基因测序:数据处理与标准问题仍待解

【导读】目前我国在数据行业标准方面概念还很模糊,这就导致科研机构、医疗机构、企业在利用基因数据的时候,没有统一的规则,也造成基因测序行业良莠不齐。这种情况,亟须得到改变。 目前我国在数据行业标准方面概念还很模糊,这就导致科研机构、医疗机构、企业在利用基因数据的时候,没有统一的规则,也造成基因测序行业良莠不齐。这种情况,亟须得到改变。 基因测序,一直被视为生命科学和生物技术发展的重大革命。在经历过前些年的积累之后,今年的基因测序行业似乎看到爆发的曙光。 日前,湖南省和贵州省相继发布了关于支持基因测序技术应用的政策。贵州省提出,高龄单独两孩孕产妇出生缺陷基因筛查享受全免费政策。湖南省的政策则似乎更加激进——未来,湖南省将用政府采购的方式开展和推广遗传病基因检测、开展基因检测试点、大力推广个性化医疗、将部分基因检测费用纳入医保等。 但在诸多专家看来,尽管基因测序日益红火,但要想真正爆发,“走入寻常百姓家”,数据量累积带来的......阅读全文

基因测序技术大升级

  DNA就像是漆黑的夜里萤火虫发的光,第二代测序技术无法辨别每一只萤火虫,所以就把上千只萤火虫放在同一个袋子里,才能收集到它们的光。但第三代技术却可以辨别每一只萤火虫,而且可以同时测量很多个DNA片断。 日前,南方科技大学生物系副教授贺建奎与另外几名中美科学家联合在生物医学杂志BioRxiv上

基因测序离你有多近?

  基因测序:反正很重要  为什么要对基因测序?因为要搞清楚我们的身体里究竟发生着什么,以及为什么会这样?  只有搞清楚这些,才能实施更准确有效的治疗,也就是精准医疗。所以基因测序是精准医疗的重要组成一环,而精准医疗是未来医学发展的方向,这一点基本已成为公论,所以才会被美、中等大国先后纳入国家战略。

基因测序探索生命奥秘

  现在,距离人类基因组草图公布已经过去近20年。2001年2月15日, 中、美、日、德、法、英等6国科学家和美国塞莱拉公司联合发表“人类基因组计划”的结果——人类基因组草图及初步分析,这也是有史以来最准确、最完整的脊椎动物基因组序列。  人类基因组草图的绘就,不仅是人类探索生命奥秘的一个重要里程碑

基因测序存在的问题

  虽然基因测序可以作为一种很好的ZL手段,但是ZG科学院北京基因组研究所教授甄二真表示,目前从应用的角度来说,科学家只确定了部分的基因位点与疾病的确切关系,也就是说真正可以用于临床诊断和指导ZL的基因检测并不多。要想真正用基因来诊病,还需要时间。  基因测序就像一把双刃剑,如果运用得不得法,它也有

基因测序市场深度剖析

   Technologies(现为Thermo Fisher收购)公司全国临床与科研事业部销售总监、ThermoFisher公司全国临床市场战略总监柴映爽写了一系列文章,对基因测序领域进行了深入剖析。让我们看看这个领域深入工作的人士,怎么看待2015年基因测序市场大热这一现实的。   ▌第一篇:基

基因测序仪的原理

  abi prism 310型基因分析仪采用毛细管电泳技术取代传统的聚丙烯酰胺平板电泳,应用该公司ZL的四色荧光染料标记的ddntp(标记终止物法),因此通过单引物pcr测序反应,DNA测序仪生成的pcr产物则是相差1个碱基的3''''末端为4种不同荧光染料的单链d

基因测序的技术原理

基因测序技术能锁定个人病变基因,提前预防和治疗。  自上世纪90年代初,学界开始涉足“人类基因组计划”。而传统的测序方式是利用光学测序技术。用不同颜色的荧光标记四种不同的基因,然后用激光光源去捕捉荧光信号从而获得待测基因的序列信息。  虽然这种方法检测可靠,但是价格不菲也是有目共睹的,一台仪器的价格

基因测序的技术原理

基因测序技术能锁定个人病变基因,提前预防和治疗。  自上世纪90年代初,学界开始涉足“人类基因组计划”。而传统的测序方式是利用光学测序技术。用不同颜色的荧光标记四种不同的基因,然后用激光光源去捕捉荧光信号从而获得待测基因的序列信息。  虽然这种方法检测可靠,但是价格不菲也是有目共睹的,一台仪器的价格

