Cell：挑战常规！一些纤毛虫没有专门的终止密码子
遗传密码---经常在教科书表格中摊开的一组指令，告诉核糖体如何制造肽---在大多数真核生物中是一样的。但是正如大多数规则一样，存在例外情形。在一项新的针对纤毛虫基因组重排的研究中，瑞士伯尔尼大学细胞生物学家Mariusz Nowacki和他的团队碰巧遇到两种引人注目的例外情况。相关研究结果近期发表在Cell期刊上，论文标题为“Genetic Codes with No Dedicated Stop Codon: Context-Dependent Translation Termination”。 作为具有两个细胞核的复杂原虫，纤毛虫已知以一种非正常的方式翻译RNA转录本。然而，Nowacki团队发现巨大突口虫（Condylostoma magnum）和一种未分类的Parduczia物种更进一步，将所有传统的“终止”密码子（UGA、UAA和UAG）重新分配给氨基酸。Nowacki说，“开始时，它有些说不通。没有人期待存在没......阅读全文
基因翻译的终止
本过程细胞主要需完成以下目标：（1）使翻译停止，不再有新的氨基酸掺入；（2）释放合成的多肽链；（3）释放结合在mRNA上的各组分；（4）确保核糖体大小亚基以及重要因子的重复利用。原核细胞和真核细胞在此过程的处理上有明显不同，下面将分开介绍。 （一）原核细胞A.肽链的释放（1）释放因子RF1/2 （t
优化基因表达的关键因素
在基因表达研究中，研究者比较注意选择合适的表达载体和宿主系统，而往往忽视基因本身是否与载体和宿主系统为最佳匹配这样一个实质性问题。基因的最佳化表达可以通过对基因的重新设计和合成来实现，如消除稀有密码子而利用最佳化密码子，二级结构最小化，调整GC含量等。以下就密码子最佳化、翻译终止效率和真核细胞中异
优化基因表达的关键因素
在基因表达研究中，研究者比较注意选择合适的表达载体和宿主系统，而往往忽视基因本身是否与载体和宿主系统为最佳匹配这样一个实质性问题。基因的最佳化表达可以通过对基因的重新设计和合成来实现，如消除稀有密码子而利用最佳化密码子，二级结构最小化，调整GC含量等。以下就密码子最佳化、翻译终止效率和真核细胞
副密码子的概念介绍
对于终产物为RNA的基因，只要进行转录并进行转录后的处理，就完成了基因表达的全过程；而对于终产物是蛋白质的基因，还必须将mRNA翻译成蛋白质。
副密码子有哪些特点？
（1）一种氨酰tRNA 合成酶可以识别一组同功tRNA （多达6个）,它们的副密码子有共同的特征。 （2）副密码子没有固定的位置,亦可能不止1个碱基对。 （3）尽管副密码子不能单独与氨基酸发生作用,但副密码子可能与氨基酸的侧链基团有某种相应性。 （4）并非所有的tRNA氨基酸柄上的G3·U
副密码子的特点介绍
（1）一种氨酰tRNA 合成酶可以识别一组同功tRNA （多达6个），它们的副密码子有共同的特征。（2）副密码子没有固定的位置，亦可能不止1个碱基对。（3）尽管副密码子不能单独与氨基酸发生作用，但副密码子可能与氨基酸的侧链基团有某种相应性。（4）并非所有的tRNA氨基酸柄上的G3·U70都是它的副密
反密码子环的定义
在氨基酸臂对面的单链环称反密码子环（anticodon loop）,该环含有由三个核苷酸残基组成的反密码子。
副密码子的特点介绍
（1）一种氨酰tRNA 合成酶可以识别一组同功tRNA （多达6个），它们的副密码子有共同的特征。（2）副密码子没有固定的位置，亦可能不止1个碱基对。（3）尽管副密码子不能单独与氨基酸发生作用，但副密码子可能与氨基酸的侧链基团有某种相应性。（4）并非所有的tRNA氨基酸柄上的G3·U70都是它的副密
副密码子的概念介绍
