Nature子刊:表观遗传学研究的强大工具

西奈山伊坎医学院(Icahn School of Medicine at Mount Sinai)的科学家们开发了一个新技术,可以更精确地揭示细菌群体的表观遗传学异质性。这项研究发表在六月十五日的Nature Communications杂志上,为人们提供了表观遗传学研究的新工具,有助于解决愈演愈烈的致病菌耐药性问题。 DNA所蕴含的信息不只是核苷酸序列这么简单,DNA上的化学修饰也会产生显著的功能性影响。DNA甲基化是细菌中最普遍的表观遗传学修饰,尤其是腺嘌呤和胞嘧啶上的甲基化。这些修饰在调控基因表达、细菌毒力和抗生素抗性中起到了重要作用。 研究团队使用PacBio® RS II测序系统,在收集DNA序列数据的同时获取碱基修饰数据。PacBio单分子实时测序技术可以检测到N6-methyladenine(6mA)和4-methylcytosine(4mC),这是组成细菌甲基化组的两种主要修饰。 现有的细菌甲基化组研究......阅读全文

Nature:遏制哮喘的表观遗传学酶

  研究人员发现重编程小鼠体内促哮喘的免疫细胞可以减少气道损伤和炎症,并有可能促成哮喘患者的新治疗。   研究人员能够重编程的促哮喘细胞是一种称为Th2细胞的免疫细胞,他们确定了一种可以修饰这些细胞DNA的酶。该酶可作为开发过量Th2细胞导致的慢性炎症疾病,尤其是过敏性哮喘的新疗法的一个靶点。相关

PerkinElmer发布表观遗传学和NGS新品

  在上周举行的实验室自动化和筛查学会(SLAS)第二届年会上,PerkinElmer公司展示了一系列新产品,包括表观遗传学生化工具箱、JANUS® NGS Express™液体处理工作站和Sciclone® NGSx Workstation™平台。   表观遗传学新品   表观遗传学生化工

PLOS-Genet:单分子测序技术助力原核生物DNA甲基化研究

  近日,刊登在国际杂志PLoS Genetics上的一项研究论文中,来自美国能源部联合基因组研究院的研究人员对230种古细菌和细菌基因组进行了测序,旨在研究DNA甲基化在原核生物中所扮演的关键角色。  细胞的表观基因组是基因组DNA特殊剪辑发生改变的一个特殊集合,这些表观基因组的改变会影响基因组的

厦门大学PNAS表观遗传学新文章

  来自厦门大学、加州大学圣地亚哥分校的研究人员证实,热休克蛋白HSP70精氨酸甲基化调控了维甲酸介导的RARβ2基因激活。这项研究发布在6月16日的《美国国家科学院院刊》(PNAS)上。  厦门大学药学院的刘文(Wen Liu)教授和加州大学圣地亚哥分校的Michael G. Rosenfeld教

何川教授eLife最新表观遗传学成果

  7月2日,国际著名学术期刊《eLife》在线刊登了芝加哥大学何川教授(Chuan He)和俄亥俄州立大学Li Wu带领的一项研究成果,题为“N6-methyladenosine of HIV-1 RNA regulates viral infection and HIV-1 Gag protei

Science:表观遗传学实现行为重编程

  在佛罗里达木蚁中,大工蚁(majors)和小工蚁(minors)属于两个完全不同的阶级,它们的社会性行为存在很大差异。宾夕法尼亚大学领导的研究团队发现, 这些阶级特异性的社会行为并非一成不变,可以人为地进行表观遗传学重编程。这一重要成果发表在本期的Science杂志上。  表观遗传学修饰可以在不

饮食改变衰老过程的表观遗传学修饰

  表观遗传学修饰可以不改变基因编码,而影响基因的开启或关闭。研究人员对185位志愿者(84位男性和101位女性)的直肠组织切片进行了研究,发现人体内基因的表观遗传学修饰主要受衰老的驱动,不过日常饮食也会对表观遗传学修饰产生重要影响。该研究发表在十二月六日的Aging Cell杂志上。   研

厦门大学PNAS表观遗传学新文章

  来自厦门大学、加州大学圣地亚哥分校的研究人员证实,热休克蛋白HSP70精氨酸甲基化调控了维甲酸介导的RARβ2基因激活。这项研究发布在6月16日的《美国国家科学院院刊》(PNAS)上。  厦门大学药学院的刘文(Wen Liu)教授和加州大学圣地亚哥分校的Michael G. Rosenfeld教

表观遗传学变异或可解释慢性肾病

  由宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院肾电解质和高血压部门的医学副教授、临床科学家Katalin Susztak博士带领的一项研究,试图阐明慢性肾病的分子根源和遗传素质,其研究成果发表在最近的Genome Biology杂志上。   在这项研究中,Susztak和她的共同通讯作者、来自阿尔伯特爱因

