清华汪小我等人开发CRISPRsgRNA设计工具

CRISPR/Cas9系统,是最近开发的一种强大而灵活的靶向基因组工程技术,包括基因组编辑和基因调控。这些应用需要设计高效、特异的单向导RNA(sgRNA)。然而,这仍然是具有挑战性的,因为它需要考虑许多标准。已有研究开发出了一些sgRNA设计工具用于基因编辑,但是目前还没有设计出用于基因调控的sgRNA设计工具。 七月二十三日,清华大学自动化系的汪小我和美国斯坦福大学的Lei S Qi博士带领的研究小组,在国际权威杂志《Bioinformatics》发表了题为“CRISPR-ERA: a comprehensive design tool for CRISPR-mediated gene editing, repression and activation”的研究论文。随着越来越多使用CRISPR/Cas9进行基因编辑和调控的实验数据,该研究小组根据这些已发表的研究总结的一套sgRNA设计规则,开发出了一种综合性的计算......阅读全文

PCB设计中高速背板设计过程

在“几大高速PCB设计中的隐形杀手”中提到了“高速背板与高速背板连接器”,那么高速背板是如何设计出来的,从头到尾会有哪些设计步骤,每个环节有哪些要点呢?本期案例分享做下概要的梳理。高速背板设计流程完整的高速背板设计流程,除了遵循IPD(产品集成开发)流程外,有一定的特殊性,区别于普通的硬件PCB模块

引物设计重点因素及设计技巧

  想把引物合成的比较好,除了前引物和后引物的Tm不能相差太大,我们还要重点考虑以下因素:   一、GC含量   引物的GC含量一般为40-60%,以45-55%为宜,过高或过低都不利于引发反应。有一些模板本身的GC含量偏低或偏高,导致引物的GC含量不能在上述范围内,这时应尽量使上下游引物的GC

音频设计屏幕发声方案设计

前言随着手机全面屏的普及,原有的16:9的屏幕逐步被18:9替代,各厂商争相扩大手机的屏占比,部分手机已然将屏占比达到了90%以上,但是传统器件的摆放日渐困难,尤其是传统受话器的位置,逐步被隐藏甚至取消;目前传统的听筒还是以动圈式Receiver为主,屏幕听筒位置开孔的问题一直未能解决,所以

引物设计重点因素及设计技巧

  想把引物合成的比较好,除了前引物和后引物的Tm不能相差太大,我们还要重点考虑以下因素:   一、GC含量   引物的GC含量一般为40-60%,以45-55%为宜,过高或过低都不利于引发反应。有一些模板本身的GC含量偏低或偏高,导致引物的GC含量不能在上述范围内,这时应尽量使上下游引物的GC

引物设计重点因素及设计技巧

想把引物合成的比较好,除了前引物和后引物的Tm不能相差太大,我们还要重点考虑以下因素:一、GC含量引物的GC含量一般为40-60%,以45-55%为宜,过高或过低都不利于引发反应。有一些模板本身的GC含量偏低或偏高,导致引物的GC含量不能在上述范围内,这时应尽量使上下游引物的GC 含量以及Tm

北京基因组研究所Plant-cell基因组研究新成果

  来自中科院北京基因组研究所、荷兰瓦赫宁根大学和中科院/马普学会等10多家机构的研究人员组成的一个研究小组,通过测序及分析醉蝶花(Tarenaya hassleriana)的基因组提供了关于十字花科植物繁殖性状和基因组进化的新认识。相关研究发表在植物学权威期刊The Plant Cell杂志上

植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式。转

植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式。转

植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式。转

植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

  叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式

植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

  叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式

清华大学揭幕三个新设计研究所

  由清华大学美术学院、清华大学艺术与科学研究中心共同举办的“清华国际艺术·设计学术月”开幕式,日前在清华大学举行。本届学术月的主题为“交叉学科的创新”,在此后一个月当中,数十位国内外著名专家将举办系列讲座。本届学术月除了众多国际级设计大师带来一系列精彩演讲外,还启动了清华大学三个前沿性研

