动物所支持使用通用CO1基因片断开展动物DNA条形码研究

DNA条形码研究的核心是采用某一基因片断用于物种鉴别。在对动物的研究工作中,目前主要是采用线粒体细胞色素氧化酶1(CO1) 5’端约650bp左右的区域。但是该片断的选用没有充分的依据表明它的效力,并且有证据表明它不能很好的识别某些类群的物种。因此,中科院动物研究所科研人员基于真哺乳动物亚纲1179条线粒体基因组序列,对线粒体基因组中各蛋白质编码基因,采用生物信息学方法评估其作为DNA条形码的效力,期望在线粒体基因组范围内寻找出最合适的基因片断用作分子标记。 基于物种识别率,种内及种间变异,高级阶元解决能力以及基因饱和度等四项标准,研究结果表明:目前通用的CO1 5’端可以反映各线粒体蛋白质编码基因用于物种识别的效力;该片断与其它基因相似,可以使物种识别率达到90%以上,且各基因片断间在种内及种间变异上不存在显著差异。不过,对于某些类群,各线粒体基因片断依然存在种内与种间变异相重叠的问题;这些线粒体基因片......阅读全文

商业条形码检测仪常用款型

 CCD扫描器,激光手持式扫描器和全角度激光扫描器二种。   一、HHP QC条形码检测仪是利用光电藕合(HHP)原理,对条形码印刷图案进行成像,然后再译码。它的优势是:无转轴,马达,使用寿命长;价格便宜。HHP因战略原因,从2012年停产全线所有检测仪相关产品,专注于条码扫描枪的业务。   选择C

中国蛇类DNA条形码参考数据集发布

  中国科学院昆明动物研究所(以下简称昆明动物所)研究员车静课题组联合国内科研团队开展合作,首次系统性构建了中国蛇类DNA条形码参考数据集(COI),对中国蛇类多样性进行了评估。日前,相关研究成果发表于《分子生态学资源》(Molecular Ecology Resources)。  据了解,两栖爬行

条形码8字开头是转基因食品?

  近日,一篇“8开头的条形码是转基因食品”的帖子又在网上流转开来。信息时报记者多方求证了解到,该说法并不准确,条形码开头数字代表的是区域而非产品,而目前国内对于商品条形码并没有强制标准。此外,转基因食品必须在外包装文字说明,消费者通过外包装便可以辨别商品是否转基因。   “8”字开头不特指产品只代

为什么线粒体自噬被抑制,线粒体数量减少

因为线粒体活性进入休眠状态。线粒体自噬被抑制,线粒体数量减少,会使线粒体代谢引起氧化,导致线粒体活性细胞进入休眠状态。线粒体,是一种存在于大多数细胞中的由两层膜包被的细胞器,细胞中制造能量的结构。

广州健康院发现线粒体基因编码第14个蛋白质的“线粒体约定”新模式

5月3日,中国科学院广州生物医药与健康研究院刘兴国课题组在《细胞-代谢》(Cell Metabolism)上发表了题为A novel protein CYTB-187AA encoded by the mitochondrial gene CYTB modulates mammalian early

科学家给2万年前大熊猫做线粒体基因组测序

  18日出版的《当代生物学》介绍了一项由中科院古脊椎所研究员付巧妹及团队主导、中科院动物所研究员魏辅文参与的研究成果。他们提取、捕获和测序了一个2.2万年前的大熊猫完整的线粒体基因组。这意味着获取大熊猫的古核DNA指日可待。  由于现存大熊猫种群的减少,其基因重建可能无法准确描述这一物种的进化历史

科学家给2万年前大熊猫做线粒体基因组测序

科技日报北京6月18日电 (记者李大庆)18日出版的《当代生物学》介绍了一项由中科院古脊椎所研究员付巧妹及团队主导、中科院动物所研究员魏辅文参与的研究成果。他们提取、捕获和测序了一个2.2万年前的大熊猫完整的线粒体基因组。这意味着获取大熊猫的古核DNA指日可待。 由于现存大熊猫种群的减

利用LCMS/MS等方法-发现线粒体基因组编码蛋白质的新模式

图 线粒体编码基因CYTB的双重翻译模式  在国家自然科学基金项目(批准号:92254301、92357302、32025010)等资助下,中国科学院广州生物医药与健康研究院刘兴国研究员团队在线粒体基因组编码研究方面取得进展,研究成果以“线粒体基因CYTB编码的新蛋白质CYTB-187AA调控哺乳动

研究揭示人体器官衰老“线粒体时钟”

