北大汤富酬、乔杰团队CellRes表观遗传学新成果
生物通报道:2016年11月8日,国际著名期刊《Cell Research》在线发表了北京大学汤富酬、乔杰团队题为“DNA methylation and chromatin accessibility profiling of mouse and human fetal germ cells”的最新研究成果。这项研究使用核小体占位和甲基化测序法,来分析人类和小鼠胚胎生殖细胞发育过程中一系列关键时间点上的全基因组染色体可及性和DNA甲基化谱。北京大学乔杰教授、汤富酬研究员为论文共同通讯作者。 在哺乳动物的胚胎发育过程中,发生了两次全基因组的DNA甲基化重编程,并已被证明对于哺乳动物的正确发育是至关重要的。最近,该研究团队与其他研究团队,已经对人胚胎生殖细胞(FGCs)发育过程中的动态转录组和DNA甲基化,进行了综合分析。妊娠后约10~11周,人类FGCs的总体DNA甲基化水平达到最低值;全基因组几乎没有DNA甲基化,只在基......阅读全文
DNA的去甲基化过程
DNA的去甲基化由基因内部的片段及与其结合的因子所调控。有两种假说可以解释DNA去甲基化的分子机制。一种假说与DNA半保留复制联系在一起,为被动去甲基化。如果甲基化的DNA经半保留复制后不被甲基化,其DNA则处于半甲基化状态,半甲基化的DNA如再次发生DNA半保留复制,而DNA甲基化活性仍被抑制,则
研究揭示合子DNA去甲基化机制
中国科学院生物物理研究所朱冰研究组揭示小鼠母源蛋白Pramel15促进合子DNA去甲基化机制。相关论文8月25日发表于《自然-通讯》。哺乳动物卵细胞受精后形成的受精卵会经历DNA甲基化的重编程,将继承自亲本的基因组甲基化状态重置,为后续的组织分化、胚胎发育做准备。其中,DNA甲基化维持的重要DNA甲
关于DNA去甲基化作用的简介
DNA去甲基化作用是指在哺乳动物细胞中缺乏和减少细胞内的DNA甲基转移酶含量会引起DNA的去甲基化,它对于开启特异性基因的表达和重编程的起始具有重要作用。长期以来,DNA主动去甲基化的机制一直是表观遗传领域的一个最基本的问题。与被动去甲基化相比,DNA的主动去甲基化是一个迅速的并且独立于细胞分裂
DNA去甲基化的两种方式
本公司提供专业的DNA甲基化修饰服务,有需要的客户请与本公司的工作人员。 作为发现较早的一种修饰途径,DNA甲基化能够引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变,从而控制基因表达。DNA甲基化修饰过程会使甲基添加到DNA分子上,例如在胞嘧啶环的5'碳上:这种
植物DNA去甲基化的机理和功能
10月19日,Journal of Integrative Plant Biology(JIPB)在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心郎曌博研究组题为The mechanism and function of active DNA demethylation i
基因组DNA甲基化分析方法
早期的基因组DNA甲基化分析技术,如SssI甲基转移酶分析法、氯乙醛反应法、免疫学抗体技术等,已经不能满足现代表观遗传学研究的需求。今年来常用的基因组甲基化的方法有以下两种。1. 甲基化敏感扩增多态性实验甲基化敏感扩增多态性实验技术被用于检测双向型真菌的DNA甲基化,它是在扩增片段长度多态性技术的基
揭示DNA去甲基化与DNA损伤修复之间的调控作用
近日,《EMBO报告》在线发表了中国科学院昆明动物研究所李家立课题组的研究论文,该文揭示了DNA去甲基化与DNA损伤修复之间的调控作用。 准确而有效的DNA损伤与修复应答对机体各种类型的细胞维持基因组完整性是十分重要的,DNA损伤修复功能的障碍会引起严重疾病,包括多种癌症、免疫缺陷、代谢紊乱、
在基因组范围定位DNA甲基化
DNA甲基化在哺乳动物基因表达中扮演了重要角色。尽管通过线粒体遗传且随时间稳定,但是细胞分化、疾病或环境影响都会改变DNA甲基化的模式。近年来,科学家们开发出多种新方法,试图在基因组范围定位DNA甲基化。 尽管从理论上来说,全基因组亚硫酸氢盐测序能让研究人员全面观察甲基化组,但它还是面临技
研究揭示受精卵DNA去甲基化重要机制
