JBC:最完整的酶家族功能图
最近,美国能源部资助的科学用户设备,与三大生物能研究中心其中之一合作,开发并分析了纤维素降解酶家族GH55中一种酶的高分辨率晶体结构。然后他们进一步运用各种技术,完成了“整个GH酶家族迄今为止最完整的功能图。” GH55酶家族的成员因其分解纤维素的能力而众所周知,因此是致力于提升大规模生物燃料生产的生物能源研究者比较感兴趣的。本研究中所描述的方法,可以允许研究人员同时研究整个酶家庭,从而加速了研究纤维素降解酶的过程。 美国能源部联合基因组研究所(DOE JGI)进行的许多微生物和宏基因组项目,都集中在昆虫和动物的肠道微生物群落,因为它们在分解宿主所消耗的植物团块中发挥作用。当DOE JGI研究人员在《Science》发表奶牛瘤胃宏基因组数据时,他们向(CAZymes)数据库增加了近30,000个候选纤维素降解基因——编码碳水化合物活性酶。 但是,对这些基因中每一个基因进行功能注释,这个过程可能是耗时的。例如,纤维......阅读全文
研究揭示功能基因缓解大豆铝毒害的微生物机制
近日,华南农业大学农学院教授年海团队在功能基因缓解大豆(Glycine max L.)铝毒害的潜在微生物机制方面取得新进展。相关研究发发表于Journal of Hazardous Materials。刘灵锐为该论文第一作者,年海、马启彬和连腾祥为共同通讯作者。植物抗性基因可以影响根际微生物群落结构
转基因猪生物反应器领域研究获重要进展
利用转基因猪唾液腺生物反应器合成hNGF蛋白示意图。研究团队 供图华南农业大学动物科学学院、国家生猪种业工程技术研究中心教授吴珍芳团队在转基因猪生物反应器领域取得重要研究进展,在国际上首次利用转基因猪的唾液腺作为生物反应器,高效合成一种对人的神经性疾病具有良好治疗作用的蛋白—人神经生长因子。相关研
基因组研究:揭示偏头痛的生物学根源
在偏头痛的研究中,研究人员第一次发现了新的5个遗传区域与偏头痛相关。这项研究为理解偏头痛的原因和生物因素打开了新的研究大门。 研究人员发现了12个与偏头痛相关的遗传区域。其中8个区域在控制脑电路中发挥着重要的作用,其中2个区域的相关基因主要作用为维持健康脑组织。这些信号通路的调节对于遗传易感性
微生物所在人体肠道细菌耐药基因研究方面取得进展
人体肠道中栖息着种类繁多的微生物,其数量超过人体自身细胞的10倍以上。这些微生物的基因组中(microbiome)蕴含大量的遗传信息,被称为是“人体的第二个基因组(the second genome of human body)”。人体肠道微生物对人体肠道内营养物质的代谢、人体自身的发育
成都生物所在新的基因敲降工具研究中获进展
锤头状核酶HHRz是一种能够催化RNA剪切反应的功能核酸大分子,可在特定的位置对底物RNA进行剪切。目前,核酶作为基因治疗工具已应用于癌症、退行性疾病以及病毒性疾病的基因治疗研究中。其中将HHRz作为基因敲降工具治疗艾滋病的临床二期研究结果表明,锤头状核酶是非常安全的基因敲降工具,由于其不需要任
Nature肠道微生物研究争论:是环境,还是基因影响更大?
