华大基因Cell子刊发表宏基因组测序新成果

人类消化道中居住着大量的微生物,它们被统称为肠道微生物组。肠道微生物组在人类代谢食物、抵御感染和应答药物等过程中起到了重要的作用。许多人类疾病都与微生物组失衡有关。 微生物组研究过去主要依赖16S rDNA基因测序。随着测序成本的直线下降,针对整个菌群的宏基因组测序越来越受到青睐。目前,双胞胎宏基因组鸟枪测序的样本量还比较小。为此,华大基因BGI和伦敦国王学院的研究人员测序了英国250名成年双胞胎的粪便样本。他们在Cell Systems杂志上发表文章,揭示了基因和环境对肠道微生物组的影响。 研究人员通过宏基因组鸟枪测序建立了全面的肠道菌参考基因目录。研究显示,肠道微生物组的许多细菌类群和功能模块是可遗传的,包括那些与人类疾病有关的细菌类群和功能模块。研究人员还在肠道微生物组中鉴定了八百万SNP。他们发现,双胞胎的微生物组SNP高度相似。但数十年分隔两地的生活会使这种相似性慢慢降低。这说明地理和家庭环境会影响肠道微生物组......阅读全文

肠道免疫系统由肠道微生物守护!

  科学家们早就知道肠道细菌对宿主有各种各样的作用,例如分解膳食纤维、制造维生素K和B7等等。然而,一项新研究揭示,微生物还有另一个作用。  布朗大学的研究小组发现,小鼠体内肠道微生物正在参与调控宿主免疫。与其说宿主的防御系统可能攻击这些有益细菌,不如说细菌可以与动物的免疫系统和平共存。  对立的外

咖啡能带来更健康的肠道微生物群?

  一项新的研究表明,咖啡因的摄入与健康的肠道微生物群有关。肠道微生物群是生活在消化道中的数万亿微生物,它们影响着你的整体健康。  近年来,大量研究表明,从2型糖尿病到某些癌症再到帕金森氏症,饮用咖啡与降低各种健康风险之间存在关联。  与此同时,越来越多的证据表明,肠道微生物群落的组成可能会影响你的

肠道微生物群可以防止急性砷中毒

   在蒙大拿州立大学进行的研究表明,人体肠道中的微生物在防止砷毒性方面发挥着重要作用,这一问题影响了通过受污染的饮用水接触砷的大约2亿人。   在过去的五年中,MSU博士候选人Michael Coryell与他的顾问Seth Walk和委员会成员Timothy McDermott一起研究人类肠道

科学家阐明肠道微生物组与机体动脉硬化之间的神秘关联

  近日,一项刊登在国际杂志European Heart Journal上的研究报告中,来自诺丁汉大学等机构的研究人员通过研究发现,消化系统中有益菌群多样性的水平或许与心血管疾病的一个特征—动脉硬化有一定的关联。在医学研究中肠道微生物组受到了科学家们越来越多的关注,因为如今我们都知道肠道菌群对机体多

科学家阐明肠道微生物组与机体动脉硬化之间的神秘关联

   近日,一项刊登在国际杂志European Heart Journal上的研究报告中,来自诺丁汉大学等机构的研究人员通过研究发现,消化系统中有益菌群多样性的水平或许与心血管疾病的一个特征—动脉硬化有一定的关联。在医学研究中肠道微生物组受到了科学家们越来越多的关注,因为如今我们都知道肠道菌群对机体

揭示肥胖和减重干预人群肠道微生物和血清代谢组变化

  2017年6月19日,来自上海交通大学医学院附属瑞金医院、华大等机构的研究人员通过宏基因组关联分析,结合血清代谢组学和蛋白组学研究手段,完成了中国青年肥胖人群肠道菌群、循环氨基酸和临床表型之间的关系研究,建立了宏基因组和临床指标的分类与预测模型。这项研究阐明了肥胖病的起因和发展的分子机制,为建立

Nature-Methods发布宏基因组测序新工具

  微生物几乎是无所不在的,它们对生态环境和人体健康起到了不容忽视的作用。然而人们对微生物的了解还相当匮乏,因为许多微生物是无法在实验室中培养的。宏基因组学是了解这些微生物的重要途径,但宏基因组测序并不是一件容易的事儿,就像是把许多拼图拆散混在一起,然后在毫无参考的情况下拼接。  最近Nature

Science新研究:肠道菌群互相竞争-保证肠道生态稳定

  最近一项研究发现人类肠道中的菌群生态系统复杂多样,不同菌群之间的竞争关系帮助维持了肠道生态系统的稳定,这对于保持人类机体健康是必不可少的。来自英国牛津大学的科学家们在国际学术期刊Science上发表了相关研究结果,他们建立了数学模型用于研究人类肠道中成百上千种细菌如何能够成功共存。  在他们的研

