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去年夏天西非埃博拉爆发的早期阶段，科学家们以空前的规模和速度测序了这种致命病毒的基因组，为人们揭示了许多疫情蔓延的关键信息，比如说病毒只通过人与人接触传播，病毒在多次传播中获得了许多新突变等等。 虽然埃博拉爆发最糟糕的时期已经过去，但这场疫情并未结束，还有许多问题需要人们去解答。为此，哈佛大学、Broad研究所、美国疾控中心（CDC）、美国国家过敏和传染病研究所（NIAID）等研究机构测序了两百多个埃博拉病毒样本的基因组，进行了迄今为止最全面的分析。这项研究发表在六月十八日的Cell杂志上，展示了病毒在这么长时间里发生的改变。 “我们之前的工作反映了埃博拉爆发后三周的病毒行为，”文章的资深作者Sabeti说。“现在这项研究跟踪了病毒在七个月内的变化，有助于理解埃博拉的长期演化。” “这些高分辨率的测序数据显示，在埃博拉疫情爆发的后期，病毒跨境传播是非常少的，”文章第一作者Danny Park指出。“这是一个重要的信息，......阅读全文
纳米孔测序的想法起始于25年前， 2012年5月4日《Science》首次报道了Oxford Nanopore公司研制的纳米孔测序仪样机——MinION，用于破译病毒DNA。然而MinION的发展历程并不那么顺利，英国牛津大学基因组学中心基因组学家Rory Bowden说，“众所周知，在每次读取
随着新型冠状病毒肺炎（COVID-19）肆虐全球，世界卫生组织（WHO）已经正式宣布其为全球流行病（Pandemic）。WHO最新新冠疫情状态报告显示，截至北京时间2020年3月26日10点，新冠肺炎疫情已蔓延至全球198个国家和地区，确诊患者超过46万例，且仍呈现迅速增长态势。 病毒在传播过
随着埃博拉病毒横扫西非，科学家缺乏重要基因数据来解答引发众多担忧的猜测：这种病毒会变得更具传染性和更致命吗？它会发生变化，让其逃避诊断测试或疫苗吗？非洲和欧洲实验室的冰箱里存放着取自埃博拉患者的数千份血液样本，但它们并未被使用，且少数几个获得新基因数据的研究小组并未公开信息。 研究人员渴望近
据统计，自2014年年初以来，几内亚已出现168例出血热病患，其中108人已死亡。世界卫生组织最新公布的数据表明，在这168例出血热病患中，71例经化验确诊为埃博拉病毒(Zaire ebolavirus，EBOV)引起，34例则有可能由埃博拉病毒引起。 据悉，埃博拉出血热发病初期主要表
4月12日，这项研究的领导者、美国疾病控制和预防中心（CDC）的微生物学家John Barnes在给bioRxiv服务器（生命科学领域专有的预印本文献库）的预印本（a preprint posted）中介绍了这项工作，他说：“我们第一次可以真正开始观察基因组在其原始状态的本质，这确实开始开辟了很
假设你是Doctors Without Borders组织中在西非工作的一名医生，一个发热、头疼、疲劳的小孩被带进你的诊所。根据当地的环境和季节，最可能被诊断出的就是疟疾或埃博拉。然而，这两种疾病都不能给病人一个积极的预后。埃博拉病毒能够快速传播给其他人，需要将患者尽快隔离。 这种情况下，确诊
新型冠状病毒SARS-CoV-2并不是第一个从动物跳跃到人类身上并造成严重破坏的病毒。人类免疫缺陷病毒（HIV）、埃博拉病毒、猪流感病毒、禽流感病毒、SARS-CoV和MERS-CoV都是如此。这个名单还在继续增加，而且还会越来越长。图片来源于网络 在一篇发表在Science期刊上的观点类型文
把埃博拉病毒基因组测序监测系统装进行李箱实现实时监测并不是梦。英国伯明翰大学Nicholas Loman团队开发了一个基因组监测系统，可以用标准的航空行李运送到疾病检测现场，并在样本收集24小时内得出检测结果。近日发表于《自然》的一项研究介绍了在西非几内亚最近的埃博拉疫情中，成功使用该系统进行的
