demethylation i

朱健康教授等人PNAS利用CRISPR技术解析DNA甲基化

  来自中科院上海生命科学研究院植物逆境生物学研究中心朱健康研究组和郎曌博研究组的研究人员发表了题为“Critical roles of DNA demethylation in the activation of ripening-induced genes and inhibition of r

看表观新修饰-6mA甲基化如何助力IF飙升!

  DNA甲基化修饰是表观遗传研究的热点之一,我们通常认为DNA甲基化就是胞嘧啶甲基化(5-methylcytosine, 5mC),却不知道随着测序技术的快速发展,科研者们已经在真核生物中(果蝇 、真菌、莱茵衣藻、秀丽隐杆线虫等)发现了一种新的DNA甲基化修饰—DNA-6mA甲基化,且DNA-6m

上海植物逆境研究中心在植物DNA去甲基化调控研究进展

  6月15日,国际权威学术期刊Science在线发表了中科院上海植物逆境生物学研究中心、中科院上海生命科学研究院植物生理生态所朱健康课题组的研究论文A Histone Acetyltransferase Regulates Active DNA Demethylation in

上海生科院发现打破细胞重编程屏障的关键因素

  2月13日,国际期刊Cell Stem Cell 杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所徐国良课题组的研究论文。该研究发现DNA加氧酶TET和糖苷酶TDG共同介导DNA氧化去甲基化,在细胞命运转变中起必不可少的作用。   生物体的各种细胞具有精细的分工,每一类