基因测序迎接挑战

  无论是农业育种,还是出生缺陷检测,或是其他常见疾病预防,基因检测技术都面临着巨大的挑战。  古语有云:“民以食为天。”这说明食物很重要,基因测序也进入到了这一领域。此前我跟袁隆平合作进行水稻基因组计划时,因为这和国家计划、全球计划有部分冲突,不符合国际水稻基因组计划的主流,也不符合国家战略,差点

基因测序仪发展历史

1. 第一代DNA测序技术 1977年,Sanger等提出了经典的双脱氧核苷酸末端终止测序法。此后,在Sanger法的基础上,20世纪80年代中期出现了以荧光标记代替放射性同位素标记、以荧光信号接收器和计算机信号分析系统代替放射性自显影的自动测序仪。另外,90年代中期出现的毛细管电泳技术使得测序的通

基因测序的功能介绍

基因测序只是基因检测的方法之一,其又叫基因谱测序,是国际上公认的一种基因检测标准。  基因测序广为人知的还有针对唐氏综合征筛查的无创产前基因检测。只需要孕妇5毫升血,通过化验血液中甲型胎儿蛋白(AFP)、人类绒毛膜促性腺激素(β-hCG)的浓度,就可以算出胎儿出现唐氏综合征的危险性。  最近公众关注

基因测序技术的原理

基因测序技术能锁定个人病变基因,提前预防和治疗。自上世纪90年代初,学界开始涉足“人类基因组计划”。而传统的测序方式是利用光学测序技术。用不同颜色的荧光标记四种不同的碱基,然后用激光光源去捕捉荧光信号从而获得待测基因的序列信息。 最新的基因测序仪中,芯片代替了传统激光镜头、荧光染色剂等,芯片就是测序

基因测序市场行业分析

  基因测序市场究竟有多火,我已找不到任何一个词语去形容,据统计,仅中国,从事基因领域的相关企业就有超过600家了。前几天从一则消息上了解到就连从事软件开发的苹果、微软、IBM等国际巨头,居然也开始将业务触及到基因领域。那么,在经济迅猛发展的当代中国,基因测序行业到底谁主沉浮?以下深度好文将能告诉你

【技术】基因测序那些事

  最早的时候,基因测序只能应用于科研之上,是遗传学及分子生物学一个重要的科研工具。随着测序技术的发展,测序价格大大降低及测序仪的能力越来越高,测序技术应该不仅仅局限于科研市场,越来越多的人想要将测序这种分子生物学技术应用到面向大众的普通消费市场,特别是医疗市场和临床市场,一旦测序技术在这些市场进行

华大基因:挖掘基因测序的“超级金矿”

  日前公布的2012年度深圳市科学技术奖拟奖名单上,奖金高达100万元的“市长奖”拟颁给一个37岁的年轻人;去年底,英国《自然》杂志评选出2012年科学界年度十大人物,他又是唯一入选的中国人。这个年轻人,就是华大基因研究院院长王俊。   他所在的深圳华大基因,没有享受到任何财政拨款,却坐上了《自

靶向深度测序和单细胞基因测序的区别

1、目标序列靶向测序是一种对感兴趣的基因组区域进行富集测序的研究策略。目标区域测序的主要优势在于可针对特定区域进行测序,有效降低了测序成本,提高了测序深度,能够更为经济有效地研究特定区域的遗传变异。2 单细胞测序是指单个细胞水平上对基因组进行测序。3、靶向测序步骤为 样品准备、探针/引物设计、目标序

关于全基因组测序的测序指标介绍

  一、全基因组测序的测序指标— 深度  测序深度(Sequencing depth)是指测序得到的碱基总量(bp)与基因组大小的比值,它是评价测序量的指标之一。测序深度与基因组覆盖度之间是一个正相关的关系,测序带来的错误率或假阳性结果会随着测序深度的提升而下降。测序的个体,如果采用的是双末端或Ma

靶向深度测序和单细胞基因测序的区别

1、目标序列靶向测序是一种对感兴趣的基因组区域进行富集测序的研究策略。目标区域测序的主要优势在于可针对特定区域进行测序,有效降低了测序成本,提高了测序深度,能够更为经济有效地研究特定区域的遗传变异。2 单细胞测序是指单个细胞水平上对基因组进行测序。3、靶向测序步骤为 样品准备、探针/引物设计、目标序

基因芯片的测序原理是杂交测序方法

 基因芯片的测序原理是杂交测序方法        随着人类基因组(测序)计划( Human genome project )的逐步实施以及分子生物学相关学科的迅猛发展,越来越多的动植物、微生物基因组序列得以测定,基因序列数据正在以前所未有的速度迅速增长。然而 , 怎样去研究如此众多基因在生命过程中所