近日,中科院上海生科院生化与细胞所一项最新研究发现,小鼠早期胚胎中母源和父源基因组在单细胞的受精卵阶段,均会发生大规模的DNA主动和被动去甲基化,DNA双加氧酶Tet3介导了主动去甲基化的发生,而糖苷酶TDG并不参与该过程。相关研究成果在线发表于学术期刊《细胞—干细胞》。 该研究由中科院上海生
研究发现植物DNA主动去甲基化新机制
近期《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为Histone Acetylation Recruits the SWR1 Complex to Regulate Active DNA Demethylation i
陈柏仰博士Cell揭示DNA去甲基化动态
精子和卵子融合是动物个体发育的起点,不过这一过程并不仅仅是简单的融合。人们发现,在哺乳动物胚胎的早期发育中,全基因组的甲基化模式会发生明显的变化。在小鼠胚胎受精之前,雌雄生殖细胞具有较高的甲基化水平,受精后父源基因组迅速的发生主动去甲基化,而母源基因组发生被动的去甲基化。 为了了解人类生殖细胞
DNA去甲基化酶催化作用介绍
DNA去甲基化由DNA去甲基化酶催化。DNA去甲基化是在DNA糖苷酶的作用下脱掉甲基化碱基的反应,等同于被损伤的DNA在糖苷酶及无碱基核酸酶酶切偶联催化下的修复反应。5一甲基胞嘧啶糖基化酶是体内侯选去甲基化酶。此外,甲基化CpG结合蛋白如MBD2等也具有去甲基化酶的活性。
线虫基因组中存在DNA甲基化现象
2012年10月18日,吉林大学和华大基因合作完成的旋毛形线虫不同发育阶段DNA甲基化差异分析的相关研究成果在国际著名期刊《基因组生物学》(Genome Biology)上发表。该研究首次证实了线虫基因组中存在DNA甲基化现象,改写了长期以来认为线虫中没有该表观遗传修饰的历史,同时也使以DN
家蚕基因组甲基化谱研究获突破
我国科学家利用新一代测序技术构建家蚕丝腺甲基化谱 由中国科学院昆明动物研究所、深圳华大基因研究院、西南大学、上海肿瘤所等合作的研究成果“家蚕基因组甲基化谱”,5月2日在国际著名学术杂志《自然—生物技术》(Nature Biotechnology)上发表,这是中国科学家
朱健康小组植物DNA去甲基化调控研究获进展
6月15日,《科学》杂志在线发表了中科院上海植物逆境生物学研究中心、中科院上海生命科学研究院植物生理生态所朱健康课题组的最新成果,他们研究揭示了编码一个组蛋白的乙酰化酶IDM1在植物去甲基化作用机制中的重要作用。这被认为是近年来表观遗传领域的一项重大突破。 DNA甲基化修饰是一种重要的表
广州生物院发现DNA被动去甲基化的新作用
DNA甲基化是胞嘧啶的甲基化是最重要的表观遗传学修饰之一,多项生物学过程均涉及DNA甲基化水平的调控。近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院郑辉课题组通过研究细胞增殖过程中DNA甲基化(胞嘧啶的甲基化)的调控,发现DNA被动去甲基化的新作用。相关研究成果在线发表在Journal of Biol
广州生物院发现DNA被动去甲基化的新作用
DNA甲基化是胞嘧啶的甲基化是最重要的表观遗传学修饰之一,多项生物学过程均涉及DNA甲基化水平的调控。近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院郑辉课题组通过研究细胞增殖过程中DNA甲基化(胞嘧啶的甲基化)的调控,发现DNA被动去甲基化的新作用。相关研究成果在线发表在Journal of Biol
昆明动物所揭示DNA去甲基化与DNA损伤修复之间的调控作用
3月21日,EMBO Reports在线发表了中国科学院昆明动物研究所李家立课题组的研究论文,该文揭示了DNA去甲基化与DNA损伤修复之间的调控作用。昆明动物所助理研究员蒋德伟为文章第一作者,研究员李家立为通讯作者。 准确而有效的DNA损伤与修复应答对机体各种类型的细胞维持基因组完整性是十分重
基因组直接测序法检测DNA的甲基化
基因组直接测序法是过去一直沿用的DNA甲基化的研究方法,用Maxam—Gilbert化学裂解法对基因组DNA进行处理,并以连接介导的PCR来放大信号强度,然后进行序列分析。此法是基于5mC在标准的Maxam—Gilbert胞嘧啶化学裂解反应中不被裂解,故5mC可通过在测序胶上缺少对应于胞嘧啶降解反应
裴端卿组综述DNA去甲基化的级联调控模型
中国科学院广州生物医药与健康研究院裴端卿课题组综合近期体细胞重编程过程中TET相关DNA去甲基化的研究进展【1】和之前的相关研究,对细胞命运变化过程中的DNA甲基化模式重排过程和级联调控模型进行了调研,提出偶联TET进行DNA去甲基化可能是转录因子打开染色质的一种基本模式,该综述以The Bat