来自巴斯德研究所（Institut Pasteur）、法国国家科学研究中心和悉尼大学的科学家们，通过对在几内亚流行的埃博拉病毒株进行基因组测序，追踪了病毒的传播，并监测了这一国家的病毒进化情况。 研究揭示出有三种不同的病毒变种在几内亚，尤其是首都的城市区域和附近的市镇同时传播，研究人员在发表
出于对埃博拉病毒的恐惧，凯内马政府医院的一间普通病房已被工作人员和病人放弃。图片来源：Tommy Trenchard 对于头上摇摇欲坠的白铁皮屋顶，Robert Garry有一种很不好的预感。这是6月的一天，他和同事Sheik Humarr Khan正在塞拉利昂凯内马政府医院一间被
第二代测序是当今应用最为广泛的技术，但读长短是它的软肋，并且它无法解决高度杂合的基因组、高度重复序列、高GC区域、拷贝数变异、大的结构变异等问题。第三代测序技术避免了第二代测序读长短的缺点，近年来渐渐被应用于各大研究中。以前谈到第三代测序，也许你想到的是病毒基因组或细菌基因组测序，而如今随着技
埃博拉病毒（EBOV）感染人类会引起致命的出血热，发病率和病死率极高。2014年这种病毒在西非造成了严重的疫情，死亡人数已经超过11,000人。今年一月份，就在人们以为这场疫情正式结束之际，塞拉利昂又出现了新的病例。 本期Nature杂志发表的一项新研究展示了便携式基因组测序仪在这次疫情中起到
石正丽研究组正在进行样本处理。中国科学院武汉病毒研究所供图 SARS样冠状病毒的自然宿主菊头蝠。广东省昆虫研究所张礼标研究员供图 电子显微镜下的SARS冠状病毒粒子。中国科学院武汉病毒研究所杨兴娄博士供图 石正丽研究组在野外作业。中国科学院武汉病毒研究所供图 15株蝙蝠SARS样冠状病毒
由来自中国的科学家领导的一个国际研究小组，对2014年秋天在塞拉利昂收集的一些埃博拉病毒分离株进行了基因组序列分析，追踪了埃博拉疫情后期阶段这一病毒的多样性和进化。埃博拉的疫情是在去年的春天首次发现在西非国家几内亚多地集中爆发，后逐渐蔓延到邻国。 在5月13日的《自然》（Nature）杂志上，
由来自中国的科学家领导的一个国际研究小组，对2014年秋天在塞拉利昂收集的一些埃博拉病毒分离株进行了基因组序列分析，追踪了埃博拉疫情后期阶段这一病毒的多样性和进化。埃博拉的疫情是在去年的春天首次发现在西非国家几内亚多地集中爆发，后逐渐蔓延到邻国。 在5月13日的《自然》（Nature）杂志上
美国 人脑研究取得新成果，医学与疾病防治取得多项重大突破，合成生物学成果纷呈。 2015年，美国科学家在人脑研究领域取得重大突破：8月，俄亥俄州立大学在实验室中培育出近乎完全成型的人类大脑，尽管它只有铅笔上橡皮擦那么大，发育程度与一个5周大胎儿的大脑相当，尚没有任何意识，但具备人脑绝大多数细
最新的一项技术，使流感病毒第一次以它原始 RNA 的形态被测序出来。流感病毒的基因编码，同其他病毒一样，都储存在 RNA 中，因此若想测得其基因序列，在之前有限的技术下，只能通过测序其逆转录后的 DNA 而获得。但是，这项新发明，使用了纳米孔测序技术，当基因通过一个微小的分子泵时，能够直接读出其
我是华大基因汪建。一名亲历03年非典疫情的老兵，当年我们在国内最早完成SARS病毒测序、最先研制出诊断试剂盒，我本人还担任过北京SARS病原组组长； 这次疫情，我们在临床上最先给出了新型冠状病毒的正确诊断、最早被国家卫健委指定为第三方检验机构、首批获得国家药监局应急审批的病毒测序和诊断试剂注册
科学家确认引起严重流感的基因突变 对一个法国女童及其父母的一项研究表明，导致被称作干扰素的抗病毒蛋白丧失的一种隐性突变可能是有时会让孩子罹患罕见但严重流感的原因。尽管喝鸡汤及卧床休息会让大多数孩子挺过流感，但有少数特殊者已知会出现一种威胁生命的流感。怀疑基因突变可能是这种严重型流感的基础，M
