研究揭示出一种维持异染色质可塑性的机制
染色质是真核生物遗传物质的包装形式。按照其包装的致密程度，染色质可分为较为松散的常染色质和较为致密的异染色质。异染色质的这种结构特征不利于蛋白质的招募，因而可能会危及到正常的异染色质DNA代谢过程，例如DNA复制和重组。 1月13日，PLoS Genetics杂志发表了中科院上海生命科学研究院生化与细胞所周金秋研究组关于酿酒酵母异染色质组蛋白标记的文章。他们发现，组蛋白乙酰化酶复合物NuA4能够被招募到端粒异染色质区，并特异性地乙酰化组蛋白H4第12位赖氨酸。该位点的乙酰化对端粒异染色质的基本DNA代谢过程起调控作用。这一研究表明，异染色质并不像人们以往认为的那样“静默”，它同样具备可塑性，而这种异染色质的可塑性直接归因于它自身的化学性质。 该论文是由周金秋研究组的助理研究员周波和博士研究生王珊珊等完成。该课题获得了国家科技部和国家自然科学基金委的经费资助。 ......阅读全文
染色质蛋白非组蛋白α螺旋转角α螺旋模式介绍
这是最早在原核基因的激活蛋白和阻抑物中发现的。迄今已经在百种以上原核细胞和真核生物中发现这种最简单、最普遍的DNA结合蛋白的结构模式。这种蛋白与DNA结合时,形成对称的同型二聚体（symmetric homodimer）结构模式。构成同型二聚体的每个单体由20个氨基酸的小肽组成α螺旋-转角-α螺
染色质非组蛋白亮氨酸拉链模式
在构建转录复合物过程中,普遍涉及蛋白与蛋白之间的相互作用,形成二聚体是识别特异DNA序列蛋白的相互作用的共同原则,亮氨酸拉链就是富含Leu残基的一段氨基酸序列所组成的二聚化结构。这类序列特异性DNA结合蛋白家族,包括酵母的转录激活因子（GCN4）、癌蛋白Jun、Fos、Myc以及增强子结合蛋白（
染色质非组蛋白螺旋环螺旋结构模式
HLH这一结构模式广泛存在于动、植物DNA结合蛋白中。HLH由40~50个氨基酸组成两个两性α螺旋,两个α螺旋中间被一个或几个β转角组成的环区所分开。每个α螺旋由15~16个氨基酸残基组成,并含有几个保守的氨基酸残基。具有疏水面和亲水面的两性α螺旋有助于二聚体的形成。α螺旋邻近的肽链 N 端也有
研究揭示NuA4乙酰化核小体的动态机制
中国科学院生物物理研究所朱平研究组与中国科学院物理研究所朱洪涛、陆颖研究组合作，揭示了酵母中组蛋白乙酰转移酶NuA4对核小体进行乙酰化的动态机制。相关论文3月18日发表于美国《国家科学院院刊》（PNAS）。 组蛋白乙酰化是一种重要的表观遗传修饰，参与染色质结构调控、基因转录激活以及DNA损伤修
基因沉寂的作用
这个“原则”就是目前尚没有真正完全清楚的“组蛋白密码”（Histone Code)。能够与甲基化组蛋白结合的蛋白质有sir1/2/3/4，这是一组被称为"Silencing Informative Repressor"的蛋白，其中，Sir2就是上文中的“去乙酰化”酶，而Sir1/3/4则负责与甲基化
基因沉寂的作用
这个“原则”就是目前尚没有真正完全清楚的“组蛋白密码”（Histone Code)。能够与甲基化组蛋白结合的蛋白质有sir1/2/3/4，这是一组被称为"Silencing Informative Repressor"的蛋白，其中，Sir2就是上文中的“去乙酰化”酶，而Sir1/3/4则负责与甲基化
基因沉寂的作用
这个“原则”就是目前尚没有真正完全清楚的“组蛋白密码”(Histone Code)。能够与甲基化组蛋白结合的蛋白质有sir1/2/3/4,这是一组被称为"Silencing Informative Repressor"的蛋白,其中,Sir2就是上文中的“去乙酰化”酶,而Sir1/3/4则负责与甲基化
关于基因沉寂的作用介绍
这个“原则”就是目前尚没有真正完全清楚的“组蛋白密码”（Histone Code)。能够与甲基化组蛋白结合的蛋白质有sir1/2/3/4，这是一组被称为"Silencing Informative Repressor"的蛋白，其中，Sir2就是上文中的“去乙酰化”酶，而Sir1/3/4则负责与甲
关于活性染色质的简介
活性染色质是指具有转录活性的染色质。活性染色质的核小体发生构象改变,具有疏松的染色质结构,从而便于转录调控因子与顺式调控元件结合和RNA 聚合酶在转录模板上滑动。 活性染色质主要特征活性：染色质具有DNase I超敏感位点（DNase I hypersensitive site）；活性染色质很