关于对微生物组成的相对影响以及微生物对疾病的影响,到底是宿主遗传学,还是环境作用更大,一直都是肠道微生物研究的争论热点。 一项最新研究指出,环境在确定人类肠道微生物群的组成方面起着比宿主遗传学更大的作用。这一研究发现,在预测人类特征(如胆固醇水平或肥胖)时,将微生物组学特征纳入评估标准,能使得
为生命工厂奠基-合成生物学研究期待完美基因工具
从进化的角度讲,酵母与制作止痛剂可谓风马牛不相及。但是通过对这种微生物的基因重新进行编辑,美国斯坦福大学科学家Christina Smolke使其精确地拥有了这一功能,Smolke团队用糖作为一种原料,将酵母转变成了一个“生物工厂”,生产出了有效的止痛剂氢可酮。 这是合成生物学的有名案例之一。
广州生物院通用型生物反应器用于多重基因分型研究获进展
基因导向个性化用药可以根据病人基因结构信息,有针对性地选择药物,并确定最适合病人的用药剂量,将成为未来理想的治病新模式。基于聚合酶链式反应 (PCR)技术的分子诊断技术是目前广泛使用的基因分型工具,然而这些技术需要复杂昂贵的热循环仪和专业操作人员,限制了它们的广泛应用。 中科院广
基因和蛋白质研究为蜘蛛生物学开启新时代
在展示大自然魔鬼般的创造力方面,很难有什么能打败蜘蛛。以隐居的鬼面蜘蛛为例,它们长着很大的尖牙以及凸起且超大的中眼。在整个热带地区,这些八条腿的怪兽挂在树枝上,并在前腿中间撑起一张可伸展的丝网,以便它们能以闪电般的速度将网罩在猎物上。相比之下,艳丽的孔雀蜘蛛到处炫耀彩虹色的腹部以吸引异性,而它
生物标志物研究与早期药物研发基因表达分析功...(四)
FFPET 样本特异性RealTime ready qPCR检测潜在生物标志物假设检验我们使用的第一套临床样本来自于各种用于人类研究的福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)组织。肿瘤来源的 FFPE 组织是临床试验或生物标志物研究中,治疗复合物研发最具有相关性的样本材料。使用 High Pure
生物标志物研究与早期药物研发基因表达分析功...(二)
材料与方法 细胞培养于标准条件下进行肿瘤细胞系(ACHN、Caki、SJSA、PANC-1、MDA-MB231、AsPC-1、SK-MES、NCI-H322M、22RV1)培养。使用TWEAK或 Anti-TWEAK(RO5458640)分别对细胞进行处理。于不同时间点收集肿瘤细胞系(0、6、2
生物标志物研究与早期药物研发基因表达分析功...(一)
生物标志物研究与早期药物研发基因表达分析功能学检测RealTime ready 应用生物标志物研究与早期药物研发基因表达分析功能学检测RealTime ready应用 Sabine Lohmann*, Andrea Herold*, Tobias Bergauer#, Anton Belouso
器官边界区基因调控网络的系统生物学研究获进展
植物的侧生器官边界区将叶片等侧生器官(分化细胞)与顶端分生组织(干细胞)分隔开,确保器官的形成和干细胞的维持。此外,器官边界区产成侧生分生组织,进而形成侧芽,影响植物株型的建成。但由于边界区细胞数量较少,表型不易观察,因此对边界区形成的正反向遗传学研究都很困难,使得我们对边界区形成的调控机理知之
生物标志物研究与早期药物研发基因表达分析功...(三)
靶基因表达标准化参考基因选择对于相关定量分析来说,通过参考基因表达进行靶基因表达标准化。理想情况下,标准化处理应该能够补偿 RNA/cDNA起始量变异情况,以及cDNA合成或 PCR 扩增中潜在抑制剂的作用。参考基因作为内源性样本材料对照,工作流中,与靶基因一同被处理。为获取可靠结果,标准化
转基因生物的概念
“转基因生物”一词的最初来源是英语“Transgenic Organisms”,因为在上世纪70年代,重组脱氧核糖核酸技术(rDNA)刚开始应用于动植物育种的时候,常规的做法是将外源目的基因转入生物体内,使其得到表达,因而在早期的英语文献中,这种移植了外源基因的生物被形象地称为“transgenic
转基因生物的种类
应用转基因技术培育的转基因生物已多达上百种,它们中有的用于生产医药类的疫苗、生物制剂;有的用于生产食品工业中的纤维素酶、凝乳酶;有的用于消除环境污染;还有许多转基因生物在农业生产中发挥了重要作用。
转基因生物的发展
随着分子生物技术的不断发展,尤其是上世纪90年代末以来,科学家们能够在不导入外源基因的情况下,通过对生物体本身遗传物质的加工、敲除、屏蔽等方法也能改变生物体的遗传特性,获得人们希望得到的性状。 在此类情形下,没有转入外源基因,严格说就不能再称为转基因,称为“基因修饰”更加合适和全面,因此现在开
华大基因中心正研究智商基因
中国有基因中心进行天才基因比对研究,希望解开人类智力密码。相关研究容易引起道德争议,被利用来针对某个族群。亦有学者担心,人类有朝一日会藉研究成果,透过胚胎筛选技术製造天才婴儿。 深圳华大基因中心进行的基因智力专桉,是将从世界各地收集到的2000组聪明人的基因样本,和普通人的基因样本做比对,
