上海应物所等在DNA计算方面取得进展
近日,中国科学院上海应用物理研究所物理生物学研究室与丹麦奥胡斯大学合作,在基于DNA纳米结构的数学运算方面取得了新进展,建立了基于组合学原理的DNA计算器原型。相关结果发表在《自然·通讯》杂志上(Nature Communications, 2015, 6, 10089),该杂志同时发布了报道(Press release)。 DNA分子具有强大的序列可编程性及精确的分子识别能力,被认为是发展下一代生物计算机的理想材料。1994年,图灵奖获得者Leonard Adleman教授首次提出了DNA计算的思想,展示了DNA分子强大的平行计算能力。然而,现有的原型DNA计算机往往存在输入输出不一致、信号串扰、运算效率低等问题,并且缺乏直观的输出模式,其运算过程与结果往往难以解读,限制了DNA计算领域的发展。 上海应物所柳华杰、樊春海等研究人员与Kurt Gothelf教授合作,提出了基于组合学原理建立类似“查找表”的全新DNA计算......阅读全文
DNA计算机模型检测神秘面纱揭开
DNA计算机的研制是各国竞争的一个科技制高点。17日,记者从郑州大学信息工程学院获悉,该校朱维军副教授、周清雷教授开发出一系列算法,初步解决“DNA模型检测”这一困扰国际DNA计算机学界多年的核心技术难题。 与其他计算工具相比,计算机的本质优点在于通用性,而通用性归根结底在于千变万化的具体
错流超滤的计算模型
错流超滤的计算模型错流超滤的自由空间内流体对膜表面有剪切力的作用,其渗透率在管道长度方向是变化的。针对错流超滤的特点,在膜的上层部分引入了流体自由流动空间,用方程来描述。在自由空间和膜的界面处,用流体的连续性将自由空间和膜介质的流场进行了耦合。膜的污染描述,基于死端超滤建立起来的污染模型。在错流超滤
计算/DNA测序仪
测序反应精确度计算公式:100%-差异碱基数(不包括n数)/650×100%差异碱基即测定的dna序列与已知标准dna序列比较不同的碱基,n为仪器不能辨读的碱基。
DNA测序仪的计算
测序反应精确度计算公式:100%-差异碱基数(不包括n数)/650×100% 差异碱基即测定的dna序列与已知标准dna序列比较不同的碱基,n为仪器不能辨读的碱基。
DNA复制的计算规律
DNA复制的计算规律:每次复制的子代DNA中各有一条链是其上一代DNA分子中的,即有一半被保留。一个DNA分子复制n次则形成2n个DNA,但含有最初母链的DNA分子有2个,可形成2Ⅹ2n条脱氧核苷酸链,含有最初脱氧核苷酸链的有2条。子代DNA和亲代DNA相同,假设x为所求脱氧核苷酸在母链的数量,形成
关于DNA双螺旋的模型介绍
DNA分子双螺旋结构积塑模型是一种采用优质彩色塑料原料制造的生物遗传物质脱氧核糖核酸(DNA)分子的装配式结构模型。本模型利用具有特殊形状结构的红、黄、蓝、绿四种色球(分别代表A、T、G、C四种核苷)和棕棒(代表磷酸P)五种零件,不仅可装配成具有双螺旋空间结构的DNA分子链,而且还可以直观地表达
大模型加速改变云计算行业规则
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498365.shtm
静态摩擦性能计算模型领域取得突破
近日,中国科学院兰州化学物理研究所润滑材料全国重点实验室的计算摩擦学课题组在静态摩擦性能计算模型方面取得了重要进展。这项研究不仅加深了我们对摩擦现象的理解,还为未来摩擦学的发展奠定了坚实的基础。相关论文发表于Physical Review B。 摩擦,这个在我们日常生活中无处不在的现象,其实蕴
计算机模型解开塑料的“基因密码”
人们的生活离不开塑料。但迄今为止,工业上还是先开发出一种塑料,然后才去发现它的用途,或试验几百种不同的“配置”看看哪种管用,既费时又费钱。据美国物理学家组织网9月30日(北京时间)报道,最近,英国利兹大学和杜伦大学解决了这一难题,他们开发出一种计算机模型,能在化学水平预测各种高分子成型时的形状,
Nature:计算机模型预测学术成功
