清华汪小我等人开发CRISPRsgRNA设计工具
CRISPR/Cas9系统,是最近开发的一种强大而灵活的靶向基因组工程技术,包括基因组编辑和基因调控。这些应用需要设计高效、特异的单向导RNA(sgRNA)。然而,这仍然是具有挑战性的,因为它需要考虑许多标准。已有研究开发出了一些sgRNA设计工具用于基因编辑,但是目前还没有设计出用于基因调控的sgRNA设计工具。 七月二十三日,清华大学自动化系的汪小我和美国斯坦福大学的Lei S Qi博士带领的研究小组,在国际权威杂志《Bioinformatics》发表了题为“CRISPR-ERA: a comprehensive design tool for CRISPR-mediated gene editing, repression and activation”的研究论文。随着越来越多使用CRISPR/Cas9进行基因编辑和调控的实验数据,该研究小组根据这些已发表的研究总结的一套sgRNA设计规则,开发出了一种综合性的计算......阅读全文
死亡基因的研究意义
这一特别的基因会影响一个人会在一天的哪个时间段内死去。人体内几乎所有的生理过程都有一个昼夜节律,这意味着,它们的高峰值主要出现在一天的某个时间段内。甚至死亡(也是一种生理过程)也有它的昼夜节律,大多数人的死亡昼夜节律平均出现在早晨,所以大多数人通常死于早晨。有些人死亡节律时间段在上午11点左右。研究
基因功能研究策略
随着人类基因组计划的顺利进行,越来越多的新基因被发现,基因功能研究成为生命科学领域中的重大课题,目前基因功能研究方法主要有基因转导、反义技术、转基因和基因剔除、染色体转导、RNA 干涉等。一、 正常情况:DNA→mRNA→蛋白质→功能(遗传效应以及表型)二、 基因功能研究策略:1、 基因功能的获得(
一项检查FDA对关键药物研究设计有多大影响的研究
据11月26日刊《美国医学会杂志》上的一则研究披露,一项对制药公司和联邦食品与药物管理局(FDA)之间就讨论未来研究的可能互动所做的检查发现,最近批准的新药中有四分之一是没有进行过任何这样的会议的;当有这样的会议时,就 FDA所做的有关研究设计或初步转归建议而言,制药公司对其中的四分之一未曾遵守
引物设计的引物设计原则
1、引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp;2、引物GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近;3、引物所对应的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之间,Tm值曲线以选取72度附近为佳,5'到 3
引物设计的引物设计原则
1、引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp;2、引物GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近;3、引物所对应的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之间,Tm值曲线以选取72度附近为佳,5'到 3
引物设计的引物设计原则
1、长度:15—30bp,其有效长度[Ln=2(G十C)十(A十T)]一般不大于38,否则PCR的最适延伸温度会超过Taq酶的最佳作用温度(74度),从而降低产物的特异性。2、G十C含量:应在40%一60%之间,PCR扩增中的复性温度一般较Tm值低等于引物的Tm值减去5—10度。引物长度小于20时,
引物设计的引物设计原则
1、引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp;2、引物GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近;3、引物所对应的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之间,Tm值曲线以选取72度附近为佳,5'到 3
兰州化物所研究找到阴离子受体设计合成新思路
