华大基因Cell子刊发表宏基因组测序新成果
人类消化道中居住着大量的微生物,它们被统称为肠道微生物组。肠道微生物组在人类代谢食物、抵御感染和应答药物等过程中起到了重要的作用。许多人类疾病都与微生物组失衡有关。 微生物组研究过去主要依赖16S rDNA基因测序。随着测序成本的直线下降,针对整个菌群的宏基因组测序越来越受到青睐。目前,双胞胎宏基因组鸟枪测序的样本量还比较小。为此,华大基因BGI和伦敦国王学院的研究人员测序了英国250名成年双胞胎的粪便样本。他们在Cell Systems杂志上发表文章,揭示了基因和环境对肠道微生物组的影响。 研究人员通过宏基因组鸟枪测序建立了全面的肠道菌参考基因目录。研究显示,肠道微生物组的许多细菌类群和功能模块是可遗传的,包括那些与人类疾病有关的细菌类群和功能模块。研究人员还在肠道微生物组中鉴定了八百万SNP。他们发现,双胞胎的微生物组SNP高度相似。但数十年分隔两地的生活会使这种相似性慢慢降低。这说明地理和家庭环境会影响肠道微生物组......阅读全文
肠道菌群粪便直接涂片染色检查
一、粪便直接涂片的优缺点:1、优点:①设备简单②操作简单③时间短④形象直观,直接了解粪便菌群的“像”,熟练者对诊断菌群失调有较高的准确性。2、缺点:①检验者必须有一定的经验,否则易判断错误②主要是定性检查,确定分度较困难。二、操作技术:1、涂片 将新鲜大便直接涂抹在洁净的玻片上,粪便不可稀释以防变
抗生素如何影响肠道菌群?
杀死有益菌: 肠道菌群平衡:抗生素不仅可以杀死致病细菌,还会杀死肠道内的有益菌,从而破坏肠道菌群的平衡。 消化问题:有益菌的减少可能导致消化问题,如腹泻或便秘。 促进有害菌生长: 耐药性细菌:抗生素的使用可能导致耐药性细菌的生长,这些细菌更难治疗。 二次感染:耐药性细菌的增加可能增加二
常用肥皂成分迅速破坏肠道菌群
最近一项新的研究表明,三氯生——存在于许多消费品(从洗手液到玩具,甚至牙膏)中的一种抗菌剂和抗真菌剂,可迅速破坏肠道内的细菌群落。相关研究结果由来自俄勒冈州立大学(OSU)的科学家发表在今天的《PLOS ONE》杂志上。 这项研究是在斑马鱼中开展的,研究人员认为这是一种重要的动物模型,可帮助确
科学家透视婴儿肠道菌群
《自然》近日发表的两篇论文详细阐述了婴儿肠道菌群的形成。研究结果剖析了微生物组、婴儿发育以及I型糖尿病潜在影响之间的关系。 肠道菌群会不断变化,但从婴儿期到儿童期的变化过渡尚未得到全面理解。研究显示,微生物组可能与不同疾病病理特征有关,包括I型糖尿病“青少年糖尿病环境决定因素”(TEDDY)。
耐力运动训练有益肠道菌群平衡
《Frontiers in Microbiology》报道,耐力运动训练可以将肠道微生物菌群组成向有益方向改变,经过6周训练,潜在引起炎症的微生物(变形菌)减少,增强新陈代谢的微生物(阿克曼菌)增加。《Frontiers in Microbiology》报道,耐力运动训练可以将肠道微生物菌群组成向有
肠道菌群影响血糖和血脂水平
肠道细菌因影响人体各种生理功能和疾病而广受关注。来自熊本大学(Kumamoto University)的研究人员分析了肠道菌群变化对糖和脂质代谢的影响,首次发现了细菌生产的次级胆汁酸(secondary bile acids)影响血糖和血脂浓度的部分分子机制。这项发现将导致以肠道细菌生产的次级胆
关于肠道菌群紊乱的基本介绍
多数研究者认为,抗生素的使用破坏了肠道正常菌群,是引起腹泻最主要的病因。抗生素会破坏肠道正常菌群,引起肠道菌群失调。Ⅰ度失调是抗生素抑制或杀灭一部分细菌,而促进了另一部分细菌的生长,这就造成了某些部位的正常菌群在组成上和数量上的异常变化或移位,在诱发原因去掉后可逆转为正常比例;Ⅱ度失调是不可逆的
肠道菌群或有助于减肥
肠道菌群,即生活在我们肠道内的所有微生物,主要是细菌。在过去的几年中,对于肠道菌群的研究,已经开始解开它在我们身体中的巨大作用,以及它如何共生地影响我们器官的功能。特别是,微生物也对热量吸收的方式和脂肪细胞的发育产生影响。通过研究没有菌群的小鼠,瑞士日内瓦大学医学院的科学家们,能够解释“微生物的
Science公布太空双胞胎实验结果之三:肠道微生物的变化
美国航空航天局(NASA)标志性的双胞胎研究(Twins Study)今日在Science封面上公布了最新的结果,其中一项研究表明长期的太空飞行会影响人体肠道微生物。 研究指出,在国际空间站(ISS)长达一年的时间里,宇航员Scott Kelly肠道微生物组经历了两种主要细菌比例的转变。但是他
减不了肥?这要怪你的肠道微生物群
根据一项新的研究,与减肥成败最密切相关的因素是肠道微生物群,与体重指数(BMI)无关。研究结果于本周发表在美国微生物学会开放获取期刊《mSystems》上。 研究主要作者、美国西雅图系统生物学研究所科学家克里斯蒂安·迪纳博士称:“你的肠道微生物群可以帮助或导致对减肥的抵御,这开辟了尝试通过改变
