只需100个细胞的表观基因组分析
近年来，表观遗传学已经成为了干细胞分化、炎症、癌症等多个领域的研究热点，但它在临床上的潜力还未得到充分挖掘。表观基因组分析可以帮助医生根据患者的自身状态调整治疗方案，最终实现个性化医疗。问题在于，表观基因组分析需要的细胞量很大。举例来说，检测全基因组的蛋白-DNA互作和染色质修饰大约需要一千万细胞，对患者样本进行这样的分析基本是不可能的。 弗吉尼亚理工学院的Chang Lu教授十多年来一直致力于开发活细胞分析工具，以便更好的理解人类疾病。他擅长用微流体装置检测细胞内发生的分子事件。 最近Lu教授与爱荷华大学的Kai Tan合作，在Nature Methods杂志上发表了突破性的研究成果。他们基于微流体装置开发了MOWChIP-Seq（microfluidic oscillatory washing based chromatin immunoprecipitation）技术，只需要100个细胞就能进行表观基因组分析。......阅读全文
PLoS－ONE：杀虫剂也会影响你的表观基因组
没有人使用农药“甲氧滴滴涕”(Methoxychlor)超过10年，但是根据一项新的研究，它可能会损伤人类的代际遗传。 华盛顿州立大学的一组研究人员，已经发现了农药对表观基因组的新影响，而且它不仅会影响到孩子辈(下一代)，甚至还会影响到孙子辈(下下一代)。这种“祖传接触”(ancestral
北京基因组所开发表观组关联分析数据库
近日，由中国科学院北京基因组研究所国家基因组科学数据中心开发的人类表观组关联分析数据库EWAS Data Hub正式上线。该项研究成果以EWAS Data Hub: a resource of DNA methylation array data and metadata 为题在国际学术期刊《核
北京基因组所发现肾癌预后监测的新型表观标记物
透明肾细胞癌（clear cell Renal Cell Carcinoma, ccRCC）是肾癌中最常见的亚型，90%以上的ccRCC患者中VHL抑癌基因是失活的，但在小鼠实验中却发现该基因的缺失并未能引起透明细胞癌形成，这意味着还存在其他的致瘤机制。近些年的研究发现，与肾癌发生发展、患者总体
蓖麻胚乳基因组印记的表观调控机制研究获进展
被子植物特有的双受精事件产生了三倍体的胚乳（两份母源基因组和一份父源基因组，2m:1p），为胚的发育和种子的萌发提供了营养，为被子植物在陆地植被中占据主导地位奠定了重要的物质基础。同时，由于胚乳中父母源基因组剂量的失衡，产生了一系列非孟德尔遗传现象特别是基因组印记（genomic imprint
华裔女学者Science解析干细胞表观遗传
来自约翰霍普金斯大学（Johns Hopkins University）的研究人员针对干细胞表观遗传性质，发现了干细胞在不对称分裂过程中的表观遗传学方式，认为这是其维持干性的一种重要机制，相关成果公布在Science杂志上。文章的通讯作者是约翰霍普金斯大学华裔女科学家陈昕（Xin Chen），她在中
北京基因组所等揭示Y染色体表观信息遗传机制
表观遗传学是与传统遗传学相对应的概念。遗传学以基于DNA序列的中心法则来传递遗传信息，在人群中，遗传信息在世代之间稳定遗传，那么表观遗传信息是否像遗传信息一样可被子代继承，尚缺少相关有力证据。DNA甲基化是非常重要的表观遗传信息，是表观遗传学研究的重要内容。目前，鲜少有DNA甲基化在人群中的继承
Cell子刊惊人发现：饮食会通过肠道菌影响表观基因组
UW-Madison研究团队十一月二十三日在Molecular Cell杂志上发表文章指出，饮食会影响肠道菌释放的代谢物。这些代谢物作用于宿主近端结肠、肝脏和脂肪组织的组蛋白，通过表观遗传学途径改变这些组织的基因转录。 研究人员首先对无菌小鼠和肠道菌活跃的小鼠进行比较。他们发现，肠道菌群能改变
孙方霖：表观遗传学－后基因组时代的领舞者
DNA双螺旋的解码者、诺贝尔奖获得者Watson说：“你可以继承DNA序列之外的一些东西。这正是现在遗传学中让我们激动的地方。” 不久前，美国国立卫生研究院利用由“路标计划”管理的新基金，启动了表观基因组学研究计划，一批表观遗传学项目和研究人员将获得数百万到上千万美元的经费支持。几乎在同时，国家自然