研究指导设计恒星大气参数测量的最佳滤光片

一支国际联合研究团队计算得到了精确测量恒星金属丰度的最佳滤光片响应曲线。相关研究成果日前发表于《天体物理学报通讯》。据悉,恒星大气参数的精确测量对天文学的发展至关重要。其中恒星金属丰度是恒星大气参数中非常重要的一个参数指标。相比基于光谱数据的恒星金属丰度测量方法,依托测光数据的金属丰度测量方法可获取

研究人员设计出室温长循环钙基多离子电池

  近日,中国科学院深圳先进技术研究院功能薄膜材料研究中心研究员唐永炳及其团队成员郎集会、蒋春磊、方月等研发了一种具有高倍率、长循环的室温钙基多离子电池,创新性地提出了三离子设计策略,实现了高达15 C的倍率性能(容量保持率97%),并在5 C的倍率条件下循环1500圈仍具有86%的容量保持率,是目

研究人员开发了可微观设计的能量吸收材料

  劳伦斯·利弗莫尔国家实验室的研究人员运用硅基油墨通过3D打印技术制造出了可编程设计的具有机械能量吸收特性的硅胶缓冲物质。  像固体凝胶和多孔泡沫这样的材料可以作为填充物和缓冲物,但它们都有各自的优缺点。固体凝胶是有效的填充物质,但其相对较重;凝胶性能还会受温度的影响

学者研究提出一种全新的菌群设计范式

华南农业大学资源环境学院教授仇荣亮团队围绕复杂有机污染情景下合成微生物组的理性构建与功能强化,提出了一种全新的菌群设计范式,为高效、稳定的环境生物修复提供了重要理论依据与技术支撑。近日,相关成果在线发表于《自然-通讯》。华南农业大学资源环境学院副教授阮哲璞和博士生谭家霖为论文共同第一作者、仇荣亮为通

学者研究提出一种全新的菌群设计范式

华南农业大学资源环境学院教授仇荣亮团队围绕复杂有机污染情景下合成微生物组的理性构建与功能强化,提出了一种全新的菌群设计范式,为高效、稳定的环境生物修复提供了重要理论依据与技术支撑。近日,相关成果在线发表于《自然-通讯》。华南农业大学资源环境学院副教授阮哲璞和博士生谭家霖为论文共同第一作者、仇荣亮为通

研究为“定制化”蛋白凝聚体的设计指明方向

  近日,大连理工大学薛闯教授团队发表题目为“合成生物系统中的液液相分离”的综述论文。该论文详细阐述了生物体大分子相变的形成机制及物理模型,论述了液液相分离这一物理现象在合成生物学、代谢工程、生物医药及材料科学的应用前景,为“定制化”蛋白凝聚体的设计指明方向。相关成果发表在在国际顶级期刊《材料科学与

基于新能源汽车平台专用故障仪的研究与设计

1 底层设计汽车故障诊断仪是车辆故障自检终端、汽车故障诊断仪(又称)是用于检测汽车故障的便携式智能汽车故障自检仪,用户可以利用它迅速地读取汽车电控系统中的故障,并通过液晶显示屏显示故障信息,迅速查明发生故障的部位及原因。根据目前科技发展趋势,传统的故障诊断仪因为采用封闭系统具有功能单一,操作相应慢,

研究指导设计恒星大气参数测量的最佳滤光片

一支国际联合研究团队计算得到了精确测量恒星金属丰度的最佳滤光片响应曲线。相关研究成果日前发表于《天体物理学报通讯》。据悉,恒星大气参数的精确测量对天文学的发展至关重要。其中恒星金属丰度是恒星大气参数中非常重要的一个参数指标。相比基于光谱数据的恒星金属丰度测量方法,依托测光数据的金属丰度测量方法可获取

美研究人员改进元件设计-提高衍射光学元件效率

  多年以来,衍射光学元件已经发展成为光束整形和分束的最有效工具。衍射光学元件较之折射光学器件的优点是众所周知的:它们重量轻、结构紧凑、便于集成到光学系统中。单个衍射光学元件还能够执行多种光学功能。衍射光学元件(DOE)的最新进展使它们成为激光材料加工、医疗和美容激光以及结构光投影系统的标准组件。由