-Nature-:肠道微生物群丰富程度对健康的影响
肥胖是心血管病、糖尿病、骨质疏松症和包括一些癌症在内的其他疾病的一个风险因素。必须有其他影响因素存在,才能确定肥胖者会患哪种代谢疾病。本期Nature上两篇论文分析这些因素中的一个所起作用,这个因素就是肠道微生物群的丰富程度。Le Chatelier等人分析了非肥胖者和肥胖者的肠道微生物基因
Nat-Commun:Tempol通过改变肠道微生物群降低肥胖
2013年9月24日,Nature Communications上发表的一篇论文提出,抗氧化剂Tempol通过改变小肠微生物群来降低小鼠的肥胖。这项研究提出了肠道微生物群在药物作用和体重调控中都有所涉及的另一个例子,同时也揭示了小肠中一个可能会被证明是减肥药物有用目标的信号通道。 Fr
AI助力,“捞出”肠道菌群中耐药菌“杀手”
在人体的“宇宙”中,居住着数百万种微生物。它们相生相克、相互制衡,维持着人体健康的微生态平衡。 很多常见耐药菌,如金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌、大肠杆菌等都是人体共生的“原住民”。而人体中同样存在着克制它们的微生物及其代谢产物。找到这些耐药菌的“克星”作为药物是当前生命科学领域的前沿问题。 如
AI助力,“捞出”肠道菌群中耐药菌“杀手”
经过AI挖掘到的抗菌肽分子(10倍最低抑菌浓度)处理后的大肠杆菌。透射电镜下可明显观察到大肠杆菌细胞内容物的泄露及细胞膜或细胞壁的破坏。论文作者供图 在人体的“宇宙”中,居住着数百万种微生物。它们相生相克、相互制衡,维持着人体健康的微生态平衡。 很多常见耐药菌,如金黄色葡萄球菌、肺炎链
Cell子刊推荐综述:人肠道细菌的命运
肠道微生物是由一群构成不同的微生物群体组成,其中包括细菌,古细菌和真核生物,它们亲密无间的生活在一起。在过去二十年间,科学家们对于这些小生物的兴趣日趋浓厚,很大一部分原因是由于测序技术相关的分析飞速发展,今天大量的证据表明肠道微生物在宿主生理病理,以及肠道免疫平衡过程中扮演了重要的角色。 近期
华大基因参与全球最大微生物基因组研究项目
华大基因3月22日宣布将参与全球最大微生物基因组研究项目EarthMicrobiomeProject(简称“EMP”),将负责EMP亚洲地区所有样本的收集和鉴定,并对整个项目提供DNA提取、扩增、建库、宏基因组测序,以及研发生物信息学分析流程所需的计算资源。 EMP将对来自全球的20万个样本进
肠道微生物影响饮食效果
当你试着在新年里改善自己的饮食时,体内的微生物群却可能会“捣乱”。近日,刊登在《细胞—宿主和微生物》期刊上的论文称,研究人员探索了为何小鼠从自由的美式饮食转换到健康低卡路里的植物性饮食后,没有立刻出现效果。他们发现,若想一项新饮食计划取得成功,必须去除某些人体肠道细菌。 “如果我们想开饮食处方
肠道微生物药物的研发
在人类的肠道里存在一个巨大的微生物群体,称之为“肠道微生态系统”,其作为宿主最重要的微生态系统组成部分,大约包含有15000~36000个菌种,由专性厌氧菌(>99%)、兼行厌氧菌和好氧菌共同组成,这些细菌共同构成胃肠道的动态微生态平衡。肠道在消化、吸收各种营养物质的同时又能将细菌及其代谢产物通
肠道微生物可以影响体重
根据最近发表在《Mayo Clinic Proceedings》杂志上的一篇文章,对于特定人群来说,肠道微生物的特殊活性或许有助于减肥。这一效应不依赖于控制饮食以及日常锻炼等行为。 “我们知道不同人的减肥效率存在差别,即使在接受了相同的卡路里摄入以及相同强度的锻炼之后依然如此”,该研究的作者P
肠道微生物加入抗癌斗争
2015年,Bertrand Routy还是法国古斯塔夫·鲁西癌症中心的一位博士生,他常去医院收集癌症患者的粪便样本。医生嘲笑他,甚至给他取了个外号:便便先生。 但Routy的研究结果发布后,人们停止了对这类研究的嘲笑。研究表明,某些肠道细菌似乎可以提高人们对抗癌治疗的反应。医生也盼望研究者能
赵立平专访:人类微生物组研究,解密人体第二基因组
2007年12月美国《科学》杂志预测:人体共生微生物的研究将可能是国际科学研究在2008年取得突破的7个重要领域之一。就如何研究共生微生物与人体健康的关系等问题,4月刚刚出席了巴黎国际人类微生物组研究联盟筹委会会议的上海交通大学生命科学技术学院教授赵立平接受了《科学时报》的采访。 深圳华大基因
华大参与:复杂宏基因组数据的新分析法
当前分析宏基因组数据的大多数方法,都依赖于与参考基因组的对比,但是许多环境中的微生物多样性远远超过了参考数据库所覆盖的范围。将复杂的宏基因组数据从头划分为特定的生物学实体(如特定的菌株或病毒),在很大程度上仍然是一个未解决的问题。 在2014年7月6日的《Nature Biotechnolog
改变机体肠道微生物组真能逆转乳糖不耐受?
