清华汪小我等人开发CRISPRsgRNA设计工具
CRISPR/Cas9系统,是最近开发的一种强大而灵活的靶向基因组工程技术,包括基因组编辑和基因调控。这些应用需要设计高效、特异的单向导RNA(sgRNA)。然而,这仍然是具有挑战性的,因为它需要考虑许多标准。已有研究开发出了一些sgRNA设计工具用于基因编辑,但是目前还没有设计出用于基因调控的sgRNA设计工具。 七月二十三日,清华大学自动化系的汪小我和美国斯坦福大学的Lei S Qi博士带领的研究小组,在国际权威杂志《Bioinformatics》发表了题为“CRISPR-ERA: a comprehensive design tool for CRISPR-mediated gene editing, repression and activation”的研究论文。随着越来越多使用CRISPR/Cas9进行基因编辑和调控的实验数据,该研究小组根据这些已发表的研究总结的一套sgRNA设计规则,开发出了一种综合性的计算......阅读全文
转基因作物田间试验的设计与管理实验
实验材料:转基因株系 实验步骤:3.1 释放试验的地理位置要求释放地点应是宜于种植该作物的一个隔离区,其动植物区系与周围农田没有差别,而且没有稀有或受保护的植物或动物物种,也必须确保释放地点较远的区域没有政府机构认定的群落生境或保护区。试验区要求地势平坦,既要能减少基因逃逸的危险,又要便于耕作
植物抗病基因的人工改良设计的视野被拓宽
近日,南京农业大学植物保护学院陶小荣教授团队在植物学知名期刊《Plant Biotechnology Journal》发表题为《Stepwise artificial evolution of an Sw-5b immune receptor extends its resistance spe
增强抑癌基因表达中国团队设计抗癌新策略
【新华社华盛顿5月26日电】新一期美国《科学·转化医学》杂志刊发中国科研人员的研究报告,介绍了一种抗癌新策略。他们利用新方法让可抑制癌症的基因得以充分表达,取得了阻止肿瘤发展和扩散的效果。 研究发现,3种人体中可以抑制癌症的基因在多种肿瘤中不能充分表达,无法有效干预癌细胞的增殖和转移。
增强抑癌基因表达-中国团队设计抗癌新策略
新一期美国《科学·转化医学》杂志刊发中国科研人员的研究报告,介绍了一种抗癌新策略。他们利用新方法让可抑制癌症的基因得以充分表达,取得了阻止肿瘤发展和扩散的效果。 研究发现,3种人体中可以抑制癌症的基因在多种肿瘤中不能充分表达,无法有效干预癌细胞的增殖和转移。南开大学药学院教授杨诚对新华社记者介
设计cas9条件性基因敲除小鼠
其关键是构建带有两个Loxp位点的小鼠,即flox(flanked by loxP)小鼠。今天我们就来详细介绍一下如何设计。共分三步:第一步,选择外显子。第二步,设计sgRNA。第三步,设计SSODN。听起来蛮简单的哈?下面我们详细讲讲。第一步,选择外显子。1. 尽量选择敲除所有转录本共用的外显子。
转基因作物田间试验的设计与管理实验
实验材料转基因株系实验步骤3.1 释放试验的地理位置要求释放地点应是宜于种植该作物的一个隔离区,其动植物区系与周围农田没有差别,而且没有稀有或受保护的植物或动物物种,也必须确保释放地点较远的区域没有政府机构认定的群落生境或保护区。试验区要求地势平坦,既要能减少基因逃逸的危险,又要便于耕作,使试验尽可
RNA引物设计怎么设计
一般就是设计引物能够跨越至少一个exon-exon junction的,就是引物在两个exon的交界处,这样pcr的时候就不会有DNA污染现在NCBI可以直接有引物设计,还可以选择上述的设计方式或者可以通过找到cDNA序列然后自己在primer3上设计也可以
研究团队设计出电磁强化的沼气生产系统
我国是农业发达的国家,玉米种植面积较大,每年生产约800吨的玉米秸秆。然而,玉米秸秆使用效率较低,如现场燃烧或堆放,造成环境污染,并浪费这一资源。厌氧发酵技术可以将玉米秸秆转化为甲烷的有效技术。 中国科学院武汉植物园水生植物与流域生态重点实验室研究员杨玉义与东北电力大学副教授赵波等合作设计出一
萨里大学研究呼吁改革人工智能设计
我们是否对我们并不完全了解的技术抱有信心?萨里大学的一项新研究表明,人工智能系统正在做出影响我们日常生活的决定——从银行、医疗保健到犯罪侦查。该研究呼吁立即改变人工智能模型的设计和评估方式,强调这些强大算法需要透明度和可信度。随着人工智能被整合到高风险领域,而这些领域的决策可能会改变人们的生活,与“
