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BioTechniques:如何提高iPS研究的重复性

生命科学中的重复性一直都是个敏感话题。至于诱导多能干细胞(iPS),因未来可能涉及到临床应用,其重复性更加引人关注。在这一期的《BioTechniques》上,Jeffrey Perkel就介绍了研究人员通过哪些方式来应对这一问题。 Perkel首先谈到了试剂困境。没有人会怀疑iPS过程本身,但问题在于细节。研究人员已开发出许多方法来导入转录因子,诱导终末分化的细胞回到类似胚胎干细胞的多潜能状态。当然,iPS细胞在遗传背景上不同,因为它们是从不同的个体创建的。不过,即使来自同一个体的iPS细胞,其转录和表观遗传图谱也不完全相同,这也许反映了培养条件或操作的细微差异。 对于重复性而言,遗传学只是硬币的一面。细胞对环境极其敏感,因此表现得很善变,改变血清或生长因子的批次都可能引起差异。然而,最主要的问题还是在于不可靠的试剂。美国NIH干细胞部门的科学主任Pamela Robey表示:“我认为这是人们有时候很难重现数据的一个主......阅读全文

CD34阳性细胞计数-1

外周血现已被广泛地被用作骨髓移植、癌症患者接受大剂量化疗或放疗后骨髓重建造所需血干细胞(Hemotopoietic Progenitor Cells HPC)的来源。外周血源性干细胞现主要被运用自体移植,其应用面也逐步拓展至异基因骨髓移植中。使用外周血替代骨髓作为造血干细胞的来源有着以下优点:1,易

中国最早人兽胚胎研究缘何被中断

首个正式发表论文的带头人盛慧珍因多种原因离开团队  最近英国原则上批准了一类人兽混合胚胎实验。其实类似的研究在中国早已进行,并发表了论文。但由著名科学家盛慧珍领导的这一工作目前已基本中断,整座大楼显得空空荡荡。 9月5日,英国“人工受精与胚胎学管理局”(HFEA)原则上批准了一类人兽混

江湖论剑:制约干细胞治疗“机会窗口”开启的技术瓶颈

  “江湖论剑”,听听不同的声音。静下心来,潜心研究,我们将走的更远。知己知彼,方能百战不殆。今天让分享一下科学网博主金石先生(原作者笔名)对干细胞治疗观点的最后一篇。  1合理的干细胞来源  许多实验室发布自己在干细胞领域的研究成果,而事实上多数发表在顶级刊物上研究成果却难以重现,排除试剂、装备、

梳理近期那些不靠谱的研究

  近年来,由于细胞系污染、实验技术本身存在问题而有待改进、实验结果无法重复和研究人员存在学术不端等缺陷,不少论文的实验结果广受质疑,甚至论文惨遭撤回。基于此,小编针对近期这方面的相关新闻进行梳理,以飨读者。  1.PLoS ONE:HeLa细胞幽灵---细胞系污染导致大约3.3万篇论文存在问题  

4月2日世界自闭症日 解读CNS杂志自闭症领域重要成果

  目前,全球人群自闭症发病率逐年上升,来自美国最新数据显示,自闭症儿童发病率已由2009年的1/88,上升至现在的1/45;有数据表明,中国自闭症发病率达0.7%,目前中国自闭症患者超过1000万,其中12岁以下的儿童约有200多万。自闭症以男孩多见,其是脑部神经发育异常造成的一种终身性疾病,目前

Nature:STAP干细胞兴衰始末,如何瞒天过海

  今年一月份Nature发表的两篇文章,曾被认为是干细胞制备的一次革命。文章指出,只要将已分化细胞置于压力条件下,就可以将它们“重编程”成为多能细胞(可分化为任何类型的组织)。然而不久,人们就发现了文章中的漏洞,对这项研究的重复也均告失败。文章的第一作者小保方晴子(Haruko Obokata)被

2018年度巨献:打破教科书,挑战常规的突破性研究解读

  很多教科书中的理论知识及日常生活中的传统观点仅限于目前科学家们的研究结果,然而随着时间推进,科学研究在不断在发展的同时,一些新的研究成果也会层出不穷,很多教科书中的观点也会被覆盖更新,很多传统认知也会被替换。那么2018年都有哪些打破教科书或挑战传统认知的突破性研究成果呢,本文中,小编就对201

常用的分子生物学基本技术

核酸分子杂交技术由于核酸分子杂交的高度特异性及检测方法的灵敏性,它已成为分子生物学中最常用的基本技术,被广泛应用于基因克隆的筛选,酶切图谱的制作,基因序列的定量和定性分析及基因突变的检测等。其基本原理是具有一定同源性的原条核酸单链在一定的条件下(适宜的温室度及离子强度等)可按碱基互补原成双链。杂交的

Science:5篇顶级癌症研究文章重复率差!