(a)磷酸根络合物的单晶结构(为求清晰略去了非酸性氢原子、溶剂及对阳离子);(b)由两分子受体组装而成的四面体笼的示意图,显示出主客体外形的高度互补性;(c) [Fe(tpy)2]2+. 的单晶结构。 中国科学院兰州化学物理研究所超分子催化组在阴离子受体的设计合成方面取得新进展。
中美研究人员设计出新型硅基光子芯片
中国南京大学和美国加州理工学院研究人员11月25日在英国《自然·材料》杂志网络版上发表论文称,他们设计出一种新型硅基光子芯片,初步实现了光的单向无反射传输,拓展了光子晶体及传统超构材料的研究领域,为经典光系统中探索和发展具有量子特性的新型光子器件提供了新的研究思路。 通过光子而非电子携带信
生活垃圾焚烧炉的选型与设计的研究
随着人们生活水平的不断提升,生活垃圾的规模日渐庞大,如何有效处理生活垃圾已经成为一个重要课题。目前,生活垃圾主要用焚烧炉进行焚烧处理,为了提高垃圾处理效率,需要对焚烧炉进行科学选型与设计。本文将针对设备选型与机械设计的相关内容进行分析,力求为我国垃圾焚烧提供一些帮助。 1.垃圾焚烧炉简介 在
我国自主设计建造的先进研究堆实现首次临界
据新华社电 5月17日,从中国原子能科学研究院获悉,由中国原子能科学研究院自主研发、设计和建造的具有世界先进水平的中国先进研究堆已于5月13日16时58分实现首次临界。 中国先进研究堆位于北京市房山区中国原子能科学研究院内,在同类中子束流研究堆中其主要技术指标位居世界前列,亚洲第
研究设计动态调控元件助力毒性天然产物生物合成
合成生物学以传统生物学获得的知识与材料为基础,利用系统生物学手段对其进行定量解析,在工程学以及计算机辅助指导下设计新的生物系统或深度改造原有生物系统。基于这一理念,以微生物为细胞工厂、重构生化合成网络或组装人工代谢途径,可实现重要化学品的生物合成,如青蒿素、鸦片等。但在实践上尚有以下问题亟待解决
研究揭示游动纳米机器人仿生设计新思路
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495142.shtm
PCB阻焊设计对PCBA可制造性研究(一)
随着现代电子技术的飞速发展,PCBA也向着高密度高可靠性方面发展。虽然现阶段PCB和PCBA制造工艺水平有很大的提升,常规PCB阻焊工艺不会对产品可制造性造成致命的影响。但是对于器件引脚间距非常小的器件,由于PCB助焊焊盘设计和PCB阻焊焊盘设计不合理,将会提升SMT焊接工艺难度,增加PCBA表面贴
单原子纳米酶设计及应用研究获进展
1月29日,《德国应用化学》(Angewandte Chemie International Edition)杂志在线发表了单原子纳米酶仿生设计的最新研究成果。这项工作有助于理解纳米酶的催化机理,并促进纳米酶在生物催化领域的发展。 自从2007年Fe3O4纳米材料蕴含酶学特性(Nature N
研究揭示材料强韧对立的纳米析出相设计
工程材料通常需要经过一定的处理流程以提升其抵抗变形的能力,尤其是抵抗位错的运动导致的初始塑性变形或者屈服,材料在这一点的应力值对应于其强度。和人们熟知的弹性变形不同,塑性变形是不可恢复的。与此同时,金属材料的塑性变形量,或者韧性,是衡量其应用的另一个关键指标。如果位错在运动中受到阻碍或者非连续的
完善顶层设计-助基础研究跑出“加速度”
◎本报记者 操秀英“我很庆幸继续从事热爱的事业,能够激励和培养更多优秀青年人才。”复旦大学人类表型组研究院执行院长田梅在接受科技日报记者采访时感慨。10年前的9月,田梅正在浙江大学医学院附属第二医院紧锣密鼓地带学生、建团队、搭平台。此前,经过十余年学习和工作的磨砺,田梅已是世界分子影像与核医学领域优
计算所在芯片全自动设计研究方向取得进展
芯片设计是一项非常具有挑战性且耗费人力和资源的工作。通常需要由工程师团队编写代码,然后在电子设计自动化(EDA)工具的辅助下生成电路逻辑。针对人工编写的代码,工程师团队需反复对其进行迭代的功能验证和性能/功耗优化。该过程通常需要上百人团队迭代数月或数年才能完成。 芯片全自动设计的目标是由机器代
研究设计出测量植物排放BVOCs动态箱系统
近日,中国科学院广州地球化学研究所研究员王新明和张艳利课题组设计了一种用于测量植物排放BVOCs的半开放式动态箱系统。相关研究发表于《大气测量技术》(Atmospheric Measurement Techniques)。该论文所有实验数据均是在中国科学院广州地球化学研究所公共技术服务中心有机地球化