《生物制药基因学》:吸烟可“开关”基因
刊登在最新一期《生物制药基因学》杂志上的一份研究报告显示,吸烟者身体健康会因吸烟受到“永久性损害”。路透社9月30日援引这份研究报告说,吸烟可“开启”一些有害基因或“关闭”一些有益基因,且戒烟后这些基因的不正常状态数年内不能得到修复。这解释了戒烟者肺癌发病率仍居高不下的原因。 加拿大不列颠哥伦比亚癌
微生物所多粘菌素耐药基因mcr1的比较基因组研究获进展
12月17日,国际学术期刊《柳叶刀感染性疾病》杂志在线发表了中国科学院微生物研究所病原室研究员朱宝利课题组对多粘菌素耐药基因mcr-1的比较基因组分析通讯文章。 11月18日,华南农业大学教授刘健华和中国农业大学教授沈建忠领导的团队在《柳叶刀感染性疾病》杂志发表文章,在动物和住院患者中发现多粘
微生物所多粘菌素耐药基因mcr1的比较基因组研究获进展
12月17日,国际学术期刊《柳叶刀感染性疾病》杂志在线发表了中国科学院微生物研究所病原室研究员朱宝利课题组对多粘菌素耐药基因mcr-1的比较基因组分析通讯文章。 11月18日,华南农业大学教授刘健华和中国农业大学教授沈建忠领导的团队在《柳叶刀感染性疾病》杂志发表文章,在动物和住院患者中发现多粘
现代生物研究揭示古生物进食模式
对比大鳄鱼和亚马逊河豚的头部,你可能会发现一些惊人的相似点。至少科学家是如此。研究人员对超过75种现存活鳄鱼物种和齿鲸的颅骨和下颌骨进行对比后发现,尽管它们在进化学上分开了近3亿年,但这些生物头骨和鼻子的形状有着广泛且惊人的相似性。 总体来看,拥有较宽鼻子和相对大而结实颅骨的捕食者,如鳄鱼和逆
中国科学家参与全球最大微生物基因组研究项目
中国科学家22日宣布将参与全球最大微生物基因组研究项目(Earth Microbiome Project,EMP),并承担核心工作。该项目旨在全面、系统地研究全球范围内的微生物群落的功能及进化多样性,以便更好地造福人类。 与以往的微生物研究有所不同,该项目的研究对象不仅仅集中于海洋和
研究实现在生物体内“剪贴”基因治疗遗传病
美国研究人员26日在英国《自然》杂志上报告说,他们在实验鼠体内实现了通过“剪切”和“粘贴”基因来治疗血友病。这一技术有望用于治疗其他遗传病。 英国《自然》杂志网站刊登报告说,美国费城儿童医院等机构的研究人员用这种方法有效治疗了患有血友病的实验鼠。血友病是由基因变异引起的一种遗传病,患者血液
朱永官等研究称基因工程有望用于砷污染生物修复
日前,中科院城市环境所朱永官课题组在光合生物对砷的甲基化研究方面取得新进展。其研究成果表明,可以通过基因工程方法使植物具有挥发砷的能力,从而应用于砷污染土壤的生物修复。 砷在环境中广泛存在并对人体健康不利。我国也是受砷污染困扰的国家之一。砷在自然界中存在多种形态,砷形态对其毒性、移动性和最
Science:新研究将转基因烟草的生物量增加大约40%
在一项新的研究中,来自美国农业部和伊利诺伊大学香槟分校的研究人员将遗传构造体导入到烟草植物中,从而调整它们中的一种称为光呼吸(photorespiration)的过程。 当一种称为Rubisco的酶意外地捕获氧分子而不是植物生长所需的二氧化碳时,光呼吸就会发生。这种过程在大约20%的时间里发生
生物芯片在功能基因组学研究中的应用进展
生物芯片技术是伴随人类基因组研究发展起来的,它是指通过微电子、微加工技术,在固体基质(如硅芯片、玻片、瓷片等)表面构建的微型生物化学系统,以实现对细胞、蛋白质、核酸及其它生物组分进行快速、敏感、高效地处理。一般来说,应用芯片进行实验主要包括3个步骤:样品制备、生物化学反应、检测和数据分析处
我国科学家参与全球最大微生物基因组研究项目
近日,深圳华大基因研究院宣布,我国科学家将参与全球最大微生物基因组研究项目,对来自全球的20万个样本进行环境DNA测序或宏基因组测序,从而建立一个全球性的基因图谱,并承担核心工作。该项目旨在全方位、系统性研究全球范围内微生物群落功能及进化多样性,以便更好地造福社会及人类。 与以往的微
生物芯片用于基因测序
基因芯片利用固定探针与样品进行分子杂交产生的杂交图谱而排列出待测样品的序列,这种测定方法快速而具有十分诱人的前景。研究人员用含135000个寡核苷酸探针的阵列测定了全长为16.6kb的人线粒体基因组序列,准确率达99%。用含有48000个寡核苷酸的高密度微阵列分析了黑猩猩和人BRCA1基因序列差异,
生物芯片用于基因诊断
从正常人的基因组中分离出DNA与DNA芯片杂交就可以得出标准图谱。从病人的基因组中分离出DNA与DNA芯片杂交就可以得出病变图谱。通过比较、分析这两种图谱,就可以得出病变的DNA信息。这种基因芯片诊断技术以其快速、高效、敏感、经济、平行化、自动化等特点,将成为一项现代化诊断新技术。例如Affymet