  Science日前报道了癌症生物学领域重现性项目(Reproducibility Project:Cancer Biology)指出该领域中一些高影响力癌症研究文章可重复性非常差。其中,第一阶段的5篇备受瞩目的癌症研究文章,在严格按照原始研究的实验Protocol下进行重复性验证后,发现只有两篇

造假十多年撤稿31篇,这位心机大牛因何骗过全世界?

近日,一条堪比“八级地震”的造假事件震惊了学术圈:一位“心肌细胞”领域大牛——皮耶罗·艾佛萨(Piero Anversa)的31篇论文被撤稿,撤稿的理由是这些论文涉嫌伪造数据。请求撤稿的不是皮耶尔本人,而是他所在的哈佛大学医学院和附属布里格姆妇女医院。  哈佛大学医学院为何执意检举自己的教授,要求期

癌症再现项目发布首批结果

   今年,美国加州拉荷亚斯坦福伯翰医学研究所(SBP)癌症生物学家Erkki Ruoslahti启动的一个在癌症病人身上开展的药物试验已步入正轨,但该实验目前也许正处于险境。原因是一项雄心勃勃的开放科学计划发布了第一批结论,Ruoslahti不幸登上了黑名单。  这个再现性项目旨在检验重要癌症生物

神经生物学领域最新研究进展

  本期为大家带来的是神经生物学领域最近的研究进展,希望读者朋友们能够喜欢。  1. Nature:新研究首次揭示抑制年龄相关的神经活动增加竟可延长寿命  doi:10.1038/s41586-019-1647-8.  在一项针对线虫、小鼠和人类的研究中,来自美国哈佛医学院的研究人员发现在整个动物界

CyTOF和细胞Barcode技术在干细胞研究领域中的应用

“每个细胞都有太多我想知道的东西, 我一直都在试图检测更多的转录因子、更多的信号通路分子、更多的表面Marker以及更多的样本——而且最好是同时检测它们,这真是干细胞研究者的梦想。”          

Cell子刊:干细胞如何领到它们的“身份证”

  来自哥本哈根大学的科学家们发现了一种机制,可以解释干细胞是如何选择变为特定的细胞类型的:这些细胞在沿着DNA的精确位点上组合了数组特定的蛋白质。当这几组特定的蛋白质组合到一起时,大门被打开,几组特定的基因由此获得利用,赋予了细胞新身份。  科学家们现在确定了其中的一种组合,其沿路驱动细胞使得它们

我国实验材料标准物质资源共享平台技术规范体系基本形成

在国家科技基础条件平台基本建设方针指导下,实验材料和标准物质资源共享平台各项工作任务稳步进行,进展喜人,促进国家科技基础条件平台建设、经济、社会发展和推动科技进步作用明显,平台技术规范体系基本形成,对平台及资源领域良性发展支撑作用明显。 通过系统设计和持续发展,全面涵盖标准物质各发展领域的平台技术

实验材料和标准物质资源共享平台技术规范

我国实验材料和标准物质资源共享平台技术规范体系基本形成     在国家科技基础条件平台基本建设方针指导下,实验材料和标准物质资源共享平台各项工作任务稳步进行,进展喜人,促进国家科技基础条件平台建设、经济、社会发展和推动科技进步作用明显,平台技术规范体系基本形成,对平

一览细胞培养的前沿技术

  在最新一期《自然》(Nature)杂志上的一篇文章中,身为《Nature》以及《Nature Methods》的技术编辑费雯丽`马克思(Vivien Marx)想读者介绍了细胞培养的新进展,并概况了这一领域的前沿技术。以下为全文:  细胞培养基技术领域的进展,能帮助科学家们更深入的了解这些混合物

超过70%的科研人员都有过重复别人试验,并且失败的经历

  超过70%的科研人员都有过重复别人试验,并且失败的经历,超过一半的科研人员在重复自己试验时也曾遭遇过失败。这就是《自然》(Nature)杂志针对1576名科研人员所做的在线网络调查得到的结果,该调查的主题就是——科研试验的可重复性(reproducibility)。  该调查发现,我们对待试验可

酶类研究

前言:酶是生物体内进行新陈代谢不可缺少的一大类大分子物质,受多种因素调节控制,具有催化生物反应的功能。酶参与生物体所有的生命活动:思考,运动,睡眠,呼吸等都是以酶为中心的活动结果。酶的生物作用催动着机体充满活力的生化反应,促使生命现象不断健康的运行。酶作为生命活动的中心,长期以来,研究者针对酶的结构

