新颖DielsAlder[4+2]环加成酶PyrI4的催化机制
Diels-Alder（D-A）反应是一类能够直接形成C-C键的重要有机反应，可以高效地实现对杂环、手性螺环和桥环等复杂结构的构筑，被广泛地应用于合成化学领域；近年来一些特殊的D-A反应还被开发为“点击化学”（click chemistry）和“生物正交化学”（bioorthogonal chemistry），并应用于材料科学和生命科学的研究中。通过对天然产物生源合成途径的分析，诸多天然产物的骨架构筑过程中可能涉及到D-A反应，因此D-A反应也经常被巧妙地应用于天然产物的仿生合成研究中。一方面，随着分子前线轨道理论的发展，合成化学家开发了一系列能够促进D-A反应的小分子催化剂；另一方面，基于著名化学家鲍林的酶催化理论（生物大分子在催化过程中可以通过主-客体相互作用稳定底物小分子的反应过渡态），人工筛选、制备的能够识别底物反应过渡态的抗体酶或核酶也能够在一定程度上催化分子间的D-A反应。然而，由于缺乏直接的结构生物学和生物化学......阅读全文
新颖DielsAlder[4+2]环加成酶PyrI4的催化机制
Diels-Alder（D-A）反应是一类能够直接形成C-C键的重要有机反应，可以高效地实现对杂环、手性螺环和桥环等复杂结构的构筑，被广泛地应用于合成化学领域；近年来一些特殊的D-A反应还被开发为“点击化学”（click chemistry）和“生物正交化学”（bioorthogonal che
上海有机所：新颖DielsAlder[4+2]环加成酶PyrI4的催化机制
Diels-Alder（D-A）反应是一类能够直接形成C-C键的重要有机反应，可以高效地实现对杂环、手性螺环和桥环等复杂结构的构筑，被广泛地应用于合成化学领域；近年来一些特殊的D-A反应还被开发为“点击化学”（click chemistry）和“生物正交化学”（bioorthogonal che
研究在周环酶催化机制取得进展
中国科学院上海有机化学研究所生命有机化学国家重点实验室周佳海课题组和美国加州大学洛杉矶分校（UCLA）唐奕课题组合作，解析了高分辨率的LepI及其与底物类似物或产物4、5、6的复合物晶体结构，并通过与UCLA的Kendall Houk课题组合作开展理论计算工作，系统地阐释了LepI催化的分子机制
研究阐述新颖黄素依赖DielsAlder[4+2]环加成酶结构和催化
Diels-Alder（D-A）反应是人们所最为熟知的有机人名反应之一，并被广泛地应用于合成化学、药物化学、材料化学和化学生物学的研究中。人们基于路易斯酸活化以及氢键活化策略设计了不同的小分子催化剂以催化D-A反应，同时还通过分子定向进化的方法筛选得到了能够催化D-A反应的RNA酶和DNA酶。但
酶的催化机制
1、酶与底物的结合：酶促化学反应中的反应物称为底物，一个酶分子在一分钟内能引起数百万个底物分子转化为产物，酶在反应过程中并不消耗。但是酶实际上是参与反应的，只是在一个反应完成后，酶分子本身立即恢复原状，又能进行下一次反应。许多实验证明，酶和底物在反应过程中形成络合物。2、酶的作用机制：对于酶的催化作
我所发表催化分子间环加成反应综述文章
近日，我所仿生催化合成创新特区研究组（02T4组）陈庆安研究员和万伯顺研究员团队发表了题为“Reactivity of ynamides in catalytic intermolecular annulations”的综述文章，系统介绍了催化分子间环加成反应的研究现状与发展前景。 分子间环加
酶催化机制的定义
中文名称酶催化机制英文名称enzyme catalytic mechanism定 义阐述酶如何与底物相结合，酶催化底物的反应进程，影响酶催化效率的主要因素等一系列问题。主要分为酸碱催化、共价催化、多元催化、金属离子催化、微观可逆原理五种机制。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），酶（二级学科）
研究发现催化竞争性2+2及4+2环加成反应的天然酶