电脑模型预测论文数量、任职机构及性别关乎学术成就 在发表同等数量文章的情况下,和男性生物学家相比,女性生物学家成为学术带头人的可能性更低。 最近,研究者用电脑模型证明:对事业起步期的科学家来说,“不发表就发臭”是一条黄金准则。根据计算公式,对于年轻科学家来说,以第一作者身份在知名期刊上发表的论文
计算机模型高估全球安全捕鱼量
近些年来,针对过度捕捞问题,科学家和资源管理者绞尽了脑汁,通过估算鱼类种群数量,制定各种政策措施,以在商业利益与生态健康和可持续性之间取得平衡。近日,一项发表于《科学》的研究对全球230个海洋渔场1980年至2018年的实际捕鱼数据及计算机模型预测值进行分析后发现,计算机模型往往高估了鱼类种群规模,
国家超级计算天津中心发布“天河天元”大模型
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/501029.shtm5月20日,在第七届世界智能大会上,国家超级计算天津中心正式发布“天河E级智能计算开放创新平台”和“天河天元大模型”。近期,ChatGPT的爆火引发了信息技术领域的“大模型热”,国内多
玻璃固化配方设计及性能计算模型初步建成
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495080.shtm 滚烫的玻璃熔融体从熔炉中缓缓浇注进容器 冷却凝固后的玻璃体整齐地放入库房…… 莫非我们正身处某个玻璃生产厂之中吗? 这些玻璃怎么不像平时见到的那样晶莹透亮呢?
交大Nature发文,DNA计算领域取得进展
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/508432.shtm上海交通大学化学化工学院/变革性分子前沿科学中心樊春海院士与王飞副教授近期发展了一种支持通用性数字计算的DNA可编程门阵列(DNA-based programmable gate ar
人工智能新模型可解码DNA隐藏“语言”
DNA包含了维持生命所需的基础信息。理解这些信息是如何存储和组织的,一直是20世纪最大的科学挑战之一。现在,借助GROVER这一基于人类DNA训练的新型大型语言模型,研究人员有望解码基因组中隐藏的复杂信息。GROVER由德国德累斯顿工业大学生物技术中心开发,它将人类DNA视为文本,通过学习其规则和上
人工智能新模型可解码DNA隐藏“语言”
科技日报北京8月6日电 (记者张佳欣)DNA包含了维持生命所需的基础信息。理解这些信息是如何存储和组织的,一直是20世纪最大的科学挑战之一。现在,借助GROVER这一基于人类DNA训练的新型大型语言模型,研究人员有望解码基因组中隐藏的复杂信息。GROVER由德国德累斯顿工业大学生物技术中心开发,它将
人工智能新模型可解码DNA隐藏“语言”
DNA包含了维持生命所需的基础信息。理解这些信息是如何存储和组织的,一直是20世纪最大的科学挑战之一。现在,借助GROVER这一基于人类DNA训练的新型大型语言模型,研究人员有望解码基因组中隐藏的复杂信息。GROVER由德国德累斯顿工业大学生物技术中心开发,它将人类DNA视为文本,通过学习其规则和上
人工智能新模型可解码DNA隐藏“语言”
DNA包含了维持生命所需的基础信息。理解这些信息是如何存储和组织的,一直是20世纪最大的科学挑战之一。现在,借助GROVER这一基于人类DNA训练的新型大型语言模型,研究人员有望解码基因组中隐藏的复杂信息。GROVER由德国德累斯顿工业大学生物技术中心开发,它将人类DNA视为文本,通过学习其规则
人工智能新模型可解码DNA隐藏“语言”
DNA包含了维持生命所需的基础信息。理解这些信息是如何存储和组织的,一直是20世纪最大的科学挑战之一。现在,借助GROVER这一基于人类DNA训练的新型大型语言模型,研究人员有望解码基因组中隐藏的复杂信息。GROVER由德国德累斯顿工业大学生物技术中心开发,它将人类DNA视为文本,通过学习其规则和上
研究提出锂循环可计算一般均衡模型