“大规模FPGA芯片设计关键技术研究”通过验收

  10月25日,来自清华大学,中国电子科技集团,航天科技集团,中科院自动化所、微电子所、半导体所等单位十余位专家组成的验收专家组齐聚中国科学院电子学研究所,对电子所可编程芯片与系统研究室(十一室)牵头承担的中国科学院知识创新工程重要方向项目“大规模FPGA芯片设计关键技术研究”进行验收评审,并一直

中科院单原子纳米酶理性设计研究获进展

  5月6日,Nature Catalysis发表了题为Matching the kinetics of native enzymes with a single-atom iron nanozyme的研究文章。该研究设计了一种以FeN3P为中心的单原子纳米酶(FeN3P-SAzyme),通过磷和氮

电力变压器容量损耗测试仪的设计研究

电力变压器容量损耗测试对于变压器制造单位的出厂试验,以及电力部门有效降低线损、防止高耗变压器进入电网有着重要的意义。为此, 设计了一种用于电力变压器的空载及负载试验的容量损耗测试仪。该仪器所测的直接参数是三相电压、三相电流、三相功率及试验电源的频率。空载试验时根据所测数据计算出平均电压、平均电流、总

研究发现新型抑癌基因

  上海交通大学医学院附属仁济医院、上海市肿瘤研究所覃文新和上海东方肝胆外科医院丛文铭研究团队,新近发现了新型抑癌基因RCAN1.4在肝癌生长和转移过程中的功能及作用机制。相关研究成果日前发表于《胃肠病学》。专家认为,该研究为进一步了解肝癌生长和转移过程的分子机理提供了重要线索。  数据显示,唐氏综

研究发现抗衰老靶标基因

  2月27日,《自然》期刊在线发表了题为《两个保守的表观遗传调控因子妨碍健康衰老》的研究论文,该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心(神经科学研究所)、上海脑科学与类脑研究中心、神经科学国家重点实验室蔡时青研究组与中国科学院上海巴斯德研究所江陆斌研究组合作完成。  衰老是生物体随时间推移各

基因重复的研究进展

基因重复是基因通过不等交换、逆转录转座或全基因组重复等途径产生一个与原基因相似的基因或碱基序列。它与生物体基因组大小的进化、新基因的起源、物种的分化以及基因抗突变的能力大小等都密切相关。文章综述了重复基因的产生机制、保留机制、选择作用、分化途径以及重复基因进化速率等方面的相关研究,揭示了基因重复对生

死亡基因的研究进展

最近,科学家发现恶性子宫肿瘤细胞中缺少一种遗传物质即“死亡基因”。当他们在实验室条件下补上这部分缺失基因后,恶性肿瘤细胞便被成功地杀死。他们说:“正常的细胞不会永久地分裂下去,但很多癌细胞都具备这个特性。如果我们能找到导致它们永远存活的基因上的依据,就能着手研究怎样使它们死去,缺乏这种“死亡基因”,

基因敲除技术的研究历史

基因敲除技术是20世纪80年代发展起来的,是建立在基因同源重组技术基础以及胚胎干细胞技术基础上的一种新分子生物学技术。所谓胚胎干细胞(EmbryonicStem cell,ES)是从着床前胚胎(孕3—5天)分离出的内细胞团(Inner cellmass,ICM)细胞,它具有向各种组织细胞分化的多分化

新研究:精准基因编辑技术

  中国科学院遗传与发育生物学研究所高彩霞研究组开创性地运用AI辅助结构预测,建立起基于三级结构的蛋白聚类方法,并扩展为全新的脱氨酶挖掘体系,开发了一系列具有中国自主知识产权的新型碱基编辑工具。该工作为蛋白功能分析、新功能元件挖掘提供了全新策略。新研发的碱基编辑系统具有我国自主知识产权的精准基因编辑