科学家呼吁关注全球基因组数据库污染

样品处理有可能是导致DNA数据库广泛污染的最主要原因 2月16日发表在《公共科学图书馆·综合》(PLoS ONE)期刊上的一份研究报告称康涅狄格大学的遗传学家Mark Longo及同事发现由顶级公共测序机构提供的测序结果构建的基因组数据库中的大约1/5的细菌、植物和非灵长类动物基因组数据受到了人类DNA的污染,样品处理有可能是导致DNA数据库广泛污染的最主要原因。这一研究报告引起了生物研究人员及各大权威媒体的高度关注,《科学家》(The Scientist)杂志以及《自然》(Nature)杂志均在其官方网络上第一时间对这一事件进行了报道。 Mark Longo等在报告中呼吁科学家们需更加努力以确保测序获得的基因组不受到污染,并应对来自公共基因组数据库的基因组进行潜在污染检测。 “基因组污染是一个大问题,但却不是一个新问题,”加州大学进化生物学家、美国能源部联合基因组研究所系统发育基因组学计划负责人Jonat......阅读全文

北京基因组所开发完成DNA甲基化重编程数据库

  DNA甲基化是一个重要的表观遗传标记,在胚胎早期发育过程中起到至关重要的作用,不同物种所采用的机制亦各不相同。因而,整合多个物种的海量甲基化数据并提供在线的数据浏览、获取及其功能分析,可帮助更多研究人员深入探析不同物种在早期发育时期的DNA甲基化差异,并揭示其DNA甲基化重编程过程与机制。   

基因组所完成开发RiceWiki数据库

  近日,中国科学院北京基因组研究所章张研究员课题组与北京理工大学、中国林业科学研究院及华中农业大学合作开发完成RiceWiki数据库。该数据库是基于维基百科的水稻基因信息平台,是可编辑且内容公开的公众注释系统。研究成果在Nucleic Acids Research杂志发表。   水稻是人类重

Rab-GTPases-Mark-Targets-In-The-Endocytotic-Machinery

The eukaryotic cell contains compartments with distinct functions bounded by lipid bilayer membranes. The movement of membrane vesicles between these

我国首个寻亲DNA数据库在京建立

   科技日报消息,我国第一个专门面向失散人员的寻亲DNA数据库日前在京宣告建立。据数据库建设方中科院北京华大方瑞司法物证鉴定中心的有关负责人介绍,通过该库,寻亲工作将变得方便快捷。同时,该库将免费为我国失散人群提供寻亲帮助,包括港澳台地区。     据悉,该库的第一批样本检测用试剂已经得到了美国

北京基因组所发布表观基因组数据库MethBank-3.0

  中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0,并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题,在线发表在Nucleic Acids Rese

北京基因组所发布表观基因组数据库MethBank-3.0

  中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0,并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题,在线发表在Nucleic Acids Rese

科学家呼吁关注全球基因组数据库污染

样品处理有可能是导致DNA数据库广泛污染的最主要原因  2月16日发表在《公共科学图书馆·综合》(PLoS ONE)期刊上的一份研究报告称康涅狄格大学的遗传学家Mark Longo及同事发现由顶级公共测序机构提供的测序结果构建的基因组数据库中的大约1/5的细菌、植物和非灵长类动物基因

全球药典草药基因组数据库已上线

  近期,中国中医科学院中药研究所团队建立了全球药典基因组数据库(GPGD)。该数据库是全球首个针对药典收载草药物种的大型基因组学数据库。相关研究成果发表在《Science China-Life Sciences》杂志,标题为“Global Pharmacopoeia Genome Database

科学家搭建草莓基因组数据库

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454861.shtm 草莓为蔷薇科草莓属,因芳香多汁、营养丰富受到喜爱,在全国各地均可种植。栽培草莓为异源多倍体,基因组复杂,杂合度高。 2019年,《自然—遗传学》发表了利用三代测序数据组装的高

英政府设数据库保留无罪者DNA

  据《自然》网站报道,今年早些时候,英国政府曾计划将无罪的普通人的DNA保留在其大型公安数据库中,一时间引起舆论纷纷。欧洲人权法庭后来裁决,无罪者的DNA不应该被保留。   近日据英国媒体报道,从一些泄露出来的电子邮件得知,英国政府仍然决定保留无罪者的DNA,但时间不是之前所称的12年,而是6年

Phosphoamino-acid-analysis:Mark-Kampss-method

Phosphoamino acid analysis:Mark Kamps's method1. Label your protein with 32Pi. Then subject the protein to SDS polyacrylamide gel electrophoresis

BioMark™基因分析系统介绍

美国Fluidigm公司www.fluidigm.com创立于1999年,总部设在美国加州。其创始人是Steve Quake和Gajus Worthington(公司CEO)。Steve Quake是美国斯坦福大学教授,是微液流领域(Microfluidic Technology)的权威专家http

基因组DNA的提取

基因组DNA的提取概 述   基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用基因组DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出,而小分

基因组DNA的定义

中文名称基因组DNA英文名称genomic DNA定  义组成生物基因组的所有DNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

基因组DNA的提取

第一节 概 述DNA的提取通常用于构建文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇,的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中,可用玻棒将其取出,而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀附于壁上及底部,

纯化DNA实验_基因组DNA的快速纯化

试剂、试剂盒尾部缓冲液蛋白酶 K仪器、耗材离心管玻璃棒实验步骤第 1 天1. 大约 1.5 cm 长的尾部活检样品放在一个 1.5 ml 盛有 0.7 ml 尾部缓冲液的小离心管中,加 35 ul 10 mg/ml 蛋白酶 K,在 55℃ 振摇温育过夜。尾部缓冲液(配 25 ml)50 mmol/L