活性染色质的概念和特征
活性染色质是指具有转录活性的染色质。活性染色质的核小体发生构象改变，具有疏松的染色质结构，从而便于转录调控因子与顺式调控元件结合和RNA 聚合酶在转录模板上滑动。活性染色质主要特征活性：染色质具有DNase I超敏感位点（DNase I hypersensitive site）；活性染色质很少有组蛋
北京大学Cell子刊探究明星抑癌基因新功能
来自北京大学、康奈尔大学Weill医学院的研究人员在新研究中证实，PTEN通过与组蛋白H1相互作用控制了染色质凝聚，这一研究发现发表在9月4日的《Cell Reports》杂志上。 北京大学基础医学院的尹玉新（Yuxin Yin）教授以及康奈尔大学Weill医学院的Wen H. Shen是这篇
CHD3基因的结构特点和作用
该基因编码chd蛋白家族的一个成员，其特征是存在染色质组织修饰区和snf2相关的螺旋酶/atpase结构域。该蛋白是组蛋白去乙酰化酶复合物（mi-2/nurd复合物）的组成部分之一，该复合物通过去乙酰化组蛋白参与染色质的重塑。染色质重塑是包括转录在内的许多过程中必不可少的。抗这种蛋白的自身抗体存在于
组蛋白去乙酰化酶抑制剂的抑制剂作用
IPF是一种慢性进展性、生存期短且病因不明的肺部疾病。肌成纤维细胞活化、增殖、分化是致纤维化的关键因素，转化生长因子β1（ TGF-β1）是主要的促纤维化因子。研究表明TGF-β1在体内外均可促进成纤维细胞分化为肌成纤维细胞（通过 SMAD2、SMAD3磷酸化途径）及上皮细胞转化为间质成分（通过调节
组蛋白去乙酰化酶抑制剂的抑制剂种类
组蛋白去乙酰化酶抑制剂（HDACIs）包括结构不同的化合物，是一组有针对性的抗癌药物。当下发现的HDACi按其结构分为4类：一、脂肪酸，如丁酸盐、丁酸苯酯和丙戊酸，其中丙戊酸被用作抗癫痫药物；二、氧肟酸盐，如TSA是被发现的第1个能抑制HDACs的天然氧肟酸，SAHA 与TSA结构相似，是食品药品管
关于芽殖酵母的基本信息介绍
是用来研究异染色质形成、细胞周期、DNA复制等重要细胞功能的理想单细胞真核生物.这2种酵母中异染色质形成的机制.异染色质是一种抑制基因转录和DNA重组的特殊染色质结构.尽管在芽殖酵母和裂殖酵母中异染色质形成都需要组蛋白修饰,但异染色质建立的机制不同.在芽殖酵母中参与异染色质形成的主要蛋白是Sir
研究证明增强子活性的维持不依赖H3K27乙酰化修饰
2月21日，Genome Biology 在线发表了中国科学院生物物理研究所朱冰课题组的研究论文“Histone H3K27 acetylation is dispensable for enhancer activity in mouse embryonic stem cells”。组蛋白H3
组蛋白去乙酰化酶Rpd3S核小体去乙酰化和DNA－linker收紧的分子机制
近日，中国科学院广州生物医药与健康研究院联合澳门大学，在《细胞研究》（Cell Research）上，在线发表了题为Structural basis of nucleosome deacetylation and DNA linker tightening by Rpd3S histone de
支架蛋白BRPF2如何调控组蛋白乙酰转移酶HBO1的活性？
2月24日，国际学术期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所国家蛋白质科学中心（上海）丁建平研究组的最新研究成果：Structural and mechanistic insights into regulation of H
Polycomb组蛋白与染色质相互作用的关键机制
2021年6月，Genome Research杂志在线发表了法国巴黎萨克雷大学植物科学研究所Moussa Benhamed教授为通讯作者题为“Polycomb-dependent differential chromatin compartmentalization determines gen
《自然》揭示DNA损伤应答过程中染色质松散新机制
