全基因测序法分析STEC

产志贺毒素大肠杆菌(STEC)是引起人类疾病的重要食源性致病菌之一,该分离菌能引起溶血性尿毒综合症(HUS),导致人体肾衰竭。2011年7月,由STEC引发的疫情曾在德国北部造成了至少22人死亡。事件爆发后,科研人员借助于快速全基因组测序方法分析疫情,并开发出一种实时荧光定量PCR检测试剂,精准地检测食品中的毒性菌株。 德国STEC疫情发生后,全球多个研究团队都在借助快速全基因组测序来分析疫情的爆发,诠释其序列信息,并开发能够从食物样本中检测到此菌株的特异性试剂。Life Technologies公司协助开发了一种解决方案,包括阐明最初序列信息到开发分离菌特异性检测试剂的完整工作流程。在与多位临床医生和多家公共卫生中心的合作过程中,科研人员提供了互补性技术,并应用生物信息学知识加速了检测试剂的开发。 初步序列鉴定 德国国立溶血性尿毒综合症咨询实验室的科研人员应用经典的血清学分型方法和基于Sanger测序......阅读全文

多重PCR法检测STEC

产志贺毒素大肠杆菌(STEC)具有很强的致病性,全球范围内由其引发的食物中毒和其他公共卫生事件呈逐年升高之势,严重威胁人类的健康。开发快速可靠的检测手段对其引发的食源性疾病的监测、控制和预防意义重大。本文结合对STEC分子生物学特征的研究,着重介绍了多重PCR检测技术在检测食品中STEC方面的

全基因测序法分析STEC

产志贺毒素大肠杆菌(STEC)是引起人类疾病的重要食源性致病菌之一,该分离菌能引起溶血性尿毒综合症(HUS),导致人体肾衰竭。2011年7月,由STEC引发的疫情曾在德国北部造成了至少22人死亡。事件爆发后,科研人员借助于快速全基因组测序方法分析疫情,并开发出一种实时荧光定量PCR检测试剂,精

食品安全风险解析:解读产志贺毒素大肠杆菌O26

  近日,媒体报道美国墨西哥风味连锁餐厅Chipotle食物中毒引发的产志贺毒素大肠杆菌O26疫情在美国蔓延,导致20人住院。美国疾病预防和控制中心宣称近两年来由产志贺毒素大肠杆菌O26引发的食物中毒事件明显增多,在未来可能引发更多的疫情,尤其是引发溶血性尿毒综合症的病例数量可能会远超过产志贺毒素大

食品安全标准中致泻大肠埃希氏菌解读

  致泻大肠埃希氏菌概况   大肠埃希氏菌,是人类和温血动物肠道内的正常栖居菌。1971年美国爆发因进口奶酪被污染大肠埃希氏菌导致的肠胃炎,从而被确定为食源性致病微生物。大多数大肠埃希氏菌对人体无害,但也有部分能使人类致病,引起腹泻,因此将这些大肠埃希氏菌命名为致泻大肠埃希氏菌。目前世界公认的

意大利从乌拉圭牛肉检出产志贺毒素大肠杆菌

  据欧盟食品饲料类快速预警系统(RASFF)消息,10月30日意大利通过RASFF通报乌拉圭牛肉检出产志贺毒素大肠杆菌(STEC)。   具体通报内容如下:通报时间通报国通报产品编号通报原因销售状态/采取措施通报类型2017-10-30意大利冷冻牛肉2017.BXY产志贺毒素大肠杆菌产品未在市场销

应用基因组学的诊断方法-识别严重传染病爆发中的微生物

  芝加哥 – 据4月10日发表在《美国医学会杂志》上的一则研究披露;在一项用宏基因组学(对从复杂的微生物样品中提取的DNA进行直接测序)对2011年德国产志贺毒素型大肠杆菌爆发所做的分析中,研究人员成功地对一个疾病爆发菌株的基因组序列进行了重建;这些结果表明用这种方法具有比基于细菌培养的方法更快识

非典型溶血性尿毒症综合征的简介

  非典型溶血性尿毒症综合征(atypical haemolytic uraemic syndrome,aHUS)是一种以微血管病性溶血性贫血、急性肾损伤和血小板减少三联征为主要临床特点的综合征。与产志贺毒素大肠埃希杆菌 (Shiga toxin-producing Escherichia coli