研究首次揭示DNA主动去甲基化可靶向病毒基因
βC1在体外和体内增强DME活性。中国农科院植保所供图 近日,中国农业科学院植物保护研究所作物病原生物功能基因组研究创新团队联合清华大学生命科学学院,首次发现植物病毒可以利用植物的DNA主动去甲基化机制来逃逸植物的防御反应,相关研究结果在线发表于《自然—通讯》(Nature Communicati
人类基因组DNA甲基化数据分析
近期来自电子科技大学,清华大学等处的研究人员从CpG岛等基本定义出发,阐述了高通量DNA甲基化的检测技术以及针对芯片技术与下一代测序技术的低水平数据处理方法,并重点对比了基于机器学习理论对CpG位点及CpG岛甲基化水平的预测算法,以及所利用的特征对预测效果的影响与发展趋势。 DNA甲基化是表观
上海生科院发现Gadd45a参与DNA去甲基化的机制
4月6日,国际学术期刊Nucleic Acids Research(《核酸研究》)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所徐国良研究组题为Gadd45a promotes DNA demethylation through TDG 的最新研究成果。该研究发现Gadd45a
朱健康研究团队发现植物DNA主动去甲基化新机制
7月30日,《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为Histone Acetylation Recruits the SWR1 Complex to Regulate Active DNA Demethylati
生化与细胞所DNA去甲基化机制研究有新发现
高等生物的基因组DNA中除含有腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)和胸腺嘧啶(T)四种常见的碱基形式外,还含有胞嘧啶的修饰形式:5-甲基胞嘧啶(5mC),被称为第5种碱基。而且它可以进一步被氧化为5-羟甲基胞嘧啶(5hmC),也被称为第6碱基。这些修饰形式在表观调控中都具有重要的作用,但它们
上海生科院合作揭示受精卵DNA去甲基化重要机制
9月11日,国际学术期刊《细胞—干细胞》(Cell Stem Cell)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所徐国良研究组、李劲松研究组和北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬研究组的最新研究成果Active and Passive Demethylation
上海生科院揭示拟南芥DNA主动去甲基化调控新机制
12月9日,《细胞研究》(Cell Research)杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为A pair of transposon-derived proteins function in a histone acetyltransferase c
顶级科学家张毅Cell子刊表观遗传学新文章
几年前,汤姆森科技信息集团旗下《科学观察》(Science Watch)评出了的高影响力论文数量最多的研究人员。原北卡罗莱纳大学医学院生物化学与生物物理学系教授、霍华德•休斯医学研究院(HHMI)研究员张毅(现就职于哈佛医学院)成为分子生物学和遗传学领域高影响力论文的数量最多的前十位顶级科学家之
上海生化细胞所发现受精卵DNA去甲基化重要机制
近日,中科院上海生科院生化与细胞所一项最新研究发现,小鼠早期胚胎中母源和父源基因组在单细胞的受精卵阶段,均会发生大规模的DNA主动和被动去甲基化,DNA双加氧酶Tet3介导了主动去甲基化的发生,而糖苷酶TDG并不参与该过程。相关研究成果在线发表于学术期刊
朱健康院士团队揭示植物DNA主动去甲基化的完整调控途径
近日,PNAS杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为“Histone Acetylation Recruits the SWR1 Complex to Regulate Active DNA Demethylation in Arabidops