mRNA的核苷酸顺序与蛋白质的氨基酸顺序之间在结构上并没有直接的相应关系,二者也不发生直接的相互作用。在这两种不同的遗传语言之间,必须通过译员才能互相沟通。扮演这种译员角色的就是各种tRNA分子。如果没有tRNA的存在,也就无所谓密码子了。因此密码子的意义并不是单独由mRNA决定的,而是由mRN
反密码子茎的定义
中文名称反密码子茎英文名称anticodon stem定 义转移核糖核酸中与反密码子环相连的茎区，通常是含有5对碱基的螺旋。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
细胞化学词汇反密码子
反密码子是在tRNA的三叶草形二级结构反密码臂的中部，可与mRNA中的三联体密码子形成碱基配对的三个相邻碱基。在蛋白质的合成中，起解读密码、将相应的氨基酸引入核糖体A和P位点的作用。 反密码子（anticodon）：RNA链经过折叠，看上去像三叶草的叶形，其一端是携带氨基酸的部位，另一端有3个碱基。
密码子的概念和种类
密码子（codon）：mRNA（或DNA）上的三联体核苷酸残基序列，该序列编码着一个特定的氨基酸，tRNA 的反密码子与mRNA的密码子互补。起始密码子（iniation codon）：指定蛋白质合成起始位点的密码子。最常见的起始密码子是甲硫氨酸或缬氨酸密码。终止密码子（termination co
密码子适应指数的概念
中文名称：密码子适应指数英文名称：codon adaptation index;CAI定义：密码子适应指数是反映编码区同义密码子与密码子最佳使用相符合的程度，取值范围在0—1之间。应用学科：遗传学（一级学科）；进化遗传学（二级学科）
起始密码子的运作原理
AUG是起始密码子，也就是说肽链起始于甲硫氨酸。这个氨基酸是甲基化的甲硫氨酸。起始密码子结合到一个与甲硫氨酸一tRNA相同的3’UAC5’反密码子的甲酰甲硫氨酸一tRNA上．也就是说，甲硫氨酸一tRNA和甲酰甲硫氨酸一tRNA都是由AUG编码．但是起始氨基酸的信号要比所有其他氨基酸的信号复杂得多。根
密码子偏倚的定义
中文名称：密码子偏倚英文名称：codon bias定 义：编码同一氨基酸的不同密码子的非平均使用现象。应用学科：遗传学（一级学科），进化遗传学（二级学科）
副密码子的特点介绍
（1）一种氨酰tRNA 合成酶可以识别一组同功tRNA （多达6个），它们的副密码子有共同的特征。（2）副密码子没有固定的位置，亦可能不止1个碱基对。（3）尽管副密码子不能单独与氨基酸发生作用，但副密码子可能与氨基酸的侧链基团有某种相应性。（4）并非所有的tRNA氨基酸柄上的G3·U70都是它的副密
反密码子臂的定义
中文名称反密码子臂英文名称anticodon arm定 义由反密码子茎和反密码子环构成，是转移核糖核酸高级结构中的一部分区域。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
关于密码子的种类介绍
构成RNA的碱基有四种，每三个碱基的开始两个决定一个氨基酸。从理论上分析碱基的组合有4的3次方=64种，64种碱基的组合即64种密码子。怎样决定20种氨基酸呢？仔细分析20种氨基酸的密码子表，就可以发现，同一种氨基酸可以由几个不同的密码子来决定，起始密码子为AUG（甲硫氨酸），另外还有UAA、U
简述简并密码子的表现
许多氨基酸的密码子的第1和第2个碱基相同，只有第3个碱基不同，密码子的简并性,特别是第三位的胞嘧啶和尿嘧啶或鸟嘌呤和腺嘌呤的简并性常常等同(右表),这说明为什么在不同生物的DNA中的AT/GC比率会有很大的变异,而其蛋白质的氨基酸相对比例却没有很大的变化。 对应于同一种氨基酸的不同密码子称为同
什么是上游起始密码子？