Cell:朊蛋白,表观遗传学的新层面

  朊蛋白prion总是与疯牛病和克-雅氏病等联系在一起,不过人们正逐渐意识到,朊蛋白在生物中也能够发挥正常的有益功能。   日前科学家们发现,朊蛋白能够使酵母从常规单细胞形态转变为多细胞协作形式,并由此在不利环境条件下增大酵母的生存几率。这种可遗传的改变不会影响酵母基因组,是一种表观遗传学现象。

美国女院士表观遗传学新成果

  TET(ten-eleven translocation)蛋白是生物体内存在的一种α-酮戊二酸(α-KG)和Fe2+依赖的双加氧酶,是DNA去甲基化过程中的一种重要的酶,对于维持干细胞的多能性有重要作用。多年来,科学家了解到,TET蛋白家族有肿瘤抑制因子的作用,但是,它们是如何抑制失控的癌细胞增

Science新闻:表观遗传学印记让基因“窒息”

  吸烟留下的可不仅仅是衣服和手指上的烟味,现在一项新研究提出了强有力的证据指出,吸烟能够通过表观遗传学修饰影响增加癌症发病风险的基因活性。这一发现,为研究者们提供了一个评估吸烟人群癌症风险的新工具。   我们DNA上的化学修饰可以影响基因的功能,决定基因的开启和关闭,这些化学修饰被称为表观遗传学

朱冰:表观遗传学过去,现在,未来

  由北京生命科学研究所朱冰研究组领衔完成的Science研究论文,揭示出染色质的紧密程度能调节组蛋白H3K27甲基化酶复合体PRC2的催化活性,从而影响基因转录,这有助于解析基因转录调控以及基因沉默的重要机制。为了更深入追踪这项研究的具体内容,生物通特联系了朱冰研究员,就几个方面请教了他。   

神经精神疾病的表观遗传学关联

  根据加州大学欧文分校的科学家报道,多巴胺信号的功能障碍,可深刻地改变大脑前额叶皮层中大约2000个基因的活性水平,可能是某些复杂神经精神疾病(如精神分裂症)的一个根本原因。  接收这种神经递质的脑细胞中基因活性的这种表观遗传学改变,首次表明多巴胺不足会影响前额叶皮层中调控的各种行为和生理功能。 

世界最大表观遗传学研究项目正式启动

  表观遗传学:主要探索细胞内随时发生的化学变化如何影响基因的活动。这些化学变化有些可能是随机的,有些可能与生活方式或者饮食有关,而这种影响可能持续多代。  记者从华大基因研究院获悉,作为人类基因组学研究中最具潜力的项目之一,全球最大的表观遗传学研究项目将于9月6日正式启动。  该项目将对

表观遗传学药物有望解决癌症治疗难题

  表观遗传学是一种调控基因表达的可逆途径,通过DNA和组蛋白的化学修饰,决定特定基因是否能得以表达。在癌症中,表观遗传学修饰的添加或删除,与肿瘤抑制基因的沉默或者癌基因的过表达有关。有研究显示,在标准的化疗流程之前先用表观遗传学药物处理癌细胞,可以增强这些细胞对抗癌药物的敏感性。这样的措施将大大有

表观遗传学研究揭示拉美人长寿之谜

  加州大学洛杉矶分校UCLA的研究人员首次证实,拉美人(Latinos)的衰老速度的确比其他民族的慢。这项研究发表在本期的Genome Biology杂志上,有望帮助科学家们找到适合所有人的抗衰老途径。  “尽管拉美人患糖尿病和其他疾病的比例较高,但他们的寿命比高加索人长。这被科学家们视为一种难以

表观遗传学开关控制基因节律性转录

  当夜晚降临,我们就会慢慢入睡,这是受昼夜节律circadian cycle影响的结果,我们的每个器官甚至基因中都存在这样的节律。   Salk研究所的科学家发现,表观遗传学修饰是使肝脏活性与昼夜节律同步的遗传学开关。这一发现能够帮助人们进一步了解高血糖、高胆固醇等健康威胁背后的机制,文章于近期

Nature-表观遗传学进展将遗传学、环境与疾病联系了起来!