中国科学院上海有机化学研究所研究员刘文、潘李锋，与美国加州大学洛杉矶分校化学系Ken. N. Houk实验室合作，在Nature Chemistry上，发表了题为A cyclase that catalyses competing 2+2 and 4+2cycloadditions的研究论文。该
上海有机所在周环酶催化机制研究中取得新进展
中国科学院上海有机化学研究所生命有机化学国家重点实验室的周佳海课题组和UCLA的唐奕课题组合作，解析了高分辨率的LepI及其与底物类似物或产物4、5、6的复合物晶体结构，并通过与UCLA的Kendall Houk课题组合作开展理论计算工作，系统地阐释了LepI催化的分子机制。该工作于2019年7
磷酸酶的催化机制
半胱氨酸依赖的磷酸酶通过形成磷酸－半胱氨酸中间体来催化磷酸酯键的断裂，具体过程如下（以磷酸化的酪氨酸去磷酸化过程为例，参见右图）[1]首先，酶活性位点上的自由的半胱氨酸亲核基团进攻磷酸基团中的磷原子并成键；然后，连接磷酸基团与酪氨酸的P-O键接受位置合适的酸性氨基酸（如天冬氨酸）或水分子所提供的质子
简述脂肪酶催化机制
脂肪酶具有油-水界面的亲和力，能在油-水界面上高速率的催化水解不溶于水的脂类物质；脂肪酶作用在体系的亲水-疏水界面层，这也是区别于酯酶的一个特征。 来源不同的脂肪酶，在氨基酸序列上可能存在较大差异，但其三级结构却非常相似。脂肪酶的活性部位残基由丝氨酸、天冬氨酸、组氨酸组成，属于丝氨酸蛋白酶类。
酶的结构和催化机制
1、酶的组成与结构：酶的化学本质是蛋白质，蛋白质分子是由氨基酸组成。酶的结构分为四级：一级结构：氨基酸残基严格地按一定顺序线性排列称为蛋白质一级结构，一个蛋白质分子可能由一条肽链构成、也可能由几条肽链构成。二级结构：由于肽链上的一个肽键上的氢原子与另一个肽键上的氧原子有可能能形成氢键，所以，肽链可以
脂肪酶的催化机制
脂肪酶具有油-水界面的亲和力，能在油-水界面上高速率的催化水解不溶于水的脂类物质；脂肪酶作用在体系的亲水-疏水界面层，这也是区别于酯酶的一个特征。来源不同的脂肪酶，在氨基酸序列上可能存在较大差异，但其三级结构却非常相似。脂肪酶的活性部位残基由丝氨酸、天冬氨酸、组氨酸组成，属于丝氨酸蛋白酶类。脂肪酶的
脂肪酶的催化机制介绍
脂肪酶具有油-水界面的亲和力，能在油-水界面上高速率的催化水解不溶于水的脂类物质；脂肪酶作用在体系的亲水-疏水界面层，这也是区别于酯酶的一个特征。来源不同的脂肪酶，在氨基酸序列上可能存在较大差异，但其三级结构却非常相似。脂肪酶的活性部位残基由丝氨酸、天冬氨酸、组氨酸组成，属于丝氨酸蛋白酶类。脂肪酶的
天津工生所在柠檬烯环氧水解酶催化机制研究中获得进展
环氧水解酶广泛分布于微生物和植物中，其生物学功能主要包括天然产物合成、有毒环氧化合物的降解以及参与信号转导等。目前主要用于有机化学和生物催化中不对称合成相应的高值手性二醇化合物。LEH突变体立体选择性催化机制示意图 中国科学院天津工业生物技术研究所研究员孙周通前期采用柠檬烯环氧水解酶（LEH）
兰州化物所水溶液中铜催化叠氮炔环加成反应研究获新进展
水溶液中铜催化叠氮炔环加成反应 铜催化叠氮炔环加成反应作为点击化学的精髓，具有反应高效、条件温和、产物收率高和后处理简单，且末端炔基的应用可提供高的区域选择性等优点，故而这一重要反应在有机合成、药物化学、表面及高分子化学、以及生物偶联方面得到广泛应用。 中国科学院兰州化
一种高效非均相催化剂可用于CO2环加成反应
近日，西安石油大学化学化工学院王文珍科研团队以廉价易得的BiOBr为催化剂模型，提出了一种晶面及空位工程协同调控的策略，构建了高效的非均相催化剂用于CO2环加成反应，相关研究成果发表在Journal of Materials Science & Technology上。研究通过理论计算预测和晶面调控
无花果蛋白酶的催化机制
无花果蛋白酶与底物反应 3 个步骤：快速形成松散的酶底物复合物；酶活性中心的-SH 基被底物的羰基酰化；酰化酶的分解，生成酶与产物。
简述磷脂酶C的催化机制
PLC的主要催化反应发生在脂质—水界面的不溶性底物上。活性位点中的残基在所有同种PLC中都是保守的。在动物中，PLC在磷酸二酯键的甘油侧选择性地催化磷脂（磷脂酰肌醇4,5-二磷酸（PIP2））的水解，形成酶与底物弱结合的中间体肌醇1,2-环磷酸二酯和释放二酰基甘油（DAG）。然后将中间体水解成肌