诊断非典型溶血性尿毒症综合征的简介

  1.患者出现微血管病性溶血性贫血、血小板减少症及急性肾损伤等经典三联征是诊断HUS的临床依据。如无STEC感染证据,考虑为aHUS。  2.肾活检发现肾脏微血管病变、栓塞等可明确诊断。  3.血浆补体测定发现补体C3降低,H因子或I因子水平降低、H因子抗体阳性支持aHUS诊断。基因检测发现旁路途

非典型溶血性尿毒症综合征的鉴别诊断介绍

  1.典型溶血性尿毒症综合征  典型溶血性尿毒症综合征主要累及5岁以下儿童,罕见于6个月内婴儿,90%的患者在发病前5~10天出现发热、腹痛、腹泻、呕吐及食欲不振等表现。可发现STEC感染证据,预后多较aHUS良好。  2.血栓性血小板减少性紫癜  血栓性血小板减少性紫癜常有中枢神经系统症状,如癫

阿根廷出口牛肉检出产志贺毒素大肠杆菌

  据欧盟食品饲料类快速预警系统(RASFF)消息,近日,阿根廷出口一批次冷冻牛肉检出产志贺毒素大肠杆菌。  RASFF具体通报内容如下:通报时间通报国通报产品编号通报原因销售状态/采取措施通报类型2017-12-11荷兰冷冻牛肉2017.CGK检出大肠杆菌志贺毒素stx2+产品未在市场销售,未批准

荷兰通报巴西牛肉检出产志贺毒素大肠杆菌

  据欧盟食品和饲料类快速预警系统(RASFF)消息,8月28日荷兰通过RASFF通报巴西牛肉不合格。不合格原因为检出产志贺毒素大肠杆菌(Shiga toxin-producing Escherichia coli,简称STEC)。   具体通报内容如下:   按照欧盟规定,肉制品不得检出产志贺毒素

宏基因组学:查明微生物身份新手段

  背景   《美国医学会杂志》(JAMA)近期刊发了一篇题为《利用不需培养的宏基因组学测序技术研究产志贺毒素大肠杆菌O104∶H4暴发株》的研究论文,引起了学界和社会的广泛关注。这篇论文中应用了一种称为“宏基因组学”的技术方法,不通过培养,直接从病人样品中检测分析其携带的病原微生物,甚至可以

FDA批准可检测11种胃肠炎病原体新方法

美国食品与药物管理局(FDA)宣布,一种可识别11种导致感染性胃肠炎的不同病原体的检测方法通过了FDA的批准。该检测名称为xTAG胃肠病原体检测板,由美国德克萨斯州奥斯丁市路Luminex公司销售,可检测如下细菌、病毒和寄生虫:弯曲杆菌艰难梭菌毒素A/B大肠埃希菌(E. coli)O157产肠毒素大

概述感染性腹泻的临床表现

  腹泻通常定义为每天(24h)排未成形大便≥3次,或每天排出未成形粪便的总量超过250克。粪便的性状可为稀便、水样便、黏液便、脓血便或血样便。同时可伴有腹痛、恶心、呕吐、腹胀、食欲不振、发热及全身不适等。病情严重者,可以因大量丢失水、电解质而引起脱水、电解质紊乱甚至休克。根据发病机制分为分泌性腹泻

替代PCR,RPA成为致病菌检测的得力工具

  重组酶聚合酶扩增(Recombinase Polymerase Amplification,RPA),被称为是可以替代PCR的核酸检测技术(由英国公司TwistDx Inc开发)。以此为基础的TwistAmp® 核酸扩增产品,能够在15分钟内进行常温下的单分子核酸检测。该技术对硬件设备的要求很低

溶血尿毒症综合征的病因

  遗传因素(20%):  HUS通过常染色体隐性或常染色体显性遗传方式遗传,常染色体隐性遗传在同一家族的兄弟姐妹间发病间期可达1年以上,儿童受累机会高于新生儿及成人,预后较差,死亡率接近65%,大多数常染色体显性遗传HUS患者为成人发病,可反复发作,预后较差。  感染(20%):  (1)细菌:分

溶血尿毒症综合征的病因分析

  HUS病因至今不明,细菌、病毒和立克体感染后均可发生。目前已知多种因素与HUS的发生有关  1.遗传因素  HUS通过常染色体隐性或常染色体显性遗传方式遗传,常染色体隐性遗传在同一家族的兄弟姐妹间发病间期可达1年以上,儿童受累机会高于新生儿及成人,预后较差,死亡率接近65%。大多数常染色体显性遗