  21世纪,表观遗传学的研究得到了快速发展,同时其产生了让研究人员感兴趣和憧憬的东西,当然了,这其中也存在一些大肆宣传的成分,本文中,我们回顾了表观遗传学在过去几十年里是如何演变的,同时分析了近年来改变科学家们对生物学理解的一些研究进展;我们讨论了表观遗传学和DNA序列改变之间的相互作用,以及表观

PNAS热点文章:表观基因组可因环境而改变

  长期以来,人们普遍认为作为有机体发育关键步骤的甲基化只是静态地DNA修饰,不会随环境条件变化而改变。Salk生物研究所的研究人员发现,处于逆境下植物的DNA甲基化模式会发生变化,从而改变对基因的调控。 科学家发现植物遭遇致病菌后,其表观遗传学密码会发生广泛的大量改

黄国宁:表观遗传学“照亮”胚胎筛选“暗箱”

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519073.shtm当辅助生殖技术照亮大量不孕不育患者“迷途之路”时,真实的研究数据依然提醒人们生殖医学的道路漫长。据2021年《柳叶刀》相关研究统计,当前全球辅助生殖(试管婴儿)的活产率不足30%。如何

关节炎中的表观遗传学基因开关

  一项新研究发现DNA甲基化是控制MMP13酶基因的开关,而MMP13酶具有重要的软骨破坏作用。文章发表在FASEB Journal杂志的网站上。   骨关节炎是一种退行性关节疾病,该疾病的典型症状是患者关节软骨持续不可逆的损失,这主要是由于基质金属蛋白酶MMP13破坏基质中的II型胶原引起

不可忽视的表观遗传学:运动可改变DNA

  瑞典德隆大学的科研人员发现运动可以从基因角度改变脂肪存储的方式。脂肪组织不仅可以被动地存储能量,还能够产生一些具有生物活性的化学物质作用于身体的其他部位。这项研究表明,运动可以使人体的脂肪细胞更高效地进行脂肪代谢,从而使脂肪存储在正确的部位。这项研究发表在Public Library of

Aging:雷帕霉素可以延缓表观遗传学衰老

  正如我们所知,年龄显然是一个不恰当的测量,因为它完全是基于时间的流逝,而不考虑我们身体的生物变化。2013年,加州大学洛杉矶分校(UCLA)的Steve Horvath描述了DNA上的化学修饰(称为甲基化)随着年龄的增长而发生变化的惊人数学精度。利用这些甲基化图谱,他推导出了一种高度精确的年龄预

何川教授Nature发布表观遗传学重要发现

  几十年前研究人员就已经知道,对遗传信息流动至关重要的信使核糖核酸(mRNA)上存在着一种化学修饰。然而直到最近,芝加哥大学的研究人员才通过实验证实,这种修饰的一个主要功能是控制RNA的寿命和降解,这一过程对于健康细胞发育极为重要。相关研究成果发表在2014年1月2日纸质版的《自然》(Nature

35岁助理教授追逐表观遗传学的奥秘

  当黄云(Yun “Nancy” Huang,音译)还是一名大学生时,她一直希望成为一名医生,但在浙江大学医学院获得学士学位后,她的想法改变了,“我意识到,要治愈疾病,我还需要了解更多疾病的基础生物学知识。”  2005年,黄云来到了美国,在乔治亚州立大学的Jenny Yang实验室开始攻读生物化

华人女院士发表表观遗传学重要成果

  MECP2的突变会引起神经发育性疾病Rett综合征(RTT)。RTT是一种常发生在女童身上的神经系统疾病,属于严重的自闭症谱系障碍。患者会出现类似自闭症的行为、丧失运动控制能力、呼吸不规律以及骨骼问题。  RTT中的错义突变MECP2R306C可以阻止MeCP2与NCoR/HDAC3复合物互作。

“小时吃好,长大不胖”的表观遗传学基础

  “再苦不能苦孩子”——数十年来,人们已经对儿童早期发育时期的营养良好供给的重要性达成共识。  确实,早期营养供给“烙印”对人的一生具有深刻且持久影响。例如妊娠期和/或哺乳期营养不良记录可作为表观遗传记忆储存在孩子的基因组上,持续到成年期,从而增加个体对肥胖等代谢疾病的易感性。  表观遗传学与成年

北大教授最新文章解析癌症表观遗传学

  来自北京市肿瘤防治研究所,北京大学肿瘤医院病因研究室的研究人员在之前研究的基础上,展开了胃癌发生发展相关DNA甲基化组扫描,进行了所获90余个基因的DHPLC大规模研究,在中日韩三国验证队列中证明了了GFRA1的去甲基化激活,SRF和ZNF382的甲基化失活可用作胃癌等恶性肿瘤的转移标志物。就此

朱健康院士Nature子刊表观遗传学成果

拟南芥5-甲基胞嘧啶(5mC)DNA糖基化酶的ROS1/DEMETER家族,是真核生物中第一个遗传表征的DNA去甲基化酶。然而,ROS1靶基因位点的特征还没有得到很好的理解。10月31日在《Nature Plants》发表的一项研究中,来自中科院上海植物逆境生物学中心和普渡大学的研究人员,对拟南芥C