  线粒体通常被认为是远古细菌与真核细胞共生演化的产物,其拥有独立的基因组,是细胞的能量工厂。然而,线粒体基因组在生命过程中不断积累突变,其突变率远高于细胞核DNA,这些突变或与衰老、疾病密切相关。  近日,中国科学院上海营养与健康研究所研究员李昕团队利用罕见变异识别技术,对国际公开数据库中超万例的

科学家在种子植物DNA条形码研究方面取得重要进展

  DNA条形码(DNA Barcoding)是利用标准基因片段对物种进行快速和准确鉴定的新技术。加拿大科学家Paul Hebert等于2003年提出这一概念后,DNA条形码已成为生物学领域发展最迅速的学科前沿之一。线粒体细胞色素C氧化酶基因CO1由于其引物通用性高、长度合适、进化速

解析了苹果轮纹病两种主要病原菌的动态进化模式

  苹果轮纹病是一种世界性病害,也是我国苹果三大病害之一,严重影响我国苹果产业的可持续发展。  2021年5月24日,西北农林科技大学植物保护学院孙广宇教授团队在Environmental Microbiology上在线发表题为“Comparison of mitochondrial genomes

云南省禾本科种质资源与基因组学省创新团队通过认定

  6月6日,由云南省科技厅主持,邀请有关专家,对“中国科学院昆明植物研究所禾本科种质资源与基因组学省创新团队”进行认定,经专家组认真审查有关认定资料,听取了团队带头人李德铢的工作汇报。   专家组认为,该创新团队通过三年的实施培养,建立了有国际影响力的禾本科植物的比较功能基因组学与进化基因组学研

线粒体分离实验—用蔗糖密度梯度法纯化线粒体

实验材料线粒体悬液试剂、试剂盒蔗糖溶液Tris-HClEDTA仪器、耗材Bockman SW28 号转头实验步骤1. 在用于 Bockman SW28 号转头(或与其等同的产品)的 Uitradear 离心管中,小心地在 15 ml 1.5 mol/L 的蔗糖溶液上加一层 15 ml 1.5 mol

线粒体膜电位荧光探针Cell-Meter-线粒体膜电位(MMP)

人体的ATP有95%为线粒体所提供,合成的ATP通过线粒体内膜ADP/ATP载体与细胞质中的ADP交换进入细胞质,参与细胞的各种需能过程,因此线粒体与细胞维持正常功能密切相关。线粒体在呼吸氧化过程中,将所产生的能量以电化学势能储存于线粒体内膜,在内膜两侧造成质子及其他离子浓度的不对称分布而形成线粒体

专家提议建立青藏高原雪豹DNA条形码

  “未来,针对雪豹的野生种群还要做一些遗传多样性评估,遗传多样性评估对恢复种群有很大的作用,确定雪豹的指纹或者DNA条形码后,从野外毛发中就可以检测在这个区域里面大概有多少只雪豹。”11日,省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室常务副主任祁得林教授表示。  据祁得林教授介绍,通过建立雪豹DN

中国珍稀濒危植物DNA条形码鉴定平台建成

  记者从中国科学院植物研究所获悉,“中国珍稀濒危植物DNA条形码鉴定平台”日前正式开通并向社会提供服务,为珍稀濒危植物的快速可靠鉴定提供了技术支撑。  珍稀濒危植物与人类关系十分密切但非常脆弱,非法盗伐、走私等危害珍稀濒危植物的事件时有发生。一些案件由于材料鉴定困难而不能给犯罪分子应有的惩罚。因此

樟科植物DNA条形码研究方面取得进展

  樟科植物作为常见的重要经济林木,在林业、轻工、医药等领域都占有重要的地位,大多数种类集中分布于长江以南各省区,然而对其物种的把握与识别却始终是困扰大家的一个难题,阻碍了对其实施有效的生物多样性保护与开发利用。物种的准确鉴定是一切生产、应用与研究至关重要的第一步,DNA条形码技术的应用,使得前述难

DNA“条形码”可快速定位体内纳米粒子

  美国麻省理工学院、佐治亚理工学院和佛罗里达大学的科研团队找到一种新方法,以DNA(脱氧核糖核酸)序列作为“条形码”,能快速测出不同纳米粒子处于身体的哪个部位,有助于基因靶向疗法在体内的精确定位。相关论文发表在近期出版的美国《国家科学院学报》上。  科学家一直在寻求通过DNA或RNA(核糖核酸)递

“条形码”序列测序(BRBseq)廉价且高效

  RNA测序是一种通过观察基因表达来分析整个基因组的技术。如今,这种全基因组表达分析是基因组研究的标准工具,因为它们依赖于高通量技术,而这些技术本身已经变得广泛可用。  尽管如此,RNA测序仍然是昂贵和费时的,因为它首先需要昂贵的准备一个完整的基因组库——由细胞RNA生成的DNA池——同时数据本身