4月16日，深圳大学医学部基础医学院、卡尔森国际肿瘤中心教授朱卫国团队在《自然》杂志在线发表最新研究。他们揭示了连接组蛋白H1脱酰胺化修饰促进染色质开放和DNA损伤修复的机制，为肿瘤放化疗的精准靶标设计夯实了理论基础，是肿瘤防治基础研究领域取得的突破性进展。 癌症现已成为世界范围内死亡的主要原
《自然》揭示DNA损伤应答过程中染色质松散新机制
4月16日，深圳大学医学部基础医学院、卡尔森国际肿瘤中心教授朱卫国团队在《自然》杂志在线发表最新研究。他们揭示了连接组蛋白H1脱酰胺化修饰促进染色质开放和DNA损伤修复的机制，为肿瘤放化疗的精准靶标设计夯实了理论基础，是肿瘤防治基础研究领域取得的突破性进展。 癌症现已成为世界范围内死亡的主要原
研究揭示核小体乙酰转移酶NuA4的动态机制
组蛋白乙酰化是重要的表观遗传修饰。组蛋白乙酰转移酶在染色质结构、基因转录调控和DNA损伤修复过程中发挥重要作用。通常，表观遗传调控中的大部分组蛋白修饰酶具有位点特异性，即一种修饰酶只对组蛋白尾部的某个特定残基进行修饰。但有研究发现，较多组蛋白乙酰转移酶可以修饰多个位点。例如，核小体乙酰转移酶NuA4
研究揭示核小体乙酰转移酶NuA4的动态机制
组蛋白乙酰化是重要的表观遗传修饰。组蛋白乙酰转移酶在染色质结构、基因转录调控和DNA损伤修复过程中发挥重要作用。通常，表观遗传调控中的大部分组蛋白修饰酶具有位点特异性，即一种修饰酶只对组蛋白尾部的某个特定残基进行修饰。但有研究发现，较多组蛋白乙酰转移酶可以修饰多个位点。例如，核小体乙酰转移酶Nu
石晓冰：CRISPR发现与癌症有关的蛋白“阅读器”
近二十年来，科学家开始逐渐认识到DNA中的遗传密码只代表了生命蓝图中的一部分信息。遗传信息还来自于DNA结构上的特殊化学标签模式，这些表观遗传学标签决定了DNA包装的紧密程度以及特定基因的开关。 2014年，石晓冰研究组与清华大学李海涛教授研究组合作发现了一类新型组蛋白乙酰化修饰“阅读器”：Y
生物物理所等揭示组蛋白乙酰转移酶活性调节的新机制
8月9日，中国科学院生物物理研究所许瑞明课题组与美国哥伦比亚大学张志国课题组合作完成的研究论文，以Multisite substrate recognition in Asf1-dependent acetylation of histone H3K56 by Rtt109为题，发表在Cell上
《Cell》文章：特殊的表观遗传调控
来自中科院生物物理所，美国哥伦比亚大学的研究人员发表了题为“Multisite Substrate Recognition in Asf1-Dependent Acetylation of Histone H3 K56 by Rtt109”的文章，报道了Rtt109-Asf1-H3-H4复合物的
病原菌通过抑制组蛋白乙酰化而调控宿主先天免疫反应
植物的先天免疫系统可以识别病原菌并启动抗病基因的表达，但是在进化过程中，病原菌会演化出新的机制来逃避寄主免疫系统的监控。病原菌侵染常常会导致作物绝收，会造成非常大的经济损失。以大豆疫霉菌(Phytophthora sojae)为例，该病原菌可以侵染大豆的根茎而导致大豆绝产，每年导致的经济损失高达
组蛋白去乙酰化酶抑制剂的医学理论介绍
组蛋白去乙酰化酶抑制剂通过控制DNA缠绕于组蛋白的松紧程度来发挥作用。组蛋白去乙酰化酶通过组蛋白的去乙酰化（去除乙酰基），使DNA更紧地缠绕在组蛋白上，从而导致这些DNA不易被基因转录因子接触。结果导致与细胞分化、细胞周期阻滞、肿瘤免疫、受损细胞凋亡等有关的蛋白的表达受到抑制。这些因素都会促使癌
Nature：酒精有害大脑健康新机制促进脑细胞组蛋白乙酰化
日常生活中的触发因素，比如偶遇以前的饮酒伙伴，路过曾经熟悉的酒吧或参加节日聚会，可能会导致从酒精使用障碍（alcohol use disorder，指的是滥用酒精）中恢复过来的人们旧疾复发。如今，在一项新的研究中，来自美国宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院和西奈山伊坎医学院的研究人员发现在肝脏分解酒精
CHD3基因编码功能及结构描述
该基因编码chd蛋白家族的一个成员，其特征是存在染色质组织修饰区和snf2相关的螺旋酶/atpase结构域。该蛋白是组蛋白去乙酰化酶复合物（mi-2/nurd复合物）的组成部分之一，该复合物通过去乙酰化组蛋白参与染色质的重塑。染色质重塑是包括转录在内的许多过程中必不可少的。抗这种蛋白的自身抗体存在于