“条形码”序列测序（BRBseq）廉价且高效
RNA测序是一种通过观察基因表达来分析整个基因组的技术。如今，这种全基因组表达分析是基因组研究的标准工具，因为它们依赖于高通量技术，而这些技术本身已经变得广泛可用。 尽管如此，RNA测序仍然是昂贵和费时的，因为它首先需要昂贵的准备一个完整的基因组库——由细胞RNA生成的DNA池——同时数据本身也很难分析。所有这些都使得RNA测序难以运行，使得它被采用的程度没有它能做到的那么广泛。 在单细胞转录组学的革命推动下，一些新的方法提供了帮助，这种方法使用了所谓的“样本条形码”或“多路复用”。在这里，每个“条形码”序列在库准备过程中被添加到每个DNA片段中，以便在分析最终数据之前对每个片段进行识别和排序，这意味着这种方法只需要一个包含多个不同样本或细胞的库。 条形码既降低了成本，又缩短了时间，这可以扩展到大样本的批量RNA测序。但是，在适应和验证大量RNA样本的可靠和廉价分析方案方面仍然存在困难——这就是我们在分析细胞或组织的转......阅读全文
“条形码”序列测序（BRBseq）廉价且高效
RNA测序是一种通过观察基因表达来分析整个基因组的技术。如今，这种全基因组表达分析是基因组研究的标准工具，因为它们依赖于高通量技术，而这些技术本身已经变得广泛可用。 尽管如此，RNA测序仍然是昂贵和费时的，因为它首先需要昂贵的准备一个完整的基因组库——由细胞RNA生成的DNA池——同时数据本身
安捷伦：用于RNA测序的文库制备与靶向序列捕获解决方案
简化的RNA和DNA测序解决方案，用于精简临床NGS 2020年9月1日，北京——安捷伦科技公司（纽约证交所：A）今日宣布推出SureSelect XT HS2 RNA试剂盒。该解决方案采用模块化设计，为RNA 和 DNA样品提供了一种简单的平行分析方法，从而确保客户能够简化并整合其工作流程，而无
《自然》：美首次对老鼠基因组调控序列测序
美国科学家在7月1日出版的英国《自然》杂志上撰文表示，他们首次详细标示出了老鼠基因组功能序列中一个重要部分——调控序列的详细情况。老鼠是生物医学研究中最广泛使用的哺乳动物模型，因此，最新研究也将有助于我们进一步解读人类基因组。 加州大学圣地亚哥分校路德维格癌症研究所基因调控实验
美首次对老鼠基因组的调控序列测序
美国科学家在7月1日出版的英国《自然》杂志上撰文表示，他们首次详细标示出了老鼠基因组功能序列中一个重要部分――调控序列的详细情况。老鼠是生物医学研究中最广泛使用的哺乳动物模型，因此，最新研究也将有助于我们进一步解读人类基因组。 加州大学圣地亚哥分校路德维格癌症研究所基因调控实验室主任任兵教
通过序列杂交和条形码进行单细胞原位分析
现代系统生物学有两种革新技术：基因组学和单细胞生物学，前者具备同时监测生物体中所有基因和蛋白质的能力，后者则可以在自然微环境中跟踪单细胞的一些特定基因。 两种技术都很强大，但具有互补的局限性：基因组学平均了一个细胞群的异质性和空间复杂性，而单细胞技术一次只能探测几个基因。因此，将基因组学与单细
RNA测序描绘人类视网膜的完整基因图
来自马萨诸萨州和哈佛医学院的调查者们发表了人类视网膜的基因表达图。Drs. Michael Farkas和他的研究员们报告了视网膜上基因表达的完整的目录。 视网膜是眼睛后的神经组织。主要的功能是接受光的信号，并把光的信号转化为神经信号并传送给脑，从而形成我们的视觉。如果把眼睛比作照相机
美国FDA关于提交抗病毒药物二代测序数据要求概述
2019年7月，美国食品药品监督管理局（FDA）发布了关于抗病毒药物产品提交二代测序数据的指南。指南为抗病毒药物产品向FDA提交二代核苷酸序列分析程序以及支持耐药性评估数据提供了意见。 一、背景信息 为保护公共卫生、避免出现可能传染他人并导致不能通过已批准药物产品控制疾病暴发的新型耐药和交叉
双RNA测序技术
在发表于《自然》（Nature）杂志上的一篇研究论文中， 由来自德国、奥地利和美国的研究人员组成的一个研究小组发现，采用一种允许在感染过程中同时研究细菌与宿主小RNA的新技术，可以揭示出两者转录谱的改变。该研究小组描绘了他们的技术、该技术如何更多地帮助了解细菌感染机制，以及在研究中获得的重要发现
专家指路：如何追上CRISPR技术快速发展的脚步？