北京基因组所构建完成质体基因组结构变异数据库

  多相催化是实现高效定向化学转化的关键技术,其中的一个重要基础科学问题是如何通过精确设计和调控催化活性位结构及所在环境,从而强化其定向催化功能并创造新型高效催化剂。近日,中国科学技术大学熊宇杰教授课题组和江俊教授课题组继在电催化体系中提出表面极化概念后,再次通过与黄伟新教授课题组合作,证实界面极化

北京基因组所开发系列特色科学数据库

  近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心(BIG Data Center,BIGD)有七篇数据库文章在国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)杂志在线发表,并将于该刊2019年1月出版的数据库专刊中集中刊发。包括表观组关联分析知识库EWAS Atlas

北京基因组所开发系列特色科学数据库

  近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心(BIG Data Center,BIGD)有七篇数据库文章在国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)杂志在线发表,并将于该刊2019年1月出版的数据库专刊中集中刊发。包括表观组关联分析知识库EWAS Atlas

血基因组DNA提取实验——血基因组DNA-试剂盒提取法

血基因组DNA提取可用于:(1)从冻全血、血浆、血清、骨髓、其他体液、淋巴细胞、培养细胞、病毒和线粒体中提取DNA;(2)用于后续测序、遗传信息学等研究。实验方法原理采用特殊的细胞裂解和蛋白去除液(包括蛋白酶K 裂解)从抗凝全血中得到基因组DNA。实验材料抗凝全血试剂、试剂盒血基因组DNA 试剂盒仪

DNA数据库:游走在科学与伦理的边缘

  你可以抛弃你的电脑,并留下你的手机在家里,但你不能逃脱你的DNA,因为他是属于你的唯一特征,但是现在它被越来越多的贡献给了某些政府当局。   世界各国当局政府打着打击恐怖主义和犯罪的旗号,正在搜集数以百万计公民的遗传信息。以美国为代表,最高法院近期就备份了许多被捕嫌疑人的DNA数据信息。英国警

小鼠肝基因组DNA制备

原理DNA 以核蛋白形式存在于细胞核中,制备 DNA 的原则是既要将 DNA 与蛋白质、脂类和糖类等分离,又要保持 DNA 分子的完整。蛋白酶K 及链霉蛋白酶 E 的应用使这两个原则得到了保证。蛋白酶K 或链霉蛋白酶 E 均为广谱蛋白酶,其重要特性是能在 SDS 和 EDTA 存在下保持很高的活性。

血基因组DNA提取实验

            实验方法原理 采用特殊的细胞裂解和蛋白去除液(包括蛋白酶K 裂解)从抗凝全血中得到基因组DNA。 实验材料 抗凝全血

基因组DNA的快速纯化

第 1 天1. 大约 1.5 cm 长的尾部活检样品放在一个 1.5 ml 盛有 0.7 ml 尾部缓冲液的小离心管中,加 35 μl 10 mg/ml蛋白酶 K,在 55℃ 振摇温育过夜。尾部缓冲液(配 25 ml)50 mmol/L Tris,pH 8                      

细菌基因组DNA提取实验

细菌基因组DNA提取可应用于:(1)获得细菌基因组DNA;(2)作为PCR模板;(3)用于测序、遗传信息分析等。实验方法原理本试剂盒采用独特的细胞裂解和相分离技术,结合DNA 制备膜选择性地吸附DNA 的方法达到纯化基因组DNA 的目的。适合于从1.0x109 细菌中获得多至20 ug 的基因组DN

细菌基因组DNA提取实验

            实验方法原理 本试剂盒采用独特的细胞裂解和相分离技术,结合DNA 制备膜选择性地吸附DNA 的方法达到纯化基因组DNA 的目的。适合于从1.0x109 细菌中获得多至20 ug 的基因组DNA。用于PCR、Southern 印迹分析、RAPD

细菌基因组DNA提取实验

实验方法原理 本试剂盒采用独特的细胞裂解和相分离技术,结合DNA 制备膜选择性地吸附DNA 的方法达到纯化基因组DNA 的目的。适合于从1.0×109 细菌中获得多至20 μg 的基因组DNA。用于PCR、Southern 印迹分析、RAPD、RFLD 等分子生物学实验。实验材料 细菌培养物

细胞化学词汇基因组DNA

中文名称:基因组DNA英文名称:genomic DNA定  义:组成生物基因组的所有DNA。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

小鼠肝基因组DNA制备

原理DNA 以核蛋白形式存在于细胞核中,制备 DNA 的原则是既要将 DNA 与蛋白质、脂类和糖类等分离,又要保持 DNA 分子的完整。蛋白酶K 及链霉蛋白酶 E 的应用使这两个原则得到了保证。蛋白酶K 或链霉蛋白酶 E 均为广谱蛋白酶,其重要特性是能在 SDS 和 EDTA 存在下保持很高的活性。

血基因组DNA提取实验

实验方法原理 本试剂盒采用特殊的细胞裂解和蛋白去除液(包括蛋白酶K 裂解)从抗凝全血中得到基因组DNA。适用于从冻全血、血浆、血清、骨髓、其他体液、淋巴细胞、培养细胞、病毒和线粒体中提取DNA。实验材料 抗凝全血试剂、试剂盒 血基因组DNA 试剂盒仪器、耗材 96孔深孔板96圆孔板96孔DNA制备板