肠道研究专家Cell发现泻药对肠道菌群的影响

  来自斯坦福大学的研究人员发表了题为“Transient osmotic perturbation causes long-term alteration to the gut microbiota”的文章,发现在小鼠出现腹泻时,保护肠内膜免受它的内含物损害的粘液层变薄,但在泻药移除两周后完全恢复

华大基因研究发现RA病理

  昨日从华大基因获悉,北京协和医院和华大基因等机构共同合作完成了类风湿关节炎(RA)口腔和肠道微生物元基因组研究。本项研究揭示口腔和肠道微生物菌群异常是RA病理生理和疾控的重要环节,并且为元基因组学辅助的RA个性化诊疗方案提供基础。研究成果于昨日发表在《自然医学》杂志。   项目的主要完成人之一、

环境和生活方式塑造肠道微生物组

科技日报讯 (实习记者张佳欣)人类肠道中的细菌与多种疾病有关,但有哪些细菌是健康的,哪些是由疾病或药物造成的?科学家迄今尚不十分清楚。荷兰格罗宁根大学傅静远教授团队与合作者在4月13日的《自然》杂志上发表最新研究,系统地揭示了环境和遗传因素与人类肠道微生物组之间的关联,这将促进微生物组靶向治疗的未来

多篇文章共同解读免疫系统与肠道菌群的奥秘

  近年来,随着科学家们研究的不断深入,越来越多的研究证据将机体的免疫系统与肠道菌群联系了起来,当然我们很多人并不清楚免疫系统到底和机体肠道菌群有着怎样的关联?免疫系统能够被肠道菌群调节,抑或者其能够主动调节机体肠道菌群的多样性从而来影响健康?  本文中就对二者之间的关联性研究进行了整理,如下:  

Science公布太空双胞胎实验结果之三:肠道微生物的变化

  美国航空航天局(NASA)标志性的双胞胎研究(Twins Study)今日在Science封面上公布了最新的结果,其中一项研究表明长期的太空飞行会影响人体肠道微生物。  研究指出,在国际空间站(ISS)长达一年的时间里,宇航员Scott Kelly肠道微生物组经历了两种主要细菌比例的转变。但是他

帕金森氏症患者肠道菌群特殊

  根据赫尔辛基大学和赫尔辛基大学中心医院进行的一项研究发现,与健康对照者相比,帕金森氏症患者肠道有不同菌群。研究人员目前正在试图确定肠道微生物和帕金森氏症之间的联系。  我们最重要的发现是,帕金森病患者肠道中有比较少的普雷沃氏菌家族细菌,不同与对照组,帕金森病患者肠道几乎没有人有这个家族的大量细菌

西方生活模式改变肠道菌群

  寄居在肠道内的天然细菌对健康十分重要,但近日一项新研究揭示,一种现代生活方式可能限制肠道积累细菌。虽然生活方式如何影响肠道菌群尚不得而知,但一项针对巴布亚新几内亚和美国居民肠道菌群的分析表明,西方生活方式可能通过限制其在人体中的传输能力,减少肠道中细菌的多样性。相关成果发表于《细胞—通讯》期刊。

狩猎采集者肠道菌群“目录”出炉

  我们已熟稔菌群“好细菌”与“坏细菌”的概念区分,但对于微生物学来讲,其划分并不是绝对的。4月15日出版的英国《自然—通讯》杂志上一篇论文指出,坦桑尼亚的哈扎人的肠道菌群中令人意外地缺少双歧杆菌——一类通常存在并被认为对我们健康非常有益的“好细菌”。此研究指出了他们可能受采集生活方式影响的肠道菌群

研究揭示肠道菌群引发肥胖机理

  本周英国《自然》上的一则与代谢相关研究论文称,面对高脂饮食时,肠道菌群会产生乙酸,从而影响肥胖、胰岛素抵抗和代谢综合征。这项在啮齿动物中进行的研究显示,乙酸这种短链脂肪酸有着激活副交感神经系统的能力。而无论是乙酸生成增加,还是副交感神经系统激活,都可能为治疗肥胖提供新的途径。   肠道菌群是生命

肠道菌群影响血糖和血脂水平

  肠道细菌因影响人体各种生理功能和疾病而广受关注。来自熊本大学(Kumamoto University)的研究人员分析了肠道菌群变化对糖和脂质代谢的影响,首次发现了细菌生产的次级胆汁酸(secondary bile acids)影响血糖和血脂浓度的部分分子机制。这项发现将导致以肠道细菌生产的次级胆

肠道菌群或有助于减肥

  肠道菌群,即生活在我们肠道内的所有微生物,主要是细菌。在过去的几年中,对于肠道菌群的研究,已经开始解开它在我们身体中的巨大作用,以及它如何共生地影响我们器官的功能。特别是,微生物也对热量吸收的方式和脂肪细胞的发育产生影响。通过研究没有菌群的小鼠,瑞士日内瓦大学医学院的科学家们,能够解释“微生物的

常用肥皂成分迅速破坏肠道菌群

  最近一项新的研究表明,三氯生——存在于许多消费品(从洗手液到玩具,甚至牙膏)中的一种抗菌剂和抗真菌剂,可迅速破坏肠道内的细菌群落。相关研究结果由来自俄勒冈州立大学(OSU)的科学家发表在今天的《PLOS ONE》杂志上。  这项研究是在斑马鱼中开展的,研究人员认为这是一种重要的动物模型,可帮助确

人体如何留住有益肠道菌群?

