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梁晗:从癌症基因组中寻找性别差异

如果有一种软件能告诉你今后患上癌症的可能性是多少,而其中判断的因素之一就是你的性别是男还是女,你会相信吗?可能大部分人都会摇头:怎么可能性别影响如此之大。但越来越多的研究表明,性别在癌症中起着不可忽视的作用。 来自美国德州大学MD安德森癌症中心的一项研究通过调查13种癌症类型,在分子水平上认识了性别对不同癌症的影响,这也就是说我们可能迫切需要开发出性别特异性的治疗策略。这一研究成果发表在Cancer Cell杂志上,为了更深入了解这项成果,生物通特联系了领导这一研究的MD安德森癌症中心生物信息学和计算生物学副教授梁晗(Han Liang),就读者感兴趣的问题请教了他。 癌症的个体差异 在很多人看来,我和他所患的是同一种癌症,为何需要区别对待呢?现代生物学告诉我们,癌症具有显著的个体差异,是多因素、多个信号传导通路作用的结果,具有高度异质性,其发生、发展过程中涉及DNA水平、转录、转录后修饰及蛋白水平的多种变化,最终导致......阅读全文

在无症状时及时“抓住”肿瘤“痕迹”,癌症不再防不胜防!

  在癌症增长得致命之前,寻求检测癌症的方法已经迈出了新的一步,新的概念验证数据表明,专门的血液检测可以发现由于肿瘤太小而无法用其他方式进行识别的突变型DNA碎片。  美国临床肿瘤学会周二在芝加哥举行的年会上提出了这一突破性研究。它发现在124位晚期癌症患者的肿瘤中发现的73%的遗传突变也被发现出现

2017年7月Cell期刊不得不看的亮点研究

  7月份即将结束了,7月份Cell期刊又有哪些亮点研究值得学习呢?小编对此进行了整理,与各位分享。  1.Cell:中科院生物物理所王艳丽/章新政课题组从结构上揭示Cas13a切割RNA机制  doi:10.1016/j.cell.2017.06.050  作为一种VI-A型CRISPR-Cas系

2018年12月Science期刊不得不看的亮点研究

  12月份Science期刊又有哪些亮点研究值得学习呢?小编对此进行了整理,与各位分享。  1. Science:CRISPRa加入肥胖之战,无需对基因组进行编辑就能对抗肥胖doi:10.1126/science.aau0629  在一项重要的新研究中,来自美国加州大学旧金山分校的研究人员证实CR

孙方霖:表观遗传学 后基因组时代的领舞者

DNA双螺旋的解码者、诺贝尔奖获得者Watson说:“你可以继承DNA序列之外的一些东西。这正是现在遗传学中让我们激动的地方。” 不久前,美国国立卫生研究院利用由“路标计划”管理的新基金,启动了表观基因组学研究计划,一批表观遗传学项目和研究人员将获得数百万到上千万美元的经费支持。几乎在同时

大数据研究推翻常规认识

  近年来,科学创新日渐进入"大数据"时代,各种高通量的分析手段以及各类"组学"的发展,使得我们对生命科学的基本原理以及与人类健康有关的疾病发生机制方面有了更加深入的认识。针对最近一段时间以来科学家们利用"大数据"的手段产生的科学进展,我们

专访中国医学科学院肿瘤医院林东昕院士

  近年来在精准医疗领域的研究和投资热度不减。尤其是针对癌症的早期诊断技术的开发如基因筛查等开始受到广泛的关注,吸引了越来越多的研究者投身其中。对于各类癌症发生的分子机制以及易感基因的研究则是这项技术的关键环节。  中国医学科学院肿瘤医院病因及癌变研究室主任林东昕院士是肿瘤病因学领域的资深

基因测序前景:上游市场增速放缓 中下游市场潜力巨大

  基因测序服务市场增速快,预计2016年超过测序仪器市场。据Markets&Markets预测,2014-2020年上游市场中测序仪的复合增长率是15.4%。中游测序服务市场重资产、技术附加值低,将是产业链中增速最快的,据BCC Research预测2011-2016年复合增长率为29%。

Cell惊人发现:DNA复制方案因人而异

  人类细胞每次分裂的时候,都得复制六十亿DNA碱基,一个一个来显然是不现实的。事实上,DNA复制机器会同时介入多个起始点,进行分工合作。  哈佛大学医学院、Broad研究所和MIT的科学家们发现,人与人之间的DNA复制方案并不相同。他们鉴定了首个调控DNA复制时序(Replication timi

除了合成蛋白质,核糖体还有哪些重要功能?

