Nature子刊发表新型细胞发育分析工具scTDA

有机组织起源于单个细胞,当细胞分裂时,其拷贝分化成特化细胞,例如心脏、骨骼或脑细胞。为了解细胞朝不同方向转变时的内部和外部线索,科学家们通常对这些细胞进行RNA测序技术,因为RNA是将DNA转变为蛋白质和其他产物的分子信使。 然而,由于细胞往往处于不同的发育状态,从一批细胞中提取RNA后的测序结果不够准确。为了解决这个问题,科学家们已经开发了单细胞RNA测序。 “一项新的技术,总能带给我们新的视野,”哥伦比亚大学生物医学信息学和系统生物学系副教授Raul Rabadan博士说。“但是,我们对同样推动了进程发展的、不同状态的细胞之间的联系,仍存在认知盲点。” 为了研究细胞发育,科学家们使用数学工具分析了大量的测序数据。但这些工具过于依赖潜在的假设,局限了搜索范围。“考虑到细胞发育的复杂程度,模型假设限制了你的发现能力,”本文第一作者、哥伦比亚大学生化和分子生物物理系博后研究员Abbas Rizvi说。 为了确定不同细胞......阅读全文

尼古丁会在单细胞水平上影响胎儿发育

  怀孕的准妈妈们需要注意了,又有新证据表明吸烟会对腹中胎儿造成极大伤害。美国一项新研究显示,尼古丁会在单细胞水平上对人类胚胎发育产生广泛不利影响,新生儿暴露在尼古丁环境下3周后,就可能导致多种出生缺陷。   尼古丁是烟草的主要化学成分。已有大量动物模型研究表明,怀孕期间暴露在尼古丁环境下会增加

迄今最完整胚胎发育单细胞图谱发布

科技日报北京8月4日电 (实习记者张佳欣)科学家以果蝇为模型生物,构建了迄今为止最完整、最详细的动物胚胎发育单细胞图谱。这一发表在最新一期《科学》杂志上的成果,利用了来自100多万个各个发育阶段的胚胎细胞数据,代表了多个层面的重大进步,有助于科学家探索突变如何导致不同的发育缺陷,以及了解人类基

单细胞RNAseq发现调节干细胞发育的新基因

  最近,Wellcome Genome Campus的一项新研究演示了单细胞基因组学的力量,揭示了它如何能帮助科学家了解细胞的早期发育。这项研究发现了参与干细胞调控网络的新基因,以及新 的细胞亚群,可让我们深入了解干细胞多能性——成为几乎所有不同类型细胞的能力。研究人员还为干细胞群落开发了新的资源

单细胞基因表达分析解密血液早期发育调控网络

  近日,著名国际期刊nature biotechnology发表了英国科学家的一项最新研究成果,他们应用单细胞基因表达分析与计算方法描述了血液发育的转录调控网络。这项研究为分析器官发育的调控网络提供了一种可行的方法。   研究人员指出,重建调控器官发育的分子途经受限于缺少对胚胎祖细胞进行研究的

科学家绘制出脑前额叶发育单细胞图谱

  近日,中科院生物物理所王晓群课题组、北京大学未来基因诊断高精尖创新中心汤富酬课题组、北京大学第三医院乔杰课题组和首都医科大学附属安贞医院张军课题组合作,绘制出人脑前额叶胚胎发育过程的单细胞转录组图谱,并对其中关键的细胞类型进行了系统功能研究,为绘制完整的人脑细胞图谱奠定重要基础。相关研究成果已发

SCIENCE-ADVANCES:单细胞Western揭秘胚胎发育异质性

  近日,美国加利福尼亚大学伯克利分校的科学家,利用单细胞Western技术在期刊SCIENCE ADVANCES(IF:12.804)发表文章:Assessing heterogeneity among single embryos and single blastomeres using ope

SCIENCE-ADVANCES:单细胞Western揭秘胚胎发育异质性

近日,美国加利福尼亚大学伯克利分校的科学家,利用单细胞Western技术在期刊SCIENCE ADVANCES(IF:12.804)发表文章:Assessing heterogeneity among single embryos and single blastomeres using ope

SCIENCE-ADVANCES:单细胞Western揭秘胚胎发育异质性

  近日,美国加利福尼亚大学伯克利分校的科学家,利用单细胞Western技术在期刊SCIENCE ADVANCES(IF:12.804)发表文章:Assessing heterogeneity among single embryos and single blastomeres using ope