著名舰船研究设计专家张炳炎院士逝世
中国工程院院士,著名舰船研究设计专家,中国船舶工业集团公司第七O八研究所因病医治无效,不幸于2012年8月2日8时20分在上海逝世,享年78岁。 张炳炎追悼会定于2012年8月6日(星期一)9时30分在龙华殡仪馆银河厅举行。张炳炎简介(来源:中国工程院) 生于1934年10月14日
新研究破解复杂胶体自组装的“设计密码”
近日,松山湖材料实验室研究员元冰团队与苏州大学教授杨恺团队合作,在复杂胶体自组装逆向设计领域取得重大突破,开发出基于机器学习的模块化逆向设计策略,成功破解“设计密码”。相关成果发表于《ACS纳米》。自组装作为自然界构建复杂结构的基本法则,为功能材料开发提供强大助力。但如何精准设计构筑单元(如补丁粒子
种子数粒仪的设计研究及结论
在如今的育种工作中,我们可能会经常听到“种子千粒重”这类行业术语, 其实它指的就是一千粒种子的重量。为什么要拿出来讲,是因为这里面的难点就在于如何才能准确数出一千粒种子甚至更多。相信如果采用人工数粒方式是很难做到 的,而且人工计数的千粒重测定方法不仅费时费力而且误差大。为此小编结合了相关资料
晶态多孔有机框架的设计合成研究取得进展
近日,西北农林科技大学化学与药学院刘波副教授提出了一种基于动态B-O、B←N和氢键组装的晶态多孔有机框架的新概念,为高效制备和实际应用可加工和可回收再生的多孔框架材料提供重要的理论依据,该研究成果发表在Angewandte Chemie International Edition上。在分析现有晶态多
如何写出优秀的生物和医学研究设计?
生物和医学研究设计 生物和医学研究设计是在生物、医学和涉及人类其他类型研究中进行实验以及观察性研究的表述。一个好的实验设计能有效提高研究水平,节省科研人员的精力及时间。那如何才能完成一个优秀的生物和医学研究设计?来跟杨国源教授学!设计范例+研究经验+理论方法,帮你打造设计方法论,快速开展科研。1.设
浅谈母线测温监控系统的设计及研究应用
随着当今社会的发展和用电量的急剧上升,新型母线因方便、节能的优点逐渐取代传统电缆,成为 发电厂、变电站高压开关柜的重要设备。母线采用铜排紧压的方式,要求散热和绝缘性能更高,若母线 触点温度过高,将会加速其绝缘老化,甚至可能引发火灾。因此供电系统中任意一个触点发生热故障,都将可能引发重大安全事故。为
晶态多孔有机框架的设计合成研究取得进展
近日,西北农林科技大学化学与药学院刘波副教授提出了一种基于动态B-O、B←N和氢键组装的晶态多孔有机框架的新概念,为高效制备和实际应用可加工和可回收再生的多孔框架材料提供重要的理论依据,该研究成果发表在Angewandte Chemie International Edition上。在分析现有晶态多
正交设计法研究花生粗脂肪含量测定方法
花生是我国主要的油料作物和经济作物,其脂肪含量为45%~55%。花生中脂肪含量的高低,决定了花生的品质。如果要知道花生中含有多少的脂肪,我们可以借助于粗脂肪测定仪,它有多种型号,如SZF-06A脂肪测定仪、SZF-06B脂肪测定仪、SZF-06脂肪测定仪。花生种子的脂肪含量是决定其品质的重要指标之一
研究人员提出OLED蓝光材料设计新策略
近日,中国科学技术大学教授崔林松团队与英国剑桥大学Alexander J. Gillett博士以及北京信息科技大学教授柳渊合作,提出一种高色纯度深蓝色有机发光材料设计新策略,开发了一系列色纯度接近BT.2020蓝光标准的高效深蓝色发光材料,有望解决未来4K/8K超高清显示技术领域的蓝光瓶颈。相关研究
散裂中子源项目组会同广东建筑设计研究院设计初步方案
11月30日至12月6日,为推进散裂中子源(CSNS)项目初步设计的进展,优化设计方案,中科院高能物理研究所CSNS项目组相关人员一行20人前往广东东莞,会同广东省建筑设计研究院人员进行CSNS初步设计方案的联合设计。 散裂中子源的建筑和工艺要求复杂,此次联合设计旨在借助高能所在加速器、靶
人脑拥有一致基因设计但生化功能极复杂
据物理学家组织网9月20日(北京时间)报道,艾伦脑科学研究所通过对“艾伦人脑图谱库”的大规模深入分析发现,虽然人类群体中存在各种不同的人格,也有着各种认知天才,但人脑却有着更多的相似性而非不同,不同的人脑有着一致的基因设计蓝图,并拥有极为复杂的生化功能。相关论文发表在最近出版的《自然》杂志上。