在全球碳中和目标驱动下,锂离子电池作为能源转型核心技术,其全球化产业链隐藏着碳排放难题。供应链的地理分散导致碳排放分布不均,碳足迹核算与管控复杂,给全球协同减碳带来严峻挑战。 近日,中国科学院广州能源研究所团队联合北京工业大学等单位,率先构建“锂电池全生命周期可计算一般均衡(LCCGE)”模型
港中大研发精准计算模型预测病毒基因演变
香港中文大学(港中大)2日公布,港中大医学院研究团队建立了一套精准计算模型“beth-1”,能准确预测病毒基因演变,有助在设计流感疫苗时选择最具代表性的病毒株。港中大医学院表示,流感病毒会持续出现基因进化演变,导致免疫逃脱,令已经感染过病毒或打过疫苗的人可能再次感染突变后的病毒,造成新的季节性流感高
神经元新计算模型或产生更强大AI
模型或产生更强大AI 数字手与人手相互绘制图画(艺术图)。图片来源:西蒙斯基金会科技日报北京6月30日电 (记者张梦然)几乎所有支持现代人工智能(AI)工具的神经网络都是基于20世纪60年代的活体神经元计算模型。但美国西蒙斯基金会熨斗研究所计算神经科学中心(CCN)开发的新模型表明,这种已有数十年历
使用分光光度法检测DNA纯度和计算DNA含量
DNA在260nm处吸收强烈,OD260值为1的溶液相当于大约50μg/mL双链DNA,而蛋白质的特征吸收在280nm处,测定DNA提取物中260nm处和280nm处的吸收值OD260和OD280,可大致判断所提取的DNA的纯度。OD260/OD280的值在1.7~1.9之间,说明提纯度较好,低于1
全国首个DNA存储领域预训练大模型“ChatDNA”发布
近年来,DNA 和人工智能一直都是科技发展的热门议题。随着科学技术的进步,它们之间便有了无限的可能性。例如,DNA 和人工智能可以帮助我们更快地研究特定基因组的变异和功能。科学家可以使用人工智能算法来分析大量的 DNA 序列,从而发现有价值的变异和基因功能,为疾病的治疗提供线索。DNA 是生物世界中
美国新计算模型可捕捉化学反应过渡态
美国麻省理工学院科研团队开发出一种基于机器学习的方法,可以更快的计算化学反应过程中的过渡态,帮助化学家设计新的化学反应和催化剂。 新计算方法使用“扩散模型”来表示两种相对于彼此任意方向的反应物,该模型可以了解哪种类型的过程最有可能产生特定的结果。科研人员在大约1,000个以前从未见过的反应上测
3D计算机模型揭开舌头的奥秘
新3D模型展示出舌头上复杂交织的肌肉。 无论何时说话或者吞咽,我们都会用到舌头。然而,关于舌头如何活动的很多问题仍然是个谜。现在,研究人员创造了一个人类舌头的3D计算机模型,并可以通过它来揭开舌头的秘密。 这个模型的创建是基于“人体可视化计划”的数据,该计划于20世纪90年代用大块明胶对
科学家建立中国人群“免疫年龄”计算模型
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/504754.shtm
交大Nature发文,在DNA计算领域取得重要进展
上海交通大学化学化工学院/变革性分子前沿科学中心樊春海院士与王飞副教授近期发展了一种支持通用性数字计算的DNA可编程门阵列(DNA-based programmable gate array, DPGA),可通过分子指令编程的方式实现通用数字DNA计算,实现了无衰减大规模液相分子电路的构建。该成
计算机模型可揭示整联蛋白的运行机制
据物理学家组织网3月21日报道,最近,美国加利福尼亚大学(UC)伯克利分校和劳伦斯·伯克利国家实验室科学家开发出一种整联蛋白的计算机模型,只有约20纳米长,能模仿真实的整联蛋白在细胞中的活动,且对能量和其他变化产生的反应。这一成果为人们探索整联蛋白如何把细胞内外环境联系在一起开辟了新途径。相关论
上海药物所发展出基于知识图谱的计算模型
9月19日,中国科学院上海药物研究所郑明月课题组在《细胞-基因组学》(Cell Genomics)上,发表了题为Identifying compound-protein interactions with knowledge graph embedding of perturbation trans