用单细胞测序绘制人胚胎脊髓发育“时间表”

中国科学院遗传与发育生物学研究所研究员戴建武再生医学团队与南京鼓楼医院教授胡娅莉团队合作,首次通过单细胞转录组技术对早中孕期的人胚胎脊髓进行单细胞测序分析,为了解人类脊髓发育、研究脊髓再生修复、探索体外脊髓制造策略中种子细胞的选择提供了理论支持。相关研究近期发表于EMBO Reports

综述推荐|-多维单细胞技术解析器官发育与维持

  近年来,依靠表观遗传组学、转录组学、细胞谱系示踪和高通量mRNA分子原位分析等技术在单细胞分辨率上的突破,研究人员对脊椎动物器官发育与维持过程中细胞与分子机制的解析取得了一系列重大进展【1-3】。目前,运用各种先进的单细胞分析技术,研究人员可以从细胞图谱绘制(cell atlas profili

单细胞测序-揭示家猪胸腰椎发育相关机制

视觉中国供图  科技日报讯 (记者赵汉斌)猪体节数量性状是猪遗传育种的重要研究方向之一。记者11月底从中国科学院昆明动物研究所获悉,该所张亚平院士研究团队与合作者通过单细胞测序,进行了猪胸腰椎发育和肋骨发生过程中的细胞类群鉴定与发育阶段胸腰椎的基因差异表达分析。国际期刊《基因组学、蛋白质组学和生物信

利用单细胞测序,科学家解析人胚胎脊髓发育过程

  脊髓是外周系统与大脑间信号传递的桥梁。脊髓背角介导着外周感受信号,而腹侧对于运动功能的执行至关重要,同时也是低级反射的中枢。作为一种高度有序的中枢组织,脊髓由多种不同的细胞类型有序发育形成。虽然脊髓的发育在啮齿类动物中已进行了一系列的研究,但对人类脊髓发育过程了解较少。  中国科学院遗传与发育生

单细胞分离用于单细胞基因扩增

 单细胞分离连接不同管径大小的毛细玻璃针,可分离捕获各种非贴壁状态的单细胞和微粒等,如细菌、酵母、藻类细胞、植物花粉、原生动物单细胞、悬浮细胞、血液细胞、免疫细胞、卵细胞、各种悬液中单细胞及特殊标记的单细胞等。  单细胞分离用于各种类型的细胞分离培养、纯化、检测;获得单克隆细胞;用于单细胞基因扩增,

暨南大学报道-造血干细胞发育单细胞lncRNA动态表达图谱

   来自暨南大学基础医学院兰雨课题组、中国医学科学院基础医学研究所余佳课题组、军事医学科学院附属医院(现为解放军总医院第五医学中心)刘兵课题组合作发表研究论文“Combined Single-Cell Profiling of lncRNAs and Functional Screening Re

我国学者在单细胞水平解析拟南芥根发育全景图

  正如没有相同的指纹、完全一样的叶片,构成生命体基本单元的细胞同样存在高度的异质性。近年来随着单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)的发明与应用,使得研究人员能够在单细胞水平研究单细胞属性、细胞间异质性和细胞类型,深入解析生命活动的内在基本机理。  4月18日,国际学术期刊Molecular

新显微镜可追踪胚胎发育单细胞分裂过程

  从一个受精卵发育成多种功能的胚胎,细胞要经过上千次分裂和复杂的排列重组。据物理学家组织网6月3日报道,霍华德·休斯医学研究院珍妮莉娅法姆研究学院开发出一种最新的成像技术,能以前所未有的速度和精确度看到这一过程,让人们能追踪胚胎成形时每个细胞在几天甚至几小时内的变化。相关

科学家在单细胞水平解析拟南芥根发育全景图

  正如没有相同的指纹、完全一样的叶片,构成生命体基本单元的细胞同样存在高度的异质性。近年来随着单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)的发明与应用,使得研究人员能够在单细胞水平研究单细胞属性、细胞间异质性和细胞类型,深入解析生命活动的内在基本机理。  4月18日,国际学术期刊Molecular