-DNA条形码:为濒危植物撑起“保护伞”

  12月20日,中国科学院植物研究所聚集了来自国家农业、林业、环保、医药、检验检疫、进出口等部门的人士,他们一起见证了《中国珍稀濒危植物图鉴》的问世和“中国珍稀濒危植物DNA条形码鉴定平台”的开通。   对于他们来说,这是一件盼望了10年的大事。   “中国濒危植物数量超世界平均水平”   

台科研人员参与生命条形码国际研究

中新网消息,台湾“中研院”生物多样性中心与国际生命条形码联盟,18日合作举办“第二届生命条形码国际会议及东亚区域合作会议”,期待未来能够替所有的物种建立身份证。   据台湾《联合报》报道,“中研院”生物多样性中心主任邵广昭表示,东南亚地区生物种类极为庞杂,是一座遗传资源的大宝库;因此这次会议特别

研究揭示马先蒿属超级条形码未显著提升物种鉴别能力

  近年来,完整质体基因组包含更全面的遗传信息,被寄望成为新一代“超级条形码”,尤其在标准条形码难以区分的近缘物种中展现潜力。然而,很少有研究系统探讨分类复杂性会如何影响质体基因组条形码的有效性。这一问题在经历过快速辐射演化的复杂支系中尤为突出。马先蒿属(Pedicularis)是被子植物中最大的半

华南植物园鼎湖山植物DNA条形码研究获进展

  日前,中科院华南植物园研究人员在鼎湖山木本植物DNA条形码研究方面取得重要进展。相关结果在线发表于《多样性及其分布》上。  DNA条形码技术是一种利用标准的简短基因片段来实现物种快速识别的工具。动物界,线粒体COI基因应用非常成功。但是在植物界,由于进化历史复杂,标准条形码还没有达成共识。  针

线粒体DNA的定义

线粒体DNA是线粒体中的遗传物质,线粒体能为细胞产生能量(ATP),是在细胞线粒体内发现的脱氧核糖核酸特殊形态。线粒体是为细胞提供能量(ATP)的细胞器。一个线粒体中一般有多个DNA分子。

线粒体基因的定义

线粒体基因:mtDNA,线状、环状,能单独复制,同时受核基因控制。哺乳动物:无内含子,有重叠基因突变率高。

线粒体疾病的症状

  在不同严重程度的线粒体疾病,主要影响大脑,心脏和肌肉。根据细胞的体内受到影响,症状可能包括:生长缓慢,失去肌肉的协调性,肌肉无力,视觉和/或听觉有问题的,发育迟缓,学习障碍,精神发育迟滞,心脏,肝脏或肾脏疾病,胃肠功能紊乱,严重的便秘,呼吸系统疾病,糖尿病,增加感染的风险,神经系统的问题,癫痫发

线粒体病的病因

  基因突变(90%):  线粒体是细胞内提供能量的细胞器,人类mtDNA是长16569bp的环状双链分子,分轻链和重链,含37个基因,主要编码呼吸链及与能量代谢有关蛋白,mtDNA缺失或点突变使编码线粒体氧化代谢过程必需的酶或载体发生障碍,糖原和脂肪酸等不能进入线粒体充分利用和产生足够的ATP,导

线粒体病的诊断

  线粒体肌病的诊断依赖于典型的临床症状:四肢近端极度不能耐受疲劳,身体矮小和神经性耳聋等,伴各亚型临床特征;血清乳酸,丙酮酸增高和肌肉活组织检查发现RRF,mtDNA缺失或点突变等之结果,线粒体脑肌病患者CT或MRI检查可见白质脑病,基底核钙化,脑软化,脑萎缩和脑室扩大等。

如何提取细胞线粒体

提取新鲜心肌组织细胞内线粒体的方案:心肌组织切碎后在4 ℃介质(0.25 mol/L蔗糖、10 mmol/L Tris-HCl pH7.4,0-4℃)中制备心肌组织匀浆。匀浆经750g、离心10 min后留上清,以9000 g离心20 min 后留沉淀,重新悬浮后以9000 g再离心20 min,弃

线粒体DNA的特性

线粒体DNA是线粒体中的遗传物质,线粒体能为细胞产生能量(ATP),是在细胞线粒体内发现的脱氧核糖核酸特殊形态。线粒体是为细胞提供能量(ATP)的细胞器。一个线粒体中一般有多个DNA分子。