基于数字PCR的单分子DNA定量技术研究进展(三)

3.2 dPCR在转基因植物检测方面的研究 转基因植物及相关食品的定量分析主要测定转入基因的相对含量。目前常用qPCR作为核酸定量方法。dPCR可以不需要校准物而准确测量低拷贝的DNA分子。Corbisier 等用dPCR分析了提取于MON810玉米种子的外源检测基因和hmg基因的拷贝数,

新型超微量染色质免疫共沉淀ChIP-seq技术-Cut&Tag

  文章导读   染色质免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation , ChIP)是研究蛋白质与DNA互作的标准方法。通过与高通量测序技术相结合,研究者开发了ChIP-seq技术,从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA片段信息,目前被广泛应用于转录调控、

新型超微量染色质免疫共沉淀ChIP-seq技术-Cut&Tag

  染色质免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation , ChIP)是研究蛋白质与DNA互作的标准方法。通过与高通量测序技术相结合,研究者开发了ChIP-seq技术,从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA片段信息,目前被广泛应用于转录调控、表观遗传等研究领

科学家揭开“垃圾”DNA的神秘角色!

  生物学家们在很长一段时间里都认为,既然几乎所有具体的生理机能都要由蛋白质来完成,那么不编码蛋白质的DNA应该是没有用的,可以称为“垃圾DNA”;而且人类基因组项目发现人的基因组中仅有1.5%的序列是给蛋白质编码的,其余的98.5%的序列是以前认为的“垃圾”DNA。  此前研究人员进行了一项名为E

知识分享:维真腺病毒系统产品手册

  产品说明书   本产品仅限用于研究,严禁用于疾病诊断。   本产品仅供购买方内部研究使用,未经Vigenebio公司书面许可,严禁转售。   产品有限责任担保   Vigenebio保证您收到的产品符合产品目录上的规格。本担保规定了Vigenebio更换产品的责任。Vigenebio不提

Eppendorf携新品亮相2014慕尼黑上海分析生化展

  9月24日,2014慕尼黑上海分析生化展在上海新国际博览中心隆重召开。Eppendorf是一家领先的生命科学公司,专注于研发和销售实验室的液体处理、样品处理和细胞处理的仪器、耗材和服务。在本次慕尼黑生化展上,Eppendorf 携全新的细胞培养耗材、New Brunswick与DASG

microRNA的实时定量茎环RT-PCR技术

  microRNA的实时定量茎环RT-PCR技术   摘要:   已开发出一种新型的microRNA(miRNA)的定量方法,即利用茎环反转录,Taqman PCR分析。茎环RT引物在RT 效率和特异性方面比传统的更好。TaqMan miRNA的检测是很具体的,可以检测成熟miRNA和区分

常见小鼠肿瘤模型特点概述

   【干货】小鼠肿瘤模型那些事儿    嗨,小伙伴们晚上好啊!首先呢,小编想问大家一个问题,咱们天天挂在嘴边的小鼠肿瘤模型到底是怎么构建的呢?每种模型的特点是什么?最优秀的模型又属哪一个?.....其实吧,要说模型佼佼者,当然是越能体现人类疾病的发生和发展就越好,毕竟,“坚持以人为本”才是我们的

日本屡屡斩获诺奖原因何在

  引言:近年来,日本诺贝尔奖“花开遍野”,而中国却在诺奖上收获无几。中日文化等方面相近,到底日本在国家政策制度和科学文化方面有哪些特点,又是如何帮助其科技进步的呢?  谈到科技兴国,人们常常拿美国做标杆,认真研讨美国的政策、法令、机制、做法,因为美国是世界上科技最发达的国家。但作为一个典型的西方国

常见小鼠肿瘤模型特点概述

嗨,小伙伴们晚上好啊!首先呢,小编想问大家一个问题,咱们天天挂在嘴边的小鼠肿瘤模型到底是怎么构建的呢?每种模型的特点是什么?最优秀的模型又属哪一个?.....其实吧,要说模型佼佼者,当然是越能体现人类疾病的发生和发展就越好,毕竟,“坚持以人为本”才是我们的最终目的!但话说回来,每种模型都有其优劣,没

高通量、低成本 SNP、突变和甲基化检测方法 ——HRM技术应用

  HRM介绍    HRM技术是 high-resolution melting analysis即高分辨熔解曲线分析技术,是近年国外兴起的一种全新的突变扫描和基因分型的遗传分析方法。基于高效稳健的 PCR技术,HRM不受突变碱基位点与类型局限,无需序列特异性探针,在 PCR结束后直接运行高分