  【1】elife:核糖体也能调控基因的表达?  doi:10.7554/eLife.45396  来自Stowers医学研究所的研究人员发现了人体细胞中核糖体的一种新功能,即存在破坏正常mRNA的功能。“很长一段时间以来,很多人都认为核糖体是细胞中生产蛋白质的分子机器,”Stowers助理研究员

王在峰教授:肿瘤患者的诊疗需“量体裁衣”

  导语:肿瘤一直以来都是块难啃的“硬骨头”,医生和科研人员为了“啃碎”它,忙的焦头烂额;平常人对它是“谈癌色变”;患者和家属对它则“寝食难安”。在菏泽市抗癌协会上我们邀请到菏泽市抗癌协会会长、菏泽肿瘤康复研究院院长、正大医院王在峰董事长,看看他对肿瘤的诊疗有着怎样的见解。  转化医学网:王院长您好

用大数据分析大脑,描绘治愈精神疾病的未来

九年前,我妹妹在她的脖子和手臂上发现了肿块,并被诊断出患有癌症。从那天起,她开始受益于科学对癌症的理解。每当她去看医生时,他们都会测量特定的分子,这些分子可以提供该如何做以及下一步该做什么的信息。每隔几年就有新的医疗选择。每个人都知道她因癌症而英勇地抗争。今年春天,她在一项临床试验中获得了创新的新药

癌症基因组——癌症研究和云计算的里程碑

图片来源:https://www.nature.com/articles/d41586-020-00308-w  2001年,人类基因组计划完成,整个计划花费约30亿美元,1985年提出,1990年正式启动,历经十余年。肿瘤是最热门的研究领域之一,该领域的研究者们一直希望可以借助测序手段去表征肿瘤的

6篇Nature齐发!癌症基因组计划成果成井喷之势

  除了Nature一次性发表6篇论文外,Nature Genetics杂志发表了3篇,Nature Communications发表9篇,Nature Biotechnology一篇,详细报道BioArt后续会陆续发布。文章合集网址:https://www.nature.com/collectio

《细胞》子刊11篇文章重磅回顾,这些年兴起的大牛技术

  还记得CRISPR-Cas9基因组编辑技术,cryo-EM,甚至高通量测序技术未出现之前,我们是怎样进行研究的吗?其实大家不用回忆太久,因为这不是很久以前的事。在过去几年间,生物学研究技术进步步伐快的让人难以置信。  Cell出版社旗下Molecular Cell杂志推出了技术特刊,介绍了新技术

2018年度巨献:打破教科书,挑战常规的突破性研究解读

  很多教科书中的理论知识及日常生活中的传统观点仅限于目前科学家们的研究结果,然而随着时间推进,科学研究在不断在发展的同时,一些新的研究成果也会层出不穷,很多教科书中的观点也会被覆盖更新,很多传统认知也会被替换。那么2018年都有哪些打破教科书或挑战传统认知的突破性研究成果呢,本文中,小编就对201

多种测序技术或将深入推动癌症领域研究

  本文中小编整理了多篇文章,来解读测序技术在阐明癌症发生机制、癌症诊断及疗法开发等方面的巨大潜力,与各位一起学习!  【1】JAMIA:新工具深入挖掘外显子测序结果 帮助找到最佳癌症治疗药物  doi:10.1093/jamia/ocw022  科罗拉多大学的研究人员最近在国际学术期刊JAMIA上

南京医科大学教授沈洪兵:基因辨癌

  前段时间,《自然—遗传学》(Nature Genetics)连续在线发表了南京医科大学教授沈洪兵团队用全基因组关联研究(GWAS)方法,在胃癌和肺癌易感基因研究方面获得的两项成果。这是在多项国家自然科学基金和科技部“863”重大专项课题资助下,我国科学家在癌症早期诊断和治疗方面取得的重要进展

高纤维食物有利于癌症免疫治疗

  美国癌症研究协会(American Association for cancer Research, AACR)年度会议的媒体预览会上公布的数据显示,与饮食质量较差的人相比,食用高纤维食物的皮肤癌患者对免疫疗法的反应更好。   黑素瘤是一种皮肤癌,如果发现得早,是可以治愈的,但每年仍有大约900

Science果:我们的寿命多大程度由基因决定?只有16%!