生活环境和生活方式会影响你的表观基因组
法国巴斯德研究所和CNRS领导的一项基因组研究，首次证实生活环境和生活方式能够影响我们的表观基因组。表观基因组控制着我们基因的表达，但不影响基因的序列。 研究人员发现，从森林迁移到城市对人类免疫应答的表观遗传学模式有深远的影响。而生活方式（定居耕种或游牧狩猎）主要影响较为持久的机能，比如发育相
男性不育重大突破！精子缺陷的表观基因组或是关键原因
每8对夫妇中就有1对存在生育困难的问题，其中近四分之一的原因都是由不明原因的男性不育所引起的，在过去10年里，研究人员发现，男性不育与缺陷的精子在发育过程中无法从DNA中“驱逐”组蛋白有关，而其背后的机制以及在精子DNA中所发生的未知，目前研究人员并不清楚。图片来源：Bobjgalindo/Wiki
单细胞表观组学：单细胞ChIPseq解码细胞命运决定机制
在国家重点研发计划“干细胞及转化”重点专项（批准号：2017YFA0103402）等资助下，北京大学分子医学研究所、北大-清华生命科学联合中心何爱彬课题组近期突破单细胞表观遗传研究的瓶颈，开发了两种具有普适性、操作简单、风格迥异的单细胞ChIP-seq技术，可适应于不同课题研究需要，解析发育与疾
华大基因等Cell子刊首次全基因组水平解析等级表观遗传
来自华大基因，纽约大学医学院，宾州大学医学院等多处研究机构组成的研究小组发表了题为“Genome-wide and Caste-Specific DNA Methylomes of the Ants Camponotus floridanus and Harpegnathos salta
－Nature重大成果：最全面的人类器官表观基因组图谱
多年来，科学家们成功获得了人类基因组的工作图——编码人类生命的完整DNA序列图像。而现在他们仍然在往这一图集添加新页面——散布在DNA链上，影响了基因抑制的化学标记物——甲基的图谱。 来自Salk研究所的科学家们报告称，他们构建出了来自个体捐赠者（包括女人、男人和孩子）十多种不同人类器官最全面
基因组所等RNA甲基化表观转录组学研究获进展
2014年1月，中国科学院北京基因组研究所基因组变异与精准生物医学实验室“百人计划”研究员杨运桂研究组，与中国科学院动物研究所“百人计划”研究员刘峰研究组合作开展的“m6A甲基转移酶复合物鉴定”研究，发现了WTAP(wilms'tumour 1-associating protein)
－Nat－Met：新型单细胞技术助力表观遗传研究
跨学科组织的专家们首次为临床医生实现“无艾滋病时代”的目标设计了最新的改进方案，方案融合了尖端的生物医学技术以及基础的行为干预方法。该研究发表在《美国医学协会杂志》上。 这项方案是由国际抗病毒组织IAS-USA召集的专家志愿者小组提出的，为临床医生实施新型HIV预防方法提供了指导方针。专家们对
干细胞多能性与表观遗传调控的综述
7月23日，Nature Review Molecular Cell Biology杂志在线发表了中国科学院生物物理研究所刘光慧研究员同美国索尔科生物学研究所(The Salk institute for Biological Studies)研究人员合作的关于干细胞多能性与表观遗传调控
细胞核基因组
每条染色体含1个DNA分子，1个细胞的全部遗传信息（基因）都编码在线状的DNA分子上。由于每个体细胞中有2套染色体（2n），故所含的DNA是由两个基因组（genome）构成。每个单倍体基因组约含3.2×109bp.人类基因的平均长度为1～1.5kb，所以基因组以足以编码1.5×106蛋白质，但实
Nat－Commun：表观基因组改变或促进黑色素瘤变得更加“凶残”
近日，刊登在国际杂志Nature Communications上的一篇研究论文中，来自鲁汶大学的研究人员通过研究揭示了黑色素瘤变得恶性的分子机理，相关研究或为后期阐明黑色素瘤发生的原理以及开发新型疗法提供一定的帮助和思路。 人类机体的DNA包含着许多信息，其可以使得我们的细胞有序工作，而来自D
首次发现！人类基因组中的表观遗传缺陷或普遍存在
