Nature:绘制出有史以来最大的人蛋白相互作用图谱
在一项新的研究中,来自美国哈佛医学院的研究人员绘制出人5800多个基因编码的蛋白相互作用图谱(或者说网络)。这些基因代表着超过四分之一的人基因组。相关研究结果发表在2017年5月25日的Nature期刊上,论文标题为“Architecture of the human interactome defines protein communities and disease networks”。 这个被称作BioPlex 2.0的网络鉴定出56000多种独特的蛋白相互作用,它们中的87%是之前未知的。这个网络是迄今为止最大的。 BioPlex揭示出与基础细胞过程和高血压、癌症等疾病相关联的蛋白群体,并且为努力理解人类生物学特征和疾病提供新的机会。 论文共同通信作者、哈佛医学院细胞生物学系主任Wade Harper教授说,“基因并不只是一段DNA。基因也会编码蛋白。除非我们能够理解人蛋白质组,否则我们很难完全搞清楚人基因组。......阅读全文
FANCI基因编码功能及结构描述
fanconi贫血互补组(fanc)目前包括fanca、fancb、fancc、fancd1(也称为brca2)、fancd2、fance、fancf、fancg、fanci、fancj(也称为brip1)、fancl、fancm和fancn(也称为palb2)。先前定义的组fanch与fanca相
ALK基因编码功能及结构描述
ALK基因编码一种受体酪氨酸激酶(eceptor tyrosine kinase ,RTK),为跨膜蛋白,属于胰岛素受体超家族,在大脑发育与及特定的神经元中起重要作用。最初在间变性大细胞淋巴瘤(anaplastic large cell lymphoma, ALCL)发现ALK-NPM1融合蛋白,目
ENG基因编码功能及结构描述
该基因编码一种同二聚体跨膜蛋白,是血管内皮的主要糖蛋白。该蛋白是转化生长因子β受体复合物的一个组成部分,它与beta1和beta3肽具有高亲和力。该基因突变导致遗传性出血性毛细血管扩张症,也称为Osler-Rendu-Weber综合征1,常染色体显性遗传性多系统血管发育不良这个基因也可能与子痫前期和
CREBBP基因编码功能及结构描述
该基因广泛表达,参与多种不同转录因子的转录共激活。首先作为一种结合cAMP反应元件结合蛋白(creb)的核蛋白被分离出来,该基因通过将染色质重塑与转录因子识别结合,在胚胎发育、生长控制和体内平衡中发挥关键作用。该基因编码的蛋白质具有固有的组蛋白乙酰转移酶活性,也作为支架稳定与转录复合物的额外蛋白质相
LCK基因编码功能及结构描述
Lck(或淋巴细胞特异性蛋白酪氨酸激酶)是一种56 kDa的蛋白质,存在于称为淋巴细胞的免疫系统的特化细胞内。 Lck是酪氨酸激酶,其磷酸化参与这些淋巴细胞的细胞内信号传导途径的某些蛋白质的酪氨酸残基。 它是Src酪氨酸激酶家族的成员。
ERG基因编码功能及结构描述
该基因编码一个转录因子的红细胞转化特异性(ETS)家族成员。这个家族的所有成员都是胚胎发育、细胞增殖、分化、血管生成、炎症和凋亡的关键调节者。该基因编码的蛋白质主要在细胞核内表达。包含一个ets-dna结合域和一个与嵌合癌蛋白的自结合有关的pnt(尖)域。这种蛋白是血小板粘附在内皮下,诱导血管细胞重
CTCF基因编码功能及结构描述
该基因属于boris+ctcf基因家族,编码一个具有11个高度保守的锌指结构域的转录调节蛋白。这种核蛋白能够利用zf结构域的不同组合来结合不同的dna靶序列和蛋白质。根据所述位点的上下文,所述蛋白质可结合包含组蛋白乙酰转移酶(hat)的复合物并作为转录激活剂发挥作用,或结合包含组蛋白脱乙酰基酶(hd
MCC基因编码功能及结构描述
该基因是一个候选的大肠肿瘤抑制基因,被认为是负调控细胞周期进程小鼠的同源基因表达一种与质膜和膜细胞器相关的磷蛋白,而小鼠蛋白的过度表达抑制了进入s期。已发现该基因编码不同亚型的多个转录变体。[由RefSeq提供,2008年7月]This gene is a candidate colorectal