上海生科院等设计高效精确基因靶向整合新策略
5月19日,《细胞研究》期刊在线发表了题为《运用CRISPR/Cas9 技术实现以同源臂介导的末端接合为基础的靶向整合》的研究论文,该研究由中国科学院上海生命科学研究院神经科学研究所、脑科学与智能技术卓越创新中心杨辉研究组、基因编辑平台施霖宇团队与苏州非人灵长类研究平台孙强团队合作完成。该研究设
转基因作物田间试验的设计与管理实验(二)
3.2.10 灌水通常小麦不需要浇水。唯一的例外是,为了保证转基因植株在干旱条件下能存活,才进行浇水。在检定转基因植株的抗病性时,也可能需要对试验田进行浇水以促进发病。对某些人工接种试验,如接种小麦赤霉病菌(FManum ),也可以利用浇水来保证田间高湿环境。在测试干旱和高温逆境效应时,也需要对
所有的看家基因(housekeeping-genes)的列表+引物设计服务3
NM_033142 Homo sapiens chorionic gonadotropin, beta polypeptide 7 (CGB7), mRNA 773NM_006351 Homo sapiens
PCR实验分区基因扩增实验室通风环境的设计
那我们先来了解一下什么是气溶胶?气溶胶是由固体或液体小质点分散并悬浮在气体介质中形成的胶体分散体系,在气体与液体面摩擦时,操作时比较剧烈地摇动反应管,离心机离心,扩增后PCR产物开盖时、吸样时及移液器枪反复吹吸样品时都可形成气溶胶而污染。综上所述,为了得到好的实验结果,PCR反应需要进行严格的实验分
转基因作物田间试验的设计与管理实验(一)
实验材料 转基因株系实验步骤 3.1 释放试验的地理位置要求释放地点应是宜于种植该作物的一个隔离区,其动植物区系与周围农田没有差别,而且没有稀有或受保护的植物或动物物种,也必须确保释放地点较远的区域没有政府机构认定的群落生境或保护区。试验区要求地势平坦,既要能减少基因逃逸的危险,又要便于耕作,使试验
所有的看家基因(housekeeping-genes)的列表+引物设计服务2
NM_002128 Homo sapiens high-mobility group box 1 (HMGB1), mRNA 1295NM_002002 Homo sapiens Fc fragment of IgE, low aff
Fluidigm和Genomenon合作开发基因组面板设计服务
分析测试百科网讯 2018年6月7日,Fluidigm宣布已与Genomenon达成共同营销协议,为翻译和临床疾病研究人员提供基于证据的基因组面板设计服务。 根据合作伙伴的说法,研究人员将能够利用Fluidigm的自动微流控系统加快设计针对疾病的新一代测序,基因分型和实时PCR板。 Gen
引物设计的引物设计原则
1、引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp;2、引物GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近;3、引物所对应的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之间,Tm值曲线以选取72度附近为佳,5'到 3
引物设计的引物设计原则
1、引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp;2、引物GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近;3、引物所对应的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之间,Tm值曲线以选取72度附近为佳,5'到 3
引物设计的引物设计原则
1、引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp;2、引物GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近;3、引物所对应的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之间,Tm值曲线以选取72度附近为佳,5'到 3