单细胞RNA测序新成果-带你解开心脏发育的长久谜题

  制造一颗心脏,这不是简单的事情。在子宫内,这个器官开始是一根管,芽珠状的硬块,自动折叠,最终变成了更熟悉的四腔结构。  但确切地说,心脏细胞是如何按照它们的基因程序,来构建这个复杂的、维持生命的泵状器官呢?这仍然是一个谜。哈佛医学院遗传学教授、心脏病学研究员Jonathan Seidman说:“

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揭示不同区域单细胞通讯控制心脏发育的新机制

  北京大学分子医学研究所、北京大学-清华大学生命科学联合中心研究员何爱彬研究组在Circulation Research杂志在线发表题为“Single-cell transcriptomics reveals chemotaxis mediated intra-organ crosstalk du

Namocell单细胞分离仪应用——单细胞测序

2018年11月,Namocell与CZ-Biohub(Chan Zuckerburg Biohub)合作,在单细胞测序领域做出了新的尝试。CZ-Biohub利用Namocell单细胞分离仪分选出目的B细胞,并且将其进行单细胞测序,为抗体新药的发现迈出了重要一步。单细胞RNA测序(scRNA-s

CloneSelect 单细胞分离系统 OR 传统单细胞克隆方法

CloneSelect™ Single-Cell Printer™ f.sight™ ( f.sight )被开发用于满足这些需求, 它可以柔和地接种单个细胞至微孔,同时记录整个细胞接种过程,提供单克隆性的图像证据以及优异的接种后细胞生长用于细胞株开发在这个研究中,我们开展了六组实验,用无血清培养基

《科学》:科学家构建了迄今最完整胚胎发育单细胞图谱

科学家以果蝇为模型生物,构建了迄今为止最完整、最详细的动物胚胎发育单细胞图谱。这一发表在最新一期《科学》杂志上的成果,利用了来自100多万个各个发育阶段的胚胎细胞数据,代表了多个层面的重大进步,有助于科学家探索突变如何导致不同的发育缺陷,以及了解人类基因组中与大多数疾病相关突变的庞大非编码部分。  

单细胞测序绘制首个人胚胎造血和免疫系统发育图谱

  2019年10月10日,来自英国Newcastle University和Wellcome Sanger Institute等机构的科学家在Nature上以长文形式发表了题为“Decoding human fetal liver haematopoiesis”的研究,首次报道了由胎肝驱动的人胚胎

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双光子显微镜活体单细胞成像揭示生物钟发育过程

  3月14日,PLOS Biology 期刊在线发表了题为《斑马鱼生物钟的活体单细胞成像》的研究论文。该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心(神经科学研究所)、上海脑科学与类脑研究中心、神经科学国家重点实验室严军研究组、何杰研究组与安徽医科大学附属第一医院教授李元海合作完成。该研究成功构建

Namocell单细胞分离仪应用介绍——藻类单细胞分离

Namocell单细胞分离仪最新应用:随着人们对环境研究的不断深入,研究人员逐渐将目光转向藻类的单细胞层面:有些需要对藻类进行单细胞级别的分析(如藻类单细胞测序等),也有需要对单细胞藻类进行培养。这样就面临一个棘手的问题,那就是如何获取藻类的单个细胞。通常实验室里的方式,是在显微镜下用毛细管吸取。这

单细胞凝胶电泳法检测单细胞DNA损伤

单细胞凝胶电泳(single-cell gel eiectrophoresis,SCGE)又称慧星试验(comet assay)是一项较新的电泳方法。自1978年被Rydcbert B.等人成功地用于检验DNA单链断裂以来,经过不断的改进,已成为一种快速、灵敏、简便的检测DNA损伤的方法,广泛地应用

何爱彬团队揭示不同区域单细胞通讯控制心脏发育的机制

  6月21日,北京大学分子医学研究所、北京大学-清华大学生命科学联合中心研究员何爱彬研究组在Circulation Research杂志在线发表题为“Single-cell transcriptomics reveals chemotaxis mediated intra-organ crosst

Nature单细胞测序绘制首个人胚胎造血和免疫系统发育图谱

  哺乳动物的造血与免疫系统发育是在胚胎发育过程中由多个组织以复杂的协同作用所驱动的【1】。尽管研究界对于人体中这一过程所涉及的功能主体和时间序列都有了较为准确的认识,例如造血干细胞是先从受孕后2至3周的胚胎外卵黄囊(yolk sac)中,以及从3至4周的胚胎主动脉-性腺-中肾区域(aorta-go