FPGS基因编码功能及结构描述
该基因编码叶酸聚谷氨酸合成酶这种酶在建立和维持细胞液和线粒体的叶酸多聚谷氨酸浓度方面起着中心作用,因此,对于叶酸的稳态和增殖细胞的生存至关重要这种酶催化谷氨酸部分对叶酸和叶酸衍生物的ATP依赖性加成选择性剪接导致编码不同亚型的转录变体。[由RefSeq提供,2014年1月]This gene enc
CTIF基因编码功能及结构描述
CTIF是CBP80(NCBP1;MIM 600469)/CBP20(NCBP2;MIM 605133)翻译起始复合物的一个组成部分,该复合物与新生mRNA的帽端共转录结合cbp80/cbp20复合物参与同时编辑和翻译步骤,该步骤识别mrnas中的过早终止密码子(ptc),并将含有mrnas的ptc
HFE基因编码功能及结构描述
该基因编码的蛋白是一种膜蛋白,与mhcⅠ类蛋白相似,与beta2微球蛋白(beta2m)相关。认为该蛋白通过调节转铁蛋白受体与转铁蛋白的相互作用来调节铁的吸收。铁储存障碍,遗传性血色素沉着症,是一种隐性遗传疾病,是由该基因缺陷引起的。至少有9个选择性剪接的变异已经被描述为这个基因。已发现其他变体,但
CBL基因编码功能及结构描述
这个基因是一个原癌基因,编码一个无名指E3泛素连接酶。编码蛋白是蛋白酶体降解底物所需的酶之一。该蛋白介导泛素从泛素结合酶(E2)转移到特定底物。该蛋白还包含一个N端磷酸酪氨酸结合域,使其与许多酪氨酸磷酸化底物相互作用,并以蛋白酶体降解为靶点。因此,它作为许多信号转导途径的负调节器发挥作用。该基因在包
常见癌基因编码蛋白的检测
实验步骤展开 经验交流
GUSB基因编码功能及结构描述
该基因编码一种降解糖胺聚糖的水解酶,包括硫酸乙酰肝素、硫酸皮肤素和硫酸软骨素。这种酶形成一个定位于溶酶体的四聚体该基因突变导致粘多糖病第七型。选择性剪接导致多个转录变体人类基因组中有许多这个位点的假基因。[由RefSeq提供,2014年5月]This gene encodes a hydrolase
ITGAL基因编码功能及结构描述
ITGAL编码整合素αL链整合素是由α链和β链组成的异二聚体膜蛋白含有α整合素的I-结构域与β2链(ITGB2)结合形成整合素淋巴细胞功能相关抗原-1(LFA-1),在所有白细胞上表达LFA-1通过与其配体ICAMs 1-3(细胞间粘附分子1-3)的相互作用,在白细胞间粘附中发挥中心作用,并在淋巴细
MYCNOS基因编码功能及结构描述
该基因反义转录至v-myc禽骨髓细胞瘤病毒癌基因神经母细胞瘤衍生同源基因(mycn)。它被认为编码一种稳定MYCN、防止细胞凋亡和促进细胞增殖的新型小蛋白该位点的转录物也可以直接作为功能性rnas向mycn的启动子招募转录调节因子并刺激该癌基因的转录。因此,这种基因通过rna和蛋白质产物发挥作用。[
HCK基因编码功能及结构描述
这个基因编码的蛋白质是酪氨酸激酶src家族的成员。这种蛋白质主要是造血的,特别是在髓系和B淋巴细胞系的细胞中。它可能有助于将fc受体与呼吸爆发的激活结合起来。此外,它可能在中性粒细胞迁移和中性粒细胞脱颗粒中发挥作用。由于选择性剪接和选择性翻译起始密码子(包括非aug密码子)的使用,产生了具有不同亚细
ATR正相关基因编码功能描述
该基因编码的蛋白属于PI3/PI4激酶家族,与ATM(一种在共济失调性毛细血管扩张症中突变的基因编码的蛋白激酶)关系最为密切。这种蛋白和atm与pombe-rad3裂殖酵母菌(schizosaccharomyces pombe rad3)具有相似性,后者是细胞周期停滞和DNA损伤修复反应中所需的细胞
GMPS基因编码功能及结构描述
在嘌呤核苷酸的从头合成中,IMP是支点代谢物,在支点代谢物处,途径分化为鸟嘌呤或腺嘌呤核苷酸的合成。在鸟嘌呤核苷酸途径中,有2种酶参与IMP转化为GMP,即IMP脱氢酶(IMPd1),它催化IMP氧化成XMP和GMP合成酶,催化XMP向GMP的胺化。[由RefSeq提供,2008年7月]In the