重要新闻!复旦大学张颖/张文宏的文章被撤回

乙型肝炎病毒 X 蛋白 (HBx) 已被证实通过多种途径参与 HBV 相关肝细胞癌 (HCC) 的发展。癌蛋白星形胶质细胞升高基因 1 (AEG-1) 在包括 HCC 在内的各种肿瘤中过度表达,并在促进细胞迁移和侵袭中发挥关键作用。然而,肿瘤中 AEG-1 上调的机制在很大程度上是未知的。2014年

关于溶血尿毒症综合征的病因分析

  HUS病因至今不明,细菌病毒和立克体感染后均可发生。目前已知多种因素与HUS的发生有关(表1)  1.遗传因素HUS通过常染色体隐性或常染色体显性遗传方式遗传,常染色体隐性遗传在同一家族的兄弟姐妹间发病间期可达1年以上,儿童受累机会高于新生儿及成人预后较差死亡率接近65%。大多数常染色体显性遗传

五种致泻性大肠埃希氏菌鉴定试剂盒(PCR法)使用说明

产品说明病菌检测系列可针对食品、饲料等样品中的致病微生物的特异核酸片段进行扩增,仪器实时监测扩增过程中的荧光信号变化,自动判读结果。本产品用于致泻大肠埃希氏菌的检测。检出限为103 CFU/ml。 产品组成(96测试)试剂含量作用孔1反应液-uidA23μl/孔12孔/排8排(本产品使用12联PCR

致泻大肠埃希氏菌鉴定剂盒(pcr法)使用说明

  致病微生物系列   致泻大肠埃希氏菌鉴定剂盒(PCR法)   产品说明   致泻大肠埃希氏菌鉴定剂盒参照《GB4789.6—2016 食品安全国家标准 食品微生物学检验 致泻大肠埃希氏菌检验》进行设计,可针对食品样品中的致泻大肠埃希氏菌特异核酸片段进行扩增,通过电泳判断样品的鉴定结果。该

致泻大肠埃希氏菌鉴定剂盒(pcr法)使用说明

致病微生物系列致泻大肠埃希氏菌鉴定剂盒(PCR法)产品说明致泻大肠埃希氏菌鉴定剂盒参照《GB4789.6—2016 食品安全国家标准 食品微生物学检验 致泻大肠埃希氏菌检验》进行设计,可针对食品样品中的致泻大肠埃希氏菌特异核酸片段进行扩增,通过电泳判断样品的鉴定结果。该产品检出限为10^3 cfu/

溶血尿毒症综合征的发病机制

  1.血管内皮损伤致肾内微血管性溶血及血管内凝血血管内皮损伤是所有HUS发病机制的中心环节,也是始动环节,内皮细胞损伤可通过炎症和非炎症两条途径,STEC来源的脂多糖(LPS)可激活白细胞,激活中性粒细胞释放TNFα,IL-1,内弹力酶及氧自由基,刺激细胞因子TNFα,IL-1的合成,LPS和细胞

溶血尿毒症综合征的发病机制介绍

  1.血管内皮损伤致肾内微血管性溶血及血管内凝血  血管内皮损伤是所有HUS发病机制的中心环节,也是始动环节。内皮细胞损伤可通过炎症和非炎症两条途径,STEC来源的脂多糖(LPS)可激活白细胞,激活中性粒细胞释放TNFα、IL-1、内弹力酶及氧自由基,刺激细胞因子TNFα、IL-1的合成,LPS和

核酸检测革命:可替代PCR的犀利技术——RPA

自PCR技术诞生以来已经有三十年了,从经典PCR、实时定量PCR再到现在的数字PCR,这一技术在不断蜕变却从未淡出我们的视野。很多人的实验根本离不开PCR。笔者曾经也接触PCR很长一段时间,加样、设置程序、等待、检测。这些过程看起来容易,但实验结果却总是会出人意料,很多时候根本不知道是哪里出了错。那

核酸检测革命:可替代PCR的犀利技术——RPA

导读重组酶聚合酶扩增(Recombinase Polymerase Amplification,RPA),被称为是可以替代PCR的核酸检测技术。本专题为大家详细介绍RPA的原理、引物设计、疑难解答以及在致病菌检测、病毒检测以及癌症研究中的灵活应用。自PCR技术诞生以来已经有三十年了,从经典PCR、实