童年以后,全球大约三分之二的人群都会失去消化牛奶的能力,正如我们所知,断奶后100%的非人类哺乳动物也会失去这种能力,进入成年期,持续消化乳糖(牛奶中的主要糖类)的能力是一种生物学异常表现。 乳糖并不会被肠道直接吸收,相反,其必须被乳糖酶破碎成两种较小的糖类分子,正常情况下, 产生乳糖酶的基因
微生物组影响的不仅是肠道,还有头发
为了让自己看上去美美哒,每个人每年都在头发上花了不少时间和金钱。不过,也许你还不知道,细菌和头发之间也存在着一种奇怪的共生关系。近日,加州大学旧金山分校的研究人员在《Cell Host & Microbe》上阐明了这种关系。 调节性T细胞(Treg)是一类让人体能够耐受共生微生物的免疫细胞,
盘点食品界中渐渐崛起的基因测序
2015年可谓是基因测序的元年,自精准医疗概念提出以来,基因测序在我国曾几度被央视报道。随着人类基因组计划的完成,基因测序技术不断提高,价格也不断降低,人类完成各种基因组测序成为了可能。无论在医疗行业还是在农业等领域,基因测序技术均大放光彩,殊不知,近年来基因测序在食品行业也渐渐崛起。本文综述了
高通量测序技术在肠道菌群多样性研究中的应用
在人体肠道中生活着数以万亿的共生菌群,它们的种类繁多,可达上千种,数量也很惊人,是人体细胞总量的10倍以上,迄今为止,仍有80%以上的微生物不为人知。这些肠道微生物和人体存在着互利共生的关系,对于维持人类的健康发挥着重要的作用。它们在肠道中保持着一种动态的平衡,能够合成维生素、帮助人体从食物中吸收
婴儿早期肠道微生物群与食物敏感性有关
日本理研综合医学科学中心(IMS)的Hiroshi Ohno领导的一项研究最近表明,在一个月大的婴儿身上发现的某些肠道细菌与食物敏感性和食物过敏的发展有关,尤其是对鸡蛋,而其他类型的细菌则没有。该研究还发现了预测新生儿肠道中存在哪种细菌的因素。总之,这些发现表明,某些益生菌补充剂可能是预防食物过敏的
母亲低纤维饮食或可永久改变后代肠道微生物群
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/12/490903.shtm刚出生的幼鼠接触和吃到的第一样东西会建立它们的原生肠道微生物群。这通常在生产和整个哺乳过程中受到它们母亲的影响。尽管饮食在生命的各个阶段都是已知的肥胖因素,但哺乳期母亲的饮食的影响仍
节食或通过影响肠道菌群促进健康
日前,上海交通大学赵立平团队与中科院上海生命科学研究院营养科学研究所刘勇团队、国家人类基因组南方中心赵国屏团队合作,发现热量限制能促进肠道益菌的生长,从而令小鼠增加寿命。该研究表明,节食或许通过造成一个更健康的菌群来促进宿主健康,相关研究论文发表在《自然—通讯》上。 通过减少食物摄入量,从
烟和增加体重的肠道菌群相关
以色列魏兹曼科学研究学院的Eran Elinav和同事通过一项小鼠研究表明,停止暴露于烟草烟雾后肠道菌群的改变或致额外体重增加。这项近日发表于《自然》的研究有助增进理解为何戒烟后人群常发生增重,但还需进一步研究验证这一关联。 吸烟是在全球导致人类疾病和可预防死亡的一个主要原因。许多吸烟者报告想