  最新刊登在Science上的一项研究发表了可能是有史以来最大的家谱:这一里程碑式的数据集关联了有血缘或婚姻关系的1300万人,平均跨越11代。而正是基于这一庞大的家谱,科学家们得出了以上结论。  在这篇题为“Quantitative analysis of population-scale fa

Nature:癌症基因组分析的新浪潮

  肺癌与乳腺癌不一样,与胰腺癌也不一样,然而根据发表在《自然遗传学》(Nature Genetics)的两项最新研究表明在分子水平上它们具有许多相同之处。同日,Nature网站对这一研究成果进行了即时新闻报道   这项“泛癌症”研究针对12种不同类型的肿瘤3000多个基因组进行了分析,寻找跨

Nature:癌症基因组分析的新浪潮

  肺癌与乳腺癌不一样,与胰腺癌也不一样,然而根据发表在《自然遗传学》(Nature Genetics)的两项最新研究表明在分子水平上它们具有许多相同之处。同日,Nature网站对这一研究成果进行了即时新闻报道   这项“泛癌症”研究针对12种不同类型的肿瘤3000多个基因组进行了分析,寻找跨

性别相关DNA甲基化差异或与白血病患病风险有关!

  慢性淋巴细胞白血病(Chronic lymphocytic leukemia, CLL)是一种典型的血癌,并且男性CLL患者要多于比女性。已有发现,CLL患者的DNA甲基化确实具有显著差异[1],并且男性的比例大于女性。一直以来,科学家怀疑这可能是由性别相关DNA甲基化模式所引起的。遗憾的是,到

2016年最受全球媒体关注的100篇论文

  截止到今年11月15日,Altmetric统计了过去一年中发布的270万篇学术论文,整理并公布了2016年的论文Altmetric指数百强榜单,列出了那些在社会公共领域引起最强烈关注或讨论的科学研究。其中有第一篇由美国现任总统发表的医保评估报告,有引力波与比邻星B这样的重大天文学发现,有最早的生

12月14日《科学》杂志内容精选

    为巴拿马境内的节肢动物计数  节肢动物包括昆虫、蛛形纲和甲壳纲,它们是地球陆地物种中最多元化的动物组群。而这可能是为什么研究人员如此难以估计它们的数目——特别是它们在热带雨林中的数目的原因;在热带雨林中人们已知有如此多的繁盛的节肢动物物种。作为一个正在进行的,对其群体进行量化

Nature:人类细胞图谱研究先锋Aviv Regev

  Aviv Regev是一位生物分析专家。现在,她正致力于绘制人体的每一个细胞。  计算生物学家Aviv Regev喜欢做一些看似不可能完成的任务。2011年,她与分子遗传学家Joshua Levin合作,测试了RNA测序的几种方法。科学家们在测试几种技术的极限,以查看哪种方法表现最佳。他们用降解

系统化生物芯片技术在功能基因组研究中的应用简介

 三、生物芯片技术研究应用点滴     人类基因组计划推动了各种生物基因组测序工作的进展,越来越多的生物全基因组序列被测定并公布,可是这才是解读“天书”的开始。掌握了基因组序列,却不知道基因序列背后所隐藏的秘密——即基因组的功能,就不能真正理解“天书”更

专访七桥基因:云端计算如何与基因学系统的完美结合?

  10月份,记者在高创会期间在硅谷专访了“七桥基因”董事长詹姆斯先生。以下为访谈实录。  记者:谢谢詹姆斯,很高兴您能接受我们的采访,您可以介绍一下您自己以及您代表的公司吗?  詹姆斯:当然可以,也谢谢您采访我。我是“七桥基因”公司的董事长,我们是一家云端计算公司,致力于生物医学、数据分析;我们专

2015年癌症诊断领域研究突破性进展

  一直以来,癌症的诊断研究领域都是科学家们关注的重点,近年来随着研究的深入,许多新型的癌症检测技术不断涌现,比如癌症液体活检技术,microRNA检测工具、成像追踪技术等,本文中小编就盘点了2015年癌症诊断领域的研究亮点。  【1】4篇权威期刊论文聚集癌症血液检测  虽然实体肿瘤的检测仍然是癌症

Science特刊:癌症治疗前沿进展

  长达十年的癌症基因组计划为了解这种疾病的复杂性提供了许多信息,也带来了不少希望。现在我们知道遗传突变会促进肿瘤生长,这在患者各个个体之间存在差异,原发性肿瘤和转移性肿瘤也存在差异,甚至在同一肿瘤的不同位置也存在差异。这种异质性解释了为何某种药物能治疗一个患者,但另外一个患者却没有效果,以及为何患

PLOS ONE:为何男性寿命更短? 这要追溯到“娘胎”

  性别的不平等起始于子宫,但可能不是以你认为的方式进行。日前,PLOS ONE杂志上的一项研究对出生于1981年至2011年间的574000名澳大利亚婴儿进行分析,结果发现男孩更容易出现早产,且出生时的风险也更大。与生育女孩的女性相比,生育男孩的女性在妊娠后期患先兆子痫、高血压或糖尿病的可能性更大