首届研究生“美丽中国”创新设计大赛开幕
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/502904.shtm6月12日,中国研究生“美丽中国”创新设计大赛启动仪式在东华大学举行。 ?启动仪式,主办方供图大赛为2023年中国研究生创新实践系列大赛增设活动,也是系列大赛中唯一一个专门
单原子纳米酶设计及应用研究获进展
1月29日,《德国应用化学》(Angewandte Chemie International Edition)杂志在线发表了单原子纳米酶仿生设计的最新研究成果。这项工作有助于理解纳米酶的催化机理,并促进纳米酶在生物催化领域的发展。 自从2007年Fe3O4纳米材料蕴含酶学特性(Nature N
PCB阻焊设计对PCBA可制造性研究(二)
PCB LAYOUT实际设计如下图五,助焊焊盘尺寸0.8*0.5mm,阻焊焊盘尺寸0.9*0.6mm,器件焊盘中心间距0.65mm,助焊边沿间距0.15mm,阻焊边沿间距0.05mm,单边阻焊宽度增加0.05mm。(图五)PCB工程设计要求按照常规阻焊工程设计,单边阻焊焊盘尺寸要求大于助焊焊盘尺寸0
PCB阻焊设计对PCBA可制造性研究(三)
优化方案PCB LAYOUT设计优化参考IPC 7351标准封装库,助焊焊盘设计为1.2mm*0.3mm,阻焊焊盘设计1.3*0.4mm,相邻焊盘中心间距0.65mm保持不变。通过以上设计,单边阻焊0.05mm的尺寸满足PCB加工工艺要求,相邻阻焊边沿间距0.25mm尺寸满足阻焊桥工艺,加大
转基因技术基因工程疫苗的研究
使用DNA重组生物技术,把天然的或人工合成的遗传物质定向插入细菌、酵母菌或哺乳动物细胞中,使之充分表达,经纯化后而制得的疫苗。应用基因工程技术能制出不含感染性物质的亚单位疫苗、稳定的减毒疫苗及能预防多种疾病的多价疫苗。 目前已经商业化使用的部分基因工程疫苗: 乙肝疫苗、丙肝疫苗、百日咳基因工
川大与中国核动力研究设计院共建联合创新研究院
5月7日,四川大学与中国核动力研究设计院深化院校合作方案签订暨联合创新研究院揭牌仪式举行。中国核动力研究设计院党委书记万钢、院长王丛林、顾问周定文,校党委书记王建国、副校长褚良银,及校院双方相关单位负责人参加仪式。仪式由周定文主持。 根据合作方案,校院双方将进一步加强校院合作体制机制建设,打造
美空军研究实验室计划推动空间实验方法和原型设计研究
空军研究实验室计划在本月召开一个新项目的讨论,主要围绕重振综合空间实验能力服务。这项服务于7月25日宣布,将向业内专家征求意见,建立研究和开发综合空间实验计划,并会授予多个合同满足关键的实验研究需求。“这些合同的目的是为空军研究实验室更好的履行空间技术分析、开发、集成、实验,演示和评估等一系列任
科学家设计出一种基因载体可帮助减肥
据在线发表于《自然—材料学》上的一项研究显示,一种特定针对肥胖小鼠体内脂肪细胞的肽链类基因载体可以携带投递一种治疗基因,从而帮助减肥。虽然其在人身上的可用性和安全性还需进一步实验才能确认,但是这种分子复杂物或能够用于治疗肥胖以及肥胖引发的相关代谢症状。 肥胖通常是过度饮食造成的,能量都储存在脂
微生物所等在基因元件设计原则方面取得进展
7月3日,中国科学院微生物研究所娄春波课题组与合作者在《自然-通讯》(Nature Communications)杂志在线发表了题为Insulated Transcriptional Elements Enable Precise Design of Genetic Circuits 的研究论文
CRISPR/Cas9设计工具,让基因编辑不再高冷!
CRISPR/Cas9已经成为最常用的基因编辑系统。CRISPR/Cas9包括2部分:Cas9核酸内切酶和sgRNA(single guide RNA),sgRNA由天然的tracrRNA (transactivating crRNA)和crRNA (CRISPR RNA)融合而来。 使用
引物设计重点因素及设计技巧
想把引物合成的比较好,除了前引物和后引物的Tm不能相差太大,我们还要重点考虑以下因素: 一、GC含量 引物的GC含量一般为40-60%,以45-55%为宜,过高或过低都不利于引发反应。有一些模板本身的GC含量偏低或偏高,导致引物的GC含量不能在上述范围内,这时应尽量使上下游引物的GC