阿尔伯塔大学的研究人员正在争分夺秒地测试一种抗病毒药物，这种药物已被证明可以治疗猫的冠状病毒，并有望对COVID-19患者产生同样的效果。 生物化学家Joanne Lemieux说："我们的实验室一直在以最快的速度工作，以得到结果。我们没有周末，日子一天天过去了。我们都在不停地工作，
中科院武汉病毒研究所石正丽研究员带领的研究团队采用宏基因组学方法，对我国蝙蝠肠道病毒首次进行了系统研究，结果发表在《病毒学杂志》（Journal of Virology）上（2012, 86(8):4620. DOI: 10.1128/JVI.06671-11）。 蝙蝠是哺乳动
据云南广播电视台《都市条形码》微信公众号报道，1月21日，国家卫生健康委确认昆明市首例输入性新型冠状病毒感染的肺炎确诊病例。云南省疾控中心急性传染病防制所所长伏晓庆介绍，1月17日中午12点，实验室收到患者采样标本，下午3点就完成了核酸检测，结果呈阳性。 1月18日凌晨1点，实验室开始病毒全基
合成生物学涉及生物分子工程，其特点是具有在自然界中无法找到的新功能。 随着生物技术产业进入了新的一年，我们将会观察到的关键趋势是2015年在技术上和市场上有望得到快速发展。这些技术和市场将是生命科学研发的重要驱动因素，将会把生物技术带到一个全新的领域。严格地从货币角度来讲，并购活动将会继续下去，形
随着生物技术产业进入了新的一年，我们将会观察到的关键趋势是2015年在技术上和市场上有望得到快速发展。这些技术和市场将是生命科学研发的重要驱动因素，将会把生物技术带到一个全新的领域。严格地从货币角度来讲，并购活动将会继续下去，形成对于生物技术产业很关键的金融和资源分配趋势。 一、大数据
临床类 杜克大学分子遗传学教授David Goldstein David Goldstein提出运用精准医学治疗神经系统疾病。Goldstein专注于几个癫痫患者大规模研究的课题，其中包括一项对超过350个患病的儿童及其父母进行测序来发现新突变的项目。尽管许多发现的突变属罕见突变，但是它
近日，我国军事医学科学院军事兽医研究所研究员涂长春领衔的联合课题组，在云南蝙蝠体内检测出了新型SARS（非典型性肺炎）样冠状病毒。全基因组序列测定与抗原性分析表明，该病毒具备感染人的能力，推断其很可能是SARS病毒的祖先或“亲属”，这一发现为理清SARS来源提供了重要数据。这一蝙蝠病毒方面的最新
随着2015年的日历翻开新的一页，生物技术产业也进入了新的一年。GEN网站近日展望了2015年有望快速增长的技术和市场，总结了生物产业的十大趋势。他们认为，这些技术将成为生命科学研发的重要驱动力，并帮助推动生物技术进入全新的领域。同时，并购活动将继续构成金融和资源分配的趋势，对生物产业的发展至关
今年四月份，伯明翰大学的Joshua Quick在行李中装了三个测序仪（MinION）然后登上了去几内亚的飞机。这在过去是难以想象的，因为绝大多数测序仪又大又重。在几内亚，Quick只用12天就测序了14名埃博拉患者的病毒基因组，收集样本之后48小时就能得到结果。 这对于流行病学家来说，是一个
试剂盒检测结果不仅与试剂盒质量有关，还与新冠病毒自身的特点、采样部位、采样量、运输和储存环节，以及实验室检测条件和人员操作有关2020年2月3日，武汉大学中南医院影像科副主任张笑春发了一条朋友圈：“别迷信核酸检测了，强烈推荐 CT 影像作为目前 2019-nCoV 肺炎主要依据”，并称这是“一个一线
这几天，已经有很多媒体报道从各个角度、特别是一线医护人员的直观视角，总结过这次应对新冠肺炎疫情的过程中出现的、特别是早期疾病发现和预警过程中的一些问题。 我首先得强调一句：在疫情的危急时刻大家都希望听好消息、正能量，这个没错，我也一样。但是，这不意味着所有反思、批评和建议都是添乱、都是制造恐慌