返座假基因的编码潜能
少数无致命突变而可能存在编码能力的返座假基因已作功能研究,如人metallothioneinⅡ假基因,鼠L32核糖体蛋白的一个假基因rpL32-4A等等。人metallothioneinⅡ假基因5’端上游缺乏RNA聚合酶Ⅱ转录所需的各种元件,且在Hela细胞及鼠L细胞中未发现转录活性。鼠L32核糖体
ACADSB基因编码功能及结构描述
短/支链酰基辅酶a脱氢酶(ACADSB)是脂肪酸或支链氨基酸代谢中催化酰基辅酶a衍生物脱氢的酶家族中的一员底物特异性是定义该基因家族成员的主要特征。acadsb基因产物对短支链酰基辅酶a衍生物(s)-2-甲基丁基辅酶a具有最大的活性,但也与其他2-甲基支链底物和短直链酰基辅酶a发生显著反应。该cDN
ASPM基因编码功能及结构描述
该基因是果蝇“纺锤体异常”基因(asp)的人类同源基因,对胚胎神经母细胞的正常有丝分裂纺锤体功能至关重要在小鼠中的研究也表明该基因在有丝分裂纺锤体调控中的作用,在调节神经发生中具有优先作用。该基因突变与小头畸形原发性5型相关。已发现该基因编码不同亚型的多个转录变体。[由RefSeq提供,2011年5
GABRP基因编码功能及结构描述
γ-氨基丁酸(GABA)A受体是介导中枢神经系统最快抑制性突触传递的多亚单位氯通道该基因编码的亚单位在包括子宫和卵巢在内的一些非神经组织中表达。该亚单位可以与已知的GABA A受体亚单位结合,并且该亚单位的存在改变了重组受体对如孕烯醇酮等调节剂的敏感性另外,已经发现该基因编码不同亚型的剪接转录变体[
ITPA基因编码功能及结构描述
该基因编码一种肌苷三磷酸焦磷酸水解酶。编码蛋白水解肌苷三磷酸和脱氧肌苷三磷酸,得到一磷酸核苷酸和二磷酸。这种蛋白质是ham1 ntpase蛋白家族的一员,存在于细胞质中,起着同二聚体的作用。编码蛋白的缺陷可导致肌苷三磷酸焦磷酸化酶缺乏,从而导致红细胞中itp的积聚。交替剪接导致多个转录变体。[由Re
FASLG基因编码功能及结构描述
这个基因是肿瘤坏死因子超家族的成员编码的跨膜蛋白的主要功能是通过与fas结合诱导细胞凋亡。Fas/FasLG信号通路是免疫系统调节的关键,包括T细胞的活化诱导的细胞死亡(AICD)和细胞毒性T淋巴细胞诱导的细胞死亡。它也与一些癌症的进展有关。该基因缺陷可能与系统性红斑狼疮(sle)有关。另外,已经描
KIT基因编码功能及结构描述
KIT基因编码的蛋白是干细胞因子受体SCFR,也被称为原癌基因c-kit或酪氨酸蛋白激酶kit或CD117,是一种受体酪氨酸激酶,这个基因突变与胃肠道间质瘤,肥大细胞病,急性髓性白血病有关。
ITK基因编码功能及结构描述
该基因编码在t细胞中表达的细胞内酪氨酸激酶。该蛋白包含sh2和sh3两个结构域,它们通常存在于细胞内激酶中。它被认为在t细胞增殖和分化中起作用。[由RefSeq提供,2008年7月]This gene encodes an intracellular tyrosine kinase expresse
常见癌基因编码蛋白的检测
实验步骤 展开
FANCL基因编码功能及结构描述
这个基因编码泛素连接酶,它是范科尼贫血互补组(FANC)的成员。这一组的成员通过组装成一个共同的核蛋白复合物而不是通过序列相似性来联系。该基因编码互补群L的蛋白,该蛋白介导FANCD2和FANCI的单泛素化。范科尼贫血是一种遗传异质性隐性疾病,其特征是细胞遗传不稳定、对dna交联剂过敏、染色体断裂增
CFLAR基因编码功能及结构描述
该基因编码的蛋白是一种细胞凋亡调节因子,其结构与caspase-8相似。然而,编码蛋白缺乏半胱天冬酶活性,似乎自己被半胱天冬酶8分裂成两个肽。该基因有几种编码不同亚型的转录变体,并且存在更多变体的部分证据。The protein encoded by this gene is a regulator