每个月都有一大波新的CRISPR工具来袭。比如，Cas9抑制剂的出现可在各种场景下防止脱靶效应。人们也将CRISPR-Cas9系统与前沿的单细胞测序技术相结合，开发出新的策略。与此同时，研究人员开发出Cas9以外的效应物核酸酶，比如C2c2，靶向RNA以实现编辑和成像应用。 对于这些热门的技术
靶向测序：表达谱分析的新选择
没有人愿意听到“癌症”这个词。不过在提到前列腺癌时，人们的情绪往往更加复杂：有些人的肿瘤不会扩散，需要积极监控；而有些人就没那么幸运，需要手术或放疗和化疗。医生所面临的挑战是正确的诊断，再加上适当的治疗。 Carlos S.Moreno是埃默里大学温希普癌症研究所（Winship Cancer
10x－Genomics独创短读序列技术－两年收入增涨20倍
近日，基因检测初创公司10x Genomics又筹集了3500万美元。本次融资是该公司D轮融资的延续，10x Genomics将用这笔资金继续推进研发工作和扩大产品营销。 在2018年4月，10x Genomics就已筹集了5000万美元的D轮融资，由Meritech Capital领投，Fi
首个亚洲人源基因检测序列标准物质完成研制
6月，中国计量科学研究院和深圳华大基因研究院共同发布首个亚洲人源(炎黄一号)DNA序列标准物质(BW-5201)和大肠杆菌O157基因组DNA序列标准物质(BW-5202)。这是全球首次发布亚洲人源DNA和微生物基因组DNA序列标准物质，为基因检测产业评估测序和数据分析的准确性提供了参考标准。
钟声教授团队开发高通量蛋白互作检测技术
通过深入了解基因组产物形成的相互作用网络，人类基因组注释功能得以飞速发展。随着技术的进步，我们已经实现了DNA-DNA、蛋白质 -DNA、RNA-DNA和RNA-RNA相互作用的全基因组映射图谱。但完成人类蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）的全基因组映射图谱仍然是一项艰巨任务。 目前，大规模PP
Science发文：RNA测序有助于发现罕见基因变异
近日，来自纽约基因组中心、哥伦比亚大学等机构的研究团队在Science发表了RNA测序应用的最新研究成果，文章题为“Genetic regulatory variation in populations informs transcriptome analysis in rare disease
RNA测序技术如何绘制全基因组转录终止？
近日，南方科技大学生命科学学院翟继先团队利用纳米孔单分子RNA测序技术绘制了拟南芥全基因组水平转录终止图谱。该方法能同时捕获包括已转录过polyA位点的 readthrough转录本、完成3’末端切割的5’或3’切割产物、以及已完成或正在进行多腺苷酸化（polyadenylation）的转录本在
北京大学汤富酬等团队发布单细胞测序技术最新研究成果
基于第三代测序（TGS）平台的单细胞RNA-seq技术的进步加速了生物学研究。自2016年以来，已经开发了几种基于TGS平台的单细胞RNA-seq方法。由于受到低准确度和灵敏度的限制，它们要么结合基于NGS平台的方法降低错误率，要么通过牺牲通量来提高检测率。 2023年1月11日，北京大学汤富
新型脑成像技术给神经元贴上“条形码”
美国冷泉港实验室（CSHL）和瑞士巴赛尔大学的神经科学家团队日前在《自然》杂志发表论文称，他们开发出一种创新的脑成像技术，追踪了小鼠大脑外部皮层数百个神经元连接。新技术能以前所未有的速度生成更详细的图片，比现有方法更快捷更有效，且成本直线下降，有利于未来认识神经发育障碍。 人类大脑中有1000
一波新的CRISPR工具浮出水面
当你读到这篇文章时，又一波CRISPR工具将会浮出水面。它们将需要接受测试和优化。不过，如果你询问开发者你在开展概念验证研究时是否应当试用它们时，你将仅获得鼓励。毕竟，迄今为止它们还不能从Addgene公司获得，但是将会很快上市了。 最新发布的一系列CRISPR工具包括新的谱系追踪方法，该方法
基因编辑进展梳理－Part－II－基于CRISPRCas9的技术应用篇(下)
上一期为大家介绍了过去一年里CRISPR技术在动物造模及单碱基技术方面取得的重大突破。本期继续为大家从功能基因组筛选、细胞谱系示踪及疾病诊断方面谈谈CRISPR-Cas系统的技术运用。 一、大规模基因功能的筛选 尽管测序和基因组编辑技术取得了重大进展，但是解析复杂的基因型-表型关系仍
环状－RNA－测序案例分析