约50%的智人（Homo Sapiens）基因带有上游起始密码子（上游AUG）。尽管真核细胞每条mRNA只表达一个蛋白，但其依然可以带有多个上游可读框和上游AUG，只是其并不翻译产生具有生物学意义的蛋白。理论上，真核细胞会翻译其mRNA上游到下游扫描遇到的第一个AUG，并且在翻译完成后解离。这意味着
碱基突变对多肽链中氨基酸序列的影响类型
同义突变同义突变(same sense mutation):碱基置换后,虽然每个密码子变成了另一个密码子,但由于密码子的简并性,因而改变前、后密码子所编码的氨基酸不变,故实际上不会发生突变效应。例如,DNA分子模板链中GCG的第三位G被A取代,变为GCA,则mRNA中相应的密码子CGC就变为CGU,
依赖ρ因子的转录终止
ρ因子是一种分子量为46kDa的蛋白质，以六聚体为活性形式。
转录终止因子的定义
中文名称转录终止因子英文名称transcription termination factor定 义辅助具有RNA聚合酶活性的转录复合体特异性地识别转录终止信号的蛋白质因子(如ρ因子等)，其作用导致转录终止。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调控（二级学科）
欧盟拒绝终止动物研究
欧洲委员会已经拒绝在整个欧盟废除动物研究的请求，理由是这样做会伤及生物医学研究。 今年3月3日，一项由117万人签名参与的“欧洲公民倡议”（ECI）活动正式敦促欧洲委员会废弃一项于2010年颁布、监管科研中动物使用的指令，并且提出了逐步取消动物研究转而寻求“更加精确、可靠和与人类相关的方法”
终止子的定义
终止子(terminator T)是给予RNA聚合酶转录终止信号的DNA序列。在一个操纵元中至少在结构基因群最后一个基因的后面有一个终止子。
抗终止作用的概念
中文名称抗终止作用英文名称anti-termination定 义生物体内大分子合成中的抑制机制。如转录过程中，某些抗终止因子作用于操纵子内存在的顺反子终止位点，使RNA聚合酶绕过终止位点，继续转录。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），总论（二级学科）
赛诺菲终止fedratinib临床开发
赛诺菲(Sanofi)11月18日宣布，将停止有关实验性JAK2抑制剂fedratinib(SAR302503)的所有临床试验，同时取消提交相关监管申请的计划。 经过一项彻底的风险-效益(risk-benefit)分析，包括与FDA、研究人员、独立的神经学专家和神经放射科医师的讨论，赛诺菲
终止子的分类
终止子可分为两类。一类不依赖于蛋白质辅因子就能实现终止作用。另一类则依赖蛋白辅因子才能实现终止作用。这种蛋白质辅因子称为终止因子,通常又称ρ因子。 两类终止子有共同的序列特征。在转录终止点前有一段回文序列。回文序列的两个重复部分(每个7～20bp)由几个不重复的bp节段隔开。回文序列的对称轴一般距转
终止子的分类
不同的终止子的作用也有强弱之分，有的终止子几乎能完全停止转录；有的则只是部分终止转录，一部分RNA聚合酶能越过这类终止序列继续沿DNA移动并转录。如果一串结构基因群中间有这种弱终止子的存在，则前后转录产物的量会有所不同，这也是终止子调节基因群中不同基因表达产物比例的一种方式。有的蛋白因子能作用于终止
终止结核－－分秒必争
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454757.shtm 编者按：3月24日是世界防治结核病日，今年的主题是：分秒必争 终止结核。我国是全球结核病高负担国家之一，尤其耐药结核病负担较重，但公众却对其关注度并不高。对标世界卫生组织提出的2