近日，一项刊登在国际杂志American Journal of Human Genetics上的研究报告中，来自西奈山医院等机构的科学家们通过研究首次揭示了人类基因组中普遍存在的表观遗传缺陷，同时还揭示了引发遗传性疾病的数百个基因中所发生的表观遗传缺陷。图片来源：Pixabay/CC0 Publ
60年谜团：DNA复制时序维持细胞表观遗传状态
近日发表在《科学》杂志上的一项研究称，美国佛罗里达州立大学大卫·吉尔伯特博士带领的研究团队回答了一个60年未解的科学谜题：DNA的复制时序维持着人类细胞中全局的表观遗传状态。 在过去60年里，科学家已经能够观察到遗传信息的复制方式和时间，并确定了“复制时序程序”的存在，该程序控制着DNA片段的
eLife：白血病干细胞干性维持表观调控机制
利用抑癌基因PTEN敲除的T-ALL小鼠模型，北京大学吴虹课题组前期工作发现PTEN缺失或PI3K信号通路激活所导致的β-catenin活化及Tcra/d-Myc易位在T-ALL的发生和发展过程中起至关重要的作用，并鉴定出LSC富集的Lin-CD3+KITmid亚群。 急性T淋巴细胞白血病（T
Science：在单细胞水平观察表观遗传动态调节
我们是否能够对活细胞进行重编程以便让它们做我们想要它们在体内做的事情呢？执行这样的控制---合成生物学的一个主要目标---可能允许开发基于细胞的疗法以便可能有朝一日替换用于治疗疾病（如癌症）的传统药物。然而，为了实现这个长期目标，科学家们必须首先学着对细胞做的很多关键事情（如细胞彼此之间通信）进
细胞编程表观遗传机制重大研究计划项目指南发布
国家自然科学基金重大研究计划遵循“有限目标、稳定支持、集成升华、跨越发展”的总体思路，围绕国民经济、社会发展和科学前沿中的重大战略需求，重点支持我国具有基础和优势的优先发展领域。重大研究计划以专家顶层设计引导和科技人员自由选题申请相结合的方式，凝聚优势力量，形成具有相对统一目标或方向的
研究揭示干细胞维持年轻态的表观遗传机制
DGCR8作为经典miRNA合成通路中的关键蛋白，广泛参与非编码RNA合成、mRNA可变剪接和转录后调控等重要生物学过程，但其在干细胞衰老中的调控作用尚不明确。7月26日，中国科学院动物研究所曲静研究组和中国科学院生物物理研究所刘光慧研究组合作，在Nature Communications在线发
表观密度概述
对于形状规则的材料，直接测量体积；对于形状非规则的材料，可用蜡封法封闭孔隙，然后再用排液法测量体积；对于混凝土用的砂石骨料，直接用排液法测量体积，此时的体积是实体积与闭口孔隙体积之和，即不包括与外界连通的开口孔隙体积。由于砂石比较密实，孔隙很少，开口孔隙体积更少，所以用排液法测得的密度也称为表观
表观密度简介
表观密度是指材料在自然状态下（长期在空气中存放的干燥状态），单位体积的干质量。通常表观密度是指材料在干燥的状态下的表观密度，其他含水情况应注明。多数材料为多孔物质，具有与外部相通的开口孔和不通的闭孔，将含有闭孔材料的密度称为“表观密度”。
细胞化学词汇镶嵌基因组
中文名称：镶嵌基因组英文名称：mosaic genome定 义：由不同生物基因组的DNA序列经过重新组合而形成的一套杂合的生物体基因。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
细胞化学词汇基因组DNA
中文名称：基因组DNA英文名称：genomic DNA定 义：组成生物基因组的所有DNA。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
细胞化学词汇基因组组构
中文名称：基因组组构英文名称：genome organization定 义：生物的基因组在诸如各基因的排列顺序、基因的结构、同源基因的序列差异等基因组结构上的特征。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
真核细胞基因组的特点
(1)主要存在于细胞核内，少量存在于线粒体中。(2)为单顺反子，表现为一个结构基因经过转录后生成一个单顺反子mRNA分子，翻译成一条多肽。(3)基本上没有操纵子。(4)为断裂基因，内含子占绝大多数，不翻译成蛋白质；外显子占少数，可以翻译成蛋白质。(5)具有较高重复序列。(6)具有多基因家族基因和假基