  科学家们早就知道,我们的身体需要控制肠道菌群,以防止一个有益的环境变成危险环境。但是,我们尚不知道,我们的身体是如何做到这一点的。  最近,牛津大学的研究人员对这个问题提出了一个巧妙的解决办法:让有益细菌变得粘性,这样它们就不会迷路。对于宿主来说,关键在于,靶定好的细菌,而不是坏的——通过免疫系

常用肥皂成分迅速破坏肠道菌群

  最近一项新的研究表明,三氯生——存在于许多消费品(从洗手液到玩具,甚至牙膏)中的一种抗菌剂和抗真菌剂,可迅速破坏肠道内的细菌群落。相关研究结果由来自俄勒冈州立大学(OSU)的科学家发表在今天的《PLOS ONE》杂志上。  这项研究是在斑马鱼中开展的,研究人员认为这是一种重要的动物模型,可帮助确

肠道菌群,焦虑和抑郁的元凶!

  来自麦克马斯特大学的科学家发现肠道菌群在焦虑和抑郁的引发过程起到很重要的作用。该研究结果发表在《Nature Communications》上,首次揭示肠道菌群的行为改变是早期生活压力导致的结果。  本文作者之一,麦克马斯特大学Premysl Bercik教授表示,该研究证明细菌在模型小鼠的焦虑

肠道菌群可引发肥胖的介绍

  上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室赵立平领导的一项研究显示,肥胖可能由细菌感染引发,而不是过度饮食、锻炼太少或者是遗传因素,这可能对公共健康体系、医药行业以及食品制造业产生深远的影响。 [5]  在世界各地科学家研究了8年之后,中国的这一发现解释了肠道细菌和肥胖之间的联系。开展

研究发现肠道菌群随季节改变

   对现存为数不多的其中一个狩猎—采集者群体开展的研究表明,生活在人类肠道中的微生物随着季节发生变化。相关成果日前发表于《科学》杂志。  来自“人类食物工程”的Jeff Leach及其团队用一年多时间收集了生活在坦桑尼亚的350名哈扎人的粪便样本。“人类食物工程”是一个非营利性机构,旨在研究微生物

肠道菌群与血压调控的关系

  一项研究发现,通过对两个主要的短链脂肪酸(SCFAs)受体——嗅觉受体78 (Olfr78)和Gpr41起作用,肠道微生物群产生的短链脂肪酸(SCFAs)可能在调控血压方面起到作用。Jennifer L. Pluznick及其同事发现,Olfr78在肾脏中表达,并且会响应短链脂肪酸(SCFAs)

科学家透视婴儿肠道菌群

  《自然》近日发表的两篇论文详细阐述了婴儿肠道菌群的形成。研究结果剖析了微生物组、婴儿发育以及I型糖尿病潜在影响之间的关系。  肠道菌群会不断变化,但从婴儿期到儿童期的变化过渡尚未得到全面理解。研究显示,微生物组可能与不同疾病病理特征有关,包括I型糖尿病“青少年糖尿病环境决定因素”(TEDDY)。

抗生素如何影响肠道菌群?

  杀死有益菌:  肠道菌群平衡:抗生素不仅可以杀死致病细菌,还会杀死肠道内的有益菌,从而破坏肠道菌群的平衡。  消化问题:有益菌的减少可能导致消化问题,如腹泻或便秘。  促进有害菌生长:  耐药性细菌:抗生素的使用可能导致耐药性细菌的生长,这些细菌更难治疗。  二次感染:耐药性细菌的增加可能增加二

肠道菌群粪便直接涂片染色检查

一、粪便直接涂片的优缺点:1、优点:①设备简单②操作简单③时间短④形象直观,直接了解粪便菌群的“像”,熟练者对诊断菌群失调有较高的准确性。2、缺点:①检验者必须有一定的经验,否则易判断错误②主要是定性检查,确定分度较困难。二、操作技术:1、涂片  将新鲜大便直接涂抹在洁净的玻片上,粪便不可稀释以防细

肠道菌群的生态平衡介绍

  人类与微生物之间的动态平衡称为微生态平衡,影响其微生态平衡的因素有外环境因素,也有宿主因素。外环境主要是通过改变宿主的生理功能产生的,如有益菌菌群,通过产生细菌素,抗生素和其代谢产物,以及争夺营养,空间争夺以阻止过路菌群入侵,保持自身的稳定性。生态平衡时,可以保持宿主的正常生理功能,如营养、免疫