上海生科院发现Gadd45a参与DNA去甲基化的机制

4月6日,国际学术期刊Nucleic Acids Research(《核酸研究》)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所徐国良研究组题为Gadd45a promotes DNA demethylation through TDG 的最新研究成果。该研究发现Gadd45a(Growth arrest and DNA-damage-inducible protein 45 a)是通过TDG参与到DNA的去甲基化过程中。 哺乳动物基因组DNA中的5-甲基胞嘧啶(5mC)是一种稳定存在的表观遗传修饰,启动子区域的甲基化与去甲基化调控着基因的沉默与表达。DNA去甲基化机制的研究是表观遗传学重要的研究内容。徐国良研究组于2011年阐述了细胞中由Tet-TDG介导的5mC氧化去甲基化机制,即5mC可以被Tet家族蛋白氧化生成5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)和5-羧基胞嘧啶(5caC)。5caC会被DNA糖苷酶TD......阅读全文

生化与细胞所揭示调控起始性DNA甲基化发生的新机制

  最近一期的《细胞研究》(Cell Research)以封面文章的形式发表了中科院上海生命科学研究院生化与细胞所徐国良研究组在研究起始性DNA甲基化发生机制方面的新进展(Cell Res. 21: 1172-1181, 2011)。同期杂志就此新进展发表了评论性文章(Cell Res

关于DNA甲基化的简介

  DNA甲基化(DNA methylation)为DNA化学修饰的一种形式,能够在不改变DNA序列的前提下,改变遗传表现。所谓DNA甲基化是指在DNA甲基化转移酶的作用下,在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5号碳位共价键结合一个甲基基团。大量研究表明,DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、DNA稳

DNA甲基化的作用原理

DNA甲基化是最早被发现、也是研究最深入的表观遗传调控机制之一。广义上的DNA甲基化是指DNA序列上特定的碱基在DNA甲基转移酶(DNA methyltransferase,DNMT)的催化作用下,以S—腺苷甲硫氨酸(S—adenosyl methionine,SAM)作为甲基供体,通过共价键结合的

简述DNA甲基化的原理

  DNA甲基化是最早被发现、也是研究最深入的表观遗传调控机制之一。广义上的DNA甲基化是指DNA序列上特定的碱基在DNA甲基转移酶(DNA methyltransferase,DNMT)的催化作用下,以S—腺苷甲硫氨酸(S—adenosyl methionine,SAM)作为甲基供体,通过共价键结

DNA甲基化反应类型

DNA甲基化反应分为2种类型。一种是2条链均未甲基化的DNA被甲基化,称为从头甲基化(denovo methylation);另一种是双链DNA的其中一条链已存在甲基化,另一条未甲基化的链被甲基化,这种类型称为保留甲基化(maintenance methylation)。

甲基化的概念和过程

甲基化,是指从活性甲基化合物上将甲基催化转移到其他化合物的过程,可形成各种甲基化合物,或是对某些蛋白质或核酸等进行化学修饰形成甲基化产物。在生物系统内,甲基化是经酶催化的,这种甲基化涉及重金属修饰、基因表达的调控、蛋白质功能的调节以及核糖核酸加工。

甲基化特异性PCR

实验方法原理 MSP是一种简便、特异的、敏感的检测单基因甲基化的方式。其基本原理是用亚硫酸氢钠处理基因 组DNA,未甲基化的胞嘧啶变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变,然后用3对特异性的引物对所测基因的同一核苷酸序列进行扩增。扩增产物用DNA琼脂糖凝胶电泳,凝胶扫描观察分析结果。实验材料 DNA

DNA-甲基化测序常用方法

随着高通量测序技术(NGS)技术的发展,使我们能够从全基因组水平来分析 5’甲基胞嘧啶及组蛋白修饰等事件,由此能够发现很多传统的基因组学研究所不能发现的东西,这就是所谓的“DNA 甲基化测序”!DNA 甲基化测序方法按原理可以分成三大类: 1、重亚硫酸盐测序; 2、基于限制性内切酶的测序; 3、靶向

RNA甲基化促进草莓成熟

  果实中富含的营养成分是人类膳食结构的重要组成部分,对人体健康不可或缺。果实品质在成熟过程中逐渐形成,受到精确调控。解析果实成熟调控机制,将为果实品质改良和新品种选育提供理论基础。根据成熟机制的不同,果实可分为两种类型:呼吸跃变型(如番茄、苹果、香蕉)和非呼吸跃变型(如草莓、葡萄、柑橘)。植物激素