广东或将出台首个基因检测行业标准

  11日,广东省精准医学应用学会精准检测分会在广州成立,在当天举行首届精准检测国际论坛上,与会专家指出,目前,市场上的大多基因检测技术仍不完善,有家族病史的患者要遵医嘱在正规机构检测,近年来,随着基因检测技术的发展,各种基因检测项目层出不穷,测性格、测智商等吸引了不少的消费者。基因检测是否靠谱?标

快速基因测序救命于襁褓

  不明病因婴儿将从中受益,但伦理问题引发担忧   在只有两个月大时,这个男孩就已命悬一线。他整个暂短的人生是在美国密苏里州堪萨斯城儿童慈善医院新生儿重症监护室里度过的,内科医生们绞尽脑汁地寻找导致其异常状况的病因所在。2013年4月,这名男婴的肝脏开始衰竭,医护人员告诉他的父母前景不容乐观。  随

埃博拉基因测序难为“无米之炊”

   随着埃博拉病毒横扫西非,科学家缺乏重要基因数据来解答引发众多担忧的猜测:这种病毒会变得更具传染性和更致命吗?它会发生变化,让其逃避诊断测试或疫苗吗?非洲和欧洲实验室的冰箱里存放着取自埃博拉患者的数千份血液样本,但它们并未被使用,且少数几个获得新基因数据的研究小组并未公开信息。  研究人员渴望近

基因测序的应用领域

国伦敦大学学院和美国罗格斯大学的联合研究团队,将基因测序技术和超级计算机技术相结合,试图探索解决这一命题。研究人员把艾滋病(HIV)蛋白酶分子作为对象,酶在不同人体中形状略有不同,尤其是在蛋白质活动区,在那里酶完成切片并构成了下一个病毒,进而形成特定的病毒基因序列。如果知道了酶的形状,就可以找到相应

基因测序:亟待加入中国元素

近几年,随着基因概念股在股市上的热浪,国际癌症基因组计划完成的消息,启动又停止、停止又启动的高通量测序的唐氏筛查工作等等。每天不断更新的消息使得基因测序这个产业和概念成为了一个非常热门的话题。 在“创新中国智库专题讲座”上,中国科学院北京基因所技术研发中心常务副主任任鲁风作了《基因测序技术

中国基因测序仪往事

  9月9日,来自深圳的消息,国产基因测序仪DNBSEQ-T7(原命名MGISEQ-T7)正式交付商用。从去年10月发布以来,诸多业内人士和媒体将T7誉为中国基因产业突破上游技术壁垒,实现跨越发展的现实注脚。  从关山难越,到部分引领,中国基因测序仪的研制开发攀越关山、跋涉荆棘,经历了起伏跌宕的20

基因测序未来研究方向

研究人员对基因测序数据的需求越来越大。Eric Green、Edward Rubin和Maynard Olson三位科学家对未来40年基因测序技术的应用进行了展望。四十年前,也就是1997年前,两篇论文首次报道了确定DNA片段中化学碱基顺序的简易方法。在此之前,分子生物学家们只能检测DNA片段,而不

基因芯片的测序原理

基因芯片的测序原理是杂交测序方法,即通过与一组已知序列的核酸探针杂交进行核酸序列测定的方法,在一块基片表面固定了序列已知的靶核苷酸的探针。当溶液中带有荧光标记的核酸序列TATGCAATCTAG,与基因芯片上对应位置的核酸探针产生互补匹配时,通过确定荧光强度最强的探针位置,获得一组序列完全互补的探针序

基因测序中国发展状况

  第三代人类基因测序关键技术取得重要进展  在人体的基因中,有30亿个碱基对,每个人的不同,就是由碱基对排列差异造成的。要想测出它的全部序列,现在的技术最少需要两三个星期、500万美元。由东南大学担纲的第三代人类基因测序关键技术研究取得重要进展。  人类基因组计划在2003年完成人体全序列的基因测

全基因测序法分析STEC

产志贺毒素大肠杆菌(STEC)是引起人类疾病的重要食源性致病菌之一,该分离菌能引起溶血性尿毒综合症(HUS),导致人体肾衰竭。2011年7月,由STEC引发的疫情曾在德国北部造成了至少22人死亡。事件爆发后,科研人员借助于快速全基因组测序方法分析疫情,并开发出一种实时荧光定量PCR检测试剂,精

基因测序的步骤是什么

PCR产物直接测序技术现已成为分子生物学和基因组学研究中的一个重要技术,广泛用于基因突变检测、遗传性疾病诊断、单核苷酸多态性研究、基因组重叠序列群等.与传统克隆测序技术相比较,直接对PCR扩增的DNA进行测序,省去了耗时的克隆步骤,避免了传统的细菌培养,模板提取等重复性操作,可以从少量的原始样品中得