案例：以结肠癌，卵巢癌，特发性肺纤维化及正常的人组织为例探讨 circular RNAs 的富集与增殖的相关性 背景：最新研究表明，circular RNAs 大量存在，是构成生物体 RNA 网络的一部分，而且研究者们推测 circular RNAs 与 miRNAs 一样具有生物学功能。 目的
核糖核酸（RNA）测序
RNA在细胞中的稳定性较差，在实验中也更容易受到核酸酶的攻击。因为RNA是由DNA转录产生的，所以信息已经存在于细胞的DNA中。然而，有时也需要对RNA分子进行测序。虽然DNA测序给出了生物体的遗传图谱，但RNA测序却反映了细胞中活跃表达的序列。为了给RNA测序，通常的方法是首先对从样品中提取的
RNA甲基化测序
1、NSUN2影响m5C在HEK293细胞中整体分布情况NSUN2被报道是RNA甲基转移酶，能使tRNAs和mRNA发生m5C甲基化修饰。为了探究NSUN2对HEK293细胞mRNA m5C甲基化修饰的影响。作者利用CRISP/Cas9技术敲减NSUN2（NSUN2-/-HEK293细胞）后进行
最准确的基因表达检测方法——RNA测序遭遇“信任”危机？
当前，RNA测序成为了一种常用工具。 利用RNA测序，研究人员能够定量地检测各种生物体的基因表达，从而更好地了解细胞中正在发生的事情以及特定基因的功能。 RNA测序的准确性 早在2014年，《Nature Biotechnology》上发表了三篇文章。它们属于RNA测序质量控制（SEQC）
Nature子刊：RNA测序鉴定小胶质细胞独特表达基因
马萨诸塞州综合医院(MGH)的研究者采用一种新的测序方法，鉴定了一组被脑免疫细胞——称为小胶质细胞—— 用来感知需要其做出反应的致病组织、毒素或损伤细胞的基因。这些基因的鉴定，能使我们更好地理解小胶质细胞在正常大脑和神经退行性疾病中的作用，为保护诸如阿尔茨海默氏病和帕金森氏综合症引起的损伤带
适合每个实验室的新一代测序系统SOLiD－5500
【摘要】基于三十年的测序经验，并由经过验证的连接型测序的准确性所支持，全新的5500 SOLiD™ 系统为每个实验室提供了一个强大、实惠的新一代测序平台。5500 SOLiD™ 系统为分析一个或多个样品提供了一种非常准确且经济有效的解决方案，让您灵活选择优化周转时间或通量。 也许您正在寻找一项新一
新型单细胞测序方法可有效追踪癌症免疫细胞
澳大利亚加文医学研究所的科学家开发了一种新的单细胞测序方法RAGE-Seq（Repertoire and Gene Expression by Sequencing），该方法兼备高通量、靶向、长读长和单细胞测序特征，能够高准确度和灵敏度的识别全长抗原受体序列，追踪与癌症免疫反应相关的免疫细胞。7
安捷伦靶向序列富集系统支持样本条形码标记及索引
进一步提升测序效率，降低测序成本高达16倍 2010年2月24日，安捷伦科技公司(纽约证交所：A)在基因组生物学技术进展年会 (AGBT)宣布：安捷伦SureSelect 靶向序列富集系统，可以根据用户所选择的不同新一代测序平台，实现每泳道12-16个样本的并行DNA测序，从而降低测序成本
NCBI使用方法之一：Map－viewer查找基因序列，RNA，启动子
下面以人的IL6（白细胞介素6）为例讲述一下具体的操作步骤 一、打开Map viewer页面，网址为 在search的下拉菜单里选择物种，for后面填写你的目的基因。 二、点击“GO”： 三、在步骤二图示的右下角有一个Quick Filter,下面是让你选择的几个复选框，在Gene前面的小方框
NCBI使用方法之一：Map－viewer查找基因序列，RNA，启动子
下面以人的IL6（白细胞介素6）为例讲述一下具体的操作步骤一、打开Map viewer页面，网址为在search的下拉菜单里选择物种，for后面填写你的目的基因。二、点击“GO”：三、在步骤二图示的右下角有一个Quick Filter,下面是让你选择的几个复选框，在Gene前面的小方框里打勾，然后点
原位进样原理
原位测序技术的原理和应用点击次数：664 发布日期：2022-3-23 来源：苏州阿尔法生物实验器材有限公司原位测序 (ISS) 是一种新方法，通过该方法直接在固定组织或细胞样品的切片中对 mRNA 进行测序。原位测序原理关键是测序信息与其位置之间的联系—在一些情况下，是亚细胞位置。这与传统测序不