木瓜蛋白酶的催化机制
木瓜蛋白酶的剪切肽键的机制包括：在His-159作用下Cys-25去质子化，而Asn-158能够帮助His-159的咪唑环的摆放，使得去质子化可以发生；然后Cys-25亲核攻击肽主链上的羰基碳，并与之共价连接形成酰基－酶中间体；接着酶与一个水分子作用，发生去酰基化，并释放肽链的羰基末端。
木瓜蛋白酶的催化机制
木瓜蛋白酶的剪切肽键的机制包括：在His-159作用下Cys-25去质子化，而Asn-158能够帮助His-159的咪唑环的摆放，使得去质子化可以发生；然后Cys-25亲核攻击肽主链上的羰基碳，并与之共价连接形成酰基－酶中间体；接着酶与一个水分子作用，发生去酰基化，并释放肽链的羰基末端。
苏氨酸蛋白酶的催化机制
苏氨酸蛋白酶使用其N端苏氨酸的仲醇作为亲核试剂进行催化。苏氨酸必须是N末端，因为相同残基的末端胺通过极化有序水而起到一般碱的作用，从而使醇去质子化以增加其作为亲核试剂的反应性。催化分两步进行：首先亲核试剂攻击底物形成共价酰基酶中间体，释放xxx个产物。其次，中间体被水水解以再生游离酶并释放第二产物。
QM/MM酶催化反应机制研究
酶反应机理研究是化学、生物学中的核心问题之一，长期以来受到广泛关注。不过酶催化反应研究相当复杂，无论实验还是计算模拟都充满挑战，这主要是因为酶反应过程的多尺度特性[1]： 如图1所示，反应底物化学键断裂与生成、蛋白局部氨基酸残基的运动往往在飞秒到皮秒的时间尺度，若要描述溶剂分子例如水的动力学行为至少
研究揭示硒酶催化的分子机制
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519853.shtm
木瓜蛋白酶的催化机制
木瓜蛋白酶的剪切肽键的机制包括：在His-159作用下Cys-25去质子化，而Asn-158能够帮助His-159的咪唑环的摆放，使得去质子化可以发生；然后Cys-25亲核攻击肽主链上的羰基碳，并与之共价连接形成酰基－酶中间体；接着酶与一个水分子作用，发生去酰基化，并释放肽链的羰基末端。
研究揭示硒酶催化的分子机制
近日，许建强副教授团队揭示了硒酶催化的分子机制，有助于理解胞内抗癌靶点的结构功能，相关成果发表在生物学领域顶刊《氧化还原生物学》。在氧化还原生物学领域里，细胞质型硫氧还蛋白还原酶是维持高等生物细胞内氧化还原平衡的关键硒酶，而导向杆基序在酶功能中发挥重要作用。前期研究发现，导向杆基序在空间上趋近硒酶羧
丝氨酸蛋白酶的催化机制
丝氨酸蛋白酶催化机制的主要参与者是催化三联体。三联体位于酶的活性位点，在那里发生催化作用，并保存在丝氨酸蛋白酶的所有超家族中。三联体是由三个氨基酸组成的协调结构：His57、Ser195（因此得名“丝氨酸蛋白酶”）和Asp102.这三种关键氨基酸均在蛋白酶的切割能力中发挥重要作用。虽然三联体的氨基酸
简述木瓜蛋白酶的催化机制
木瓜蛋白酶的剪切肽键的机制包括：在His-159作用下Cys-25去质子化，而Asn-158能够帮助His-159的咪唑环的摆放，使得去质子化可以发生；然后Cys-25亲核攻击肽主链上的羰基碳，并与之共价连接形成酰基－酶中间体；接着酶与一个水分子作用，发生去酰基化，并释放肽链的羰基末端。
半胱氨酸蛋白酶催化机制介绍
半胱氨酸蛋白酶催化肽键水解的反应机制的xxx步是通过具有碱性侧链的相邻氨基酸（通常是组氨酸残基）使酶活性位点中的硫醇去质子化。下一步是去质子化半胱氨酸的阴离子硫对底物羰基碳的亲核攻击。在这一步中，底物的一个片段被释放出一个胺端，即蛋白酶中的组氨酸残基恢复到其去质子化形式，并形成将底物的新羧基末端连接
酶的活性部位在酶的催化机制中的作用
酶的活性部位在酶的催化机制中的作用:由于酶的活性部位与底物结合后，能使底物作用浓度相对增加，易于反应(称为邻近效应，Proximity);或使底物功能基团受酶影响，作定向转移 (Orientation)，更有利于催化作用发生;或活性部位内的催化基团提供质子或吸收质子，呈现酸碱催化剂的作用;或形成一个