关于甲基化的功能介绍

  甲基化是蛋白质和核酸的一种重要的修饰,调节基因的表达和关闭,与癌症、衰老、老年痴呆等许多疾病密切相关,是表观遗传学的重要研究内容之一。 最常见的甲基化修饰有DNA甲基化和组蛋白甲基化。  DNA甲基化能关闭某些基因的活性,去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。DNA甲基化能引起染色质结构、DNA

DNA的去甲基化过程

DNA的去甲基化由基因内部的片段及与其结合的因子所调控。有两种假说可以解释DNA去甲基化的分子机制。一种假说与DNA半保留复制联系在一起,为被动去甲基化。如果甲基化的DNA经半保留复制后不被甲基化,其DNA则处于半甲基化状态,半甲基化的DNA如再次发生DNA半保留复制,而DNA甲基化活性仍被抑制,则

DNA甲基化的原理机制

DNA甲基化是最早被发现、也是研究最深入的表观遗传调控机制之一。广义上的DNA甲基化是指DNA序列上特定的碱基在DNA甲基转移酶(DNA methyltransferase,DNMT)的催化作用下,以S—腺苷甲硫氨酸(S—adenosyl methionine,SAM)作为甲基供体,通过共价键结合的

DNA甲基化的过程介绍

由于Dnmtl和Dnmt3基因家族没有针对CpG二核苷酸序列的特异性,人们因此提出了DNA甲基化转移酶发现靶位点的机制。首先,甲基化转移酶并不是同等地接近所有染色体区域。具有染色体重构和DNA螺旋酶活性的蛋白质能调节哺乳动物细胞内DNA甲基化,如SNF2家族2个成员ATRX和Lsh;其次,附件因子(

甲基化的生理功能

甲基化是蛋白质和核酸的一种重要的修饰,调节基因的表达和关闭,与癌症、衰老、老年痴呆等许多疾病密切相关,是表观遗传学的重要研究内容之一。 最常见的甲基化修饰有DNA甲基化和组蛋白甲基化。DNA甲基化能关闭某些基因的活性,去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、D

DNA甲基化的类型介绍

DNA甲基化反应分为2种类型。一种是2条链均未甲基化的DNA被甲基化,称为从头甲基化(denovo methylation);另一种是双链DNA的其中一条链已存在甲基化,另一条未甲基化的链被甲基化,这种类型称为保留甲基化(maintenance methylation)。

甲基化干扰实验的原理

甲基化干扰实验(Methylation interference assay)是根据DMS(硫酸二甲酯)能够使DNA分子中裸露的鸟嘌呤(G)残基甲基化,而六氢吡啶又会对甲基化的G残基作特异性的化学切割这一原理设计的另一种研究蛋白质同DNA相互作用的实验方法。

吸烟可以改变-DNA-甲基化

  近日,英国 Nature 出版社子刊《Scientific Reports》在线发表了浙江大学医学院附属第一医院李明定教授和他的学生马云龙博士最新研究成果——首次利用系统生物学的方法探讨吸烟如何导致癌症发生的表观遗传学机制,证明了吸烟可以通过改变 DNA 甲基化而导致癌症的发生,为预防和治疗由吸

甲基化特异性PCR

亚硫酸氢钠法             实验方法原理 MSP是一种简便、特异的、敏感的检测单基因甲基化的方式。其基本原理是用亚硫酸氢钠处理基因 组DNA,未甲基化的胞嘧啶变成尿嘧啶

概述DNA甲基化的机制

  由于Dnmtl和Dnmt3基因家族没有针对CpG二核苷酸序列的特异性,人们因此提出了DNA甲基化转移酶发现靶位点的机制。首先,甲基化转移酶并不是同等地接近所有染色体区域。具有染色体重构和DNA螺旋酶活性的蛋白质能调节哺乳动物细胞内DNA甲基化,如SNF2家族2个成员ATRX和Lsh;其次,附件因

氯甲基化反应的简介

  向芳环上直接导入一个氯甲基的反应称为氯甲基化反应。利用苯的氯甲基化反应可制备苄氯,也可将该反应看作一类特殊的傅-克反应。和普通的亲电取代反应一样,当芳环上有第一类取代基(给电子基团)时,反应易 于进行,氯甲基主要进入对位。例如:  Ph—CH3 +H2C═O +HCl —→CH3—Ph—CH2C

DNA的诱变和甲基化

·         In Vitro Mutagenesis Using Altered Sites (Bowtell Lab) In vitro Mutagenesis with dut ung single stranded DNA (Hahn Lab)·         Site-direct

羧甲基化反应的定义

天然纤维素是自然界中分布最广、含量最多的多糖,来源十分丰富。当前纤维素的改性技术主要集中在醚化和酯化两方面。羧甲基化反应是醚化技术的一种。纤维素经羧甲基化后得到羧甲基纤维素(CMC),其水溶液具有增稠、成膜、黏接、水分保持、胶体保护、乳化及悬浮等作用,广泛应用于石油、食品、医药、纺织和造纸等行业,是

DNA甲基化的作用特点

DNA甲基化(DNA methylation)为DNA化学修饰的一种形式,能够在不改变DNA序列的前提下,改变遗传表现。所谓DNA甲基化是指在DNA甲基化转移酶的作用下,在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5号碳位共价键结合一个甲基基团。大量研究表明,DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性

关于甲基化的类型介绍

  甲基化包括DNA甲基化和蛋白质甲基化。  (1)DNA甲基化:脊椎动物的DNA甲基化一般发生在CpG位点(胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤位点,即DNA序列中胞嘧啶后紧连鸟嘌呤的位点)。经DNA甲基转移酶催化胞嘧啶转化为5-甲基胞嘧啶。人类基因中约80%-90%的CpG位点已被甲基化,但是在某些特定区域,如

DNA甲基化有什么作用

DNA甲基化作用主要是DNA甲基转移酶以S-腺苷甲硫氨酸(SAM)为甲基供体,将甲基转移至碱基特定结构上的过程。哺乳动物中90%的DNA甲基化修饰是由DNA甲基转移酶识别DNA的5'CG-3'序列(CpG),并将SAM的甲基转移至胞嘧啶C-5位上。DNA 甲基化可引起基因组中相应区域

RNA甲基化研究深度剖析

  一、听说最近 RNA甲基化很火,它是何方神圣?   1、高分文章频现   说起近来的科研热点,RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一,亮点文章频出,着实让人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月发表的文章影响因子为10分以上的,就有高达 17 篇。

概述甲基化的功能作用

  甲基化是蛋白质和核酸的一种重要的修饰,调节基因的表达和关闭,与癌症、衰老、老年痴呆等许多疾病密切相关,是表观遗传学的重要研究内容之一。 最常见的甲基化修饰有DNA甲基化和组蛋白甲基化。  DNA甲基化能关闭某些基因的活性,去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。DNA甲基化能引起染色质结构、DNA

母体维生素C调节DNA去甲基化和雌性胎儿生殖细胞发育

  通常来说,发育被认为是基因组固有调控的,不过目前这种观点已经被刷新。证据表明,发育很容易受到外界环境调节的影响,并可能产生长期后果,当然这其中也包括哺乳动物。所以呢,由于这种表观遗传效应的潜在可能性,研究者们对具有这种潜能的生殖细胞一直青睐有加。  哺乳动物的生殖细胞经历了广泛的DNA去甲基化,

Hopx甲基化通过激活SNAIL转录而促进鼻咽癌细胞的迁移-二

4、HOPX抑制鼻咽癌细胞的EMT过程在N2-Tert,,NP69 和SH cells敲低HOPX后,细胞形态发生显著变化。SUNE1细胞系中过表达HOPX后,检测发现ECADHERIN显著上调。5、鼻咽癌细胞中HOPX抑制SNAIL转录由于EMT-TFs在EMT过程中起着重要的角色,研究者检测了H

Hopx甲基化通过激活SNAIL转录而促进鼻咽癌细胞的迁移-一

《Nature Communications》甲基化研究揭示鼻咽癌治疗新靶点研究背景在中国华南地区,鼻咽癌有较高的发病率。目前,鼻咽癌病人的治疗方案主要取决于病人的TNM分期。但是,约30%的鼻咽癌病人虽然处于相同的TNM分期,采用相同的治疗方案,其结果也不尽相同。表观层面的改变对于肿瘤起始和发展,